[Mon Aug 29 18:06:25 2016] >Input file: TMA3X4M8M6G.pdb >TM segments: 458-472_ 475-503_ 507-518 MAIDEN score = -0.9169 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V466 -R500 0.893884827947859 D475 -L480 0.781700699110931 L470 -L477 0.725974524109862 V466 -A499 0.684341541630335 L461 -L503 0.657555177825922 V466 -L502 0.617657649834747 L461 -R500 0.602162422873938 L477 -V496 0.595259864100836 L461 -V466 0.587659932802403 E471 -D478 0.583753392990163 V466 -L503 0.56952372571951 H465 -L503 0.560086384390372 F469 -A499 0.532497785129206 L470 -V496 0.531009481153042 S464 -F469 0.518506394508406 L470 -I498 0.459931771106041 K472 -Q492 0.453550473627199 L480 -L488 0.446301063923348 L477 -Q492 0.442286964676093 P483 -L488 0.43958477130093 A467 -V481 0.433150913782109 A467 -K472 0.431523077496955 L477 -R495 0.419907248880224 A467 -V496 0.416946863092674 A463 -D478 0.410647073049999 Q458 -H465 0.380543732204717 A460 -A501 0.379067189728652 L477 -G491 0.363662879726061 D478 -R495 0.351874728713835 L480 -R493 0.342923704352099 K459 -A499 0.32820545992322 L480 -G491 0.320952123519871 L470 -D478 0.316660892323316 L480 -G490 0.315376628343006 P483 -Q492 0.313002964614696 Q494 -E513 0.310806611921738 H465 -G476 0.30768227829712 A501 -L509 0.299030218154356 L461 -A499 0.285251352865863 F469 -D478 0.274785347691052 R495 -A514 0.263653549920528 L461 -D468 0.260331953013104 E471 -Q494 0.258910709434397 D468 -R495 0.258348084240883 A501 -A514 0.255952097752877 P483 -Q494 0.254667824261259 V466 -E471 0.253956083299866 A467 -L477 0.245869789330067 D468 -V497 0.243844814469938 D478 -V497 0.237523759672456 L480 -S489 0.236844777778081 S486 -G491 0.235461337639676 L470 -T479 0.233970296729152 Q458 -A463 0.23129199450282 D468 -G476 0.228422931642424 D468 -V481 0.22590378127166 Q492 -T515 0.221845102348617 D478 -G491 0.219620079365055 D468 -D478 0.212802003459625 V466 -V496 0.208842360519199 L470 -V497 0.208311291978412 G476 -S489 0.205928480829975 L461 -D478 0.195808103950701 V481 -R495 0.195405083026811 K459 -H465 0.193582350803412 K472 -A499 0.192625456021908 H465 -V496 0.187774071783589 D468 -R493 0.178566388214165 D475 -R484 0.178129931314725 A467 -A501 0.17728845854047 L477 -R493 0.176421932187642 V481 -R500 0.175975784931043 R493 -A514 0.175263702872077 K459 -R500 0.175167616024233 R493 -A517 0.173605419678626 P483 -R495 0.173509557053654 A467 -G491 0.172015246677333 D475 -G491 0.167014354055294 T479 -A487 0.165518208969631 G476 -G482 0.161840751650489 A467 -G485 0.161636831452177 R495 -E513 0.159707177141087 G476 -Q494 0.15886635130131 K462 -L502 0.15819974073433 K472 -G490 0.15602239085371 K462 -G482 0.154420700825652 H465 -V481 0.150541960788996 G482 -G490 0.149340259082553 A467 -R493 0.147242693501303 I498 -E513 0.146620106809758 A460 -I498 0.146543483380728 A487 -Q494 0.141005829385618 D475 -V481 0.139572019081983 K462 -L477 0.138058131239544 G476 -L488 0.13752676849656 L480 -I498 0.136989654446949 F469 -A501 0.13551134133245 L477 -L502 0.13463979408253 A460 -V481 0.133849669675345 K462 -D475 0.133079039168038 Q492 -A517 0.132554636188174 D475 -P483 0.130526060853243 A467 -D475 0.12686453869437 A460 -D478 0.12638295429418 S464 -G476 0.125533820617853 G491 -I498 0.121421591778107 S486 -R493 0.121177639702589 L503 -L510 0.11806943425009 L477 -L503 0.118058925668975 S464 -T479 0.117700061820016 L511 -S516 0.115852049882806 A463 -A499 0.11392761947561 R495 -T515 0.113647201484702 D478 -A499 0.112176288530762 R493 -A501 0.108364725880572 S464 -L502 0.107341544517828 G476 -R495 0.106589016869669 G491 -A499 0.106217966645949 S464 -L503 0.106169718212244 L502 -L511 0.104589297086195 D468 -A499 0.103722767813867 E471 -G476 0.103671030239466 V497 -L509 0.103572097896124 G485 -V496 0.102335246436087 R493 -I498 0.102307975484358 E471 -R495 0.102188477930754 V497 -L518 0.101357688684172 R493 -T515 0.100961321311569 D478 -G490 0.0995895432138956 D478 -L488 0.0986445540527008 Q492 -R500 0.098119778749421 D468 -L477 0.0976407151047418 L480 -Q492 0.0970674852811282 R484 -Q492 0.0969123625640997 Q494 -L511 0.0963077152010605 D475 -G490 0.0956177274454575 K459 -V481 0.0948885495586045 Q458 -L502 0.094778950223027 A463 -T479 0.0945594103465752 Q458 -L477 0.0945153241216472 P483 -A499 0.0931794108683333 G485 -R500 0.092812091772235 T479 -R484 0.0917593699152263 A463 -V481 0.0916346753637147 D512 -A517 0.0912900949185969 S464 -A499 0.0910109380519097 L488 -L518 0.0909063402414483 V497 -L511 0.0907796788386745 V481 -A487 0.0904021056105396 V481 -S489 0.0901370717179857 A460 -V466 0.0899985846362568 L461 -V481 0.0894737902287073 A487 -V497 0.0887776702009719 K462 -G476 0.0884709304677271 K472 -R495 0.087429249220615 A467 -I498 0.0874205894502627 K462 -R500 0.0864704945674664 Q494 -L518 0.0859846065397587 G482 -A499 0.0858966696514569 F469 -L477 0.0858485059470766 L480 -R500 0.0849520785007002 G485 -A517 0.0848251255781487 G482 -R493 0.0841862692822568 G482 -G491 0.0832086634369102 G476 -G485 0.0830734053494286 L470 -Q494 0.0830429484815554 A499 -A514 0.0817989687286276 L488 -I498 0.0801031461173265 K459 -L502 0.0797607138675462 L477 -G490 0.0795738363619186 A463 -G476 0.0794549305686427 S489 -R495 0.0793774624963408 L461 -R495 0.079145733032701 L503 -V508 0.0789099562395343 E471 -G490 0.0773034042603071 A460 -L477 0.0766375546669491 A487 -V496 0.0764990762684414 R493 -R500 0.0744993663151909 S486 -V497 0.0738038649865222 L503 -L509 0.0733320960032744 L461 -L480 0.0730985116870118 D475 -V496 0.0708602090205357 V466 -Q494 0.0705388850946379 V497 -T515 0.0689983369765909 T479 -V496 0.0687194811851275 V481 -Q494 0.0683372642061344 V466 -G476 0.0680928339699687 A463 -V496 0.0679377370231666 D475 -R495 0.0675865299665008 T479 -R495 0.0671756991516254 V481 -V496 0.0659654656435507 A499 -L510 0.0658409807678806 K459 -F469 0.0654307548062416 R484 -V497 0.0653945857625118 A467 -R484 0.0648156788449251 F469 -Q494 0.0646521370285593 T479 -A499 0.064649259782386 Q494 -L503 0.0640980596776402 A499 -P507 0.063815326934229 I498 -A517 0.0627650383161376 R484 -A499 0.0618978143742283 Q458 -V481 0.0605441028361782 H465 -D478 0.0604712543523949 L461 -A467 0.0603259190136205 L470 -A499 0.0602334066032282 A463 -G482 0.0592885420376519 L477 -A487 0.0586683286943182 T479 -R493 0.0585806170846161 G485 -I498 0.0585363916338357 G490 -V496 0.0583015406542877 L503 -L511 0.0582186711105601 S489 -V496 0.0576679607864516 V497 -D512 0.0568471782328128 A467 -Q494 0.0566752045315064 Q494 -L502 0.055816338317447 V497 -L510 0.0554404165621536 P483 -V497 0.0552291484172667 A467 -G482 0.0547632465418353 G476 -A487 0.0543995483866966 L470 -G476 0.0540179075284692 H465 -I498 0.0538255332817574 A460 -L503 0.0514910816381873 V466 -G491 0.0511148585305768 Q494 -A501 0.0499281771991702 L461 -E471 0.0491757747696666 A467 -Q492 0.0487181425981729 V481 -Q492 0.0484649827433912 L477 -S489 0.0484463990432045 A463 -D468 0.0471169144203465 S486 -V496 0.0468736668520373 L480 -S486 0.04627351259474 E471 -R493 0.0450243455603312 V481 -A499 0.0442572400255248 Q458 -D468 0.0440330871412435 A460 -V496 0.043653827445703 D468 -R500 0.0436449202604612 F469 -I498 0.0436211247208416 A460 -V497 0.0432556792390102 H465 -A501 0.0429007416251554 A463 -L470 0.0411589561827879 T479 -Q494 0.0403818730628218 G490 -V497 0.0383402616505306 G491 -R500 0.0359766930279966 G476 -R500 0.0359766930279966 F469 -V481 0.0358538281964546 F469 -T479 0.0350846418889681 V496 -A514 0.0347757000367315 L510 -T515 0.0341980687746224 K472 -V496 0.0341566809762774 I498 -L518 0.0339203391450917 A499 -L511 0.0338042907528511 G482 -S489 0.0333915585022484 A463 -L480 0.0330847902003764 L461 -G482 0.0319344053833324 K462 -F469 0.0307835696620522 R484 -R500 0.0291180072854833 E471 -V497 0.0275975867416432 V481 -I498 0.0275355217376951 G482 -V497 0.0275297613608108 V481 -S486 0.0269174611786052 T479 -S489 0.025700514020516 K462 -V496 0.0251678899324438 L470 -V481 0.0247606113143375 Q492 -A499 0.0246799829488822 R500 -L509 0.0241050425942673 A460 -A467 0.0240885355808178 K472 -V481 0.0238587314215871 L477 -R500 0.0228885920179263 E471 -V481 0.0228291871951694 R495 -R500 0.0220597774413287 Q492 -S516 0.0219644318199275 S464 -V481 0.0203510516937828 V466 -L509 0.0198249856871398 D468 -A501 0.0181004602051127 K462 -R495 0.0174551315497249 V497 -E513 0.0172910510941866 G485 -L518 0.0172023992765475 K472 -D478 0.0153598622498914 G476 -P483 0.0151685702947817 G490 -R495 0.0130911862944504 K472 -I498 0.0130787257276244 D468 -V496 0.0123921970752292 D478 -S489 0.0109159557690062 K459 -A467 0.0109148818521855 G485 -A499 0.00934590764937537 G476 -R493 0.00819915603060078 V466 -T479 0.00805365404354763 F469 -G491 0.00760858948692711 F469 -Q492 0.00717476480956414 R484 -R493 0.00649807169362837 R484 -G491 0.00617243906900256 Q458 -T479 0.00576310752480724 V496 -T515 0.00539176176199296 S489 -Q494 0.00507788320368441 A463 -L503 0.00505640618546099 F469 -R500 0.00491489279780621 R500 -A514 0.0041597674038627 L461 -G476 0.00285512481930272 D475 -G485 0.00237222472488607 A501 -P507 0.00226376601194112 P483 -S489 0.00220130420578979 G485 -R495 0.000648782060214348 A467 -R500 0.000181948994302683 A501 -L510 -0.000190333903653972 Q458 -R500 -0.000510905436386544 F469 -L480 -0.000951971266114793 A467 -A499 -0.00215754449195948 V466 -V481 -0.00310878463690978 K462 -D468 -0.0033917186409253 A501 -T515 -0.00371748862933163 L480 -A499 -0.00384567292239257 A467 -G490 -0.00412495729273576 V497 -A517 -0.00412686344726287 V466 -Q492 -0.00429302237600027 K462 -A499 -0.00431967081970974 D475 -A487 -0.00530016529459321 S486 -Q494 -0.0060975703913293 A467 -R495 -0.00759073130513377 K462 -D478 -0.00835825950388674 R500 -L510 -0.0085920787224909 V466 -L480 -0.00884524431349831 F469 -L502 -0.00893633134151717 K459 -D478 -0.00901959768423621 D478 -Q492 -0.00915665079658745 L477 -G485 -0.0109491166724152 P483 -G491 -0.0113106418948314 D468 -G482 -0.0128512717348541 L488 -R493 -0.0139938385535934 Q492 -A501 -0.014277660047576 R484 -Q494 -0.0143876695711915 Q458 -A499 -0.0151320081634356 D475 -R493 -0.017039742371417 Q494 -A499 -0.0177816513741549 A501 -V508 -0.0179540427595839 G485 -R493 -0.0186598821871025 S464 -E471 -0.0187743267488301 A463 -E471 -0.0197708904650344 D468 -G491 -0.020109647308461 E471 -S489 -0.0206446176910232 G476 -A499 -0.0208020944137555 G482 -V496 -0.0213832166019454 D478 -R493 -0.0237155244282572 G476 -G491 -0.0239892017194743 A467 -P483 -0.0244229980480101 L488 -A499 -0.0268349276892579 G491 -V497 -0.0277321386594682 Q494 -A514 -0.0284323358778109 R500 -L511 -0.0298464081273533 K472 -T479 -0.0305409758011117 Q458 -D478 -0.0319157090859543 L477 -A501 -0.0321283653122206 S464 -V496 -0.0322372724157689 A460 -E471 -0.0327587826316053 A501 -E513 -0.0341723518719443 A460 -L502 -0.0357271625742968 L470 -G490 -0.0362071342141008 G491 -L518 -0.0365966676111968 I498 -L503 -0.0382457063943047 D468 -I498 -0.0389190222429168 R500 -P507 -0.0394763863010006 D468 -L502 -0.0397221059347882 S489 -V497 -0.0407028709269257 E471 -A501 -0.0420222998949966 Q492 -V497 -0.043279525586556 D475 -S489 -0.0435258066118343 R493 -S516 -0.0457029423485344 R484 -R495 -0.0473661144157579 S486 -R495 -0.0485829923643077 L461 -A501 -0.0493500103325726 V481 -L503 -0.0496247009212176 D478 -R500 -0.0508278235745101 V497 -L502 -0.0530751528236717 I498 -V508 -0.0571438908010879 S464 -K472 -0.0572086324895563 K462 -L503 -0.057490367376861 K472 -L488 -0.0579406645767464 E471 -L502 -0.0586067720139403 A501 -D512 -0.0592560714991142 Q492 -A514 -0.0601617903695606 K462 -A501 -0.0602091254295773 S464 -R500 -0.0603383803089028 L509 -A514 -0.0606904433792992 S489 -L518 -0.0631645359952353 L470 -D475 -0.0650010669557775 R493 -L502 -0.0654452146695186 D468 -L480 -0.0658936985137792 T479 -G485 -0.0660885466682957 A487 -R493 -0.067186361241339 I498 -S516 -0.067377333856379 E471 -L480 -0.0674526010430823 Q458 -G482 -0.0696709768290633 V496 -L511 -0.0703664199347163 S486 -A517 -0.0714471593241051 E471 -Q492 -0.0715932577441654 Q492 -L518 -0.0729804262680371 L480 -A487 -0.0734951125848271 H465 -E471 -0.0739981477535135 H465 -L502 -0.0741100339598268 V496 -L518 -0.0744450928325087 F469 -D475 -0.0747505555428942 G476 -V497 -0.076068718279191 S486 -Q492 -0.0765618140312059 K462 -V481 -0.0766311889747406 L461 -P483 -0.0766399539275806 I498 -L510 -0.0766904923521166 D478 -G485 -0.0776053858411325 E471 -A499 -0.0778466803542628 Q458 -S464 -0.0788779018962894 I498 -P507 -0.0798618329652214 V481 -V497 -0.0806351025234191 L511 -A517 -0.0811326738580398 G482 -R500 -0.0818946272628693 V497 -S516 -0.0826950767613668 A460 -L470 -0.0837595943263962 L461 -T479 -0.083763719495626 Q458 -A467 -0.0847452469485095 I498 -A514 -0.0848170403900195 H465 -L480 -0.0857205333011377 V481 -R493 -0.0859584330519647 A499 -L509 -0.0862848314414033 K472 -G491 -0.0867280412270417 V497 -A514 -0.0871135208873692 D478 -L503 -0.0871869935691752 H465 -T479 -0.0872171598260878 D468 -Q494 -0.0877523901958183 D512 -L518 -0.0890091208684211 R484 -S489 -0.089369637396323 K462 -K472 -0.0895170418165891 D478 -L502 -0.0898969246953829 V466 -K472 -0.0905979071414666 Q494 -D512 -0.0907685376309186 D475 -Q494 -0.0924334564554531 D478 -Q494 -0.0926970605691408 L461 -I498 -0.0929524007925338 D468 -Q492 -0.0932058466902384 F469 -R495 -0.0938606261938606 K459 -V466 -0.0939891124729035 P483 -V496 -0.0942177272086964 Q458 -L480 -0.0950175736298688 Q494 -A517 -0.0950654537656552 G482 -Q492 -0.0958626361975821 F469 -V497 -0.0971698351549803 D475 -Q492 -0.0981398025137159 Q494 -T515 -0.100049790148081 A501 -L511 -0.100237880052896 R495 -L503 -0.101659476561707 D478 -I498 -0.102337790526434 D475 -G482 -0.103080099369287 V466 -A501 -0.103450373683501 S464 -D478 -0.103585841849011 G485 -G491 -0.106744916943882 K472 -R493 -0.107002883955047 G491 -V496 -0.108465675156015 G476 -I498 -0.110673667980038 P483 -R500 -0.111787782705614 R495 -S516 -0.112201938872601 G476 -G490 -0.113009940385585 A467 -L480 -0.113024638505026 E471 -L503 -0.114214391753104 V481 -G491 -0.115321493559744 Q458 -F469 -0.115778666199853 A467 -T479 -0.116732076857091 V466 -D478 -0.117552841333808 D478 -R484 -0.117602362158419 A467 -G476 -0.119259632891609 Q494 -R500 -0.119597610247167 R495 -L511 -0.120263248585928 G476 -V496 -0.121094084588696 K462 -I498 -0.123973309028336 L470 -A501 -0.125464980223868 V466 -R493 -0.12617270217565 D468 -L503 -0.127316334521874 Q494 -S516 -0.127539538150448 R495 -L518 -0.127796979909667 S464 -L480 -0.1281860754836 A460 -F469 -0.128626873601439 F469 -L503 -0.13072723980616 F469 -R493 -0.131715342650879 R495 -L502 -0.133426428084101 L477 -I498 -0.136128025253894 K459 -L503 -0.136156231427631 R493 -L518 -0.137735448768681 D478 -A487 -0.140892963491583 L502 -L509 -0.140936033458743 T479 -Q492 -0.141729676466893 A463 -L502 -0.143754317518261 E471 -I498 -0.143865420753005 I498 -D512 -0.14400033073615 L461 -L470 -0.144707940244247 F469 -G476 -0.145139116106649 V481 -G490 -0.147043856765836 L477 -R484 -0.147467107935155 G482 -R495 -0.147533050313735 G485 -V497 -0.147980058903218 D468 -T479 -0.148128910327058 S464 -L477 -0.152194750211678 I498 -T515 -0.152316866645663 K472 -G482 -0.152331753403513 H465 -K472 -0.153104588085589 S486 -L518 -0.154112699456823 E471 -V496 -0.154464537690247 L480 -Q494 -0.15660313380989 E471 -L488 -0.158236487246788 A467 -L488 -0.158657542920063 R484 -V496 -0.158905926690232 T479 -G491 -0.158917801107425 L470 -G491 -0.159176524829336 L502 -A514 -0.161380860132746 L470 -L488 -0.16414056202926 E471 -R500 -0.164937634381564 V496 -L503 -0.165072298741142 V466 -R495 -0.165338203124932 L502 -V508 -0.167372365426842 A487 -R495 -0.16873263670928 G476 -R484 -0.170781801554674 R495 -A501 -0.17218182867242 K462 -L480 -0.173340552918855 G485 -G490 -0.173620464945816 L461 -F469 -0.174532823329539 K459 -D468 -0.175110683092835 A460 -H465 -0.176115674836512 D468 -D475 -0.176999114092687 K459 -L470 -0.178952546012342 H465 -R495 -0.179303231568142 L470 -L480 -0.179941435712404 R495 -A517 -0.182594057796731 R493 -A499 -0.184694367156461 L502 -L510 -0.189679797355635 A463 -R500 -0.190248428103289 E513 -L518 -0.190882827872509 Q492 -I498 -0.191162947601989 K472 -L480 -0.19145877931419 L470 -L503 -0.191966124218241 K462 -V497 -0.193339456823152 K462 -A467 -0.19419183234154 L480 -G485 -0.195030231743743 L488 -R495 -0.195296840159909 L477 -L488 -0.197375853557881 L461 -K472 -0.199354871116221 K462 -P483 -0.202326241106239 L470 -R500 -0.203257096812604 L470 -R493 -0.203577298273783 R484 -G490 -0.204078806783594 E471 -T479 -0.205778740314452 K459 -S464 -0.206350178341477 V481 -L488 -0.20787098919352 K472 -L477 -0.208132492017671 A460 -R500 -0.209742261342058 K462 -E471 -0.211378463480079 L480 -V497 -0.212498109840212 A487 -Q492 -0.213032406690836 G482 -A487 -0.220849828078282 A460 -D468 -0.222751041264454 L488 -V496 -0.224472704405652 G482 -L488 -0.226269170252588 A463 -L477 -0.226811831179873 A467 -V497 -0.229249295652803 E471 -G491 -0.230803839617317 Q458 -L503 -0.231006814177937 L488 -V497 -0.231143788063634 L461 -V497 -0.231610168760455 L461 -L477 -0.232976546145528 P483 -G490 -0.233152217771798 H465 -L477 -0.23357244097417 A460 -A499 -0.235148822178502 K462 -L470 -0.23685875372036 K472 -Q494 -0.238002761185475 K459 -L477 -0.238930984173982 L477 -Q494 -0.239049439339282 G476 -V481 -0.243398314347016 G485 -Q492 -0.244843041612981 E471 -L477 -0.24713210108121 A463 -K472 -0.251743822925425 H465 -R500 -0.252526062501469 L461 -V496 -0.258572669693105 S464 -L470 -0.259253080619166 L477 -V497 -0.262574140657996 V496 -L502 -0.263899455555713 A467 -L503 -0.266860312404368 K462 -T479 -0.268719121942096 A463 -F469 -0.26929946799959 D478 -V496 -0.271058097602701 L480 -R495 -0.272534518577779 L470 -Q492 -0.275272119285102 H465 -V497 -0.279208260311466 R500 -V508 -0.279596073238506 A467 -L502 -0.286021991282082 T479 -L488 -0.290581001414315 G485 -Q494 -0.295108441737402 D475 -L488 -0.302162589555583 L477 -A499 -0.302876526468316 G476 -Q492 -0.305470510956612 I498 -L509 -0.311269082301876 H465 -L470 -0.321703731816191 F469 -V496 -0.322597927734092 L477 -G482 -0.32904939968037 V466 -V497 -0.330138835314031 P483 -R493 -0.335038799297537 A467 -D478 -0.358048575222095 T479 -G490 -0.36012413338543 I498 -L511 -0.374035065130172 L502 -P507 -0.379603844841242 L477 -P483 -0.39991654517914 D478 -P483 -0.401794875493454 V497 -L503 -0.404822873062162 Q458 -V466 -0.407936437888284 V466 -L477 -0.416186513012603 L470 -L502 -0.433166952857911 H465 -A499 -0.440031317650788 L461 -L502 -0.446482059334698 V496 -A501 -0.454671478473129 L480 -V496 -0.45908147257507 V466 -I498 -0.47012129490564 L470 -R495 -0.478823382352823 L488 -Q494 -0.500966357414535