[Mon Aug 29 17:26:40 2016] >Input file: TMA2Q3K0M4G.pdb >TM segments: 485-537 MAIDEN score = -3.2073 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- I493 -E524 1.28760928317143 D490 -L522 0.891609071253841 Q526 -L534 0.837694687959754 Q525 -F530 0.675104900940636 D490 -E524 0.660975993238815 V499 -A529 0.61972049089352 D498 -L528 0.589910306728804 I493 -R527 0.572295318971895 I493 -L528 0.555924951773542 L510 -V519 0.552080953125834 D490 -Q525 0.514728026469276 T513 -V519 0.498438594842974 Q525 -L533 0.488875369523109 D498 -F530 0.478867024796063 Y503 -Q525 0.462539469733908 Q525 -K537 0.442303538014067 D511 -V519 0.425399674229286 L510 -S518 0.418040510049272 R527 -L533 0.416906081867519 K486 -Q525 0.415910236017031 R500 -L505 0.40740183493403 T513 -S518 0.399277101586993 T489 -S521 0.371598474821366 E497 -F530 0.338681298492121 F508 -E515 0.325740602631872 V499 -R532 0.320290561891317 Q526 -A531 0.317589032474392 P487 -K494 0.314281957677909 E497 -L528 0.307971775973507 I493 -D498 0.301936159903381 P506 -T513 0.289112865472715 D490 -R527 0.277200431424055 G502 -A529 0.272632201655703 K488 -K494 0.249624795933071 T489 -L505 0.241890072735398 K494 -R532 0.23504925223967 L501 -A529 0.233548388279018 E515 -L520 0.233286394144157 K488 -Q525 0.232333377024241 K486 -L520 0.231772287305607 E497 -Q525 0.227860575220986 G502 -Q525 0.225931342659257 L501 -L533 0.225147428886908 T489 -L520 0.223933765656359 K494 -Q525 0.222292354604885 S518 -G523 0.217438376962891 I493 -V499 0.215307098383098 R500 -R527 0.210050073330663 P487 -Q525 0.208196385397352 T489 -G509 0.207801888080466 I493 -I504 0.202127851681213 G509 -S521 0.193784353077833 T513 -L520 0.191657462373613 K488 -I493 0.190961173512214 K488 -S518 0.188362893125298 D498 -K537 0.18689442426563 K488 -L496 0.184147010354842 L522 -K537 0.183252201714075 P487 -S517 0.182661050624983 K486 -E515 0.18106510875473 D511 -K537 0.179530560688899 D498 -R507 0.175902806787934 D490 -V519 0.174388972918225 P506 -L522 0.170185798677899 E497 -A531 0.170092483077959 R500 -S536 0.168277399643283 K486 -E524 0.166808860819345 D498 -L533 0.164232255157145 M485 -D490 0.160705094540148 G523 -L534 0.158726497911731 D498 -R527 0.156943644779617 Q526 -R532 0.155644058583173 K494 -S521 0.151912041126234 L501 -Q525 0.149916124545889 G502 -G509 0.146879784531814 R507 -Q525 0.14630951696274 K494 -L505 0.14614034716393 V499 -S536 0.145421806238964 P506 -S518 0.14493435431551 I495 -Y503 0.142062833185366 K486 -F508 0.137366366152953 I495 -L505 0.13653727557393 R500 -A531 0.133696555842187 P487 -G523 0.132308560385637 R500 -F530 0.131909680012332 I493 -Q526 0.128857252342716 V499 -L535 0.127821272959694 I504 -S536 0.126934317425967 L505 -S512 0.126198746351391 I504 -E524 0.125481378294217 K494 -A529 0.125424957385038 I495 -Q526 0.12353957473834 L528 -L535 0.122202119368012 L492 -G523 0.120899649366025 S518 -Q525 0.120331471360256 K486 -L522 0.119290314866954 D498 -S536 0.119110909280022 T489 -R507 0.1172732073836 E497 -A529 0.116958369795019 R500 -Q526 0.116902016963708 F508 -Q525 0.115075476079994 E491 -G523 0.113765660295928 E491 -I504 0.113248760393391 M485 -E491 0.111939309793057 L528 -L534 0.111810661549802 K494 -L533 0.111671810715273 L492 -L505 0.111628472810639 L501 -K537 0.111225087523323 Q525 -L535 0.109366538411076 I504 -Q526 0.108792953153385 P487 -L520 0.106966043918603 G502 -A531 0.106592816526576 V499 -Q526 0.105386370674844 L492 -S521 0.10465724666538 R507 -T513 0.104507160852737 E524 -S536 0.104259084385331 D498 -L535 0.103872551925639 E497 -R532 0.103540119499149 R527 -R532 0.103308356256976 S517 -G523 0.102148059197946 D498 -R532 0.10195479929237 T489 -S517 0.101318088465198 E524 -R532 0.100781900004119 V519 -Q525 0.099629855965534 F508 -S536 0.0987858738301153 L522 -A531 0.0984513685489858 L496 -L522 0.09776848470913 D490 -S518 0.0968610302594246 E524 -F530 0.0966629438201121 S512 -S521 0.0959294597034086 K486 -L510 0.0953669419935639 S521 -A529 0.094643621924718 V499 -L505 0.0946404698588417 L492 -E497 0.0943477500542816 P487 -V519 0.0938293174394476 L505 -S521 0.0937305477168651 E491 -S521 0.0925713536936508 L522 -A529 0.0923073988626535 R500 -P506 0.092002834919906 I504 -L534 0.0916985965487402 P487 -S518 0.0911374808915397 L496 -L533 0.0911159481089885 L522 -L534 0.0900351876689061 F508 -S517 0.0891683563850023 P506 -V519 0.087946334610904 D490 -R507 0.0874482041267672 T489 -V519 0.0871721445945557 G502 -K537 0.0852333432554763 L492 -L501 0.0850218091408559 K494 -G523 0.0844529719611256 T489 -Q526 0.082498932951518 K494 -F530 0.0820027925853037 G509 -W516 0.0816883158091715 L522 -R532 0.0816502724462511 P506 -R532 0.0799557086013705 L492 -V499 0.0785128348710185 E491 -E497 0.078011232044557 E491 -R527 0.0774890876663679 D511 -S521 0.0772039368182564 S518 -E524 0.0769155125280951 L505 -F530 0.0750614637504321 I495 -I504 0.0749604995061919 L505 -L528 0.0744766878883922 D490 -I495 0.0744741209934405 G509 -G523 0.0740861075124556 L496 -G502 0.0731609964677951 R507 -L522 0.0723072275601538 P506 -Q525 0.07108590621643 Q525 -R532 0.0701578214135847 H514 -S521 0.0701124383604604 D498 -L534 0.0693435685616492 E491 -Q526 0.0681437765382067 E497 -E524 0.0673881985871931 I493 -L520 0.0663879159733778 G523 -R532 0.0660539328169851 E497 -Q526 0.064064259256714 L496 -R507 0.0638257111344265 E524 -A529 0.0626013490829001 T513 -S521 0.0603704657401507 L492 -R527 0.0597458382958163 D498 -A531 0.0593996786883704 L496 -F530 0.0593897410790927 L496 -Q526 0.0593742614623212 L510 -G523 0.0592334153470359 G509 -S536 0.0591082205401054 I493 -G502 0.0572336423372942 L510 -W516 0.0569416387098736 R507 -S512 0.0567990084950347 L505 -L535 0.0563318945391567 G509 -L520 0.0556420516055421 I504 -S521 0.0537909131406695 G523 -A529 0.0526461931422197 L496 -L501 0.0521538719184251 E491 -D498 0.050510181732462 G509 -S517 0.0502015779440701 E524 -L534 0.0499592853195598 E515 -S521 0.0492753953006062 F508 -L533 0.0488256701504497 K486 -W516 0.0482797789755345 L505 -L533 0.047591900240842 H514 -L520 0.0463841629050671 F508 -H514 0.0456926125292476 D511 -S517 0.0449572592075543 F508 -G523 0.0440653890061418 K486 -T513 0.0428296708966832 G523 -S536 0.0428120318015274 D511 -S536 0.0425117895931206 L505 -G523 0.0422979884742327 I493 -R532 0.0421360435069036 D498 -E524 0.0397068108599545 V499 -Q525 0.0388251170457148 D490 -L505 0.0383667977807813 R507 -V519 0.0382313211865104 L505 -Q525 0.0364451315119361 L522 -S536 0.0360498893400838 T489 -D498 0.0359766456822684 P487 -F508 0.0351935906986656 L501 -E524 0.0351433806051031 G502 -Q526 0.0347677830609427 D511 -L520 0.0341535861834004 L505 -A529 0.0329044277565664 L528 -S536 0.0328611398212413 L520 -Q526 0.0327091713790084 G509 -E515 0.0305061662507136 Y503 -L533 0.029409765036732 I493 -Q525 0.0276826284599743 D490 -D498 0.0275107302038138 Y503 -S536 0.0273147901503445 I493 -P506 0.0267377869216026 I495 -L522 0.0246655460899472 K494 -V499 0.0237435888688196 I504 -K537 0.0235266208456973 G502 -L510 0.0231720253501657 I495 -R527 0.0227443063681285 F508 -E524 0.0216716291114456 I504 -R527 0.0206001572337302 G523 -K537 0.0198696373486467 K486 -S518 0.0193843716209541 P487 -L522 0.0191717329267185 K488 -F508 0.0186842943497177 I493 -L510 0.0184855076601123 L510 -L533 0.0176329933867869 V499 -R527 0.0175834472003387 G509 -V519 0.0175666035546449 D490 -G523 0.0163198129519468 V519 -E524 0.0160306677074478 Y503 -G509 0.0156313248678064 L505 -L534 0.0154900608259005 D490 -S517 0.0153378941799701 V499 -F530 0.0140101491305398 E497 -L533 0.0126272906533249 S512 -S517 0.0110142246731461 R500 -L528 0.0106538586522293 R500 -R532 0.00972906549208541 S521 -L528 0.00892930915656365 L505 -L520 0.00883236228702344 M485 -G523 0.00849090877079561 S521 -R527 0.00842493106319164 K488 -S517 0.00826667778619061 T489 -G523 0.0077644408258013 E524 -A531 0.00769685931256436 F530 -S536 0.00686566819544687 L501 -R527 0.00631451270634376 I504 -A529 0.00601496212044106 P487 -I495 0.00553013433274718 L522 -L535 0.00462467889887463 K486 -E491 0.00446137216648568 T489 -L528 0.00270957995720433 Y503 -R532 0.00102032729299761 T489 -R527 0.000349300115753515 E491 -L522 -0.000765478121746543 L496 -G523 -0.00108049588557591 Y503 -A529 -0.00112564036929186 K488 -G523 -0.00146501963985579 T513 -L522 -0.00159475333232795 G502 -L528 -0.0021344613265315 L492 -I504 -0.00289272335511104 R532 -K537 -0.00366889439400442 G502 -L534 -0.00467454214420582 L501 -R532 -0.00481071824938706 G502 -L522 -0.00657259196985471 E497 -L505 -0.00824800110691415 S517 -E524 -0.0107798914254625 I493 -V519 -0.0112534037847656 F508 -S518 -0.0113357978793269 T489 -L510 -0.0113404124277237 L505 -E524 -0.0115172376182692 I493 -L505 -0.0120523152005458 L505 -L510 -0.0125095648375906 M485 -L520 -0.0128210530564346 D511 -G523 -0.0138665921903587 E491 -L528 -0.0139554238494197 L492 -E524 -0.0146790249775082 L520 -Q525 -0.0149452433474764 H514 -V519 -0.0166419125378965 K488 -L520 -0.0168861370013547 L501 -G523 -0.0175496386508005 L496 -L505 -0.0199303550118648 M485 -V519 -0.0210001372013608 M485 -W516 -0.0214525276417037 L501 -F508 -0.022103067326781 T489 -Y503 -0.0224513958633672 T489 -Q525 -0.0232217883455985 T489 -A529 -0.023496265061854 D511 -W516 -0.0246784538170375 E515 -L522 -0.0248773342490818 Q526 -L535 -0.0252515943098093 L492 -L522 -0.0253878137078027 G509 -Q525 -0.0256946967050542 E524 -K537 -0.0277149478439156 L492 -G502 -0.0277740491036145 G502 -F530 -0.0278332676857422 L492 -P506 -0.028546515973531 D490 -A529 -0.0289283068719968 L496 -E524 -0.0297828462917042 K488 -L522 -0.0300634040146619 D511 -S518 -0.0301516414050246 T489 -L501 -0.0302192417084592 F508 -T513 -0.0302833974659686 F508 -W516 -0.0313927628516644 I493 -S536 -0.0322512276543284 I504 -R532 -0.0323403625185156 I493 -R507 -0.0326800345508198 L501 -G509 -0.0337114553597706 G523 -A531 -0.0362286405849037 L505 -V519 -0.0369219008794417 G523 -L528 -0.0369857984169402 M485 -I493 -0.037123391870856 K486 -I495 -0.0372223375879965 P487 -R527 -0.037859181344301 I504 -L535 -0.0379756952704113 A529 -K537 -0.038048738021162 D498 -Q526 -0.0384263325226446 Q526 -S536 -0.0385289565618907 L492 -A529 -0.0387625808328913 L492 -R500 -0.0408627890549624 D511 -L522 -0.0414165748165041 M485 -Q525 -0.0435343527254313 K486 -G509 -0.043632808131508 D498 -G523 -0.0448997072609432 K486 -G523 -0.0451196574378598 I493 -L501 -0.0464585131210651 K486 -L505 -0.0484485620429201 V519 -Q526 -0.0527035003957952 R527 -K537 -0.0531058190915688 D490 -S521 -0.0535730207093585 R507 -S536 -0.0538892387670868 R507 -S521 -0.0539780587705017 K488 -S521 -0.0557417381361869 Y503 -L510 -0.0572622486001444 D498 -P506 -0.0583140876019224 L510 -Q525 -0.0589299932766141 L510 -S536 -0.0596212528462069 L505 -S518 -0.0596507285484735 I504 -L533 -0.0602155430083311 G502 -R507 -0.0608295733188071 I493 -Y503 -0.0614969394689231 L492 -Q526 -0.062664825709149 F508 -S521 -0.0629823269681946 P506 -Q526 -0.0648207067044604 Q526 -L533 -0.0648753895887291 I495 -L501 -0.0663319508886002 P487 -E524 -0.066352021407825 E491 -A529 -0.0669499621311715 L496 -R532 -0.0674589901978226 D490 -Q526 -0.0676451385026077 R527 -S536 -0.0681623893064205 I504 -V519 -0.0681780634150329 I493 -S518 -0.0690162068343843 R500 -Q525 -0.0692456482068827 R507 -L533 -0.0709281172219447 S512 -L522 -0.0719479291640308 K494 -Y503 -0.0728487663495914 F508 -L520 -0.0730741515947759 F508 -Q526 -0.0744938023588291 V499 -P506 -0.0750632058065314 P506 -L535 -0.075336981008383 S512 -S518 -0.0760255639513554 R507 -S518 -0.0775769258897328 A531 -K537 -0.0778714268620533 R500 -F508 -0.078201334881709 L501 -L534 -0.0796933864735454 L505 -L522 -0.0797409691849165 I504 -D511 -0.0798788244754802 M485 -S521 -0.0799629817469443 L492 -Y503 -0.0801635553177058 I493 -L533 -0.08051965333432 K494 -I504 -0.0813642361689948 L501 -Q526 -0.0820695963594478 L505 -T513 -0.0835889991823038 R500 -L535 -0.0836657526689191 G502 -R532 -0.0843761110463284 E491 -Q525 -0.084476084297326 D490 -L501 -0.0847695193086509 F530 -L535 -0.0849666143996597 R527 -L535 -0.085335750540243 P506 -S536 -0.0871431800561586 Y503 -L522 -0.0873639988749808 M485 -L510 -0.0874380954403391 D498 -I504 -0.088294014616074 D490 -F508 -0.0894396787602108 D490 -L520 -0.0894795308630822 L505 -Q526 -0.0898120678265553 D498 -L522 -0.0899070312385719 T489 -E524 -0.0899255954285341 L496 -P506 -0.0906025838446087 R500 -R507 -0.0906744921923968 E497 -R527 -0.0910434631963009 L528 -K537 -0.0915788623957923 P506 -S512 -0.091768673814502 P487 -L496 -0.0923802670180951 I504 -L510 -0.0933857219124035 D498 -L505 -0.0937826317895363 M485 -L522 -0.0945511445283949 R500 -L534 -0.0949912149870142 I504 -L522 -0.0954410803177996 P487 -L528 -0.0971180460029997 I504 -F530 -0.0972818753530875 P487 -Q526 -0.0973359884841134 D490 -E497 -0.0975910302577994 K486 -K494 -0.0985607819052063 D490 -F530 -0.09967593282712 P487 -S521 -0.100873158656325 S512 -L520 -0.101254178246378 L496 -R527 -0.101308553574695 G502 -F508 -0.103653844261907 I493 -F530 -0.104180362647916 Q525 -S536 -0.104884902098568 K486 -S521 -0.104976178244863 L501 -F530 -0.104984542322883 R500 -L533 -0.106311339294061 K494 -G502 -0.106986386434182 E491 -L496 -0.107354816408767 I495 -G523 -0.108547241965804 I493 -G509 -0.110076929190222 I495 -G502 -0.110470867127333 M485 -K494 -0.111037054254704 P506 -D511 -0.111229291452607 W516 -S521 -0.111432160067407 P506 -L533 -0.111524825909691 E497 -G502 -0.111931570612446 L496 -F508 -0.11254232447455 I495 -A529 -0.112602015108612 I504 -L528 -0.113017018617704 E491 -E524 -0.113027568516459 K486 -I504 -0.114588896578037 L496 -L528 -0.117666250588207 K494 -E524 -0.117968428721451 I504 -G523 -0.118263385290929 M485 -S517 -0.118506839332101 D490 -L528 -0.119236680399426 L510 -E515 -0.119440185179827 F508 -K537 -0.121279450422888 K488 -I504 -0.126022822645056 K494 -A531 -0.126586977282143 T489 -K494 -0.128993996774548 G509 -S518 -0.129475017032835 P506 -K537 -0.130479887251603 W516 -G523 -0.131404953987722 I504 -Q525 -0.132831617621072 G502 -L535 -0.133085463752546 L505 -A531 -0.135579254908518 V499 -A531 -0.13655692142839 R527 -L534 -0.137512256831837 K494 -R527 -0.138036066519875 D490 -I504 -0.138789375374795 K486 -S517 -0.13907166085355 K494 -R500 -0.139212516974204 L505 -R527 -0.139420142860794 M485 -S518 -0.140324602962887 E497 -Y503 -0.141016133623943 E524 -L533 -0.141325065224509 D498 -Q525 -0.142757398317994 I495 -Q525 -0.143222932942221 I495 -R532 -0.143547641579322 D490 -L533 -0.144292246148199 L496 -A529 -0.144658528115935 I495 -F530 -0.148143017659323 M485 -G509 -0.148981773834947 L522 -F530 -0.14968925443678 L492 -R507 -0.150138505318316 T489 -F508 -0.151266942734541 L520 -R527 -0.154880189312298 I493 -A531 -0.155002174804549 W516 -L522 -0.155105035000595 F508 -L522 -0.155488238898744 G523 -F530 -0.157215749115293 E491 -L520 -0.158324231125758 L492 -F508 -0.15992661642214 L496 -A531 -0.161443775694405 Q525 -A531 -0.161825883944257 G509 -L522 -0.163065203985908 E491 -L505 -0.165380889465726 K488 -L528 -0.165883356681083 E491 -L501 -0.165889539565621 L510 -E524 -0.166211983814662 P506 -S521 -0.166695249099228 L496 -Y503 -0.166709746147558 I495 -E524 -0.16977854986269 R500 -A529 -0.17045803431749 K488 -V519 -0.171285077912691 G523 -L533 -0.173630824521845 T489 -L496 -0.175285499610926 Y503 -F508 -0.175461209922779 P487 -I493 -0.175880455461725 A529 -L534 -0.177280604814634 S521 -L533 -0.177470479833906 L505 -R532 -0.177740209403713 L492 -D498 -0.178466188323213 D490 -L510 -0.179595571142346 S521 -Q526 -0.179773558307887 A529 -L535 -0.182192826279365 D498 -Y503 -0.182336226763065 L501 -L522 -0.183392250757435 K494 -L501 -0.183540601966524 K486 -Q526 -0.183829518641027 K488 -R507 -0.1851638223602 F508 -V519 -0.186905513173256 K494 -L522 -0.187057390969421 L510 -L520 -0.187109941488051 L522 -L533 -0.187344172853468 L522 -L528 -0.188258526245275 M485 -E524 -0.188511863686136 I493 -F508 -0.189581121676182 L492 -L528 -0.189670094376964 K494 -Q526 -0.189846671882599 L528 -L533 -0.191434535186335 A529 -S536 -0.193658838935404 T489 -E497 -0.194413764488248 L501 -L528 -0.194518377520484 L505 -K537 -0.195152336634964 I504 -G509 -0.196198196505149 M485 -E515 -0.196426362127767 E497 -I504 -0.197426372744468 V499 -L534 -0.198267492392858 M485 -F508 -0.199977409920098 K488 -E524 -0.202511685828493 Y503 -L535 -0.202904409933128 L496 -I504 -0.202919837942735 K486 -R507 -0.20348354649388 T489 -S518 -0.203698823969847 S517 -L522 -0.206540244585075 F530 -K537 -0.207303766517736 K486 -L492 -0.208326717870971 E491 -F508 -0.208513235250136 Q526 -K537 -0.210055574310585 L492 -Q525 -0.210135372454552 T489 -P506 -0.210647372171444 L501 -P506 -0.214990091302976 K486 -V519 -0.216982226008062 Q525 -L534 -0.217024462293038 G502 -S536 -0.220931933545409 T489 -I504 -0.224053696607488 L510 -K537 -0.230155721987916 G509 -H514 -0.230363136837321 L510 -S521 -0.24219523295884 L501 -R507 -0.24368491530056 V499 -L528 -0.253102021418982 L501 -A531 -0.257755252518285 I493 -G523 -0.265028460858372 S512 -V519 -0.268795157859362 P487 -L492 -0.269735200241885 L522 -R527 -0.27399426850139 K494 -F508 -0.275000073253471 L510 -S517 -0.283646792949699 I493 -R500 -0.286874397263574 I493 -A529 -0.289690663037762 L505 -D511 -0.292511448355844 D490 -L496 -0.297775585752194 M485 -R507 -0.303986805014778 I493 -S521 -0.308082346323777 I493 -L522 -0.309153976471823 M485 -L492 -0.309192103018994 D498 -A529 -0.309717850200099 I495 -R500 -0.319596064966606 T489 -L522 -0.320111281465282 L505 -S536 -0.322221612090241 L501 -S536 -0.332330407443066 G502 -L533 -0.337555800674475 K486 -I493 -0.356269061974689 K488 -I495 -0.359009862603114 V499 -I504 -0.380983827918174 T489 -I495 -0.383350033917445 I495 -L528 -0.392888654194694 V499 -L533 -0.408616187914801 L510 -L522 -0.412758495449099 L501 -L535 -0.430897862588619 K494 -L528 -0.432195012781393 A531 -S536 -0.461512909547365 L496 -Q525 -0.524345913980909