[Mon Aug 29 16:47:09 2016] >Input file: TMA4YA35M2G.pdb >TM segments: 447-467_ 474-486_ 490-499 MAIDEN score = -1.4131 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- L454 -R460 1.83230927148537 Q459 -I477 1.08301048958276 V457 -I477 0.767972953558121 Q459 -D474 0.696719568222155 L484 -R491 0.610898709110008 V455 -R460 0.607230612167433 R453 -S485 0.589351009865074 H450 -R482 0.528120197891549 V457 -G478 0.440537060370829 R453 -L484 0.438378271841628 L454 -R482 0.405582968179792 R453 -L458 0.40108125561483 L467 -D474 0.363192122477262 L454 -Q459 0.353321759524061 R460 -D474 0.34327358711244 D451 -R482 0.342489986326575 V455 -M475 0.32977432936367 L467 -M475 0.302356349451507 H450 -G464 0.297287412060772 L454 -L463 0.29427388655537 D451 -L463 0.283529712308424 D474 -E479 0.283198711569196 V455 -D474 0.280161705346326 R460 -M475 0.278882850589665 L454 -G464 0.277953193056734 L458 -G480 0.276848487117206 Q459 -G478 0.276595977189777 D474 -G481 0.271465267608518 L463 -G481 0.270613363158621 V461 -D474 0.258739518775537 A452 -R482 0.258653336191737 D451 -E456 0.255104422431152 T448 -E456 0.240600046328964 Q459 -Q483 0.208690861341015 H450 -R460 0.198317005305328 H450 -V461 0.192271068897252 E456 -G478 0.190724621557415 Q459 -E479 0.187773746288723 M475 -V494 0.186198655566091 L454 -V461 0.184616150293902 G493 -L498 0.178554248354475 V461 -G478 0.175062132641271 R453 -Q459 0.173882878421327 D451 -G481 0.162709825693416 L454 -G481 0.160103423476819 E479 -R496 0.159707177141087 R447 -Q459 0.149989910903782 H450 -A465 0.149600442926103 S485 -R490 0.148421113294614 A449 -R460 0.148064927784925 D451 -G462 0.141559181382113 W476 -G493 0.139041349601161 T448 -G486 0.13470137564315 A465 -I477 0.133716880359361 I477 -Q483 0.133624927553063 V461 -M475 0.131577962710851 V457 -L463 0.129789623500107 L466 -W476 0.1273830235265 D474 -G480 0.126657109174193 E479 -R490 0.125093082778832 Q483 -I492 0.119605588566835 W476 -A495 0.11648247861504 A452 -G480 0.115962497007192 V455 -S485 0.114710629346619 R460 -G478 0.114634980319612 L458 -I477 0.108240057921594 E456 -Q483 0.106834142537648 L454 -G478 0.10675139945481 V461 -G481 0.106207784802855 G464 -G481 0.105145387570602 A452 -G478 0.104202284101078 G481 -G493 0.102343113812367 L454 -L467 0.101660930190907 V461 -L467 0.0988627577743224 D451 -R460 0.0985099234867095 S485 -R491 0.0977083413472939 G462 -R482 0.0975457219729943 G464 -M475 0.097504792872841 E456 -E479 0.0962824168820009 E456 -G462 0.0957705755960698 I477 -G493 0.0950175122741523 G480 -G486 0.0943231245315683 G481 -I492 0.0942864741745439 R482 -G493 0.0939291892062861 R453 -V461 0.0926364621793896 G462 -D474 0.0922621442400944 R447 -G481 0.0902114097447952 I492 -A497 0.0895671247640908 R447 -R453 0.0886491015198447 V455 -G478 0.0876099582023517 E479 -G486 0.0871242635499372 L458 -D474 0.0862375896546688 L458 -R482 0.0838733697082765 D451 -L484 0.0838124158560789 L484 -R490 0.0831588381667068 G464 -G478 0.0817277425594067 T448 -R460 0.081623231489806 Q483 -R491 0.0814295796707567 E456 -M475 0.0802545396322767 R460 -L466 0.0796767407565171 G462 -E479 0.0772723659479664 V455 -G464 0.0761785688197867 R460 -G480 0.0759284175123782 E456 -V461 0.0735715943135657 G462 -G481 0.0728288738939104 R447 -L463 0.0725449614425342 L467 -E479 0.0721503715169489 I477 -A495 0.068278862200736 I492 -L498 0.0682036288440284 R447 -S485 0.067011540382629 A452 -G462 0.0656150557618354 A465 -G481 0.0651063818925901 R491 -A497 0.0646576490786141 V455 -R482 0.0636286308678522 M475 -Q483 0.0625998025548595 R447 -A452 0.0623730485361094 I477 -R482 0.0616410612612053 Q483 -V494 0.0598545316649588 A449 -Q483 0.0587306132814794 T448 -R482 0.0581758077051762 E456 -L463 0.0579500828681918 R447 -V455 0.0575596372585203 A449 -L454 0.0554011751075318 W476 -G481 0.0549089787300518 R453 -R460 0.0544422696675662 R447 -G486 0.052457337101818 Q459 -S485 0.0515954781224934 V457 -Q483 0.0509648829032969 V457 -G464 0.0501977816281474 H450 -S485 0.0498238423643054 L458 -A465 0.0494324127189731 L454 -A465 0.0474154238334918 A449 -L463 0.0466743416003856 R453 -R482 0.0458193774230853 H450 -L458 0.0453872642710341 L454 -S485 0.0448327394433576 G480 -R490 0.0438811200863531 E456 -W476 0.0425851555214831 L466 -I477 0.0392374872118229 T448 -Q459 0.0385574195903143 H450 -V455 0.0383489231700676 A465 -G478 0.0381384560277311 H450 -G478 0.0380620348518788 V455 -L484 0.0362810334801864 L463 -R482 0.0362117918915015 L454 -G486 0.0354633030575098 L458 -L484 0.0341928978564638 H450 -G462 0.0341394498670518 I477 -V494 0.0338941307001264 L484 -G493 0.0329738390011096 G486 -I492 0.0324253264324526 H450 -I477 0.0294477157742201 E479 -V494 0.0276465043459079 G478 -Q483 0.0238109645965316 L458 -G464 0.0237674002727379 G478 -G486 0.0233234803222642 Q459 -L484 0.0203569654784648 A452 -L463 0.0198400357377091 A465 -D474 0.0197732788458636 E456 -R482 0.0191728580556036 R447 -G462 0.0186814729002531 A449 -S485 0.0175243908073668 G462 -G480 0.0167355755921004 L463 -E479 0.0167272785535122 G478 -G493 0.0157951702355896 Q459 -L467 0.015289411983046 L463 -G478 0.0150919340650324 L467 -R482 0.0138150667560373 V494 -L499 0.0109598644557938 A449 -G480 0.00980063424402422 W476 -I492 0.00949007598981311 R453 -D474 0.00867676593352229 V455 -Q483 0.00806801558747683 Q459 -R482 0.00661851745278375 G481 -R491 0.00622034397618987 E456 -S485 0.0050829278298492 D451 -G478 0.00481412335956694 A449 -G478 0.00403734204369499 A452 -R460 0.00293063695378759 D451 -G464 0.00191897651166806 T448 -G481 0.00159225875348223 E456 -G480 0.000693781992591624 A465 -R482 0.000646073033591321 L458 -E479 -0.00116770816573464 H450 -G480 -0.0030365981695335 A452 -V461 -0.00342828991548005 V457 -G486 -0.00448279711542643 A452 -I477 -0.00542312247945853 E479 -R491 -0.00789732724938141 L466 -R482 -0.00791891846067383 V457 -G481 -0.00804176785044719 D474 -R482 -0.0100674427640322 L466 -E479 -0.0120575963879774 I477 -S485 -0.0130943577232908 T448 -L484 -0.0144195287603601 R453 -I477 -0.0149490819872433 L463 -G480 -0.0156367680712455 R453 -E479 -0.0170091353295956 A452 -G486 -0.0174360508386218 D451 -G486 -0.0203872423551257 R453 -G481 -0.021733232400873 A465 -M475 -0.022426758604956 R453 -G462 -0.0238837927635954 T448 -L463 -0.0241208656304241 V457 -A465 -0.0243432765793195 A449 -V457 -0.0256756229761761 G480 -V494 -0.0277030112248418 L467 -G481 -0.030916522280279 M475 -G481 -0.0314998213015416 Q459 -G480 -0.0315246304598225 L467 -G480 -0.032294220320185 A452 -L484 -0.0335874434166286 L454 -D474 -0.0338179985210663 M475 -L484 -0.0345112034889281 D451 -S485 -0.034973701177288 A449 -Q459 -0.0372791787702647 V455 -G480 -0.0382727634216726 M475 -R482 -0.0382911404073347 W476 -S485 -0.0386136775989216 W476 -R482 -0.0391249897351567 R482 -R490 -0.0400275437181683 G462 -W476 -0.0403621528843549 E479 -A495 -0.0432773476275288 V455 -I477 -0.0445153977070358 R482 -I492 -0.0446834847827824 R460 -S485 -0.0476493584182237 G480 -A495 -0.0505250452769461 V455 -A465 -0.0526831051892822 R460 -L484 -0.0534214183524411 R453 -G464 -0.0547838716879703 Q459 -W476 -0.0552677798051333 G478 -S485 -0.057445950737705 A465 -E479 -0.0574807976354692 R482 -R491 -0.0596830695044324 A452 -Q483 -0.0598405727981126 H450 -E479 -0.0600980135238425 L458 -Q483 -0.0603470943618225 R447 -E456 -0.0611750180388984 M475 -A495 -0.0643494080698882 R453 -G478 -0.0684465763005444 R447 -G464 -0.0695134413601819 E456 -G486 -0.0700574372149352 E456 -D474 -0.0710360724797217 R460 -R482 -0.0743339495952904 V457 -G480 -0.074867137930017 L463 -D474 -0.0755220140797972 L454 -I477 -0.0775645297402789 S485 -I492 -0.0782438909816328 G464 -D474 -0.0783521984342386 E479 -S485 -0.0795395334039713 L454 -E479 -0.0798216829421383 H450 -L463 -0.0808393138937569 R453 -G480 -0.0837158538048093 M475 -G493 -0.0844075876644368 R447 -R482 -0.0845094291705196 A452 -Q459 -0.0855516231567544 L467 -I477 -0.0865633387427844 G480 -R491 -0.087139335498253 V461 -L466 -0.0871800373530309 R447 -R460 -0.0894506449997691 G464 -R482 -0.0897581376494339 L466 -G481 -0.0899951216199062 L458 -M475 -0.0903894781867451 L463 -I477 -0.0904026488616568 I477 -I492 -0.0914528220164019 D474 -Q483 -0.0919432453237206 A449 -G481 -0.0920532324400298 D451 -Q483 -0.0925859351199568 L463 -M475 -0.0926609241961611 A449 -L458 -0.0927667281518545 W476 -Q483 -0.0933398815883988 L466 -G478 -0.0941552495558347 A452 -E479 -0.0951599556878433 L463 -S485 -0.0960674320963202 G464 -I477 -0.0975651009076453 D451 -I477 -0.10134985582714 L484 -I492 -0.101399468010692 G481 -G486 -0.101797996493664 Q459 -L466 -0.103140293683647 A465 -W476 -0.105130371773727 V457 -M475 -0.107662063607577 L454 -M475 -0.109111317691433 V457 -G462 -0.111830431481849 V457 -S485 -0.112504570953979 Q483 -G493 -0.113096362197239 H450 -Q483 -0.114196462336489 T448 -V457 -0.115411406681495 R453 -G486 -0.116406491598628 E479 -L484 -0.116826120400119 V461 -I477 -0.117779549672417 G478 -R491 -0.12010169555077 R453 -L463 -0.123508938374794 R453 -Q483 -0.125331501647509 W476 -V494 -0.126798339464082 G480 -G493 -0.128102610500945 V455 -G462 -0.130285906380319 L454 -Q483 -0.130531358984426 L458 -W476 -0.134573256911687 L458 -G478 -0.136569897511197 D451 -G480 -0.13873202078995 R453 -W476 -0.139483756932466 Q459 -G464 -0.139619885272636 D451 -Q459 -0.139983350420766 Q483 -R490 -0.141626579138081 V455 -W476 -0.142825657713275 G486 -R491 -0.14284333259504 G481 -R490 -0.14550838461514 H450 -E456 -0.149408948055319 V457 -R482 -0.15076339118421 H450 -L484 -0.151401260062819 V455 -G481 -0.154054786098217 R460 -L467 -0.156261920292394 T448 -R453 -0.159971106471397 L454 -L466 -0.164625273288853 L454 -W476 -0.164855441122025 R447 -L484 -0.166301520142202 R460 -E479 -0.168584768733538 D451 -A465 -0.172127495936953 W476 -R491 -0.173232107289495 E479 -I492 -0.174257915580485 G462 -M475 -0.174518307121593 I477 -R491 -0.177922750608356 V457 -D474 -0.180730358223134 W476 -R496 -0.183133445152812 A449 -R482 -0.186206629587565 R460 -W476 -0.186598609352891 L454 -L484 -0.187342730444168 L458 -L463 -0.187869920749314 L458 -S485 -0.189143919817289 G462 -G478 -0.189213019623438 E456 -I477 -0.192827295409131 V455 -E479 -0.19401449351268 E456 -L484 -0.202194010886108 H450 -V457 -0.203346697375561 E479 -G493 -0.20342896697858 V457 -L484 -0.205903924339051 R460 -G481 -0.207107198387763 L467 -G478 -0.207582011119259 H450 -G481 -0.208514729903122 L463 -W476 -0.209414072022287 H450 -Q459 -0.210313992215109 D451 -V457 -0.210654184435418 R447 -V461 -0.213994564631982 V457 -W476 -0.220129099764458 R453 -M475 -0.221278528257962 Q459 -A465 -0.22189522458318 T448 -S485 -0.221936708002308 L467 -W476 -0.226775696329987 G462 -I477 -0.227174701130672 D451 -E479 -0.228342968349141 G480 -S485 -0.231683368478665 R460 -A465 -0.238606654900465 G462 -L467 -0.242128098533134 R447 -L454 -0.242777803265734 G480 -I492 -0.24697359626134 E456 -G481 -0.248196957116438 A449 -E456 -0.251619655427515 Q459 -G481 -0.253967441201048 H450 -G486 -0.258357304370128 A452 -G481 -0.25983958069353 T448 -V455 -0.268346994328681 T448 -L454 -0.275603533214013 L454 -G480 -0.27747747128627 W476 -L484 -0.283431592964746 D451 -L458 -0.285077894486662 L454 -G462 -0.287015647049722 A452 -L458 -0.295798283619996 V455 -V461 -0.297935148255575 A449 -L484 -0.299493658137639 D451 -V461 -0.29967905098978 L466 -D474 -0.303105444702883 V455 -L463 -0.307480962636449 L458 -G481 -0.314116477082628 M475 -G480 -0.317658998982264 Q459 -M475 -0.323078035879035 G478 -L484 -0.32991925950806 V457 -E479 -0.341482074311865 I477 -L484 -0.344147455947537 A452 -S485 -0.355406343642917 A449 -V455 -0.357182975882196 A449 -G486 -0.371531776073024 L466 -M475 -0.380894540046338 R460 -I477 -0.383615012649932 A452 -V457 -0.45809314386386