[Fri Aug 26 16:52:03 2016] >Input file: TMA0R431M1D.pdb >TM segments: 12-37_ 39-59 MAIDEN score = -18.5964 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- R35 -L40 1.44991733115419 A24 -P54 0.880370699703103 L21 -P54 0.774451108638042 V18 -A23 0.530776240528223 V20 -A53 0.415284088619167 V36 -A41 0.37537267364984 I34 -L40 0.363750230442946 H37 -G43 0.288798626217073 L22 -G51 0.283305690447134 V28 -V47 0.281655790985955 L33 -G43 0.27951947165841 L29 -G43 0.271443010260814 A24 -G50 0.271006379755468 A15 -A23 0.250820834049531 A53 -G58 0.241802123615288 R35 -M46 0.229508293159784 G16 -V56 0.221999554732181 G32 -N45 0.208911243776777 L33 -M46 0.190195471433487 L40 -N45 0.189503822171378 G43 -A53 0.16528310009388 L39 -M46 0.16477215087606 A24 -G43 0.161636831452177 A19 -G50 0.160549089255443 N45 -G51 0.159086146765719 G30 -L40 0.15684133373153 A23 -G51 0.153160332491262 L44 -G51 0.150914410841462 L52 -G58 0.146505132760453 T13 -T55 0.143621176497363 V14 -V56 0.140536282822602 L29 -V47 0.128106764907483 I26 -L52 0.126477718520792 G30 -M46 0.124068167619555 A19 -A53 0.122998820058179 L22 -L52 0.117200375836837 L29 -L40 0.114445708335626 V27 -I34 0.11441238765622 V28 -T55 0.112893088575976 R35 -I42 0.109874650963486 V20 -G50 0.109439307452476 V36 -G43 0.107853846128557 A41 -G50 0.106777710605157 G30 -A41 0.106100309149653 G32 -A53 0.105951228518127 L29 -G51 0.105531092068923 L39 -L44 0.105059937544769 V28 -G51 0.102232965386507 V28 -L40 0.101699530578014 G30 -G43 0.101149902393449 V18 -A53 0.0991078056502896 V28 -L44 0.097135123039894 L44 -L52 0.096366919399725 L29 -A53 0.0958840559187341 G30 -H37 0.0955603001998577 R35 -N45 0.0922860344891339 H37 -I42 0.092069620482494 A25 -V47 0.0912745134601023 V28 -I42 0.0901409177760905 G32 -V49 0.0896572123963635 A25 -A48 0.0894947063070015 V28 -L52 0.0893682149695465 A23 -V56 0.0891566327940079 V28 -A48 0.0887610577843992 G16 -T55 0.0879684727356373 R35 -L44 0.0859673307650203 G32 -G51 0.0857705030012261 I34 -A41 0.0852722662368599 G43 -G51 0.0837101537670262 G30 -G51 0.0834353738631897 A24 -G32 0.0827209478613025 L29 -A41 0.0823756742647515 A24 -M46 0.0822843846589851 V31 -G51 0.0822245581049985 V31 -I42 0.0777145721650179 L29 -V49 0.075351813343983 V31 -V49 0.0753477650154899 L21 -V49 0.0747060929783045 L29 -P54 0.0746137945019548 I26 -V36 0.0729671308428761 A25 -M46 0.071292405299249 I26 -A53 0.0712373207731765 A23 -G30 0.0711727211499751 G30 -G50 0.0697800463889948 F17 -L52 0.0663616894284327 L29 -I42 0.0658869242792548 A25 -T55 0.0645751294149854 A25 -R35 0.0640408279297711 V49 -P54 0.0622964735013194 F17 -V56 0.0606074357130897 V27 -P54 0.0605323743035429 L22 -G50 0.060307450356256 G32 -L44 0.0600020196691635 A19 -V56 0.0583726627632206 G30 -A53 0.0563263299698795 V28 -N45 0.0543411468726589 V27 -R35 0.0528900340353761 G30 -V49 0.0522321880129211 G16 -P54 0.0520947310876956 V49 -G58 0.0504327340340575 V20 -G58 0.0502806778291498 V18 -G51 0.0497735169904461 V47 -P54 0.0476883908285046 I26 -G51 0.0471278967262165 L22 -G30 0.044456015228902 V27 -A41 0.0437547232226052 R35 -V47 0.0397768039501005 F17 -G51 0.0385397914641654 L21 -L29 0.0380826637988232 A24 -G51 0.0346862167374571 V31 -A48 0.0321789374940211 A24 -A48 0.0306792322627061 A23 -V31 0.0300422228817609 A48 -P54 0.0288491307286032 V36 -L44 0.0287245899392019 V36 -V47 0.0264528332221707 T13 -V56 0.0261608147136805 G43 -L52 0.0243360613773653 V18 -L52 0.0237425972338434 A24 -V47 0.0229374624412249 A41 -V47 0.0227542569203782 G30 -R35 0.0210518361815653 L29 -H37 0.0204282512427726 V27 -T55 0.0200568061723363 V18 -T55 0.0178021357145539 G50 -T55 0.0155910870081144 M46 -P54 0.0154841265244712 A41 -V49 0.0135916130165992 L33 -G50 0.0118994397298726 V36 -M46 0.0081868835752692 G16 -A25 0.00795191012585628 L22 -T55 0.00737992253589681 A25 -V49 0.00668745097427148 V28 -V36 0.00641010427274535 G30 -L39 0.00529222054516598 I42 -A48 0.00290681030161678 I42 -G50 0.00219605690315383 I34 -G43 0.00207915997868557 A24 -A53 0.00180661130351112 L22 -G32 0.000428998447270401 V27 -M46 -0.000394384527679481 V27 -G51 -0.000980065623066295 V20 -P54 -0.00223365597325031 G32 -I42 -0.00228201767069081 N45 -A53 -0.00440696184829217 A25 -L52 -0.00538640408022761 A15 -P54 -0.00605550332610738 A24 -V56 -0.00670021953018951 A23 -V49 -0.00719893013589812 A19 -V27 -0.00763075234733157 A23 -G50 -0.00778452309821454 I26 -P54 -0.00885312081408629 T13 -L21 -0.00897367092870915 V28 -P54 -0.00995033998123329 A41 -A48 -0.0103612747780923 V14 -A23 -0.0119639117063317 V27 -G43 -0.0132576421837749 I34 -L39 -0.014237439659647 I26 -G32 -0.0166655867891166 G16 -A53 -0.017293158981956 V47 -T55 -0.018136951397679 G30 -V47 -0.0192062314670096 V28 -A41 -0.019377428350736 G51 -V56 -0.0194603792258925 R35 -G43 -0.021338859890343 F17 -A53 -0.0225059934680223 G16 -A24 -0.0229079293168428 L52 -W57 -0.0249638350544323 V28 -G50 -0.0251965982441908 G32 -A41 -0.0252252111061324 V31 -A53 -0.0253583323604524 A19 -V28 -0.0253805803211913 A15 -A24 -0.025657392223617 F17 -A25 -0.026157855427408 F17 -W57 -0.0262607623466784 V28 -M46 -0.0266306206485654 V36 -N45 -0.0273616469799796 V14 -P54 -0.0292016281253349 I26 -V47 -0.0299826434333408 V31 -N45 -0.0350748893707773 V27 -V36 -0.0378287902245071 V18 -V27 -0.0389007348435166 V20 -W57 -0.0395236910773278 A23 -G32 -0.0402125118039987 V27 -A48 -0.0421776713171078 L29 -L52 -0.0435293308306264 V49 -V56 -0.043922406836984 V18 -V56 -0.0443564931470759 V20 -V49 -0.0444207943777938 G32 -A48 -0.0446725079664825 A15 -V56 -0.0449243450798749 A25 -L33 -0.0459335801581044 A19 -G51 -0.0478554276786856 T13 -W57 -0.0495862138161687 I42 -G51 -0.0514607027751359 L21 -A48 -0.0542402717505572 A25 -G43 -0.0606465208803698 N45 -L52 -0.0607886695600097 A53 -W59 -0.0639241470773153 L29 -M46 -0.0664801312788299 L40 -M46 -0.0682123686139353 V14 -L22 -0.0690069326542808 L29 -L44 -0.0706559892626473 A25 -G50 -0.0736724005721463 V31 -G43 -0.0749307598763638 V28 -A53 -0.0755483480817092 I26 -V31 -0.0768851971491458 V31 -V47 -0.0827537053035174 A23 -L52 -0.0850573422078442 A25 -G32 -0.0855874595194281 L40 -V47 -0.088401391882468 G16 -A23 -0.0891920461122808 A19 -P54 -0.0897618839000262 L29 -A48 -0.0900380008536894 G50 -V56 -0.0901137970394186 V31 -H37 -0.0902261552848787 V20 -V28 -0.0920367021138488 G30 -I42 -0.0929123183503964 A41 -M46 -0.0942977109440886 G32 -M46 -0.0952723670380493 V27 -V47 -0.0971605159275785 L44 -G50 -0.098207319791473 A24 -G30 -0.101412442172444 V18 -I26 -0.101641981700427 L21 -G50 -0.102187696857017 L22 -V31 -0.102565676797956 A24 -T55 -0.103260110125361 L21 -V47 -0.103527263738352 A19 -T55 -0.104271832231487 L33 -V47 -0.104367384100946 V20 -L29 -0.104776232823773 T13 -L22 -0.10482002384855 L21 -G30 -0.105455511555147 V31 -L44 -0.10594049213786 V27 -V49 -0.107188007173235 L33 -I42 -0.109893632241204 A24 -V31 -0.110474157823058 G32 -L39 -0.110908456487776 F17 -A24 -0.111591081072679 G43 -A48 -0.111686203874586 V28 -G43 -0.111752236430035 I26 -V49 -0.112258604954586 V31 -V36 -0.113325541128207 A24 -L29 -0.113531275160897 V31 -L40 -0.116348607499344 V31 -G50 -0.116448900686164 M46 -A53 -0.119966669581226 F17 -P54 -0.120595934709557 N45 -G50 -0.123344859499261 I26 -M46 -0.124467762312154 L29 -R35 -0.125775463669397 R35 -G50 -0.126247861666038 A48 -T55 -0.12652203320707 V27 -A53 -0.127075527065465 G43 -G50 -0.127385332927434 A23 -T55 -0.12740386700473 L12 -L21 -0.128355848919217 L21 -V56 -0.13047677577481 V20 -G51 -0.132433065765777 A25 -P54 -0.135527945049258 L22 -A53 -0.139814807826419 V31 -A41 -0.141426717530578 F17 -I26 -0.142869367490816 L44 -V49 -0.145181150146371 A25 -I34 -0.145723420909342 L12 -V20 -0.14648383156397 G32 -V47 -0.146670483924842 V14 -A19 -0.146835792552832 G32 -G50 -0.150360602117293 V28 -R35 -0.150978404545944 G43 -V49 -0.152900075182188 P54 -W59 -0.154982080139721 A24 -L33 -0.159080181414178 A15 -L22 -0.161682085248691 A19 -L52 -0.163653992875757 I26 -R35 -0.164735883664765 A25 -A53 -0.166484106004472 L33 -A41 -0.169092854444183 V31 -L39 -0.173539828135192 A19 -A24 -0.174449465346347 V27 -L33 -0.183749995947553 V27 -L52 -0.18629894521624 L22 -L29 -0.187914422365073 L39 -N45 -0.189619789775428 L33 -L39 -0.190030622796696 V31 -M46 -0.190190103168173 G16 -W57 -0.190789343178689 G32 -H37 -0.191454552917717 A19 -I26 -0.195109733363631 T13 -V20 -0.195673494768362 V18 -A25 -0.197105559482067 L21 -G51 -0.198494531959449 G30 -V36 -0.203435011687401 V49 -T55 -0.205280407338377 I34 -M46 -0.210441960567666 T13 -P54 -0.213114760826411 I42 -V49 -0.215958178428969 I42 -V47 -0.217933314377458 V18 -P54 -0.219642255626237 T13 -A19 -0.221819929745653 F17 -T55 -0.22207507918863 L21 -L52 -0.225854880341481 G32 -G43 -0.226167925164495 L21 -T55 -0.226242350070019 V27 -G32 -0.228507499042306 L33 -L40 -0.232494188765187 V27 -G50 -0.235799689326909 V14 -L21 -0.237758278184014 V20 -T55 -0.237835609308652 A23 -A53 -0.239680137071725 T13 -V18 -0.240639424219295 I34 -I42 -0.24322985388639 M46 -G51 -0.243989146523958 I26 -G50 -0.245925557792789 F17 -L22 -0.247580148392242 A19 -A25 -0.248933691609896 F17 -A23 -0.253109275349868 I26 -I34 -0.253909283671409 V28 -I34 -0.266720610536353 L21 -A53 -0.27097749067932 V28 -V49 -0.27259341088453 L21 -V28 -0.272621175695157 L12 -A19 -0.275867675439941 V28 -H37 -0.276226725807857 L29 -G50 -0.277220628849244 V47 -A53 -0.281011007689305 V20 -L52 -0.287268469487389 L12 -F17 -0.293813033203913 V20 -A25 -0.29562028083178 A24 -V49 -0.29590396413307 A15 -L21 -0.297486175023222 A23 -L29 -0.298206441638365 A24 -L52 -0.302697582269057 V20 -V27 -0.317320809748226 I26 -L33 -0.31739869001125 V14 -V20 -0.3305372810225 G16 -L22 -0.337889123132455 V20 -V56 -0.352290702679718 V18 -A24 -0.352314129805032 A25 -V31 -0.363922258864703 G16 -L21 -0.36625784013518 L21 -V27 -0.371332971644407 A23 -P54 -0.37838482451495 V20 -I26 -0.381627918044096 G32 -L40 -0.383832429820124 L21 -I26 -0.383860229313749 A48 -A53 -0.385587333216975 L29 -I34 -0.386647553386862 V47 -L52 -0.388703448957509 A23 -V28 -0.392311824698645 A25 -G30 -0.392446659741017 L22 -V28 -0.398401395181943 L29 -V36 -0.405140840089077 L12 -V18 -0.405549684301438 L22 -P54 -0.433596356880039 V28 -L33 -0.436800939175239 L22 -V27 -0.437622254439862 A15 -V20 -0.453094681830532 M46 -L52 -0.458067456606415 A25 -G51 -0.470918664967956 V36 -I42 -0.484411463270645 R35 -A41 -0.671952381555355