[Fri Aug 26 16:28:45 2016] >Input file: TMA0A125UMJ1M1D.pdb >TM segments: 31-69_ 76-95 MAIDEN score = -7.4319 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V52 -V68 1.16818900841003 A57 -D69 0.885304016636961 A56 -D69 0.852465071307968 H48 -L76 0.816863586509794 V42 -V47 0.796905946545999 A35 -P40 0.620088382241766 V52 -A57 0.605466681231684 S44 -G80 0.584168542184977 L32 -P40 0.579196724543621 H48 -V77 0.545612390111517 A56 -N67 0.545320237018471 E51 -A56 0.542841995798401 F90 -P95 0.536022711755866 A50 -T55 0.504787738000887 H62 -N67 0.442471434241885 S44 -V77 0.441555843286317 H48 -V68 0.407248722023807 A45 -L76 0.385749288139531 A57 -V68 0.385690131826713 V52 -N67 0.379768836713551 A45 -A84 0.363912357748591 S31 -A41 0.340498279752247 P40 -P79 0.340466514546944 E51 -V68 0.334214585701558 H48 -G66 0.30771686311486 L32 -V42 0.303443988838895 G59 -K64 0.302465350763548 P40 -T55 0.296118100319323 P40 -E51 0.280444420497561 V42 -D69 0.279671234585134 T55 -V68 0.271365197096478 T39 -P79 0.271094564916982 V47 -D69 0.261119120280677 L32 -A43 0.255670657824767 E51 -G66 0.252611834552923 S31 -G37 0.226317287204001 K64 -D69 0.224433127908026 V42 -E51 0.217733810586249 L33 -T39 0.21440586588316 S58 -G66 0.211655588734414 V52 -G66 0.208206154295141 H48 -N67 0.204176997438939 S81 -A89 0.202637401948013 I38 -G66 0.202118526987978 P40 -L76 0.199946561961259 V47 -G80 0.196011207132768 H48 -A56 0.195321628946016 F36 -A41 0.190727824709752 S44 -G83 0.186787954900161 G37 -V42 0.183225415716245 T54 -D69 0.181324182897737 G59 -V68 0.171383968366387 V52 -V60 0.169562853265867 A45 -V53 0.166604600168728 A50 -D69 0.161404615532932 A50 -G66 0.161045955741296 T39 -D69 0.160953024856442 F36 -S44 0.157379170974849 V42 -A84 0.156446342686841 A57 -N67 0.155692177902157 G37 -G66 0.155555631367516 H48 -I78 0.151670940601648 H48 -S81 0.149663446314688 L33 -A41 0.148386024695416 L49 -G80 0.148191490262322 S44 -F85 0.14774624783301 V47 -A56 0.144682623502125 S61 -V68 0.142944848860994 A57 -H62 0.140904772195914 A35 -G80 0.139116690632802 F36 -G66 0.136985356075019 V52 -S61 0.135995146009864 S46 -V68 0.13580908692997 T54 -G59 0.135056736321533 T39 -T55 0.1321829201445 A43 -I78 0.130575868376072 A50 -N67 0.129836523957254 S31 -A84 0.129565885513161 S44 -V52 0.129046239413701 N67 -L76 0.125687698351046 A41 -A50 0.12541479520475 P40 -D69 0.125078770554698 L32 -A41 0.11943003733104 T39 -G80 0.118914769382835 H48 -P79 0.118470871948735 L34 -A43 0.117783924026758 S46 -G80 0.11730512926518 L32 -S44 0.115556427201543 P40 -H48 0.115037502909221 L49 -V77 0.114283729089632 L32 -A84 0.112896833118356 V53 -G59 0.112763148727683 A43 -L49 0.111582334242374 A41 -A84 0.111077204372022 A43 -A50 0.110222556224145 L34 -A41 0.109868179424048 A43 -G87 0.106790622804933 G37 -A43 0.106602917915493 S46 -V53 0.105590432594751 S46 -V77 0.105062221237314 T39 -H48 0.103505016982471 L86 -P95 0.103287987057651 A41 -G83 0.103100129655734 V42 -V77 0.102401095819197 A43 -G80 0.0999656472474761 A50 -A57 0.0992497413236064 A50 -L76 0.0976058799622845 A50 -S58 0.0966761438084554 A35 -V47 0.0957879937038699 A43 -I82 0.0941074015233352 A35 -G83 0.0940901382628686 V42 -S81 0.0940088400167856 S46 -A56 0.0937823851830075 L32 -V47 0.0915730001416124 L86 -L94 0.0915259738161127 V52 -G59 0.0910703848023053 I63 -V68 0.0901089609610319 T39 -E51 0.0892554484848089 V53 -V60 0.0883012192449382 G37 -F65 0.0869993391510357 P40 -V52 0.0850738163029621 T54 -S61 0.0846851046964714 A84 -S92 0.083452889762321 S46 -T55 0.0816239323220009 A56 -H62 0.0809682637880567 A41 -N67 0.0778104823923735 L32 -A45 0.0776839026420291 T55 -S61 0.0763146457428241 G80 -A89 0.0743644894929636 S46 -A84 0.0738555677854569 F36 -L76 0.0728827887866701 A41 -S46 0.0726463578721415 L49 -A57 0.0673467259839087 L33 -V42 0.0651154671244392 S58 -D69 0.0646851209273662 T39 -S44 0.0644929002422261 F85 -Q93 0.0637979482826103 A41 -I82 0.0627650383161376 H48 -V53 0.0625071806642898 V42 -H48 0.0621880287319652 A35 -G66 0.0620683227811383 I82 -A89 0.0620214243499451 A35 -A45 0.0610310363225064 T55 -H62 0.0601242409113549 S31 -S44 0.056864206238058 A41 -L49 0.056448495242587 G80 -A88 0.0553239723356826 V47 -S81 0.0536970188948427 I38 -H48 0.053514862926817 E51 -H62 0.0531120968566245 S31 -G80 0.0527566496865903 V47 -G66 0.0522321880129211 A45 -G80 0.0507723974789007 S31 -G87 0.0499157481029933 V42 -P79 0.0481842588909966 A35 -L76 0.0458301649165831 L32 -L76 0.0453604088622992 T39 -F65 0.045146475332003 T54 -V68 0.0449892396253306 G83 -S92 0.0449040904551925 A50 -V77 0.0429984612104564 T39 -K64 0.042769490373909 A56 -G66 0.0408576443469464 T54 -K64 0.0407987361616882 P40 -S61 0.0407114370198922 P40 -V77 0.0401367181030121 V47 -N67 0.0398197207294735 L33 -A43 0.0382543850798349 S31 -G83 0.0365271267280307 P40 -S46 0.0362501741505845 A43 -E51 0.0356779028983718 P40 -F65 0.0351912917855124 A45 -V68 0.0343591408660542 A43 -A88 0.0336996382580228 P40 -I63 0.0329708010481418 S46 -S81 0.0315243716625373 G83 -L91 0.0297326303680694 S61 -D69 0.0253392870952858 T39 -G83 0.0249361902099372 T39 -A45 0.0247533677946858 E51 -V77 0.0241115906784402 P40 -A45 0.0212144556519007 A35 -S44 0.02088855541137 G59 -F65 0.0205057863227962 A43 -L76 0.0195294046032846 A56 -I63 0.0194855466305475 G37 -L76 0.0191381188376984 T39 -V47 0.0187597953032204 S46 -D69 0.0180236953391699 V53 -S61 0.0175516887995522 D69 -V77 0.0172081874743615 L34 -G80 0.0160930647005886 T39 -V77 0.0159818971133032 A56 -V68 0.0159072552438531 I38 -G80 0.0156556022893533 V53 -N67 0.0156526681783689 A35 -A41 0.0153610175515659 T39 -I78 0.0129724623099756 A45 -D69 0.0122356877918892 A41 -G66 0.00922716097452625 I38 -V68 0.00857825849453775 A41 -V77 0.00651538645976713 A45 -T55 0.00644736595814255 A45 -V77 0.005972134495142 V42 -L49 0.00414882683757867 V77 -F85 0.00351089136196892 E51 -V60 0.00318960211568342 I38 -A43 0.00311991149020356 S44 -V68 0.00304537186064735 A45 -I82 0.00230651997591744 V42 -G83 0.00193417544065699 V42 -G66 0.00187000530777448 S31 -I38 0.00184096126629107 L33 -S44 -0.000806715402513081 E51 -D69 -0.000831478143449971 T39 -N67 -0.000862709936714445 V42 -T54 -0.00153036226105119 A41 -V68 -0.00201042173912924 A57 -K64 -0.00204658720046202 A35 -V77 -0.00304028698269221 L49 -G66 -0.00358890563226522 A45 -G83 -0.00444350852540865 G80 -G87 -0.00490748186266288 V47 -I78 -0.00503093806309618 G83 -P95 -0.00519708023497856 P40 -V47 -0.00591168819089827 A57 -I63 -0.00820918154050343 S44 -I82 -0.00840586369401386 A41 -S81 -0.0094963278843041 E51 -G59 -0.0100397590071206 L32 -G83 -0.0118021893504432 P79 -G87 -0.0118752564416731 F36 -E51 -0.0119989447791453 T39 -L49 -0.0127789373953888 V42 -I78 -0.0128489140066925 E51 -K64 -0.0138924181358042 P40 -A50 -0.0141107018711795 A41 -V52 -0.014374772977324 F36 -N67 -0.0145902483899176 S46 -E51 -0.0150187649937532 F85 -P95 -0.015220168722295 A35 -P79 -0.0156801280650567 A43 -F85 -0.0185512475160596 T39 -I63 -0.0189451877026237 A84 -P95 -0.0192312916531814 A41 -T55 -0.0199437162415799 A45 -V52 -0.0211465928895018 S58 -I63 -0.0215713898043419 S46 -T54 -0.0225163785542757 V42 -V52 -0.0230239717712442 I38 -N67 -0.0230981217077693 S44 -G87 -0.0261234884774539 S31 -T39 -0.0262869424813803 S31 -V47 -0.0270862720225438 A43 -V68 -0.0274025308327914 V42 -L76 -0.0289763248111718 A41 -P79 -0.0291534814064343 S44 -V53 -0.0304301493607801 F36 -F65 -0.0304647483006235 T54 -I63 -0.031544909452375 G87 -P95 -0.0326695514956619 L32 -G80 -0.0333201665999526 A88 -Q93 -0.0350782020519125 V42 -T55 -0.0355067899095811 T39 -L76 -0.035870651913859 A45 -T54 -0.0362860332841679 A57 -F65 -0.036828845542292 L34 -G83 -0.0393481524374746 A43 -V52 -0.0403757669803677 I38 -F65 -0.0418117560819993 T55 -F65 -0.0428800504379061 V42 -V53 -0.0441573956844821 E51 -I63 -0.0454491164987307 H48 -D69 -0.0466282086196563 T54 -G66 -0.0475438566168149 I38 -G83 -0.0476116520894774 S46 -I78 -0.0490742877002015 V53 -G66 -0.0491886671899788 E51 -S58 -0.0495020015086648 S81 -F90 -0.0505275014407713 V52 -L76 -0.0508666881007702 T55 -K64 -0.0515541342307015 S31 -P40 -0.0550017776253204 L49 -P79 -0.0573524091052757 A35 -A84 -0.0574286467813834 P40 -L49 -0.0574485714657911 V42 -G80 -0.0579614283242051 L49 -N67 -0.0584108636998653 A50 -V68 -0.0584349754290892 E51 -S61 -0.059500478546213 T55 -N67 -0.0602349404113944 S44 -E51 -0.0629781366129565 A43 -H48 -0.0650170702470607 P40 -G66 -0.0655866580507709 V77 -L86 -0.0669666706270347 P40 -G80 -0.0669935752759436 A35 -H48 -0.0676507816827439 T39 -V52 -0.0688099557706363 T55 -D69 -0.0690310115128956 P79 -A88 -0.0709064507390174 V60 -G66 -0.0716903914612068 T54 -V60 -0.0724023358057035 V47 -P79 -0.0737543364383125 L49 -T55 -0.0751746214445141 S58 -F65 -0.0753982541893863 A41 -E51 -0.0778531366915025 I82 -F90 -0.0804388360277764 V42 -N67 -0.0814791727751257 L76 -A84 -0.081644486020056 F36 -I63 -0.0824718365324522 A84 -Q93 -0.0838075725935949 I82 -L91 -0.0851010927645621 V60 -V68 -0.0866034670386691 L32 -G37 -0.087328086342815 E51 -L76 -0.0884866800191957 A43 -P79 -0.0890277396917432 T54 -H62 -0.0903623647884975 S44 -L49 -0.0909958740651504 I38 -L76 -0.0928353995451304 A41 -H48 -0.092928990461564 I38 -P79 -0.0977441288533138 A56 -F65 -0.0986726030431939 V68 -V77 -0.0989801949351083 V52 -V77 -0.0994296208422069 L86 -Q93 -0.103432385382038 S58 -K64 -0.103602332932143 G66 -L76 -0.103627165185189 L49 -I78 -0.104542257765307 G59 -D69 -0.105408500366713 F36 -G80 -0.108432922166239 I78 -G87 -0.109023236303307 S81 -A88 -0.109385327682245 L76 -F85 -0.109570808052278 F85 -L94 -0.10964969735112 F36 -V42 -0.109683062831957 L34 -V42 -0.11210514065727 G37 -I63 -0.11271165800128 V77 -A84 -0.113170596611536 A56 -K64 -0.114174791979274 F36 -A43 -0.116494669191745 V52 -F65 -0.116776557921401 A43 -S81 -0.121248040660562 A43 -L86 -0.126482444299674 G59 -N67 -0.129736766375409 S46 -L76 -0.130645117187907 V42 -I82 -0.131717658445899 A41 -G80 -0.131766516979858 S61 -N67 -0.133078991305519 H48 -T55 -0.134053406910163 G80 -L86 -0.13532862891878 V60 -D69 -0.13772236574831 F36 -V47 -0.138900570449165 A45 -E51 -0.139703728656252 F36 -V68 -0.141529882891456 L76 -G83 -0.141547536583449 A57 -G66 -0.142539376644189 E51 -N67 -0.144289115864215 V53 -V68 -0.144949648314141 A45 -P79 -0.145032946175578 H48 -T54 -0.145474281479901 S81 -G87 -0.149828124996128 S44 -I78 -0.15073361978545 P40 -V68 -0.151959058025354 F85 -L91 -0.15277642197674 A41 -I78 -0.15362727076314 G59 -G66 -0.154530099384124 H48 -A57 -0.155439475732091 H62 -V68 -0.155861363476819 F85 -S92 -0.15627495153505 V53 -D69 -0.158043513497353 E51 -A57 -0.158775943121016 G83 -F90 -0.159272338689026 A41 -D69 -0.160256772755919 I78 -L86 -0.160617826031068 A41 -V47 -0.160658038683954 S81 -L86 -0.162144854242149 G37 -N67 -0.164490338667578 F36 -H48 -0.167442486882258 T55 -I63 -0.168384803705386 S46 -P79 -0.169134479256895 V68 -L76 -0.169916873374813 S44 -P79 -0.170196080042491 L49 -D69 -0.171720144762147 T39 -V68 -0.172438421614475 A45 -F85 -0.176797950685792 V47 -L76 -0.17989287970071 H48 -G80 -0.181142102347419 A43 -A84 -0.181955091150398 A43 -G83 -0.184142162033651 A50 -A56 -0.184437139020162 L49 -S81 -0.188993605670491 E51 -F65 -0.190110134380714 A84 -F90 -0.192033009916958 T54 -N67 -0.196082757755163 I78 -F85 -0.196395780729808 S31 -F36 -0.197361177098229 S44 -A84 -0.198828294982133 V47 -T54 -0.200310319316301 V77 -G83 -0.201408981044928 S44 -A50 -0.203518236095773 V52 -K64 -0.2106636959279 G83 -A89 -0.211303204238215 A56 -S61 -0.212201098230003 L32 -H48 -0.217288469255157 I82 -G87 -0.226134963822824 L34 -T39 -0.226754133158134 G80 -F85 -0.228909867963579 T55 -V60 -0.230581969615693 A89 -L94 -0.234569431289669 T55 -G66 -0.235466121115894 A45 -S81 -0.236299293150736 G87 -Q93 -0.238883839692217 P40 -K64 -0.239268235856682 I78 -G83 -0.239786944444381 P79 -F85 -0.240381127132809 S31 -A43 -0.241441685828583 A88 -L94 -0.243409147573227 P40 -N67 -0.246516101819121 V53 -S58 -0.250595247129388 V47 -T55 -0.255186288224136 G87 -S92 -0.258918277509557 S61 -G66 -0.260902879127405 L32 -T39 -0.262556120728512 L76 -S81 -0.26376495674074 L49 -A56 -0.274686082953413 V60 -N67 -0.274768026415787 A84 -L91 -0.277800076368682 S46 -V52 -0.278480972811884 L49 -T54 -0.280779765235513 V47 -V52 -0.289077481770728 L33 -P40 -0.295123912052207 S58 -N67 -0.295681253266995 A41 -L76 -0.30013298850154 P40 -H62 -0.300175036977091 F85 -F90 -0.302726770608217 A89 -P95 -0.303119613988418 D69 -L76 -0.305531174301663 V52 -S58 -0.308742401778185 P79 -A84 -0.310967744901903 G87 -L94 -0.313082672012835 V47 -V77 -0.32186922872336 A88 -P95 -0.324060694327668 V47 -V68 -0.329228839940573 S58 -V68 -0.331560496183022 L32 -I38 -0.333897141333414 L33 -I38 -0.3343459964373 V42 -A50 -0.339128715889017 I78 -A84 -0.340972657170735 L86 -S92 -0.343109225179069 I82 -A88 -0.34492089984823 V47 -V53 -0.345632902724292 S44 -L76 -0.346502506462923 V42 -V68 -0.348408356366507 P79 -L86 -0.352534498622646 T39 -G66 -0.358823827396517 S31 -V42 -0.366287575277431 V60 -F65 -0.366340483123659 A35 -A43 -0.383328465313917 L86 -L91 -0.398922578240319 L49 -V68 -0.400408816615945 A84 -A89 -0.404879194692835 L76 -I82 -0.416640358612589 A45 -A50 -0.424297676667508 L49 -L76 -0.424319337961307 A35 -V42 -0.443786910558806 A43 -V77 -0.444206040825169 L34 -P40 -0.444576597961754 V77 -I82 -0.469820687729151 A45 -I78 -0.479196259196982 G83 -A88 -0.486611131645723 S44 -S81 -0.561673543138157 V52 -D69 -0.606622212078215