[Mon Aug 29 16:59:19 2016] >Input file: TMA0R026M1G.pdb >TM segments: 45-104 MAIDEN score = 6.8312 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V57 -V62 1.17828256520789 L56 -I72 1.10795998672866 L65 -F70 0.892596134667741 I89 -V94 0.857009921873164 V57 -I72 0.830973688436599 V80 -V86 0.781529539063611 V62 -I72 0.774438248236363 L48 -L53 0.75447694350146 T58 -F87 0.730566897771263 V80 -T90 0.711837031235985 F49 -M55 0.695776926440109 M55 -I72 0.69210782860869 I76 -T90 0.688702392062151 M55 -L73 0.68316457891879 L65 -I72 0.672909483183506 M81 -F87 0.666357770676555 L65 -P71 0.629164500694791 F78 -G91 0.613921048233007 F49 -A54 0.609892703790978 V75 -T90 0.585641402527525 G59 -S74 0.57837803230865 V80 -F87 0.569728617866825 L56 -V75 0.569531539966521 A46 -F70 0.519745791037324 L48 -M55 0.505604118808161 A88 -V94 0.504141897980559 I76 -R93 0.501208809760192 M81 -V86 0.482218938019026 I79 -T90 0.468406008941622 V57 -L73 0.461379420943687 V57 -V75 0.446663444022386 T58 -A88 0.440465304353673 A95 -K100 0.417344070395346 V80 -V85 0.409807300628437 V75 -R93 0.404854288049396 R93 -V98 0.362270315748458 A54 -I72 0.356394420691662 I79 -F87 0.346081507414913 M81 -V94 0.336433635386711 M55 -P71 0.332941656974159 V80 -A88 0.331100155497168 R93 -K100 0.326203209624436 G77 -A88 0.324649408106543 L48 -A54 0.324481270100646 A54 -L73 0.323332837957492 P92 -K100 0.32128996574042 K63 -P71 0.306861419241292 S74 -A88 0.305056072396359 G77 -G96 0.299686152558345 G45 -M55 0.298327694781145 V62 -L73 0.291426157200199 L56 -G97 0.283468923381518 M66 -I72 0.258635596045115 L56 -V62 0.254148819578967 A88 -G97 0.251566735267509 P92 -G97 0.249909473256153 G47 -G68 0.243778526775803 L56 -L73 0.24102204363454 G77 -G97 0.240620697106426 T58 -P71 0.235499524838823 L53 -P71 0.232615127680525 I79 -V85 0.222239039011872 F87 -A95 0.220149496954382 V62 -V75 0.219024341696152 G91 -V98 0.218010341399915 K63 -I72 0.215543443406703 I89 -A95 0.209009438830631 T58 -V75 0.20575771997933 G97 -S102 0.204014592570105 S74 -V94 0.186805179116681 L48 -P71 0.184003782346653 A61 -F70 0.181114585220877 L56 -G77 0.178461998042609 M55 -G68 0.17516863663985 T58 -G77 0.171787543304811 M55 -G97 0.171413572958968 G59 -I76 0.170155278167096 V75 -V94 0.168470129392267 A61 -V80 0.167018770356933 V86 -A95 0.165837222255317 G45 -G69 0.160859189564712 G77 -R93 0.159455730212092 V62 -A88 0.158983525550956 S74 -R93 0.158674809025682 V60 -V86 0.154664610249184 M55 -V94 0.153070266865523 G45 -L65 0.148663635502714 A95 -S101 0.146722253618845 G59 -V86 0.146381921579199 S74 -M81 0.144581714862219 G47 -A54 0.143088363438124 V75 -V85 0.142814648362303 G45 -A61 0.139646219954836 V62 -S74 0.133767514246351 V60 -M81 0.132905887015885 T58 -F78 0.131254525439925 V60 -V85 0.129072683358478 A61 -F87 0.128841797292303 A61 -G68 0.128233368751753 F49 -G69 0.126659728596318 A46 -V62 0.123371573967704 A46 -A61 0.123306482503597 V86 -P92 0.123203184078523 R93 -D99 0.117202187185375 G96 -A103 0.115913419753708 V75 -G96 0.11340871635863 A88 -G96 0.113015418606656 G77 -T90 0.11278751599354 L48 -L73 0.112313983414921 T58 -V85 0.110683410994749 V57 -G77 0.110533204128978 V60 -T90 0.109282005685498 V57 -G97 0.106036202466592 V62 -T90 0.105719632344535 A54 -G97 0.105464617993652 F78 -G84 0.105280190300637 G47 -I72 0.104785676571205 G59 -V75 0.104136630739569 V60 -I72 0.103985212228347 I79 -V86 0.103756234451549 G59 -I89 0.103550562529047 G45 -G52 0.101323656070942 G59 -F78 0.100811037468751 L73 -V94 0.100799156959154 G59 -G83 0.100314024633713 G59 -G68 0.100186303186736 T90 -G97 0.100002983207614 G83 -A88 0.0988679380853892 G59 -M81 0.0983505205675899 G45 -L73 0.0982653828016105 A61 -G69 0.0968758645399802 G59 -P71 0.0946882865193794 V75 -G84 0.0939595324390146 V62 -V80 0.0939034291828964 V57 -G84 0.0938943973714697 A88 -V98 0.0929720447963351 T58 -G97 0.0921808443238268 V57 -G68 0.0912750867331757 V60 -G68 0.0909777996044507 L56 -M66 0.0907569104305433 A46 -M66 0.0907475675334908 A61 -V86 0.090695366894805 V50 -G69 0.0903846466185256 F49 -F70 0.0902417686942893 G59 -T90 0.0894760707914085 V57 -F70 0.0864505044563035 L48 -V57 0.0859148118082094 L51 -P71 0.0847685590924296 G47 -L53 0.0840154598435 L73 -R93 0.0838118385966093 A61 -G84 0.0826912269290716 V85 -G91 0.0826174806196901 L73 -F78 0.0813777060549965 P92 -V98 0.077400862173948 F82 -A88 0.077358991489155 I79 -G84 0.0766919624745288 V57 -I79 0.0764518278264434 A61 -I76 0.0746188970086679 G84 -G91 0.0741290719177032 L73 -I79 0.0739923747070543 V60 -F87 0.0739529304687698 M55 -A64 0.0715881424101374 G84 -T90 0.0715101769807882 G96 -S102 0.0696064847121267 G45 -A64 0.0691552379103388 V57 -T90 0.0689990131123753 T58 -R93 0.0688543943793584 A46 -A64 0.0685130832761969 F78 -T90 0.0684533748575884 T58 -G91 0.0679130462518609 L56 -I89 0.0672044122237994 L56 -R93 0.0639389933785912 S74 -I89 0.0630163357565805 V62 -I76 0.0600606567110313 G77 -G91 0.0599472820702447 L56 -I67 0.0597461228391296 V57 -R93 0.0588561969077777 I67 -L73 0.0571739001408051 G47 -G69 0.0560570389404895 S74 -G84 0.0553830199640588 A61 -V75 0.0543770424412364 G77 -V86 0.0537914039303962 F49 -P71 0.0534683732386649 I76 -G97 0.0522388695658162 V50 -I72 0.0513598045906356 L56 -P92 0.0512718984405032 I76 -G96 0.0510466079426082 V60 -I76 0.0490661066969196 M55 -L65 0.0477981376415819 G45 -K63 0.0470233911433029 V50 -P71 0.0469067105006435 V75 -V98 0.0464691214231383 A54 -R93 0.046315898164115 A46 -V57 0.0451505852428955 L48 -G68 0.044905204421825 I79 -V94 0.0444306954858211 V75 -F87 0.0434826296879542 A64 -V75 0.0430571700451514 G52 -P71 0.042554070063447 V57 -V86 0.0414743980699281 L56 -A95 0.0406984572248013 F78 -G83 0.0404798226386682 V57 -G69 0.0400633229153859 V60 -G83 0.0393881208724647 K63 -V75 0.0384257541509309 T58 -M66 0.0374037533165965 T58 -M81 0.0368940850129054 V80 -R93 0.0363302026878165 M81 -T90 0.034510699105903 F78 -A95 0.0342101968693536 T90 -D99 0.0335165056506639 V75 -P92 0.0318139779306725 F49 -I72 0.0317406773938189 V57 -F78 0.030550154184269 G59 -V80 0.0295896755396132 L53 -L73 0.0289601592751918 F87 -P92 0.0288473841796555 F87 -R93 0.0275048069083343 A54 -V62 0.0272097853068578 F78 -I89 0.0268569347200889 L56 -F70 0.0267532627029781 G68 -L73 0.02470859454015 F82 -T90 0.0242582584181887 M55 -G69 0.0240189402668403 M55 -M66 0.0229664082438967 V75 -G97 0.0214795885662902 A64 -S74 0.0214525988476146 L56 -A88 0.020845041481909 I76 -V98 0.0182305411144341 G52 -L73 0.0170004885043271 L51 -F70 0.0167240923992851 V60 -I79 0.0165581367621735 V57 -I67 0.0160227761299723 F49 -V62 0.0155753079996588 F78 -V85 0.0147802973430333 G91 -K100 0.0145193266322988 G45 -V60 0.0143906239602041 M66 -P71 0.0130867730170523 G59 -I67 0.0120465187796901 A61 -A88 0.011906124292306 G69 -S74 0.0109172983895145 F78 -G97 0.00999908764674196 G97 -A103 0.0099371519333995 G59 -G77 0.00988976273872377 L56 -I76 0.0096994559378909 V98 -A103 0.00959245543066523 G77 -A95 0.00774157017493859 G45 -I67 0.00727987275113051 G96 -P104 0.00601411262040319 L65 -S74 0.00557829754511641 V62 -F87 0.00552260601856358 T90 -G96 0.00491349865253987 G45 -M66 0.00381145809595473 S74 -T90 0.003293955478469 I76 -V86 0.00269128903401716 A54 -A61 -0.000308910133954399 I79 -R93 -0.00045482466772917 G84 -I89 -0.00100363008436943 F49 -A64 -0.00136179260069103 A64 -F70 -0.00197204992234212 S74 -G97 -0.0020116870075304 V60 -V75 -0.00247185896110325 A54 -M66 -0.00353743146381746 M55 -I76 -0.00410567292109176 A61 -V85 -0.00440742757616697 F49 -S74 -0.00530365000969013 G52 -I72 -0.00538105828996538 G47 -L65 -0.00627480478104081 A54 -L65 -0.00652348487715138 G45 -S74 -0.00657840411441413 V75 -A95 -0.00716376397036966 A54 -V75 -0.00740343651563102 A46 -L73 -0.00753016267195061 T58 -G83 -0.00797296095176936 A54 -V94 -0.00896857471532697 V86 -R93 -0.00913113351069672 G59 -G84 -0.0100604081425786 V60 -A88 -0.0106660380314181 A46 -L56 -0.0114977310734412 V80 -A95 -0.0127779914099175 S74 -G91 -0.0139934426519116 T58 -F70 -0.0140453692239966 I76 -M81 -0.0146530503419311 L53 -L65 -0.0157524629771562 A54 -G69 -0.0162219383621496 T90 -A95 -0.0168933936848887 F87 -V94 -0.0171192664467918 L56 -F78 -0.0175513150552096 A54 -I76 -0.0179265808145932 T58 -I67 -0.0211249614180149 V75 -M81 -0.0213467941191068 V57 -V98 -0.0221575466254591 M55 -V98 -0.0226684298612181 G47 -L56 -0.0228238612384351 L53 -G97 -0.0246831532105429 L56 -G69 -0.0265918702431414 F49 -V57 -0.0271272748654865 M55 -V60 -0.02811112063557 V57 -A95 -0.0287063822806823 M81 -G91 -0.0298384697069436 G47 -P71 -0.0299035545176554 T58 -A95 -0.0304679512867936 L48 -G69 -0.0310663231317223 L73 -G97 -0.0319375994970432 K63 -F87 -0.0327425714755307 A46 -M55 -0.033913369815072 G83 -I89 -0.034191478090964 L65 -V75 -0.0365671464315804 L56 -A61 -0.0365992245437207 G47 -M66 -0.0373016647878277 A61 -P71 -0.037531522707118 L56 -V80 -0.0391963184453665 F49 -M66 -0.0397872546847182 G59 -F82 -0.0398946406180238 V57 -A88 -0.0430738576817378 M55 -A88 -0.0433122772730981 I89 -V98 -0.0437608526833557 R93 -S101 -0.044888066681243 G45 -V50 -0.0449115430755214 L73 -T90 -0.0483720511203689 F49 -G68 -0.0484070998995787 F78 -R93 -0.0486229192553527 L56 -S74 -0.0498838895768685 L48 -L56 -0.0501777844365012 L56 -G68 -0.0503392467677024 T58 -F82 -0.0510924010392202 F78 -G96 -0.051487501469166 I89 -D99 -0.0527685987540024 A64 -L73 -0.0528032966065961 F87 -G97 -0.0531891459564295 G52 -F70 -0.0532067612349025 F87 -G96 -0.053292498928189 V57 -V80 -0.053558416671768 D99 -P104 -0.0543314626067537 T58 -V94 -0.0547548784839904 I76 -G84 -0.0549275033301435 V62 -G84 -0.0551752436570743 G47 -G52 -0.055462573694105 G45 -T58 -0.0561290835541306 L56 -V98 -0.0565698914639103 A54 -V98 -0.0566835590192585 I89 -G97 -0.0575460335745532 S74 -V86 -0.0584767099660604 V80 -P92 -0.0607274472150428 A54 -S74 -0.0612693704097786 T58 -L73 -0.0617317092152483 G45 -P71 -0.0635845788437863 M55 -A61 -0.0684456977061458 I76 -A88 -0.0686393601239548 I76 -I89 -0.0702409311188559 G83 -T90 -0.070566274144941 T90 -V98 -0.0707272973300255 L56 -G91 -0.0710032791743593 G59 -F70 -0.0724907524016412 F49 -L65 -0.0726139336228409 I89 -K100 -0.0739112438958216 V60 -P71 -0.0766205353298444 A61 -L73 -0.078024890899802 V60 -G69 -0.0781137718907807 L73 -A88 -0.0782196994119335 I67 -S74 -0.0793773659454279 I76 -A95 -0.0794576471923225 V57 -G91 -0.0803386396607335 L48 -I72 -0.0813282698658124 I79 -P92 -0.0828226699815597 F78 -V94 -0.0840760054598997 K63 -S74 -0.0849474455224877 L48 -M66 -0.0861649649637062 L51 -I72 -0.0869580163020292 G97 -P104 -0.0870412784586539 F49 -L56 -0.0888290842579949 G77 -V94 -0.0891328452695315 V50 -L56 -0.0891573958818057 A46 -I67 -0.0896322339758249 G59 -A88 -0.0898104020695873 A46 -P71 -0.0906187725521744 K63 -F70 -0.0918162269352987 F78 -P92 -0.0918488475269137 I79 -I89 -0.0920670983891299 L48 -L65 -0.0922425493828616 V50 -G68 -0.0935771624499711 L56 -F87 -0.0939837637326519 V80 -V94 -0.0954917861922288 V94 -S101 -0.0971834659634832 L56 -I79 -0.0980076239582437 L56 -P71 -0.100569792480919 G47 -M55 -0.101310666601408 G59 -V94 -0.102514363719314 L73 -V80 -0.102794172699885 L56 -G96 -0.102893998498717 L53 -V98 -0.103001114991366 V57 -K63 -0.103638308407371 V62 -F70 -0.104773674144328 F82 -I89 -0.104953475934241 V60 -I67 -0.105286329105664 V75 -V86 -0.105288706949794 G91 -G97 -0.105807047324895 G45 -G68 -0.106256208098851 L56 -A64 -0.107366744109555 V86 -V94 -0.10846518219676 L48 -V62 -0.108901808902395 V50 -L65 -0.110495404393095 V80 -G91 -0.111754698956293 A46 -G68 -0.11248885958338 G91 -G96 -0.114118158353913 T58 -K63 -0.116097895074075 V62 -G69 -0.116645319189104 L51 -L56 -0.117086504810299 G91 -D99 -0.11809104424498 F82 -G91 -0.118449554337494 F87 -V98 -0.119331492243838 T58 -V80 -0.120061818733818 A88 -D99 -0.121684433080263 G45 -L56 -0.122585679848905 M66 -S74 -0.122702276736577 L56 -T90 -0.12271647074222 G59 -M66 -0.123738892902277 V62 -I79 -0.123876294036304 V94 -D99 -0.125279137864376 L73 -F87 -0.126328081215937 G45 -V62 -0.128760151830798 G45 -V57 -0.129424372150218 S74 -F87 -0.130488670190446 G96 -S101 -0.135156817019973 L53 -F70 -0.135193391857912 V60 -F70 -0.141453729067294 A46 -K63 -0.14258738423197 A64 -P71 -0.143935411735725 V62 -P71 -0.144659731017692 G59 -V85 -0.145959009055865 V80 -I89 -0.148601081067802 M55 -K63 -0.149566802358935 A46 -L65 -0.150670751772795 V60 -G84 -0.150913631007528 K63 -G84 -0.151808243407281 G45 -L53 -0.153605070800555 F78 -A88 -0.154774389018618 M55 -S74 -0.155128969165463 V85 -T90 -0.155529889723471 A61 -I72 -0.156469150403977 A61 -S74 -0.156850675414486 I79 -A88 -0.156929130845883 M66 -V75 -0.162730803449138 G77 -P92 -0.163372160842941 G77 -F87 -0.163377723941065 G47 -F70 -0.164041910055718 F49 -L73 -0.164291763014366 L53 -S74 -0.165405702862464 L48 -F70 -0.166716267398369 M55 -F70 -0.169398075337085 P92 -S101 -0.170217837025481 A54 -F70 -0.177413795171206 F78 -F87 -0.177744354219769 K63 -G69 -0.179949483288454 I67 -I72 -0.182067747967473 T58 -S74 -0.184765330551996 G59 -L65 -0.184848860976734 V60 -L65 -0.18767244859044 A46 -I72 -0.188022849139659 I79 -G91 -0.189660174199993 V86 -G91 -0.191396223485246 G77 -I89 -0.193257561337717 A46 -A54 -0.195769472306899 V50 -F70 -0.195880443424647 A88 -R93 -0.196309825455502 L56 -K63 -0.196738503290549 T58 -V86 -0.200551332482156 V75 -G91 -0.201511091103094 M81 -A88 -0.202650748589987 V60 -V80 -0.203262614511987 T58 -A64 -0.203620224556963 V62 -G68 -0.203833739245848 K63 -V80 -0.205441808869668 V94 -K100 -0.206864719052317 M55 -I67 -0.208317649094875 V50 -M55 -0.208405103902297 G59 -I72 -0.213157517179265 A46 -G52 -0.214349666955025 M55 -R93 -0.217666266401984 V60 -L73 -0.218174247160731 V57 -I89 -0.219745728870251 V57 -P71 -0.220055071615044 G59 -A64 -0.221053443652945 I76 -G91 -0.232254342302772 G45 -F70 -0.234781640626222 T58 -G84 -0.238003158818447 A64 -G69 -0.238736835159422 K63 -L73 -0.239464985600216 T58 -I89 -0.240555949197298 L65 -L73 -0.243852552751535 V57 -A64 -0.244158528585938 T58 -I79 -0.246797741895461 G59 -F87 -0.249392735749382 I89 -G96 -0.250885981969113 T58 -L65 -0.251361576367935 G59 -I79 -0.253060503785719 V57 -S74 -0.253278156898924 G45 -I72 -0.253799411007442 L53 -I72 -0.261062286470752 I76 -P92 -0.261583553744648 G45 -A54 -0.264411721140317 S74 -V80 -0.264858299503094 I76 -F87 -0.266760993319548 A46 -G69 -0.269341331268443 A54 -P71 -0.271430279305905 K63 -G68 -0.278801379444444 V75 -V80 -0.291888158448193 V57 -M66 -0.293588509054518 V57 -V94 -0.299177179556693 A61 -M66 -0.29938240135349 A46 -L51 -0.303094137574707 A46 -L53 -0.313169863451312 M55 -V62 -0.313976614796528 T58 -I72 -0.334256065210569 G59 -L73 -0.334842010305378 A61 -I67 -0.338119193998593 A64 -I72 -0.338464527326919 G45 -L51 -0.341639144005488 S74 -I79 -0.342028215704249 V60 -S74 -0.34927847921224 V60 -M66 -0.349830446679855 T58 -T90 -0.35250988645002 F78 -V86 -0.352984261697987 M55 -V75 -0.361850704018929 M81 -I89 -0.377131396179656 V57 -F87 -0.377284683396055 P92 -D99 -0.38601871159012 V57 -L65 -0.394572182747858 A88 -A95 -0.400262603534658 L56 -V94 -0.405877920770601 V57 -I76 -0.406282402999689 T58 -I76 -0.418485650155505 I76 -V94 -0.423928906087493 M66 -L73 -0.424245689792635 F82 -F87 -0.438939825328105 L56 -L65 -0.448306180743197 V75 -I89 -0.449814852367364 V75 -A88 -0.453206312588648 V62 -I67 -0.479089677515016