[Mon Aug 29 16:41:02 2016] >Input file: TMA0A120J306M1G.pdb >TM segments: 3-47 MAIDEN score = 26.0443 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V11 -L30 10 G12 -L30 10 T10 -W15 1.96462358854937 V3 -W24 1.17792854133746 G12 -I31 1.01419670088312 I17 -A39 0.919652363224445 W15 -A28 0.868008460500526 P16 -L29 0.823301923967245 W15 -L30 0.801520176044229 V11 -L29 0.76432641269467 P16 -L30 0.741700295352126 A19 -R26 0.700690275814008 G12 -I17 0.68121007559691 V6 -R25 0.646739519353959 V3 -A19 0.641869339578348 W15 -G27 0.641226975584804 V3 -F23 0.616226749722381 A13 -L30 0.589982716280918 R9 -I31 0.582383329478335 V11 -I31 0.577436543994657 I17 -V37 0.569148405332775 V11 -G27 0.523732339094961 A13 -V37 0.515911339976916 A13 -I31 0.442078866823991 L7 -R26 0.438150905294869 P16 -A39 0.435151996193239 V21 -R42 0.432657425310186 R9 -L30 0.431399919840491 R9 -L29 0.430410223437011 V6 -W15 0.422331601748132 A13 -L18 0.419747521481343 V3 -R26 0.41210154624685 V6 -A19 0.397248566609919 A5 -A28 0.37851107618249 V3 -N22 0.374324967553303 T10 -L30 0.36774838578814 A19 -W24 0.323686678221675 T10 -A19 0.321049513591143 G12 -A38 0.311910864609557 W15 -L29 0.308732490151883 L30 -V35 0.303578719528459 A13 -G36 0.301487276873599 A19 -G27 0.299700515521122 A13 -A39 0.286022985701513 G36 -L43 0.284244353554325 R4 -L18 0.271966649732228 T10 -A28 0.265858253550758 A13 -G27 0.259065558778246 R9 -G27 0.25325673703922 L7 -G27 0.244301661154037 G20 -G36 0.244053041714761 V11 -G32 0.243688517754933 L41 -S46 0.234212858270856 R42 -E47 0.227176205175644 V40 -E47 0.216892048726185 G20 -R42 0.216766006366609 A13 -R42 0.214143644132324 R9 -A19 0.210653223075055 I17 -G27 0.19342919422059 V11 -R26 0.193286021503594 G20 -A39 0.191058823305427 V21 -G27 0.184712556497001 T10 -L29 0.183956970396196 A13 -G32 0.181775998164118 T10 -I31 0.179072234638616 G34 -L41 0.177884597739521 V35 -V40 0.17783012651584 V11 -G20 0.177681397677226 V3 -G27 0.172455401256753 G20 -R25 0.172186742161672 G12 -I33 0.170868788520367 Q14 -A19 0.166306092457359 A28 -G36 0.16299845750289 W15 -W24 0.162508529163691 G32 -A38 0.160270857803015 A28 -V40 0.159966153360003 P16 -W24 0.157341481744898 T10 -L18 0.156184564410677 A19 -V40 0.154078865439277 A28 -V44 0.153653793170883 P16 -R26 0.152432402059627 W15 -G32 0.145205573003066 A5 -G20 0.144341382506052 G12 -G20 0.143764864797383 R4 -A28 0.143037362816594 Q14 -G34 0.139900342561031 W15 -R25 0.137362117845081 Q14 -R25 0.137007745837386 I17 -R42 0.136061956595347 L18 -V37 0.135700788977104 A39 -E47 0.133904583268672 A28 -A39 0.133326284386024 R8 -W15 0.128926322591913 Q14 -R42 0.128559113763434 V37 -V44 0.127805757971127 Q14 -R26 0.127508432264284 A5 -W24 0.127338513809915 V11 -V40 0.126820825898804 R4 -G27 0.124809078036961 A39 -S46 0.124241767197361 I17 -N22 0.124049047454514 A28 -R42 0.123969134842522 L7 -P16 0.120965922243754 A5 -L18 0.119505468160142 A5 -P16 0.116708254925134 A19 -V44 0.116448598203848 V21 -L43 0.115583671281385 R4 -V21 0.114131753012551 G27 -V44 0.11393620877534 L18 -G36 0.113835112666676 G12 -V21 0.11344284206589 G12 -R42 0.112336831169185 R8 -R26 0.109202613469542 T10 -V40 0.108498554852964 L29 -L41 0.107631600054813 I17 -G34 0.105307153787169 L7 -L30 0.104909688804582 V21 -R26 0.103679125090042 G27 -A39 0.103025226006539 R4 -F23 0.102842256763212 A5 -L29 0.102073473141699 R9 -Q14 0.10148729880554 A5 -G27 0.0999845509719757 R8 -Q14 0.0969564089341901 L29 -V37 0.0957140557788996 V21 -L41 0.0937575537315363 R8 -G27 0.0934318938276331 A5 -I17 0.0933324548331811 L7 -L18 0.0924365038006467 I17 -A38 0.0921156560953231 V6 -G12 0.0902628666063592 T10 -G36 0.0902401281700236 T10 -G32 0.0898336199778332 V11 -A39 0.0880409890897158 N22 -G27 0.0880008337808258 G27 -R42 0.08787356140494 R9 -G32 0.0877219321836531 L30 -V37 0.0868646706462659 P16 -G36 0.0866019265860398 L30 -V40 0.0848980202633034 Q14 -L30 0.0848179235881372 V6 -L30 0.0846444529488315 L7 -I31 0.08185399774213 V6 -N22 0.0809830052373883 G12 -L18 0.078833959010951 V6 -I31 0.0775581394895288 L18 -L30 0.0773445700409097 R25 -L43 0.0754770907219208 P16 -G32 0.0754678190586211 Q14 -V40 0.0745956980241694 W15 -G20 0.0741091575058634 R25 -V44 0.0725347311310178 T10 -N22 0.0715433584445888 N22 -V44 0.0706483612677971 G20 -R26 0.0704369348585834 L29 -R42 0.0700406336308569 I17 -A28 0.0699395525926008 R26 -L43 0.0694593591221562 V11 -A38 0.0692979059344818 A28 -L43 0.0689719981995127 V21 -L29 0.0689715290016091 R9 -R26 0.0688954170891005 W24 -R42 0.0683372182082853 G32 -A39 0.0682417089669425 L29 -A38 0.0649978146423895 P16 -V35 0.0630531020256746 L18 -V35 0.0618294564553654 V21 -G36 0.0612173815642656 R8 -A19 0.0611269193689541 L41 -E47 0.0605797601860978 V6 -Q14 0.0600407925300928 I17 -W24 0.05967978012497 L29 -G36 0.0593078978188514 L7 -L29 0.0589736817026352 R4 -R26 0.058274588984738 A19 -V35 0.057435434751266 R8 -P16 0.0560293121821274 L30 -R42 0.0541683529896 G12 -L43 0.0538549623755999 A19 -L30 0.0531134857061322 I17 -V44 0.052983397481662 T10 -I33 0.052849407383085 G36 -V44 0.05203127584133 G32 -V37 0.0514756004326182 V35 -L41 0.0507895665011375 A13 -R25 0.0504607359545393 N22 -A39 0.0493937423311199 A28 -L45 0.0483991878667491 A19 -L41 0.0483792446137032 N22 -A38 0.0483708144534338 L18 -L41 0.0471998484882858 W15 -G36 0.0469280032561823 V3 -I17 0.0456127067058043 G12 -L41 0.0424962919217982 L30 -A38 0.0419207375065509 A13 -V35 0.0404856073904654 R26 -V44 0.0390668203975271 L18 -W24 0.0372049661983871 W15 -F23 0.0366705921827144 I31 -V37 0.0364775156425194 I17 -V35 0.0362708894704902 G12 -R25 0.0359766930279966 Q14 -I33 0.0334628261546936 A28 -V35 0.03317041781846 W15 -V40 0.0327544329431273 G12 -L29 0.0320960532218031 R26 -A39 0.0317584551536738 R4 -G20 0.0312289196070714 G12 -R26 0.0309202670367803 A19 -L43 0.0308268605561905 T10 -R42 0.0301835431696152 L29 -L45 0.0298567692993954 T10 -V21 0.0283835650326288 I31 -G36 0.0281446990014782 A13 -N22 0.0277892296539535 A19 -A38 0.0274663275353508 I17 -G36 0.0273885242481313 I17 -G32 0.023867919104537 V6 -I17 0.0233198860362123 V11 -V37 0.022895805047416 W24 -L45 0.0220784145788304 I17 -L45 0.0220591481372008 I31 -V40 0.0218873021458199 T10 -A39 0.0214267999274522 V3 -P16 0.021135029716137 A28 -I33 0.0211127689053976 T10 -V35 0.0200706647126778 F23 -L43 0.0196314259462236 G20 -L30 0.0192185145221928 I33 -V40 0.0182619600155223 G20 -L45 0.0179693986737419 A38 -V44 0.0175971607091587 V3 -V21 0.0172960630091534 A19 -G36 0.0169707200818964 G32 -V40 0.0163225049201277 Q14 -A28 0.0151916274679138 I17 -I33 0.0130324447239687 V6 -P16 0.0124879084910221 V21 -L30 0.0120840846068533 V6 -F23 0.0109716989548225 T10 -R26 0.0109694323192135 R9 -W15 0.00990767554433325 T10 -G27 0.00839367101303545 F23 -R42 0.00754102016453018 A5 -V21 0.0065390286728837 N22 -R42 0.00463171567695575 P16 -L41 0.00426344370269582 L18 -G34 0.00265870370727583 W15 -I33 0.0025218540410803 Q14 -N22 0.00220537960434453 F23 -A39 -0.00158426564858694 L7 -A28 -0.00175789197137011 G20 -S46 -0.00183883370365434 A39 -L45 -0.002255147654318 V11 -R25 -0.00252827050485482 V21 -A39 -0.00304201588895148 P16 -G34 -0.00351254640596288 A19 -I31 -0.00394965153240978 G27 -L43 -0.00396463255188784 R8 -I31 -0.00434612447745608 V11 -P16 -0.00510809082745944 A5 -Q14 -0.00533673876919294 I17 -I31 -0.00630821918480606 N22 -L43 -0.00710791648183928 W15 -A38 -0.00820283608211736 G12 -A28 -0.00878608959076921 I17 -L43 -0.00910822858439131 R4 -V11 -0.0108908494072111 F23 -V44 -0.011881057508996 G34 -L43 -0.0127162340022524 A28 -G34 -0.014478006217189 V21 -A28 -0.0147066341268571 N22 -A28 -0.0148477932774329 L18 -A28 -0.0157776763261923 L7 -I17 -0.015862851565708 R9 -I17 -0.0191890100392591 G27 -L45 -0.0201663563923038 Q14 -G27 -0.0201957409153466 L7 -G20 -0.0204822037507606 V3 -Q14 -0.0218302423833352 V6 -A13 -0.0219526615470136 P16 -A28 -0.0219642432320073 A5 -V11 -0.022744573975948 I17 -L30 -0.0238898939386445 T10 -G20 -0.0239423182703042 V35 -V44 -0.0241580654851004 R8 -L30 -0.0248097348135996 G27 -V35 -0.0248284699440822 G12 -V35 -0.0248343440856635 R26 -R42 -0.0257844786392607 V21 -V35 -0.026011923420159 L7 -G12 -0.0262994808953536 A19 -V37 -0.0264388249781533 L18 -L29 -0.0274453447995944 P16 -I33 -0.0275560601679561 Q14 -A38 -0.0276930610674517 V3 -A28 -0.0290921169274778 L29 -A39 -0.030421531287796 V11 -G36 -0.0307074643116731 G27 -V40 -0.0320022982642891 W15 -N22 -0.0326561146839713 N22 -V37 -0.0363476909214744 T10 -G34 -0.0400067847713252 I31 -A39 -0.0402967112474073 G20 -V44 -0.0407842315363114 R8 -R25 -0.0426683065732331 V11 -V21 -0.0439421571182583 P16 -I31 -0.0446533968332699 L7 -A19 -0.0460756054638489 V3 -G20 -0.0479470070091095 I33 -A39 -0.0502707658464576 W15 -L43 -0.0507537303141969 T10 -W24 -0.0508183472193262 P16 -V44 -0.0516473770159269 R25 -L45 -0.0553065413581482 L30 -L41 -0.0575740549424051 A38 -E47 -0.0586932384736651 R25 -R42 -0.0621943887444717 R4 -Q14 -0.0639254768411592 L7 -Q14 -0.0655216038233308 R8 -A28 -0.0661597437864265 R9 -R25 -0.0672993279288703 R4 -L29 -0.0682109607299595 R9 -L18 -0.0697154981011563 R26 -L45 -0.0704867963081099 I33 -A38 -0.0716279141934724 G20 -I31 -0.0716707636711038 A5 -F23 -0.0726914172395268 A38 -S46 -0.0728680946395492 W15 -V37 -0.0741228660912205 Q14 -L41 -0.0757329287931525 V11 -L43 -0.0760987840717169 R9 -G20 -0.0768746658413058 W15 -R26 -0.0775311644439896 R4 -W15 -0.0793557448257757 G34 -V40 -0.0813632477775115 V3 -T10 -0.0819140549937054 V40 -S46 -0.0832368991618448 V6 -V21 -0.0833794258765028 Q14 -L43 -0.0851595020298719 T10 -L43 -0.0861041175107897 R4 -R9 -0.0861610028372732 R4 -A13 -0.0869170296882764 A13 -L29 -0.0876744827114102 W15 -R42 -0.0888980021509447 G12 -A19 -0.0892650100816752 A13 -L43 -0.0909858212490744 R25 -A39 -0.0922985130869414 P16 -L45 -0.0928431448090539 G20 -L29 -0.0941500817735987 A13 -I33 -0.094729050839824 V37 -L43 -0.0950450803424925 V21 -V40 -0.0954152611590924 W15 -G34 -0.0977494492488526 A38 -L45 -0.0987595855761789 T10 -R25 -0.0988278913910681 L18 -G32 -0.100636056086033 V3 -W15 -0.101256586083057 G12 -V40 -0.101617648060141 A5 -A19 -0.10301361116503 V21 -V44 -0.103395765355513 A13 -V21 -0.103631173542693 L18 -V44 -0.10418077838332 I17 -F23 -0.104376972643977 N22 -L41 -0.104469334503824 A13 -L41 -0.107674084384184 W24 -L43 -0.108450520402223 L18 -I31 -0.109666921471748 L18 -L43 -0.110177929944362 I17 -L29 -0.111485612583001 G12 -V37 -0.111882426351753 W15 -V35 -0.113056473026792 V6 -G20 -0.113526893747313 V11 -G34 -0.115242920187497 L18 -F23 -0.117613875315758 G20 -V40 -0.119295568988665 G34 -A39 -0.119608176111619 W24 -V44 -0.119649672962858 L30 -G36 -0.126395878497525 G12 -G27 -0.127513835676123 W15 -I31 -0.12809536159533 G20 -V37 -0.12871651425531 R4 -T10 -0.12996389868037 L7 -N22 -0.131296467248355 G20 -V35 -0.13292308092201 V3 -R25 -0.134870631430847 L7 -W24 -0.140084999488768 R4 -I17 -0.142381980571435 R9 -P16 -0.14334255946291 Q14 -V37 -0.146919382702123 V6 -R26 -0.150849745393428 R8 -L29 -0.15281166957342 L29 -V35 -0.153044623332077 V37 -R42 -0.153305504215295 V35 -R42 -0.153591016319717 G36 -L41 -0.156516082197442 T10 -I17 -0.156584898332851 A5 -N22 -0.156814682018211 W15 -A39 -0.158346241742114 G34 -R42 -0.160967485845118 L18 -A38 -0.161104321637533 L29 -L43 -0.163411008504067 P16 -A38 -0.164224400573848 L29 -E47 -0.164731049721429 I17 -R26 -0.16473670601451 V6 -L18 -0.165836633784579 A19 -L29 -0.168416499415819 P16 -F23 -0.17284729212122 A13 -A28 -0.176667337407602 Q14 -A39 -0.177678757564077 A13 -R26 -0.17892804518991 Q14 -G36 -0.179688780024159 G20 -L41 -0.180108218497685 G12 -G36 -0.180500377257118 L18 -R26 -0.181124951891296 A13 -A38 -0.183717263643925 V11 -I33 -0.184096045559399 V35 -E47 -0.186692650196539 L30 -L43 -0.188592347479302 L18 -R42 -0.189586840105787 L29 -S46 -0.190293451666592 P16 -V37 -0.191306931310149 V35 -L43 -0.191923517748389 G36 -R42 -0.192139504019829 G20 -A28 -0.192608831337097 L18 -G27 -0.19299420565762 R4 -W24 -0.19432147664002 V40 -L45 -0.195385431459867 G12 -G34 -0.200545842669379 A19 -A28 -0.203763884240738 R4 -N22 -0.204423985208261 A5 -T10 -0.208352143406952 P16 -V40 -0.208610968964985 A13 -A19 -0.215246851187898 L29 -G34 -0.219637810932239 L29 -V44 -0.219829411892666 V6 -L29 -0.223077752437954 L18 -V40 -0.227911585681635 L18 -R25 -0.229574300613574 W15 -V21 -0.232477416253868 A13 -G34 -0.232620467009145 A19 -A39 -0.23748033166037 V11 -R42 -0.237862236257576 V3 -L18 -0.238804264169223 A13 -G20 -0.240639675236746 L7 -R25 -0.241527585325325 Q14 -G20 -0.24706558893203 A19 -R42 -0.251367570597475 V6 -G27 -0.256265542983966 A5 -W15 -0.259248386613697 G20 -A38 -0.261729094255571 Q14 -V21 -0.264909772109079 R4 -P16 -0.27051353271658 T10 -P16 -0.270529790945798 L18 -A39 -0.271714067747864 L7 -W15 -0.272586773813161 I17 -L41 -0.27291410651479 P16 -V21 -0.283218130265681 A38 -L43 -0.29750023760044 V21 -A38 -0.3030266805038 Q14 -G32 -0.306976127973256 L30 -A39 -0.311356951208419 G20 -G27 -0.313391297855285 P16 -G27 -0.314038923194468 R4 -R25 -0.316858622416388 G12 -G32 -0.318928168882445 V6 -W24 -0.329339692718125 Q14 -V35 -0.330476964625724 R9 -A28 -0.330815963504589 P16 -N22 -0.332164695859727 V11 -A19 -0.333786788954437 Q14 -I31 -0.33911012899246 A19 -R25 -0.341260312440326 V11 -V35 -0.341613003175575 V6 -V11 -0.353118559299125 V21 -V37 -0.353124743678211 I17 -R25 -0.353686864248511 A39 -V44 -0.368096752497162 A13 -V40 -0.369453819135825 Q14 -L29 -0.392543419485181 L29 -V40 -0.393327302796349 V11 -L18 -0.400379456576201 V11 -I17 -0.405108252604668 G20 -L43 -0.414257052372653 V6 -A28 -0.436691371731071 P16 -R42 -0.439126805680029 P16 -R25 -0.462560489967654 I17 -V40 -0.470271050414259 V11 -A28 -0.478522347916786 G12 -A39 -0.4838843408842 R4 -A19 -0.487594081574811 P16 -L43 -0.568950326781089 A5 -R26 -0.667305743518 A5 -R25 -0.70732238016028