[Fri Aug 26 17:34:01 2016] >Input file: TMA0A0S4W627M1D.pdb >TM segments: 292-328_ 456-492 MAIDEN score = -13.8593 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- E319 -A324 0.866456855820338 A314 -E458 0.828955745496341 L296 -D475 0.769718033722504 V310 -E458 0.698563668156594 T299 -V471 0.672732474549182 T307 -I464 0.64483091132114 E459 -I464 0.605016774858047 E305 -V310 0.543914946947717 R318 -L323 0.505613449503553 L306 -I464 0.476263214591783 T309 -E458 0.445227641934253 T304 -E465 0.442533576326661 T307 -E458 0.433825423814768 A300 -V471 0.427182912118414 L306 -R311 0.422612560135605 L306 -R461 0.400402669275474 D315 -A320 0.366144179452911 A470 -D475 0.364895426484216 H466 -M474 0.340291875301858 R461 -H466 0.330139152152856 T307 -E459 0.326049154531721 T299 -T478 0.315233358850346 L296 -A301 0.31438107538054 A300 -A470 0.31270329508481 E305 -Q460 0.312490309945614 E297 -Q472 0.309233268916898 M303 -Q472 0.297788869911458 A320 -A328 0.290553447482946 E305 -R311 0.286060100092333 A314 -S321 0.281974765897733 S302 -G468 0.280405378721369 E305 -R312 0.276300699202374 E465 -Q473 0.27290721013866 A317 -A456 0.26966311851269 V310 -R461 0.265685300117642 L484 -A489 0.264391116124366 M303 -R311 0.248919486445588 T309 -A314 0.247468500952566 E308 -R461 0.244503263980051 T307 -R461 0.239413917994976 S295 -Q472 0.233726210900929 M303 -R461 0.230799345179423 Q460 -Q469 0.230455713427529 M303 -Q469 0.230108150246428 Q292 -T299 0.224621609012793 Q469 -Q479 0.22173708359598 Q479 -E486 0.219980032491974 E308 -Q460 0.219927254950887 Q292 -E476 0.218481373030587 V471 -E476 0.217899335563363 N481 -Q487 0.216319758044158 G468 -D475 0.215080991990254 Q480 -V485 0.212331961369544 D475 -A482 0.205263541143991 E305 -N463 0.205253212798284 S321 -S457 0.199753399358443 T307 -H466 0.196901748720287 N313 -R461 0.196736913049723 M303 -Q460 0.190870344408765 Q460 -H466 0.187997038641676 A300 -E308 0.184265006211742 Q292 -E298 0.182795514499331 M303 -G468 0.18185617613046 M303 -H466 0.174773000876437 A317 -T325 0.173206130013785 V310 -E459 0.168122709728421 T299 -Q473 0.167642935054178 A293 -E476 0.158103353094577 V310 -E465 0.157871674221667 E465 -A470 0.156074094108696 D475 -N481 0.153481887383467 E298 -Q472 0.153238843123457 Q460 -G468 0.152788732825446 Q469 -M474 0.152306790059429 E308 -E465 0.148946352796357 R318 -A456 0.148602881429535 E297 -E305 0.148031678548113 A300 -M474 0.146779957738838 N463 -Q469 0.146453631025234 A294 -Q479 0.145748065983413 E308 -E458 0.144179328796913 S302 -E465 0.142006789263972 R311 -A456 0.139887755696571 A301 -G468 0.136986721928116 T307 -S457 0.135230406397911 E458 -H466 0.135224510625616 A300 -E305 0.133211873559512 A294 -D475 0.131680497795906 A300 -E465 0.131319021587161 E308 -N463 0.129168723765784 S302 -V310 0.127732198462684 V310 -S457 0.126770875635774 S295 -V477 0.126762501257916 T304 -Q460 0.126301493931999 R461 -G468 0.125930858218633 S321 -A456 0.124891682016846 T309 -G468 0.123948121614384 S302 -V467 0.122440017404934 E308 -S462 0.11990407481187 A293 -A482 0.116885473305429 A293 -S302 0.116713143291698 S462 -V467 0.116445083448153 A482 -Q487 0.11558241674849 R318 -A326 0.115045991270113 R312 -A320 0.113394180317036 M303 -E465 0.112374532467525 A300 -Q473 0.112222086538858 R318 -T325 0.111530202874183 T304 -V467 0.110507870185838 R312 -R318 0.109931972713359 Q479 -L484 0.10919988591929 A301 -T309 0.108804629707818 E305 -E465 0.10783492055854 N316 -A324 0.107294286916737 R318 -S457 0.105580188616121 Q292 -V477 0.104965825678813 E297 -E476 0.10492799461902 L306 -A456 0.1039877606922 E297 -S302 0.103118483811084 L306 -S457 0.102216243958336 T304 -R311 0.102089978831101 S302 -M474 0.101442553149431 E297 -V471 0.100578979389135 T309 -N463 0.10052159069895 S462 -A470 0.0996823199597432 E297 -T307 0.0990246919387432 T304 -V471 0.0969071168923248 L306 -Q460 0.0964613304803343 S295 -N481 0.096169605132892 T304 -N463 0.0960461808663617 T304 -R461 0.09498655514765 A294 -S302 0.0947623812739753 N481 -A489 0.0946888394750167 E298 -G468 0.0936779502301053 A314 -S462 0.0929050723183802 N313 -Q460 0.0926588861286454 T309 -V467 0.0921506873354376 H466 -V471 0.086859453383056 E305 -G468 0.0848099418523667 Q469 -E476 0.0845362851196265 G468 -E476 0.083925014702019 M303 -M474 0.0836708841910458 T309 -S462 0.0834689766700676 A314 -T322 0.0810311413597757 L306 -Q469 0.0794049473764638 V310 -G468 0.0770633719450846 E465 -Q472 0.0770496606561428 V310 -V467 0.0748993047658741 A301 -Q472 0.074539359030795 E308 -E459 0.0741439941538276 A483 -A491 0.0722489997776368 A301 -V310 0.0715853537387687 T304 -R312 0.0715346385201338 R311 -R318 0.0708247286738495 E305 -R461 0.0707231372278034 Q292 -A483 0.0705346874412625 L306 -E465 0.0693315101760996 T299 -V477 0.0690934997579671 T478 -V485 0.0688328123820369 Q292 -M474 0.0680026477773588 S302 -Q469 0.0678665518289163 N463 -A470 0.0668811653264916 A293 -M474 0.0637767654531829 N313 -A456 0.0629680475856578 E486 -A491 0.0625384370634633 I464 -M474 0.0621915238101121 M303 -S462 0.0621725765723915 E319 -A327 0.0588524497599474 N316 -S457 0.0570298761167352 T304 -Q472 0.0554668327733978 M303 -A470 0.0551359771431716 L296 -L306 0.0542684313713453 A293 -E298 0.05422556599546 L296 -Q480 0.0526200928381311 E297 -M303 0.0517917855574268 T304 -N313 0.051039691422254 M474 -A482 0.0504027013961958 I464 -Q472 0.0477249802466591 S295 -Q473 0.0474811054728628 R311 -S462 0.0464037500806045 A314 -E319 0.0459985294221283 N316 -T325 0.0445256350766812 L296 -G468 0.0433254624985904 A470 -T478 0.0422117164641866 E308 -G468 0.0419053429880001 T299 -Q479 0.0416597924096463 L296 -T304 0.0413959589078345 A301 -M474 0.0410833901803946 S295 -T304 0.0403357817391194 L306 -S462 0.0398463937966504 A293 -A301 0.0391231327673753 E298 -D475 0.0389086948897734 V310 -R318 0.0383382932086469 T307 -Q472 0.0368850927768254 V467 -Q472 0.0359616398824123 S302 -Q460 0.0357907645734135 A301 -V471 0.0348883762438379 T309 -E459 0.0346959974926255 T309 -A456 0.032407477264099 N316 -Q460 0.0321039153557692 R311 -N463 0.0317451674485629 E458 -N463 0.0307016615486732 A300 -V467 0.0301958302568655 T307 -Q469 0.029246776304896 R311 -R461 0.0284089225307542 Q487 -A492 0.0274141459996784 E305 -N313 0.0264361523921708 S302 -D475 0.0258024718460887 T478 -Q487 0.0253388572084818 T307 -A456 0.0252592358760868 S302 -A470 0.0247542707324833 S302 -Q472 0.0245815860274157 E459 -V467 0.0239830073906678 S295 -Q480 0.0233310018582249 A294 -A482 0.0223148016585046 L306 -H466 0.0221114103404597 A482 -A490 0.0219170542626719 H466 -Q472 0.0216932826313787 L306 -V471 0.0206621699879044 V471 -Q479 0.0192374180678285 R318 -E458 0.0186833792588001 V310 -N463 0.0171839901303361 N313 -S321 0.0149053609022908 S302 -I464 0.014442033564805 V310 -A317 0.0141883381773331 H466 -D475 0.00975738078416999 A294 -Q472 0.00966790818812385 E305 -V467 0.00910579323585559 A470 -Q480 0.0088858380040972 A300 -Q479 0.00868344159259354 E297 -G468 0.00856242401311236 A301 -Q469 0.0080802785397881 R311 -E319 0.00760407167693877 T307 -E465 0.0074114511973602 A293 -Q473 0.00694856153573647 D315 -A324 0.00666662803013063 T307 -A314 0.00558752608659852 Q480 -A490 0.00467365955423205 Q292 -V471 0.00458931219078584 Q480 -A488 0.00387624459872749 A293 -V477 0.00352441475659759 Q473 -N481 0.00351761026009795 R312 -S457 0.00171445500325618 T307 -A470 0.00147874286303296 R311 -S457 0.00115902061883721 S295 -M303 0.000430815685443342 E459 -G468 -2.09549090073313e-05 S302 -T309 -3.01841631724642e-05 M303 -N463 -0.00029642189564516 A301 -D475 -0.00123585962973127 T299 -I464 -0.00130574221343416 A293 -N481 -0.00239716408581342 L306 -E459 -0.00288785999976282 N316 -A456 -0.00313712035655805 V485 -A492 -0.00350442002603568 L306 -E458 -0.00370727952400363 N481 -A490 -0.0042550056562691 Q480 -A489 -0.00454924972441817 A293 -V471 -0.00481498900578048 A294 -V471 -0.00611270078273374 Q292 -V485 -0.0064996992633608 T307 -V471 -0.00816053370700612 N313 -S457 -0.00927666479112332 Q292 -A301 -0.00964578859219101 E319 -S457 -0.0101479617956851 E305 -S457 -0.0103556608316084 T304 -S462 -0.0122398719961221 D315 -R461 -0.0128928550453642 N463 -V471 -0.0131965738288677 Q292 -E486 -0.0139647366636942 G468 -M474 -0.0173034599428452 D315 -L323 -0.0183258204382231 S302 -E308 -0.0187179053285249 R312 -E458 -0.0189417584429323 S462 -V471 -0.0190314273789306 Q469 -V477 -0.0193321187034536 A301 -I464 -0.0197193764885299 R311 -E459 -0.0199763869379455 R312 -E319 -0.0200999187968235 V310 -Q460 -0.020115071377014 E298 -L306 -0.0214318731693752 Q292 -T478 -0.0215508966913064 A300 -T478 -0.0244791161743798 T304 -Q469 -0.0245878901112107 M474 -A483 -0.024727410423095 R312 -A317 -0.0247690641895671 A317 -Q460 -0.0250808998173286 T309 -Q460 -0.0250898873864814 V477 -Q487 -0.0256357137958194 A301 -V467 -0.0263521648715761 A293 -A300 -0.0267294256492132 M474 -Q479 -0.0276086791971863 E459 -H466 -0.0276703755884413 T299 -Q469 -0.0282458808332251 D315 -S457 -0.0283461164053163 T299 -Q472 -0.0301869229136619 Q469 -T478 -0.031504075566273 E297 -Q479 -0.0319628037990268 A456 -E465 -0.0320174994700841 R311 -I464 -0.0325331826845366 Q472 -T478 -0.0342244084905188 E308 -A317 -0.0343608913239188 D475 -A483 -0.0350271526751786 Q472 -V477 -0.0369313151988344 L484 -A490 -0.0369803658685731 N316 -T322 -0.0412751474438848 E305 -A314 -0.0413088343470455 T304 -A470 -0.0414121689907907 A300 -E476 -0.0414841569769486 A317 -S457 -0.0417812681961358 V471 -Q480 -0.0418302274428743 S457 -H466 -0.0420209608707629 E308 -D315 -0.042601460561188 A300 -T309 -0.042692401301455 A300 -Q469 -0.043151798481988 E319 -A328 -0.0432699477328609 A294 -M474 -0.0440512667485051 A293 -Q472 -0.0442064090909264 S295 -G468 -0.0448894372623039 A314 -I464 -0.0476101435855316 A293 -A483 -0.0486194061757184 A293 -Q480 -0.0492588650319727 T309 -R318 -0.0496791542430912 E298 -M303 -0.0496845094236908 A293 -T299 -0.0497829785059825 A482 -A491 -0.050785420400945 R311 -E458 -0.0521356453327759 A300 -Q472 -0.0532999072217342 A483 -A492 -0.0539571177966574 R461 -Q469 -0.0553303581886879 Q292 -D475 -0.0554676294503818 A470 -Q479 -0.0560262455279277 E308 -S457 -0.0572041277648241 R318 -A327 -0.0584729802582054 A317 -A326 -0.0584917609903797 Q292 -N481 -0.0595126302225555 A301 -A470 -0.0595888605695949 A320 -S457 -0.0596120715364492 T307 -S462 -0.06009547610517 N481 -A488 -0.0603869185747088 A294 -E476 -0.0609211149335995 A294 -M303 -0.0612100177863499 Q292 -A300 -0.0626053198438008 L296 -Q469 -0.0626771743826438 D315 -S321 -0.0627121691356398 E308 -N316 -0.064256858650154 N316 -E458 -0.0667677934543858 Q292 -Q480 -0.0667734691815907 N313 -E459 -0.0673212914738112 A301 -E465 -0.067830275761867 A314 -S457 -0.0679929753964017 E297 -A470 -0.0686939069107018 N313 -A320 -0.0688047009526445 E476 -L484 -0.0705601566135514 S295 -E476 -0.0706523326644954 G468 -V477 -0.0708802472727585 N316 -A326 -0.0715021387992966 E297 -D475 -0.0722645687707103 A314 -N463 -0.0728279358482202 R312 -Q460 -0.0737758908152681 Q473 -A482 -0.0753344869361836 A317 -E459 -0.0767425661266961 T304 -G468 -0.0773024153662032 A456 -N463 -0.0795882660211495 M303 -D475 -0.0798724919127842 S302 -R311 -0.081671718249622 D475 -Q480 -0.0830016010209733 D315 -A456 -0.0834065049486572 A294 -T299 -0.0834192489837496 T478 -A483 -0.084596210260168 Q472 -Q479 -0.0848728045636369 Q469 -D475 -0.0862274434163959 D315 -Q460 -0.0863848595133589 T299 -A470 -0.0866907359068438 A483 -A488 -0.0871050084049712 R312 -I464 -0.0871228576125125 V477 -V485 -0.0877729353227912 V467 -D475 -0.0886356906148027 R461 -V467 -0.0889648579243176 R311 -Q460 -0.0912603990499852 A300 -I464 -0.0915933175813242 T322 -A328 -0.0918134621678477 R312 -R461 -0.0923227731909071 R312 -E459 -0.0926895728405914 E298 -A470 -0.0927789077671246 T307 -Q460 -0.0935577693899448 A456 -I464 -0.0941634782913111 A294 -T478 -0.0942366071017136 D315 -E458 -0.0971724279416628 A300 -T307 -0.0988537825400435 E458 -V467 -0.0988545131594534 Q479 -A488 -0.0989481296796684 L296 -A470 -0.0994746804914373 Q480 -E486 -0.0994843302269638 A470 -E476 -0.0999508757528011 A300 -D475 -0.101693836209419 E465 -M474 -0.102021523481105 Q479 -Q487 -0.103511412381126 T309 -A317 -0.104344833950926 E459 -E465 -0.104375789476277 L296 -V467 -0.104622258749704 S295 -A482 -0.105177236441776 L306 -G468 -0.105938212160499 E297 -L306 -0.106228939628591 T478 -E486 -0.106507943226577 L484 -A492 -0.107633133230504 L306 -A314 -0.107829128611859 S295 -D475 -0.108341848693672 A301 -L306 -0.108859400666875 E308 -A314 -0.109021872749193 A317 -T322 -0.110292628969627 N313 -I464 -0.111404853840871 D315 -T322 -0.111444550033354 R312 -S321 -0.111538044481563 S302 -R461 -0.11220303793352 E308 -N313 -0.112616346060503 I464 -Q469 -0.112667040245761 L306 -A470 -0.113010349600684 S295 -M474 -0.11301902483738 S457 -E465 -0.11318016152303 A300 -H466 -0.115074624632737 L306 -D315 -0.11531491269783 L296 -S302 -0.117058702351196 V310 -D315 -0.117855039661083 T309 -I464 -0.118671060496828 T322 -A327 -0.118953128387847 Q292 -E297 -0.119434597495208 Q472 -Q480 -0.120417802035959 T309 -R461 -0.121447389674194 L296 -Q472 -0.123386140709494 Q472 -N481 -0.123653212668867 S295 -A470 -0.12428236763218 L296 -A482 -0.125817597858274 E297 -T304 -0.126018974495246 S462 -Q469 -0.126407531957778 N313 -T322 -0.129147479350383 M303 -Q473 -0.129244856152426 N316 -S321 -0.130057461844639 A293 -T478 -0.131537745314959 S295 -S302 -0.131662037916769 G468 -Q473 -0.132904488744404 T304 -H466 -0.132963292795175 T299 -H466 -0.133111180899954 L306 -N313 -0.134086848070696 A314 -L323 -0.135729424913563 I464 -Q473 -0.136033326801201 L306 -N463 -0.136049834103354 T307 -D315 -0.136175274009568 A317 -L323 -0.136176801963186 N313 -L323 -0.136623740448009 E308 -V467 -0.138078402347595 R318 -A324 -0.139249150113524 V310 -N316 -0.140090243888706 T299 -D475 -0.140913373855864 L296 -Q473 -0.141040604259304 E305 -I464 -0.143888544310026 E476 -A482 -0.144047726970641 E298 -M474 -0.144565834607549 S457 -S462 -0.144839174931263 E308 -I464 -0.145407064953442 L296 -M474 -0.146555882849865 E486 -A492 -0.146690512292113 E319 -A326 -0.146771142104395 Q473 -Q480 -0.148844506843029 S462 -G468 -0.150096074740067 S457 -I464 -0.150734523472411 L296 -N481 -0.151028272606746 V467 -E476 -0.152783176968366 Q473 -T478 -0.155153269741083 R312 -A456 -0.157948618181958 N313 -E458 -0.158267706411123 T307 -R312 -0.15898719795208 D315 -E459 -0.161507702948949 L484 -A491 -0.161857663755761 D475 -L484 -0.162400225004756 V310 -A456 -0.163216865910247 N463 -Q472 -0.164158851313931 E458 -E465 -0.16426686767862 T309 -D315 -0.164553586522555 V471 -T478 -0.164852460072866 L296 -E305 -0.165170616838927 A300 -G468 -0.168000237940241 L296 -E476 -0.16829795779954 R311 -E465 -0.168464318872614 T309 -N316 -0.170615998922679 V477 -L484 -0.171850406552472 E297 -M474 -0.172045079526028 H466 -Q473 -0.172297200283358 E319 -T325 -0.172386158194302 A320 -A327 -0.172691794259232 A314 -A320 -0.17327293394483 T478 -L484 -0.173472323636178 M303 -V310 -0.173854853616776 I464 -V471 -0.176283674089333 T299 -E465 -0.177201032111403 E298 -V467 -0.178497617075359 A483 -A490 -0.178803382992444 R311 -A317 -0.179028712502122 R311 -A320 -0.18002486238408 E305 -V471 -0.18012454070274 E476 -A483 -0.182838257481366 L323 -A328 -0.183199327097705 S295 -Q479 -0.18395303006839 T307 -N313 -0.184657885305963 N463 -G468 -0.18475342756604 A294 -A301 -0.186857355101623 A320 -A326 -0.187673500027196 V477 -E486 -0.188257344880214 M474 -N481 -0.18963048143278 E297 -T478 -0.190421044320824 R461 -A470 -0.19144073007384 S321 -A328 -0.193224695857075 E476 -V485 -0.194072125301993 T307 -N463 -0.195484612408338 A470 -V477 -0.195833987533177 E476 -N481 -0.196336134902535 E458 -I464 -0.196484476084799 S321 -A327 -0.196672355372512 A314 -Q460 -0.197217473074902 T299 -T304 -0.19770773422059 E298 -E305 -0.197988690163009 T299 -E305 -0.198347884241364 A482 -A489 -0.199600170767771 T309 -E465 -0.199921703124099 Q480 -Q487 -0.200304849512634 S295 -A301 -0.201970521924316 A314 -A456 -0.203004738415984 E298 -T304 -0.203360967535349 T299 -E476 -0.205101608904349 E298 -T307 -0.207350130075315 Q473 -Q479 -0.207383998941727 A301 -T307 -0.208852902351817 A456 -R461 -0.209022846728512 A294 -A300 -0.2093320138818 L296 -V477 -0.209717444150771 T304 -I464 -0.210049573596894 L296 -Q479 -0.210698404686698 M303 -E308 -0.212471029722891 A293 -Q479 -0.212979914318074 N481 -E486 -0.214022657441428 T307 -G468 -0.214629656750365 T304 -V310 -0.215933831036484 T299 -E308 -0.216198778783785 E298 -T478 -0.216269564077203 L306 -V467 -0.218057708459713 L296 -V471 -0.221418755590875 T299 -G468 -0.221973939388409 A456 -S462 -0.222820742051438 V485 -A490 -0.226240283761754 Q292 -A482 -0.226746620163347 A293 -D475 -0.226927876266417 T309 -S457 -0.22784516290583 S457 -N463 -0.228905757820782 Q292 -Q479 -0.229079904742709 T307 -V467 -0.229818517594639 A483 -A489 -0.23189823536761 N316 -L323 -0.23292633434631 A317 -A324 -0.236458342746057 E465 -V471 -0.239003472893808 A314 -R461 -0.239111206808365 T299 -V467 -0.240693130513488 S295 -T478 -0.241419305217138 A317 -E458 -0.245467396473951 A482 -A488 -0.245960684247578 M303 -R312 -0.251933349876346 A301 -E308 -0.257401438577457 A300 -L306 -0.25981993988515 V310 -H466 -0.261364892671476 T299 -L306 -0.262643278853152 S302 -T307 -0.265298540358777 E298 -V471 -0.266807503220467 N313 -E319 -0.26906471345802 R461 -V471 -0.269467132806434 L306 -R312 -0.270996684595726 V467 -M474 -0.274792604211629 A314 -E459 -0.275580430388588 V310 -S462 -0.283845135951556 V477 -A483 -0.287310902627969 T304 -T309 -0.289097818916458 M474 -Q480 -0.295910804774725 Q460 -E465 -0.305402786928756 L296 -T478 -0.308278247222869 V310 -I464 -0.31621647461853 S302 -V471 -0.316468115882741 M303 -T309 -0.316999912597789 T299 -M474 -0.325639069079259 S295 -V471 -0.332039013017537 S321 -A326 -0.334041869996005 I464 -A470 -0.338488911096924 V471 -V477 -0.34622484619086 M303 -V471 -0.351850361204273 V485 -A491 -0.356605674520633 M303 -V467 -0.35986873610435 N313 -R318 -0.360749589990616 M303 -I464 -0.362540486132882 T299 -T307 -0.369498957037694 A320 -T325 -0.375115557182282 R311 -N316 -0.395966830389593 Q460 -V467 -0.399474813454481 Q479 -V485 -0.406663044247956 V477 -A482 -0.434800558743667 S295 -A300 -0.450782082825938 V467 -Q473 -0.460509695885161 L296 -M303 -0.470185862813386