[Mon Aug 29 16:51:18 2016] >Input file: TMA0A024R9Z1M1G.pdb >TM segments: 44-85_ 126-137 MAIDEN score = 18.9833 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- C64 -I70 10 I70 -L81 1.22571118412053 C61 -R72 1.19778214423632 C64 -R69 1.19744554731212 I70 -I82 1.12391860011333 V59 -Q74 1.07906070432723 R69 -P83 1.00732310065112 P62 -P71 0.986541908753269 P62 -R72 0.777035417935575 F48 -Y84 0.753643556211914 P71 -L78 0.753089195750761 V59 -E75 0.733173220361707 E52 -D57 0.713646198325939 F53 -V59 0.707918392164375 D57 -E75 0.707167229538546 R72 -V79 0.664458335955919 P71 -L81 0.48764028014207 Q65 -I70 0.435072723157995 P62 -E75 0.433273835241164 Y50 -Q74 0.422978942445819 R72 -L81 0.422039571085772 C64 -P71 0.414327194457944 D57 -Q74 0.411007244095713 Q74 -V79 0.404905820407174 Q65 -Y135 0.399865162179488 P71 -S85 0.36346502275427 F53 -S58 0.351475157733125 P62 -I70 0.328802367377822 E52 -Q77 0.322800872467482 C61 -V133 0.30853969002733 G68 -I82 0.307926089521032 V51 -Y84 0.304660592469588 Q65 -P71 0.294155798626229 T63 -P83 0.29337502926893 R72 -Y84 0.292173032965318 Q47 -E52 0.281096202616602 V59 -R72 0.279301910634107 T60 -R72 0.270242851673691 P62 -G73 0.263893592928517 C61 -R69 0.261125910620747 C61 -N76 0.254788873447688 Y50 -D57 0.246883179977399 T54 -Q77 0.246357775696373 C64 -P83 0.236843187654897 T54 -V59 0.234965035806939 G73 -L81 0.234395474476386 S58 -N76 0.234232192214043 P71 -P83 0.232369470441711 I70 -A80 0.226792857408826 G55 -N76 0.225142628036049 S46 -S85 0.224943050392131 C61 -Q77 0.221538112528063 C61 -P71 0.219355806795409 Q47 -P83 0.216541439632349 Y50 -V79 0.211960282110747 R69 -I82 0.208098363946729 C64 -Y84 0.198990028537581 R72 -Q77 0.196640921340045 R56 -C61 0.191214439953853 F53 -Q74 0.190017294074995 I70 -P83 0.188602819896031 Y50 -R72 0.187396195218033 G66 -P83 0.185838867452013 Q47 -R72 0.184027772487323 E52 -A80 0.182825277422251 S46 -Y84 0.181876026605948 V51 -R56 0.178556783586788 G66 -L81 0.178212135219844 P49 -G73 0.176526563553468 Y50 -S85 0.168073147971853 E52 -Q74 0.167353027699738 E52 -Y84 0.160013708607404 P49 -R72 0.150262119848073 C64 -R72 0.148241839470865 T54 -G73 0.14699255206872 T54 -E75 0.145268301773045 E52 -E75 0.138025321227526 V45 -Y84 0.134037528126535 S58 -V79 0.131020434793382 E52 -N76 0.127159066971536 I70 -V79 0.126045053109498 Q65 -R72 0.122256375494995 V51 -S85 0.122035851820166 G66 -P71 0.119557914078621 F53 -Y84 0.118833744527519 L78 -I126 0.118806243801843 I126 -Y132 0.117052345012487 P49 -T54 0.115610908040585 V59 -A80 0.115064114276053 T60 -E75 0.112972940302627 F48 -V59 0.108771741138357 S58 -L78 0.10840976237665 D57 -R72 0.107209047004189 R56 -Q74 0.106679718956428 G66 -A80 0.106638983202166 Y50 -P62 0.106270192082691 T63 -R72 0.104962239437411 T67 -A80 0.0997028988498861 G66 -Y135 0.0988476372026845 S58 -A80 0.0971641444031284 Q77 -I126 0.0966660158638373 P49 -Q74 0.0949377624043874 Q47 -L81 0.0931669645423154 G55 -T60 0.0889155119188467 E52 -S85 0.0873137884903543 P49 -S85 0.086598935052038 T63 -Y135 0.0864149619150079 T60 -I70 0.0849533115421899 G66 -V137 0.0846388741187605 P49 -C61 0.082692335836394 T63 -S134 0.0826522310939629 G68 -V79 0.0825949460076993 E52 -G73 0.0823040357285043 C61 -S134 0.0822386390884656 Q65 -S134 0.081794117339836 Y50 -P83 0.0813984218743569 C64 -S134 0.0796017306261395 C64 -S85 0.0790749400042946 T67 -V79 0.0770992926361735 V59 -L81 0.0741587347856651 Q47 -V59 0.0739611939106263 T63 -I82 0.0720677313558289 Q47 -S58 0.0713399099039771 C64 -Y135 0.0698473151325736 T60 -V79 0.0683659762378636 F48 -T60 0.0682383878022768 P49 -A80 0.0668090505580965 T63 -Y84 0.0666153715601134 V45 -Y50 0.0653864852047139 F53 -I70 0.0634975400575317 C61 -G73 0.0634308332948668 T54 -R72 0.0599891560508242 T63 -I70 0.0597466453152276 P49 -R56 0.058256230832201 F53 -S85 0.058203396309648 P62 -Y84 0.0551797975704704 R72 -P83 0.0543352496709284 G68 -S85 0.0540277758293981 Q47 -T54 0.0519024006073492 T54 -N76 0.0494136939742376 P49 -P62 0.045463181986201 F48 -A80 0.0435363215032187 P62 -P83 0.0426548569627307 V59 -G73 0.0424167482779128 D57 -P62 0.0407707481144661 Q65 -V79 0.0406564343627789 P49 -I70 0.0369878197906255 P62 -I82 0.0365032753248813 C61 -Y132 0.0360505271431977 T63 -P71 0.0349453286717551 Y50 -T60 0.0299426031280059 Q47 -I70 0.0291796596020841 P49 -V79 0.0259514128575553 G55 -G73 0.0251991471370747 S46 -P83 0.0221697175205726 P62 -Q77 0.0197649168539789 T60 -A80 0.0188382089306629 C64 -V79 0.0173500044898649 T63 -Q74 0.0172903406399652 G66 -I82 0.0158778571747251 C61 -L81 0.014429313560563 F48 -S58 0.0143326200683544 V59 -N76 0.00975586342566181 T54 -V79 0.00850279036937529 F48 -P71 0.00805581806614875 R56 -G73 0.00773534290999833 T67 -I82 0.00666363782963897 V51 -V79 0.00648608760213376 C64 -G73 0.00581465911309448 V128 -V133 0.00578919287165292 D57 -Q77 0.00335243245544259 T63 -V133 0.00250619404533159 F48 -V79 0.00235852361677891 T60 -L81 0.00215074371385249 G55 -L78 0.000428998447270401 C64 -L78 -0.000312474428596055 Q47 -F53 -0.000508364915237536 F53 -P83 -0.00148498185318935 P49 -P71 -0.00161614927767989 G66 -D136 -0.00222573341230559 R69 -S85 -0.00241853466816 Q65 -D136 -0.00257064295634457 F53 -A80 -0.00302937395331604 V45 -P83 -0.003194004161168 R56 -L78 -0.0035958222629473 F48 -R72 -0.00842739109971063 E52 -I70 -0.0109089724202143 P49 -I82 -0.0110883258508968 Q47 -S85 -0.0122833799715309 P49 -G55 -0.0126426710967005 P71 -V79 -0.0134019676699642 D44 -P83 -0.0134905509032122 E52 -R72 -0.0135331973174761 G73 -V79 -0.0144844602247074 Q65 -P83 -0.0153235832257144 F48 -T63 -0.0162333152331575 P62 -G68 -0.0169609968763036 T54 -L78 -0.0188274267604767 T54 -Q74 -0.0210950837781078 G68 -Y84 -0.0214054161866617 R56 -Q77 -0.0223792690390323 T67 -Y84 -0.0226247538153642 F48 -I82 -0.0236973732464802 T54 -C61 -0.0238852737428749 Q74 -A80 -0.024058610099043 T60 -P71 -0.0254945812667469 P71 -A80 -0.026421935376284 D57 -P71 -0.0276634651327736 P62 -V79 -0.0295632146142761 V51 -Q74 -0.0302536584000865 G127 -V133 -0.0308836808238411 T54 -T60 -0.0310753027842633 T67 -R72 -0.0324158809161128 I126 -A131 -0.0326337059496549 T63 -R69 -0.0330836035419262 E75 -A80 -0.0330890269674563 Q47 -I82 -0.0339816607933248 G73 -L78 -0.0346788403883899 T63 -Q77 -0.0356189970158436 D57 -N76 -0.0370012435670413 V59 -L78 -0.0384722254368093 E52 -L78 -0.0393882787899287 P71 -N76 -0.0402318478957806 S46 -F53 -0.0409789092136366 T67 -S85 -0.0416758055363562 R56 -R72 -0.0417276111023536 N76 -I126 -0.0422445686629351 P71 -I82 -0.044952441264984 C61 -A80 -0.0461248834541185 Q65 -L78 -0.0473127527226813 Y50 -Y84 -0.0500842943451349 R72 -S85 -0.0516681055592541 F48 -G55 -0.0517390872982931 F48 -G73 -0.052544254282252 F53 -R72 -0.0526191646070194 G55 -Q77 -0.0530005248859808 F53 -C61 -0.0537320196463815 P49 -Y84 -0.054440756450282 P71 -Y84 -0.0571115576351415 P62 -V133 -0.0574585432390236 Q65 -V137 -0.0577912808942214 F53 -L78 -0.0584979784938815 T54 -P62 -0.0586302034593227 F48 -I70 -0.0597960848104145 F48 -Q74 -0.0600717704367497 I70 -Q77 -0.0603854213531383 Q74 -L81 -0.0615073878465658 D57 -A80 -0.0618155645392511 G73 -I82 -0.0629565918230073 F48 -D57 -0.0636831439607537 Y50 -S58 -0.064560456520554 F48 -S85 -0.0657754632739573 C61 -L78 -0.0658131388483394 G127 -Y132 -0.0683710210085172 P62 -R69 -0.0700380663396034 G66 -R72 -0.071546159487867 S58 -R72 -0.0722094747312636 R69 -Y84 -0.0736117946326873 R56 -E75 -0.0759624763572199 S58 -Q77 -0.0783303798078335 F53 -P62 -0.0830021858717043 V51 -V59 -0.0836292742705633 G55 -R72 -0.0838714925321336 Q65 -Y84 -0.0847330832657018 V59 -C64 -0.0861592312558148 V79 -Y84 -0.0863858252915479 S46 -V51 -0.0867716120048967 Y50 -L81 -0.0873432975047024 S58 -E75 -0.0881841729054011 E52 -L81 -0.0906750860826959 G73 -V133 -0.0908734586612292 R56 -V79 -0.091091926541111 G68 -A80 -0.0936686731852294 F53 -V79 -0.0960283180646879 Y50 -G73 -0.0962639123773341 G55 -Q74 -0.0977069231500889 Q47 -P62 -0.0986195916091406 E52 -I82 -0.0989726621586708 F48 -T54 -0.100214062281275 Q65 -G73 -0.100881523368383 R72 -I82 -0.101873346616417 V51 -L81 -0.104079987608245 I126 -V133 -0.106355514568048 G68 -P83 -0.108979847230787 G73 -A80 -0.111356517485104 P62 -N76 -0.121687653892426 P62 -A80 -0.122285793111104 P62 -T67 -0.125567163699768 P49 -P83 -0.125921485718855 F53 -G73 -0.12830819376257 C64 -A80 -0.128346827646372 T63 -L78 -0.128922504827546 P49 -S58 -0.129054863126156 P62 -Q74 -0.129159814261966 C61 -Q74 -0.14043904297281 Y50 -R56 -0.140820730871454 P49 -V59 -0.141889970896539 Y50 -G55 -0.143435590303264 F48 -R69 -0.144563019444733 E52 -S58 -0.144803987649186 F53 -N76 -0.145961463081911 D57 -L81 -0.146528352095524 P49 -L78 -0.146685159347167 C64 -L81 -0.148653616320872 T60 -Q77 -0.151377234176725 V51 -D57 -0.151953167172876 T63 -G68 -0.153108254911193 R69 -L78 -0.153209190431515 F48 -L81 -0.155467607554478 F53 -L81 -0.156002763692973 F53 -P71 -0.158694009404028 G55 -E75 -0.161861746858899 R69 -V79 -0.163110348306678 C61 -V79 -0.165114599239611 F48 -P62 -0.167618070671847 D57 -G73 -0.169408304389289 S58 -P71 -0.171076519486565 I70 -S85 -0.17324696517161 T63 -A80 -0.17597368374997 T60 -Q74 -0.176988709079752 F48 -P83 -0.177022906087489 D57 -V79 -0.18037372557462 T60 -N76 -0.181834373325219 L78 -S85 -0.182902741023859 G68 -L81 -0.188616958309899 S58 -G73 -0.19078944471423 V59 -I70 -0.192003034797674 V59 -P71 -0.19241145921149 I70 -Y84 -0.192862996253411 P49 -T60 -0.198607762200593 P49 -L81 -0.208350358388724 T67 -P83 -0.211033489662937 P62 -L81 -0.21333774862237 E52 -T60 -0.213347756740282 T63 -L81 -0.220474441617349 Q47 -Y84 -0.223591695495585 Q65 -A80 -0.225080613457035 T67 -L81 -0.234547464980211 R69 -A80 -0.236114865812426 F53 -Q77 -0.236417942386065 F48 -C61 -0.243276511536964 Q65 -I82 -0.246391791947693 C64 -I82 -0.247722832522713 D57 -L78 -0.253148959161483 T63 -V79 -0.256686359605723 E52 -P62 -0.27452400818222 C61 -I70 -0.278456607033564 T60 -L78 -0.28192535339281 F53 -T60 -0.283434722633641 P49 -D57 -0.283826874573688 R72 -L78 -0.283849230234486 R56 -N76 -0.286417479094651 V51 -S58 -0.288419409010402 V51 -R72 -0.288441496975649 R69 -L81 -0.292261935396573 V79 -S85 -0.307806614715173 T60 -G73 -0.30883035661574 S58 -Q74 -0.315302576378684 R72 -A80 -0.317560685121288 Q65 -L81 -0.332164947636981 E52 -V79 -0.33934422240484 E52 -V59 -0.342091968923855 V59 -V79 -0.343812596243749 T63 -G73 -0.361269743931448 E52 -P71 -0.3753306564323 E52 -P83 -0.38137307896486 Y50 -V59 -0.383383193098224 I70 -L78 -0.397900307640529 C61 -E75 -0.41091315687757 F53 -E75 -0.423918407355214 F48 -F53 -0.426487390948459 V59 -Q77 -0.465260559429794 P62 -L78 -0.49487245324005 P71 -Q77 -0.515488994769299 A80 -S85 -0.526741248365509