[Fri Aug 26 16:45:32 2016] >Input file: TMA0A026W8S8M1D.pdb >TM segments: 40-54_ 80-86_ 137-147_ 160-194 MAIDEN score = 8.8430 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- K181 -I188 7.24618475217108 R141 -V168 0.965893066961153 F140 -S167 0.962936921598489 V178 -R185 0.91776186786188 V142 -V168 0.801922509236833 F140 -L165 0.797537648763905 F140 -V168 0.792583657787937 N147 -V168 0.711726824324236 E183 -I188 0.662677320475328 F146 -V160 0.642171241887742 G179 -I188 0.583549137996899 V142 -L169 0.576960803151187 D171 -T177 0.565307898573694 D171 -V178 0.560985739862463 S180 -R185 0.560964309132544 F140 -L162 0.506343562807641 V176 -E183 0.460194711055287 S143 -V168 0.431479004452467 R172 -V178 0.429401304121798 S180 -G187 0.422360585531023 D45 -A50 0.420643028483816 V176 -R185 0.41497766961893 S143 -S170 0.407622354601203 T177 -Q182 0.400625021846552 H173 -S180 0.396918702164499 V142 -R172 0.39071136269742 T177 -E189 0.382588201576059 F140 -S166 0.377999418078464 K181 -G187 0.345380752343114 S139 -V168 0.337608318620274 H173 -K181 0.324418880864357 N147 -L169 0.320008407947682 S180 -I188 0.312535225518193 F146 -R172 0.303195377408652 H173 -E189 0.2998604292053 R141 -D171 0.284460594653074 E138 -T161 0.283309588076746 D171 -V176 0.283173378514495 I188 -V193 0.280107805654554 N145 -H173 0.278484960807296 V178 -E183 0.277170545804922 D171 -G179 0.269508169436132 G179 -N191 0.267508671121159 E138 -L165 0.26646308424789 D42 -V86 0.259973439551691 G179 -R184 0.259756351527683 V142 -V160 0.259729685242407 Y175 -K181 0.252770464580396 V176 -E189 0.247802010130509 Y175 -R185 0.240917968924884 S51 -H81 0.232988941472254 S139 -S170 0.227846165912774 V178 -R184 0.227175747109332 S144 -S166 0.226127707102756 K181 -N191 0.225424603276533 D45 -V84 0.223279417079991 G46 -V84 0.218129193079345 Q182 -I188 0.210655538419148 V178 -N186 0.207086732482433 R172 -N186 0.199998219396054 G46 -D52 0.193151476996163 T161 -S167 0.193084135598053 N145 -Y175 0.192368451578031 T47 -A54 0.189572083203253 S143 -S180 0.186264786770511 T44 -T83 0.182985362932336 T83 -F140 0.182408101110529 D171 -K181 0.178857887253698 Q80 -G163 0.177596069836787 D171 -R184 0.17507482787682 Y175 -V193 0.174715177430658 A50 -F82 0.17442945113126 H81 -V142 0.174143737498746 N147 -D171 0.172939318249224 T44 -D52 0.170461272664222 S144 -Y175 0.166353372689317 V142 -V178 0.164680503576552 V40 -V86 0.160545787223434 T83 -E138 0.159700214920452 G187 -V193 0.158423288460827 H81 -L162 0.156919529778476 N145 -L169 0.155365717542076 S170 -S180 0.154232899668104 N145 -T177 0.150433881028288 S143 -G179 0.150345031085623 R141 -S166 0.14921177005876 T47 -D52 0.146642914498025 T83 -G164 0.142967133063651 V40 -V84 0.142491209761347 S180 -V193 0.141953893365493 V84 -V142 0.140926928175467 T47 -S53 0.140796573363918 T47 -S85 0.138319111754026 S170 -T177 0.137409959799132 F82 -V160 0.133738052435573 D42 -A50 0.131512297441484 A50 -Q80 0.130211848327385 D42 -N49 0.128974547914589 S144 -H173 0.128754553012531 S144 -V168 0.12747160800507 R141 -G164 0.127363883989146 F146 -H173 0.126935346802654 Q182 -N191 0.126159493296551 S143 -T177 0.125408933800786 Y41 -N49 0.124621088936485 S143 -T161 0.124287087660259 R43 -D52 0.124025382389741 V160 -H173 0.122913857294529 S180 -E189 0.122095033605919 T177 -G190 0.121249834189921 V142 -G163 0.114195304933944 N186 -N191 0.114185654740701 R185 -N191 0.113829667380938 V168 -H173 0.110165573534701 R172 -R185 0.109930673472207 F140 -F146 0.109589345332081 V40 -A50 0.109033254515293 E183 -V193 0.10800015388779 R172 -G179 0.106623579039157 Y175 -R184 0.106299789887552 R141 -G163 0.103296431536577 F82 -G164 0.102863570486622 N147 -H173 0.102857953677375 T44 -V86 0.100736600525814 T44 -S51 0.100340635226699 A48 -S85 0.0997900432566903 F140 -G164 0.0997082238416329 E138 -V168 0.0996205786307387 V84 -T161 0.0986364363607719 S139 -L165 0.0985207764459783 R172 -E183 0.0979185199355697 S180 -N191 0.0977682394069217 R141 -L165 0.0974965016492995 Y41 -A50 0.0940265210520219 E138 -L162 0.0930573808333047 S143 -Y175 0.0917909871931699 A48 -H81 0.0900249560683752 T177 -R185 0.0863962359493744 S144 -T177 0.0860957537860836 T83 -S139 0.0857693601192736 G46 -V86 0.0851386693313857 T177 -E183 0.0849129223430558 S139 -S144 0.0849055928641596 V160 -L165 0.0842995677166472 L169 -R185 0.0830016643002293 S143 -Q182 0.0812683225067703 S85 -E138 0.0812361452056214 N147 -L165 0.0804995205637278 N145 -V168 0.0790351392879989 S144 -T161 0.0782198430247103 A50 -H81 0.0781168211199175 V142 -S167 0.0780306477208139 F82 -L165 0.0767981185606526 F146 -L169 0.076029986099325 T47 -H81 0.0758064406588383 S170 -R185 0.074843134134002 V178 -G187 0.0747337307369236 V142 -T177 0.0746460416809107 S139 -V160 0.0732055245162666 R172 -T177 0.0707327314976692 S51 -V84 0.0696788100851253 A50 -T83 0.06937734396198 S144 -S174 0.0690279864346485 V178 -I188 0.0686997526643722 S143 -S167 0.0671911718531559 S85 -S139 0.0670160404565783 Y41 -G46 0.0665864107189336 E138 -G164 0.0644536179632389 D52 -Q80 0.063350885323716 D45 -S53 0.0603398819909597 D171 -Q182 0.0598255962020507 T83 -R141 0.0596995036525303 E183 -G190 0.0570342338156387 N145 -V176 0.0564457147917805 D42 -V84 0.0564014830521069 V142 -S174 0.0557172773439398 N186 -V193 0.0557161799216574 L162 -L169 0.055169459145878 G46 -S85 0.0550712037743916 F146 -T177 0.0549427607033817 N147 -V160 0.0529865149594833 V142 -N147 0.0515234259140806 D171 -E183 0.0514443218849889 R172 -R184 0.0498482605240402 H173 -E183 0.0485790842070708 N145 -G179 0.048170170666356 S174 -K181 0.047282362659014 D52 -F82 0.0459251819817355 S174 -S180 0.045237138980172 H81 -G164 0.0451523519477295 T83 -G163 0.0451155329179 H173 -V178 0.045098821729376 D171 -S180 0.044449574772268 S139 -N147 0.04433103011604 S53 -Q80 0.0435679047581643 S170 -G179 0.0422846119743741 V40 -A48 0.0415455433224006 S174 -R185 0.0409772329569087 H173 -I188 0.0409476584896519 G179 -S192 0.0406276013801901 D45 -S85 0.0396425673446974 G187 -S192 0.0394387204792225 V160 -R172 0.0394060049223202 D42 -S85 0.0384902625174416 R184 -N191 0.038297495484354 V176 -V193 0.0374083464758774 E137 -G163 0.0363570780509117 N145 -S167 0.0352920210348919 S174 -G190 0.0336449395935332 Q182 -E189 0.0333828930618285 L169 -T177 0.0333702331098089 V160 -S167 0.0333544817378906 G46 -S53 0.0327824487756344 F140 -D171 0.0308457064027339 F140 -S170 0.0296232957628262 T83 -L165 0.0275258763857593 D171 -N186 0.0270299057667061 R43 -T83 0.0269394241844729 H81 -F140 0.0249362521814498 H81 -R141 0.0246033679797334 H173 -G190 0.0223577392799187 H173 -G187 0.022011143360245 N147 -G163 0.0207213183429484 G46 -A54 0.0201155171114452 S139 -G163 0.018659135013479 T83 -V142 0.0185251788441696 S174 -N186 0.0183992644778079 E137 -V168 0.0180096100289822 N147 -S166 0.0155345459888932 V84 -F140 0.0153122910398658 T44 -F82 0.0149755059851246 T83 -V160 0.0145937625843269 S174 -G187 0.0145414459179394 D42 -S51 0.0139454147280251 V142 -L165 0.0137044216516449 F146 -L165 0.0133031085650845 V40 -N49 0.0126855244833033 A48 -T83 0.0122799260663198 K181 -D194 0.0107468561911452 T47 -V84 0.00930892036518571 Y175 -N191 0.00729458700850688 V142 -S170 0.00704488259292368 F146 -S166 0.00608735397570381 R43 -S85 0.00585631763732186 S143 -S166 0.00536304925781272 S139 -T161 0.00532817973457611 R141 -R172 0.00467336374770078 F146 -G163 0.00400028775829986 S143 -V176 0.00314683357590129 S85 -F140 0.000143618141804858 F82 -V142 -0.000162314878367376 Q182 -D194 -0.000973200159438692 S144 -G179 -0.00190281690267957 I188 -D194 -0.00313998169240515 N145 -V178 -0.00417004262220688 A50 -V84 -0.00571327918857478 H81 -S143 -0.00686355141480943 R43 -S51 -0.00730093809927901 H81 -V160 -0.00738076247863018 S51 -T83 -0.00814505959100176 Y175 -S180 -0.00874527892838145 A50 -S85 -0.00876105445256492 F140 -N147 -0.00919197472391531 D42 -A48 -0.00982298245650526 A48 -F82 -0.0100616652564605 S174 -E183 -0.0112406054293855 E137 -S167 -0.0115996838633761 Y175 -G190 -0.0142110298891769 S170 -N186 -0.0143954448483066 R185 -G190 -0.0158708931330833 V142 -H173 -0.0163406274174854 S139 -F146 -0.0186457902939745 V160 -S170 -0.0194326852340162 S85 -E137 -0.0203484596387269 A48 -V84 -0.0205353490324773 S170 -V176 -0.0206078706955899 V176 -Q182 -0.020831005151916 N186 -S192 -0.0215429625697581 G179 -G190 -0.0220665909443873 V40 -S85 -0.0227500083930683 T161 -S166 -0.0255108806775679 S180 -D194 -0.0267504611527523 S143 -L165 -0.02763032258592 D45 -S51 -0.0282710970772284 F82 -E138 -0.0283446791357633 Q182 -V193 -0.0294515040843506 R43 -A48 -0.0300894096123691 S143 -L162 -0.0303918990121783 N147 -L162 -0.0316637810578613 T44 -S85 -0.0319632899661132 N147 -S174 -0.0343798891028746 V142 -Y175 -0.0345088754948346 V178 -V193 -0.035632064246937 T47 -Q80 -0.0360397666310133 L169 -G179 -0.0361116671513937 T44 -S53 -0.0364358575206176 Y175 -E189 -0.0387767308865001 G179 -E189 -0.0390541872841648 R184 -E189 -0.0390807066550432 K181 -G190 -0.0400136134034175 Y175 -S192 -0.0434576337446924 R172 -G187 -0.0446280733456978 T44 -V84 -0.045160118398476 H81 -G163 -0.0470498103284145 E137 -G164 -0.0471597976472307 E183 -S192 -0.0479237424571374 G46 -T83 -0.0495540711586452 V178 -N191 -0.0500398600512479 S144 -R185 -0.0512829883812205 N145 -D171 -0.0531257820802711 H81 -T161 -0.0553930580700147 S143 -L169 -0.0554270558720997 V40 -G46 -0.0563152518491501 R184 -G190 -0.056787494622446 N147 -T161 -0.0589179906593258 V142 -G164 -0.0591379052689609 K181 -V193 -0.0604876920758786 F82 -F146 -0.0619077215584554 S167 -R172 -0.062021802245154 S170 -Y175 -0.0624122726495592 E137 -L162 -0.0639501601635963 F140 -L169 -0.0649882295882236 T177 -G187 -0.0658416883967923 R141 -T161 -0.0664228634794957 T161 -L169 -0.0673527474857782 Y41 -A48 -0.0690935964643067 N49 -V84 -0.0692588496207889 N145 -V160 -0.0698014687510935 S170 -R184 -0.0704840103510194 V86 -E138 -0.0723590585227738 A48 -Q80 -0.0728570989882646 R172 -Q182 -0.0728758328405042 R43 -F82 -0.0732716270663287 S51 -Q80 -0.0740305561865051 Y41 -T47 -0.0747230442523181 D171 -R185 -0.0754305118028602 G179 -D194 -0.0754646787939781 E138 -V160 -0.0758638673876164 T44 -N49 -0.077351964935825 S180 -S192 -0.0785394400241677 S51 -F82 -0.079891966538111 D45 -A54 -0.0803067391543131 S174 -R184 -0.0804693089181768 T47 -V86 -0.0806160763416661 F82 -R141 -0.0808149076947924 V176 -N191 -0.0808340572674385 S143 -R185 -0.0810306341889832 S144 -L169 -0.0823385611961047 R172 -S180 -0.0833352478221318 H173 -Q182 -0.0842020438808673 S144 -V176 -0.0845777181868375 V160 -S166 -0.0849294015447875 T177 -N186 -0.0856067220977506 V84 -G163 -0.0876231410582666 V142 -G179 -0.0894543122999596 F146 -S167 -0.0907780715256594 H173 -N186 -0.0910201958857186 E189 -D194 -0.0925687793930354 Q80 -L162 -0.0937663176498296 T83 -L162 -0.0950985426132434 E137 -S166 -0.0956878341568284 G187 -D194 -0.0963088136819006 S174 -I188 -0.0980706086847309 N145 -T161 -0.0981328853093268 G163 -V168 -0.0999301208956944 L169 -S174 -0.101242815186378 R141 -S170 -0.103237307620575 S144 -R184 -0.104597473610774 S174 -E189 -0.104782426362292 T47 -T83 -0.105109908081459 S143 -V160 -0.105388611097842 N49 -A54 -0.106926278489764 F146 -L162 -0.106959536651648 S143 -R184 -0.110731620244025 T47 -F82 -0.110883645586684 S174 -G179 -0.114306237408634 N145 -S174 -0.114395570255252 G46 -F82 -0.114741518804558 S174 -Q182 -0.116865803060914 V142 -D171 -0.117611808934031 F146 -V178 -0.118952349390436 Y175 -Q182 -0.1193072950523 Q182 -G190 -0.120279956895708 D171 -G187 -0.120932879488234 N186 -D194 -0.121346962990681 E138 -S167 -0.121350348135454 N147 -S167 -0.12247208174511 F140 -H173 -0.122773101870967 F140 -N145 -0.123295460614699 E138 -G163 -0.123422029339197 E137 -L165 -0.125042385783297 H81 -F146 -0.126844595052945 G179 -V193 -0.127048459083898 D42 -T47 -0.128492023083876 Y175 -E183 -0.131866886441779 F140 -R172 -0.135533705406785 Q182 -S192 -0.136115841872709 R141 -F146 -0.136415303998775 F146 -T161 -0.137284859561428 V86 -F140 -0.137325084097398 V84 -L162 -0.139080496944118 L162 -S167 -0.140201182153612 F146 -S170 -0.142230336055571 Q80 -F146 -0.145375159305515 V40 -D45 -0.146955261403034 V178 -G190 -0.147072631530945 S144 -S167 -0.148913165285424 R43 -V84 -0.151796463260458 F82 -F140 -0.157280228221125 R141 -V160 -0.157436569322458 Y175 -G187 -0.157453961051127 H81 -N147 -0.158594393926233 S139 -G164 -0.158904518483499 F82 -G163 -0.162061677629857 K181 -N186 -0.163265022982256 F146 -Y175 -0.163363379706944 H173 -R184 -0.163532158159942 R43 -V86 -0.16360492115006 E138 -L169 -0.165430619890641 E137 -V142 -0.167543472129635 Y175 -I188 -0.17030076879887 V84 -E138 -0.170991651162431 K181 -S192 -0.171433608405566 R141 -H173 -0.171825897216764 S85 -L162 -0.172824951807443 V176 -K181 -0.17314186446068 T44 -A50 -0.174473166042268 R43 -N49 -0.175720944870146 R172 -K181 -0.176419564038398 V176 -G187 -0.180078031697544 F140 -G163 -0.180304852216954 F82 -T161 -0.182298274282435 N49 -F82 -0.18234478846219 G179 -R185 -0.184075213426489 V176 -N186 -0.18675245332599 T83 -T161 -0.18723719096521 T177 -I188 -0.188032565756046 D52 -H81 -0.18864582075168 S144 -V178 -0.192016829874644 D45 -D52 -0.192320580097772 S139 -L169 -0.195097746162375 Q80 -T161 -0.195723998002486 S143 -D171 -0.199947426255042 E183 -D194 -0.206006361438027 F146 -S174 -0.206132718040638 H173 -G179 -0.20625595256748 V176 -G190 -0.209815939966563 E183 -N191 -0.210739238840941 F146 -D171 -0.214208713218312 L169 -V178 -0.215466259099435 N145 -R172 -0.216514085184146 A48 -A54 -0.219403511869553 G46 -S51 -0.221300547371984 L162 -V168 -0.224947676400283 V142 -T161 -0.2274699761192 V160 -L169 -0.228140422802926 Q80 -V160 -0.228636574056555 Q182 -G187 -0.228770240442089 R141 -L162 -0.229931456775973 R43 -A50 -0.233461813147561 R184 -V193 -0.234456470836847 E138 -S166 -0.23927395179612 V40 -T47 -0.244067708544457 G179 -G187 -0.245369174492822 D45 -V86 -0.249843117672157 V84 -R141 -0.250253821156035 V160 -D171 -0.250390697184376 R185 -V193 -0.251546065605016 H81 -L165 -0.255894437843629 H173 -R185 -0.258242820167084 S180 -G190 -0.261908702118062 T161 -V168 -0.264323675213507 F140 -T161 -0.265323695011097 V160 -V168 -0.2662205468774 R141 -V178 -0.274957252341665 S144 -V160 -0.276520118631166 S170 -V178 -0.280089925012193 T177 -R184 -0.301005259474604 A48 -S53 -0.30130159778235 N147 -R172 -0.311052922612326 S144 -D171 -0.311735057998518 N147 -S170 -0.315334086824527 S139 -L162 -0.321962422117709 S143 -S174 -0.323281395130651 N145 -S170 -0.324110714672452 V178 -E189 -0.337520014038075 E183 -E189 -0.345933349059961 R141 -N147 -0.34771137583411 S144 -S170 -0.358642506849568 S139 -S166 -0.359454642485392 S143 -V178 -0.360866146493166 V176 -R184 -0.365166466481629 V142 -S166 -0.365337980412305 F146 -V168 -0.366676432166793 F140 -V160 -0.37154890423664 F82 -L162 -0.372464097008075 V176 -I188 -0.384541829823741 V142 -L162 -0.399351662421118 S180 -N186 -0.414892440143541 Y175 -N186 -0.426334952150679 S143 -R172 -0.479409200472307 R141 -L169 -0.493049094532378 S144 -R172 -0.501963956164402 S139 -S167 -0.527475043879341 S143 -H173 -0.592682692654185 G179 -N186 -0.595242640530537 R141 -S167 -0.595900285008852 K181 -E189 -0.632031538674161