[Fri Aug 26 18:14:04 2016] >Input file: TMA0A109SY06M1D.pdb >TM segments: 50-74_ 76-91 MAIDEN score = 9.3294 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- I51 -I91 1.69746546674616 I57 -A85 1.64036163834336 I51 -V90 1.19684249484149 I57 -L86 1.17086657033306 M50 -I91 1.09591039138578 L55 -L86 1.0420114802113 L56 -L86 0.875507163475382 W67 -F74 0.802928056100143 L56 -V87 0.743076870176346 L55 -V87 0.742422792506497 I57 -L82 0.69906006919387 F54 -F89 0.690564184013552 V64 -G69 0.649716171622657 F54 -V87 0.648761391923156 G63 -V81 0.639287384456905 I51 -F89 0.637803560919885 A60 -P78 0.610040828520822 L56 -A88 0.590339291361089 V58 -L82 0.55341607556488 M50 -F89 0.543209911064862 L56 -A85 0.531396016427941 F54 -L86 0.522708226101512 V58 -L86 0.468892317486434 V58 -A85 0.393592214061706 L55 -A88 0.360785260711239 V81 -L86 0.351259914143838 G63 -G84 0.313476590746881 I57 -G84 0.306511278568672 L56 -G63 0.284461818604849 A60 -L82 0.283524156457863 V58 -V66 0.282393315762715 G63 -L83 0.274681410507366 M50 -V90 0.259314465906868 F74 -L79 0.246094240721812 A60 -L79 0.241977578248772 G69 -F74 0.238045759934444 V64 -P78 0.221535073730105 G63 -L82 0.219849258905149 A60 -F74 0.215471200712685 G63 -P78 0.214840412210577 V66 -F74 0.204121855644398 V62 -L82 0.192192280152138 G65 -F74 0.190679452308769 S61 -M76 0.186895355853753 L55 -A85 0.185661065015072 V66 -I77 0.184289108929382 A68 -I77 0.183738342543452 G63 -M73 0.177434022644205 I57 -V87 0.176356558384407 G65 -L82 0.170155496248917 G65 -G80 0.168230290419122 G52 -I91 0.159011174737675 A60 -I77 0.15740410912179 W67 -T72 0.153196634981031 P78 -L86 0.14928403059429 W67 -G80 0.147449730957159 I57 -G63 0.14359288126347 S61 -L83 0.139722029149368 M50 -L55 0.127926285886766 I77 -G84 0.124406671556426 A53 -V87 0.123963115053975 G59 -V66 0.122469576945818 V62 -A85 0.122257740503938 A60 -G84 0.119836642256649 V66 -A88 0.119244180837259 G59 -V87 0.113099971328839 G63 -L86 0.112774694061482 S61 -F74 0.111813059600085 V62 -G80 0.109538091049619 A60 -M76 0.107505652686334 G69 -V81 0.104399075817322 A60 -G69 0.103853778966695 S61 -L79 0.103664285441459 A53 -A85 0.101569422542547 V66 -G80 0.0988997332120529 V62 -L83 0.0973141012588941 L56 -V81 0.0971881244676727 L56 -V90 0.0964034014795534 A60 -A85 0.0961762604069114 A60 -L86 0.0945172020101102 G63 -A88 0.0938589728857231 G65 -I77 0.0929968981758105 L55 -F89 0.090559466857024 I51 -V87 0.0899023900417622 L79 -L86 0.0892231259533993 S61 -A68 0.0872524057008395 I57 -G65 0.0863220984416024 V66 -L86 0.0825658521833201 L55 -V62 0.0811449292474855 G65 -G70 0.080266305793544 A53 -V90 0.080141701447209 G63 -V87 0.0800601052792758 A53 -I91 0.079982738677816 L83 -A88 0.0796128750905538 G70 -M76 0.0766619927404499 V66 -L79 0.074361844763191 L55 -L83 0.0739232793794415 G59 -I77 0.0718991942542351 I77 -A85 0.0692949778743701 S61 -V81 0.0687508412553992 V66 -M73 0.0674073251620912 G63 -I77 0.0671981245197397 G63 -G70 0.0653723448925696 V62 -A88 0.0621424670723441 I57 -G80 0.060223886932393 A60 -A68 0.0595670945052238 L82 -A88 0.0571335006083302 F71 -L79 0.0543712139184227 V58 -V81 0.0537533618877344 L79 -A85 0.0531392850938017 S61 -G69 0.0523876710259794 S61 -I77 0.0521663658449212 V58 -G69 0.0517249197937865 L55 -V90 0.0513371523316319 V66 -M76 0.0508929997607144 V62 -G84 0.0480384003366998 G65 -P78 0.047254356154302 V66 -V87 0.0468581798540093 L56 -V66 0.0447359728834362 V58 -F89 0.0435475554301827 S61 -V66 0.0427001908172011 V62 -F74 0.0411426909288946 G65 -L79 0.0409418977074014 G69 -I77 0.0382959531055498 F74 -V81 0.0350150336512414 G70 -I77 0.0341382973684734 G63 -M76 0.0326890609592967 G59 -A88 0.0305069920425112 G69 -L79 0.0300556332475788 I57 -I77 0.0290054732967775 L56 -S61 0.0265579944625639 F54 -G84 0.0254499248623348 V62 -W67 0.025437316269078 P78 -G84 0.0252602595088152 G63 -L79 0.0251233204907351 V64 -L86 0.0231956749072164 L56 -V64 0.022100861070129 I57 -V64 0.0215891517092448 V62 -I77 0.0163027494219443 G69 -L82 0.015869492179061 A53 -F89 0.0155749517293753 A68 -M76 0.0128222798533106 I57 -P78 0.0125040937358734 M73 -V81 0.011722043093064 A60 -M73 0.0115041320925222 L56 -G65 0.0103172349441785 G59 -W67 0.0101204279777738 F54 -I91 0.00984312154796729 G69 -G80 0.00921736575086615 S61 -G80 0.00556302921263452 W67 -L86 0.00522052726214284 V64 -T72 0.00300876434455732 G59 -V64 0.0018264318379142 F71 -P78 0.00179860335899695 M76 -L83 0.000167304718372563 G70 -L79 3.43483585134585e-05 L56 -G80 -0.00138534865875795 L55 -V81 -0.00140870774650459 I57 -V81 -0.00155970110231785 P78 -A85 -0.00228064461185351 S61 -L82 -0.00430465475351482 A68 -V81 -0.00564777088191226 V66 -P78 -0.00661296057133676 V62 -G69 -0.00749540402876736 I77 -L82 -0.00943646732764414 W67 -L79 -0.00963603094463483 V62 -A68 -0.0112517217903862 G70 -P78 -0.0123960150343772 F74 -L83 -0.0159931259851369 G65 -V81 -0.0174214134286323 V81 -A88 -0.0180300716952788 G52 -L86 -0.019219752803211 M50 -V87 -0.0217650101204068 G63 -A85 -0.025055040700408 G59 -G80 -0.0261146896578976 S61 -A85 -0.0275023807235613 V62 -V87 -0.0295716176120648 S61 -G84 -0.034156030153623 F54 -V81 -0.0357135343942039 F54 -A88 -0.0360727066502728 A53 -V58 -0.0367370173762778 V64 -M76 -0.036801026378775 I77 -L86 -0.0384858056446271 V66 -F71 -0.0386747267143654 G59 -G65 -0.0437275803481496 G59 -M76 -0.0458800109043231 T72 -G80 -0.0477520071506015 V58 -A68 -0.0507355134063228 W67 -P78 -0.0541571952896955 I57 -V66 -0.0563884073025456 M73 -G80 -0.0593717344883444 G80 -L86 -0.0609144263775008 G59 -F74 -0.0619226510258297 G69 -M76 -0.0625686454016723 G63 -F71 -0.0649314054095127 V64 -M73 -0.065401041660486 V81 -V87 -0.0671049037706224 I57 -F89 -0.0672042025766748 V62 -L86 -0.0676513550880022 T72 -P78 -0.0699161244043636 A60 -G80 -0.0728488707534225 L56 -L83 -0.0744378439118325 G59 -V81 -0.0761630833814007 A68 -L79 -0.0829217630595638 G80 -V87 -0.0839194422746061 V62 -P78 -0.0858460979260434 V64 -F71 -0.0882178756658125 L55 -G63 -0.0919915958657134 L82 -V87 -0.0932922955917466 V64 -L83 -0.0943325114769538 M73 -L82 -0.0965911609802939 V58 -V64 -0.101308147794418 G80 -A85 -0.10348551104364 F54 -G59 -0.104302092499758 G63 -G80 -0.109279339617499 P78 -L83 -0.110142200839399 V58 -P78 -0.11015731957108 G63 -G69 -0.110340034057318 G52 -V87 -0.111944461275071 T72 -L79 -0.114971510523768 F54 -V62 -0.116245423090154 M76 -V81 -0.116900318620026 A68 -F74 -0.117759786706685 A68 -P78 -0.118501272678308 V64 -G80 -0.120397111596738 G59 -G84 -0.121217032702305 G65 -F71 -0.12535560532376 G65 -M73 -0.126217128005134 F71 -I77 -0.126951835645382 L56 -G84 -0.129564052606794 G59 -L86 -0.13002773259302 A60 -G65 -0.130549057701335 V58 -F74 -0.131025345184928 G63 -F74 -0.131363949818094 V66 -F89 -0.132931345073968 V58 -M76 -0.132992595566347 V58 -G84 -0.134329129439978 I77 -L83 -0.135094803040904 V64 -G70 -0.141867909917355 G52 -F89 -0.149262672514237 F74 -L82 -0.150004731007986 A60 -L83 -0.15582222553375 L79 -G84 -0.160453614999829 L55 -L82 -0.164117035536261 I57 -L79 -0.164577960491953 F74 -G80 -0.167444164896376 W67 -M76 -0.167987676066992 I57 -W67 -0.170287640001107 V64 -L79 -0.170770522908136 V58 -L79 -0.173947208951118 M76 -G84 -0.177293001149791 V58 -G80 -0.178150145331495 V58 -G63 -0.178554124204751 G59 -A85 -0.179932221201522 V58 -I77 -0.180341082805456 L56 -L82 -0.180351415522598 S61 -L86 -0.183502241924093 V64 -L82 -0.186614567397495 V58 -G65 -0.187287646560245 I57 -L83 -0.188899869908495 L56 -F89 -0.191360686717861 V64 -F74 -0.19288660463916 I51 -A88 -0.193241887545335 W67 -I77 -0.199331803039483 G69 -P78 -0.200254908624264 V62 -L79 -0.205567126380131 A60 -W67 -0.208333784583269 G59 -L82 -0.210299823942419 T72 -I77 -0.211616139855837 A68 -M73 -0.2160637238486 M73 -P78 -0.221266746868315 S61 -W67 -0.228739126173698 V66 -L82 -0.233168245586905 W67 -L82 -0.241084473349283 I57 -V62 -0.249978144406526 G59 -P78 -0.25623102975565 F54 -V90 -0.261946247532315 V66 -V81 -0.262664420138389 F71 -M76 -0.264265703910797 F54 -A85 -0.281546648211286 S61 -P78 -0.288353874868962 G63 -A68 -0.291118085286909 A60 -V66 -0.291818369225567 A53 -L86 -0.295081619004026 G52 -V90 -0.296888171603316 V58 -W67 -0.299932060201366 L55 -G84 -0.304244513887562 I57 -A88 -0.327415760615841 G52 -A88 -0.328186807800155 G59 -L79 -0.335510087631945 V58 -V87 -0.340375803604745 G59 -L83 -0.340505756522067 V62 -V81 -0.344132100039181 V64 -V81 -0.349340778258168 W67 -V81 -0.357421024044625 M50 -A88 -0.362130526709247 V58 -A88 -0.371869513102564 L56 -V62 -0.402227848593584 A53 -A88 -0.429556756279044 W67 -M73 -0.437558545194969 V58 -L83 -0.449473279436079 A60 -V81 -0.456112309326802 V64 -I77 -0.457220152476218 M76 -L82 -0.474667053550491 M73 -L79 -0.481191249891601