[Fri Aug 26 18:27:57 2016] >Input file: TMA0A0H3M7X0M1D.pdb >TM segments: 31-62_ 64-84 MAIDEN score = -6.1610 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- A61 -I67 1.80804242082997 R42 -L48 1.80602262125229 A39 -Q44 0.864677385777255 A61 -F70 0.537904948538282 R42 -G52 0.522104685593249 R42 -A47 0.514948279400249 V57 -I72 0.504555596256308 V57 -S74 0.466676112145061 F62 -I67 0.445349354159284 T38 -L43 0.428076694464126 L53 -V75 0.41681836239656 V60 -P71 0.400174354015482 L43 -F49 0.395151533231808 T38 -G45 0.394450799983319 I67 -I72 0.387913737020271 V57 -V75 0.382952218067402 E64 -F70 0.357671630867486 V60 -F70 0.343140029655427 A61 -S69 0.317838521511959 V60 -S74 0.309238756745614 V60 -I67 0.291632710829004 L43 -L48 0.27288257118306 G59 -S74 0.27015206046348 R40 -L48 0.26800986038661 L56 -V75 0.263386511639329 P37 -Q44 0.26145283890262 Q44 -G84 0.251351389359213 F49 -G84 0.241555045013701 G59 -F70 0.239861399537454 I67 -V75 0.228369115541616 A61 -I72 0.226487422346395 R42 -F49 0.223843867907485 V57 -G77 0.221119399094546 G59 -I72 0.217623599008202 R42 -M55 0.208391245667383 L53 -V80 0.200594701016395 G52 -V75 0.199535616547049 T65 -L73 0.199335009727272 F49 -V79 0.198451625978094 G52 -V80 0.196965668018922 V60 -T65 0.194198518683822 M66 -P71 0.186675098817274 A61 -G68 0.185410967473358 G54 -I72 0.183879512942511 S74 -M81 0.182547147126633 A36 -R42 0.182115584351715 L53 -P71 0.181115759014396 G31 -A39 0.17894575697747 M55 -G68 0.176919906311611 Q44 -G52 0.174381881619388 V75 -V80 0.172890180374702 G68 -L73 0.172165011005736 T65 -F70 0.14447264911776 L53 -I67 0.136850890609078 V57 -P71 0.134103670819064 A61 -M66 0.1291286405683 G45 -G54 0.12780216591192 L43 -M81 0.127004223719109 V57 -V80 0.126446115644411 T38 -G52 0.12566814226743 R42 -G84 0.124840804683503 G45 -G52 0.124600246143854 A46 -V80 0.123996474693911 G52 -F78 0.122856167199498 F34 -Q44 0.122729286834891 T65 -S74 0.119854487993429 G54 -F78 0.119259542398087 S58 -F76 0.118236110606457 I50 -G84 0.117711990670347 P37 -L48 0.117016983733693 F78 -G84 0.113969032669334 F76 -F82 0.110718784735694 F70 -G77 0.110453004346591 R42 -I50 0.108147018594541 R42 -I51 0.107034644072233 V60 -V79 0.104892083525852 P37 -A47 0.104748892274677 F76 -G83 0.103358807176213 F49 -G83 0.10205258624455 G54 -G68 0.101264966598385 A36 -L48 0.095465475148249 P37 -A46 0.0953225598822698 L53 -L73 0.0949006659048199 A61 -G77 0.0941463073702922 A46 -G54 0.0921231568156133 E64 -S69 0.0918026768012705 A47 -M55 0.0911836005190034 G68 -G77 0.0876155451317313 S58 -I67 0.0874078048206699 L53 -F82 0.0859159477829829 L43 -G83 0.0856223153809754 Q44 -I51 0.0839251333583304 S74 -V80 0.0816068067421263 G54 -P71 0.0815685130430621 A36 -A47 0.081028126049222 G59 -V75 0.0797880945034617 L56 -V80 0.0787135479617094 I67 -S74 0.0782439733302529 G77 -G83 0.0775699791795441 R41 -L53 0.0775283725185072 G52 -S74 0.0764288469535659 I51 -A61 0.0761253069559564 R42 -G54 0.0759678652332241 L48 -V80 0.075825604208057 A36 -A46 0.0738026038434878 R42 -V80 0.073550095844761 G54 -G77 0.0730947806024421 G33 -G45 0.0717522152497284 S58 -L73 0.0710686072229132 G45 -G84 0.0708674731745527 G54 -F62 0.0706890411698922 S69 -G77 0.0694951739173493 V57 -T65 0.0687805669179938 G77 -G84 0.0665885873317105 P37 -F49 0.0648878081314098 S74 -V79 0.062477205219702 F70 -F78 0.0619992179659796 I67 -F76 0.0604137481736498 I51 -V75 0.0599606990835149 F70 -F76 0.0594570642416459 L56 -G68 0.0583612672879895 L48 -M81 0.0581019146188322 R35 -Q44 0.0578117067634962 L53 -G77 0.057688777220215 S58 -F78 0.0558057553056219 A36 -L43 0.0554603419929105 G59 -S69 0.0543996666069077 S69 -S74 0.0530274095791774 G54 -M66 0.0523156498037887 R35 -R40 0.0519122540075967 G54 -S74 0.0517317481968127 G54 -V80 0.0514964810488356 G54 -M81 0.0512466009337125 G68 -V79 0.0507646829830178 A47 -V80 0.0491587962065232 G45 -L53 0.0452616598067408 M55 -V80 0.0425375875664269 A61 -F76 0.0417775669066409 I51 -M81 0.0410948492608263 S58 -S69 0.0402613382172556 F62 -V75 0.0398790815855649 G54 -I67 0.038875145504206 G33 -Q44 0.0377319275893866 V60 -G77 0.0372084745022008 F34 -L43 0.0350713058787155 L48 -L53 0.0350598694683955 Q44 -I50 0.0346656388726586 I50 -F76 0.0334633193226903 L53 -S74 0.0333488564905711 V57 -F62 0.0328684580784824 F34 -R42 0.0319157105507335 G54 -L73 0.0311846420777337 L48 -V57 0.0306424468364943 P71 -V79 0.0305964582876974 G31 -R40 0.030254467773509 M55 -F78 0.0300335848607398 G59 -E64 0.0295143433986103 R40 -A47 0.0283761159691771 V75 -F82 0.0274973146905884 G59 -G68 0.02649369285262 L56 -G77 0.0256793492274312 I50 -V79 0.0252485956056283 A36 -R41 0.0251527337796777 L48 -G84 0.0248932789962535 A47 -L56 0.0248227933564475 G54 -F76 0.0236177434713873 I50 -M81 0.0227066726996199 L48 -V79 0.0221830893004729 A46 -G84 0.0211625075722264 F62 -S74 0.0190283611376667 F49 -F76 0.017712552677946 E64 -V75 0.0174884652976856 I51 -V80 0.0160740069047861 R41 -L48 0.0152657256970112 R35 -R41 0.0145136541381061 L43 -V79 0.0139810607255986 F49 -V75 0.0130799669357735 V57 -I67 0.0114096354952373 G54 -F70 0.00999908764674196 P71 -G77 0.00928769499340909 G33 -R41 0.00921749603368577 R40 -I50 0.00901347079313197 M55 -P71 0.00677451494863823 G31 -Q44 0.00640254064916945 R40 -G52 0.00533910176174657 T65 -V75 0.00502981720967177 L48 -L56 0.00310875995719329 L53 -G68 0.00125501868308753 E64 -S74 0.00104278792783385 M55 -F76 -0.0001384691307178 R42 -L56 -0.000436761316744416 F49 -V57 -0.00511385009460641 F49 -M81 -0.00574127998512786 T38 -F49 -0.00577501333620578 A46 -M81 -0.00602464821036675 I51 -G59 -0.00741008006639343 G68 -V75 -0.00776517103082952 R41 -I50 -0.00950257249752218 S58 -P71 -0.00952435739274105 F49 -V80 -0.00990249117628217 L53 -G84 -0.0105901327896474 Q44 -V80 -0.0111187327890621 F34 -G45 -0.0124615498177105 R40 -A46 -0.0134710067980448 G59 -I67 -0.0135495486129891 V57 -V79 -0.0138002457476709 A39 -I50 -0.0144365356363507 I51 -V79 -0.018169021557112 A39 -I51 -0.01922016872222 G45 -I50 -0.0204346992696696 L48 -G54 -0.0235185002435632 R41 -I51 -0.0239445119744286 R41 -A46 -0.0242196541968229 G32 -R40 -0.0245283455126652 E64 -F76 -0.0251369980846547 A46 -L53 -0.0256809436841756 L56 -F70 -0.0256913980318316 G32 -Q44 -0.0270655548009925 T38 -Q44 -0.0272758983875838 F62 -I72 -0.0274853900661496 L53 -G83 -0.0278480107422006 R35 -L43 -0.028704176619323 S69 -F76 -0.0296035327798418 F62 -P71 -0.0302665237929611 R40 -I51 -0.0306058226974497 E64 -P71 -0.0312240186415234 M55 -I72 -0.0314852850458767 G59 -T65 -0.0336774819484993 G54 -S69 -0.0346028830113001 V75 -M81 -0.0351478839839323 G59 -L73 -0.0360263604906066 L56 -E64 -0.0380949769624124 G32 -P37 -0.0382715196350432 G52 -P71 -0.0389603886404282 A46 -M55 -0.039165525385497 G54 -E64 -0.0400617305044624 G52 -G59 -0.040172202351064 G54 -V75 -0.0412940373869031 G32 -A39 -0.0414796843679941 G59 -F76 -0.0439938846993604 I50 -G83 -0.0460874307777528 M55 -I67 -0.0461705703966202 P71 -F78 -0.0474544992866393 L53 -F78 -0.0474551882031351 L56 -M66 -0.04817754247739 S58 -V79 -0.050328053091401 V60 -F76 -0.0503855971781846 L56 -I67 -0.0506614900151705 T65 -P71 -0.0512972252492956 I51 -L56 -0.0522622617822428 A46 -V79 -0.0526831051892822 L48 -S58 -0.0526853495948965 F76 -G84 -0.0537036882101654 R40 -L53 -0.0549101830007044 I50 -V75 -0.055065126089108 G59 -P71 -0.0551133928882179 S58 -E64 -0.0555115785225557 I72 -G77 -0.0556356662576523 L53 -I72 -0.0557396185348802 A39 -G52 -0.0574554536284051 G32 -R41 -0.058298942652665 I50 -S58 -0.0591829900529497 R35 -G45 -0.0597469490938964 G52 -A61 -0.0607083725253385 G52 -I72 -0.0619069265976329 M55 -V79 -0.0625146845678133 I72 -V79 -0.0635166717990945 I50 -F78 -0.0664218028927701 A39 -A46 -0.066750623355011 A36 -Q44 -0.0667975492816144 F34 -R40 -0.0681028317102377 F49 -F78 -0.0685409865159246 F62 -L73 -0.0693909618025756 T38 -A46 -0.0696940837491979 L56 -L73 -0.0707972463545943 L56 -V79 -0.0714228126913694 I72 -V80 -0.0724299987506001 F49 -S58 -0.075366025935985 V57 -G68 -0.0764008768799274 R41 -F49 -0.0768588931518712 R42 -F78 -0.076948457747383 R35 -L48 -0.0773003124820948 G54 -V79 -0.077586695841438 L53 -V79 -0.0788922673508363 F62 -G68 -0.0791876746977866 Q44 -L53 -0.081291275324344 M66 -V75 -0.0814029834917873 L43 -V80 -0.0822382140447395 I51 -F78 -0.0829049534601047 R35 -R42 -0.0854245722382382 S58 -S74 -0.0863031588168002 A47 -G54 -0.088341743544941 L53 -M81 -0.0883555369614351 V79 -G84 -0.0903617512759372 L43 -L53 -0.0915411984159515 F62 -S69 -0.092712883281074 L43 -I51 -0.0928918744881622 G54 -A61 -0.0947826753753311 T38 -A47 -0.0969256321226395 G33 -R40 -0.0987982443505828 G68 -F76 -0.103304423160635 A39 -F49 -0.103495698574111 E64 -L73 -0.103985187586888 V75 -G83 -0.104110520229061 V60 -F78 -0.104390680453949 L73 -V80 -0.104997101092872 M66 -L73 -0.105139857593207 L53 -A61 -0.106630909774253 L56 -T65 -0.107071424378545 G59 -F78 -0.107498354530452 G52 -S58 -0.109681368583426 I50 -G59 -0.110431551400292 G33 -T38 -0.111106694273844 T38 -L48 -0.111292119976401 F78 -G83 -0.111780205580599 V60 -V75 -0.111874576744068 S58 -T65 -0.112303448504965 L53 -F62 -0.124645571324604 G52 -V79 -0.125753901273214 I51 -V60 -0.126913411249318 A39 -L48 -0.127078794586573 G52 -F76 -0.129027413051972 G68 -S74 -0.129083665938206 G52 -V60 -0.130330796656827 G68 -F78 -0.130766385384908 V57 -M66 -0.132327322691837 A36 -G45 -0.134397047034551 S69 -V75 -0.135597437127494 A47 -G52 -0.139983053725105 L53 -G59 -0.140591081116073 F62 -F70 -0.14182414807687 G59 -M66 -0.142148172649287 R35 -A46 -0.142843661513871 R41 -A47 -0.143677408255521 M55 -S74 -0.143962915133303 I50 -V57 -0.14604438720883 F49 -F82 -0.146762340800157 P71 -F76 -0.147750218775779 L56 -S69 -0.148231872238231 L56 -I72 -0.149256292619576 V57 -E64 -0.150676154394186 I51 -S58 -0.150730558577645 F70 -V75 -0.152671332121585 L43 -G52 -0.15595422463839 I67 -L73 -0.15767892305559 L43 -I50 -0.159324588434451 L56 -F76 -0.159797728581988 G31 -R41 -0.16214127771196 P37 -G45 -0.162670735679303 G54 -V60 -0.16291961318042 G77 -F82 -0.163496350025415 S58 -I72 -0.166693538836205 L73 -V79 -0.167102525939513 F49 -L56 -0.167946703390286 A61 -F78 -0.169344211650301 R42 -G83 -0.170376436877116 L43 -G84 -0.173784565194423 I50 -V80 -0.174823766976845 M55 -E64 -0.175106881823722 R41 -G52 -0.175235261179067 A61 -S74 -0.175243954450763 M66 -S74 -0.176266412554762 M55 -V75 -0.17908813969987 L53 -F76 -0.179414476819529 R40 -F49 -0.182524394402974 L73 -F78 -0.18474923348516 F49 -M55 -0.185869773563892 L48 -M55 -0.186438922829609 F34 -A39 -0.187279590301706 G45 -I51 -0.188721295521442 A39 -A47 -0.191339924531836 S58 -M66 -0.192705582963596 M66 -I72 -0.193250604249947 S58 -F70 -0.193746168432793 G31 -T38 -0.196040249120897 E64 -I72 -0.196715577197913 F34 -R41 -0.196981945880751 G31 -P37 -0.202786999867774 R42 -M81 -0.205372274372144 G52 -M81 -0.222091398520125 G52 -V57 -0.22360943362546 G54 -G59 -0.2281303633396 S58 -G68 -0.22934709556429 V60 -G68 -0.230137555478463 I72 -F78 -0.238164168075689 G32 -T38 -0.243163189370753 L56 -F78 -0.248769972131386 A61 -L73 -0.255764731302374 F49 -G54 -0.256350512837446 V57 -S69 -0.258087122835439 L53 -V60 -0.264642075818887 G33 -A39 -0.26728849871021 R41 -M55 -0.270383105407581 A46 -G52 -0.270408448952875 M55 -F62 -0.271702835770477 R42 -V79 -0.272239559693952 L56 -F62 -0.278122893520653 L56 -S74 -0.280583951870542 R42 -L53 -0.281692741476881 L56 -A61 -0.282669269190762 A47 -L53 -0.286960332398901 M55 -M66 -0.291946467496502 V57 -F78 -0.292821628296275 V57 -L73 -0.294667900147756 V60 -I72 -0.313675919406691 F76 -M81 -0.318141786125271 A61 -V75 -0.32088422394981 R40 -G45 -0.32534191445905 A61 -P71 -0.329924924081721 A46 -I51 -0.337216594457869 V60 -L73 -0.343279564687351 L53 -S58 -0.344198767134806 V60 -S69 -0.346959798176769 L56 -P71 -0.349397779839344 M55 -V60 -0.354216255568196 S58 -V75 -0.361674972003651 V60 -M66 -0.361818712306824 V57 -F76 -0.362453780724016 V57 -F70 -0.372553731270741 A39 -G45 -0.377978017079534 Q44 -F49 -0.40079379278591 T65 -I72 -0.411278243626726 M55 -A61 -0.411834420581164 I50 -L56 -0.411861695551095 I50 -M55 -0.420274864502625 I51 -V57 -0.420420732057412 P37 -R42 -0.442085366208288 G31 -A36 -0.45006670870544 P37 -L43 -0.569403704701136