[Mon Aug 29 17:52:40 2016] >Input file: TMA6TX10M3G.pdb >TM segments: 293-335_ 401-449_ 550-558 MAIDEN score = 18.5956 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- S404 -I411 10 L405 -V412 10 L405 -I411 1.14227854322508 M326 -I333 1.10769332386497 R406 -V412 1.04055001884178 L405 -D415 0.796081168664795 F335 -T401 0.729620546147363 K299 -V308 0.699298939142602 Y429 -A443 0.668883906354296 N433 -V439 0.630247663911005 L405 -Q414 0.618214880769123 E437 -A443 0.58695343268683 Y297 -V308 0.569276447326065 M326 -N334 0.524308562182908 N433 -A443 0.512543910217383 R406 -I411 0.48547452731442 M440 -K445 0.468254885922077 E425 -K431 0.387340981643149 E438 -K444 0.367982214176424 Y429 -M440 0.35088884532848 G430 -E438 0.344147912876788 G430 -E437 0.343864192964888 N296 -R306 0.342710092605342 E330 -F335 0.34067568620503 N322 -R328 0.334444576093111 G430 -E441 0.325388981756713 G300 -F307 0.317967907437334 G327 -I333 0.315699650485705 Q432 -K445 0.312271545226473 E407 -V412 0.31047175199538 R328 -I333 0.308237711586434 E316 -Q556 0.30346515101614 S305 -V310 0.301273725537215 E438 -H449 0.2998604292053 Q432 -A443 0.275891273628748 A443 -A448 0.273195579296143 F419 -E425 0.271456558720572 E438 -A443 0.269877783154155 Y429 -D436 0.267665931199388 N334 -E553 0.267612405223759 A442 -A448 0.266262538301904 D415 -G421 0.264130767518771 G430 -D436 0.261008154692802 Q402 -Q413 0.259818751654926 E325 -I333 0.256510168038204 E295 -R306 0.252877523878329 Q432 -E441 0.250775716640351 Q414 -Q432 0.246058528477883 E325 -F335 0.23812694280765 R406 -D415 0.231614041017419 S404 -G410 0.228703937925915 K444 -H449 0.228443945428458 N296 -M301 0.228288916738649 N426 -Q432 0.22577880118726 S420 -N426 0.22304957376597 D415 -D436 0.220781822949873 P315 -S320 0.21472529665679 D436 -A442 0.204855108817894 G303 -E309 0.19820065613942 N408 -Q414 0.197708756496531 G300 -E309 0.196170641244389 D415 -T422 0.194806671241329 A428 -K445 0.193093270529564 D436 -K444 0.18943161249332 E437 -K445 0.186647564764871 E425 -N433 0.185063388883744 V416 -G421 0.184659264025148 G421 -N433 0.181025635682639 F304 -E309 0.180427450667406 N296 -G303 0.179291190153314 G331 -Q402 0.176066349686504 F419 -K431 0.174090885136849 E438 -A448 0.172832123438111 T435 -A442 0.169080843819059 S403 -N408 0.166918975809849 G410 -V416 0.165592499382507 L405 -G410 0.164022074747775 N433 -M440 0.160998149403992 Q402 -Q414 0.160889660170934 S403 -Q413 0.150826210221214 M326 -R332 0.148818969528646 G300 -L311 0.148237604566781 G421 -Q432 0.14639644541095 A323 -E552 0.146066922270256 E437 -A442 0.144709184814936 D415 -N433 0.144578263509584 Q413 -T435 0.143588644563853 I409 -D415 0.143136669937808 M301 -V310 0.142197722863557 E321 -R328 0.142094406433058 A323 -R332 0.139425587602512 E441 -A448 0.13574823687428 N322 -A329 0.133635096674872 S420 -A428 0.131999493774074 I317 -A323 0.131674551146904 G421 -G430 0.131165696843161 T422 -P434 0.129932180133064 I427 -T435 0.12651700062847 V423 -Y429 0.126252596772371 T401 -I411 0.125295518669051 K324 -E552 0.125130758236687 V294 -V310 0.123670671118874 G421 -I427 0.123522760331105 V416 -K424 0.123179315355012 D415 -P434 0.122656738594112 Y297 -G303 0.122002284887474 G327 -R332 0.121971533227191 E316 -N322 0.119129581938088 V308 -L313 0.118402443420005 A428 -A442 0.117082795980383 A443 -H449 0.115829602340182 N322 -F335 0.115695532672002 I333 -Q402 0.115289339714767 D415 -K431 0.11404116650563 E316 -E553 0.113576706714797 S404 -Q432 0.111583596222229 Q298 -R306 0.10990365832517 K424 -G430 0.109567445599119 S404 -T435 0.109128762033253 T435 -K444 0.108591006140516 V416 -T435 0.107664153694036 Y297 -F307 0.107375838381541 L418 -V423 0.107245127817174 I427 -K444 0.107197423820512 R406 -E437 0.106189799647491 Q413 -F419 0.105396658127367 E312 -E558 0.105006693564246 D319 -L555 0.104785245749309 D436 -E441 0.103958958525723 S403 -D415 0.103274937892388 D319 -M326 0.102106054334454 L418 -K424 0.101696320198658 V416 -P434 0.101598529826137 E321 -G327 0.101163207250596 Q414 -F419 0.100911457605902 F419 -A428 0.100524409178549 Q413 -K431 0.100317366906537 N296 -F307 0.100233552584198 D319 -E553 0.0993804789297035 G331 -T401 0.0978679392550067 L293 -V308 0.0962596562060678 R328 -F335 0.093722353461362 V416 -Q432 0.0917483761420792 L405 -Q432 0.090682591183862 R406 -Q432 0.0905986527928557 K431 -E441 0.0889107252694674 M301 -E309 0.0885729170106955 T422 -E437 0.0873232243809507 L313 -Q556 0.0870189733669862 H551 -Q556 0.0862830083136994 A302 -V310 0.0845383491320035 R406 -Q413 0.082647287496643 R306 -E312 0.0801882122641704 Q413 -G421 0.0795503936617201 E321 -E553 0.0793699499289316 V318 -L555 0.0784381637483409 V318 -L554 0.0767053606836168 A323 -G331 0.0765026923376957 E295 -M301 0.0736460077250056 F304 -L311 0.0727805688572327 V439 -A448 0.072113649881818 V423 -N433 0.0703271089569159 Y429 -E437 0.0679377903912059 N408 -V416 0.0678159451701148 L293 -Q298 0.0671626502091953 M326 -F335 0.0668740428799275 S404 -D436 0.066534172231755 L293 -A302 0.0663385937339703 K324 -F335 0.0650152859816959 E295 -E309 0.0642590476119441 L405 -T435 0.0642087356529712 P315 -E558 0.0640348167385838 S404 -I409 0.0630540308418022 E407 -D415 0.0627978448838435 I409 -Q414 0.0621448847049972 S420 -I427 0.0616797536922329 M440 -A448 0.0601214870944236 Y429 -E438 0.058665064274114 F417 -T435 0.0581988736381474 D319 -K324 0.0581019572740225 R332 -Q402 0.0575110130676628 S404 -Q414 0.0574619000434451 S420 -N433 0.0572746760315952 R306 -L311 0.0570717108766079 K424 -Q432 0.0553591251304235 E316 -Q557 0.0541539863359892 E407 -H551 0.0528339326222953 I409 -F417 0.0519462252053406 N322 -R332 0.0512007463457826 S320 -G327 0.0501218690748557 A323 -F335 0.0500790820315729 V318 -A323 0.0475575301525177 E316 -E321 0.0472559037342415 Y429 -A446 0.04645756219705 F417 -K424 0.0463059600003887 L293 -F304 0.0461280744077461 D319 -N334 0.045213333508727 N322 -I333 0.0403755683973994 G430 -M440 0.040207185849833 S420 -G430 0.0400455925035184 V423 -P434 0.0394304402059573 F419 -T435 0.0390274901512475 A323 -E553 0.0388060493017832 G327 -F335 0.0385041749287902 N426 -N433 0.0373739385975226 E407 -Q414 0.0365798083080904 Q414 -T422 0.0359557282434519 K324 -E553 0.0356950824262618 E425 -Q432 0.0345542372262253 S404 -V416 0.0344189243480995 N296 -F304 0.0344133897716192 V416 -K431 0.0330443866419918 K431 -V439 0.0326384130351541 Q402 -E437 0.0325861540671872 N408 -D415 0.0319501447729252 N296 -E309 0.0318269990153843 Q298 -F304 0.0309606174577168 A329 -F335 0.0297774651633693 S403 -V412 0.0283011317993305 P434 -A443 0.0258212155648705 I411 -F417 0.0251499996142854 S320 -N334 0.0234539578890804 Q402 -T435 0.0229799393184715 V318 -E553 0.0206283814535376 G421 -A428 0.0189393290436985 Q402 -V412 0.0181752379598277 I411 -T435 0.0181582506033271 F307 -L313 0.0157726259320867 I317 -E552 0.0157394325842342 K431 -E437 0.0141630857570734 G430 -K445 0.0132713685405843 Q432 -A442 0.0128571956073462 L405 -V416 0.0127324753751346 T422 -I427 0.012584471299355 S420 -D436 0.0125837646302592 K299 -F307 0.0122740728572186 Y297 -A302 0.0121388491258837 Q298 -G303 0.0120737567648876 N334 -S403 0.0113799274905451 D319 -F335 0.0107556694033422 G421 -Y429 0.0106608205652394 A428 -K444 0.0103806684038816 K431 -A442 0.0100593574017935 K324 -I333 0.0087230711447015 K299 -E312 0.00862906542827568 L405 -E437 0.00862546619763727 S320 -M326 0.00859343205796215 A302 -V308 0.00800854369012527 N408 -S550 0.00752145678493976 E316 -E558 0.00737699604686792 D415 -Q432 0.00629236988265003 Y429 -K444 0.00619244943147734 N322 -G327 0.00609025958666942 M301 -L311 0.00495493239678968 R406 -H551 0.00493982230735579 V423 -T435 0.00481545274753625 D319 -G327 0.00366858549786048 A428 -D436 0.0029391555364966 F419 -P434 0.000907384199736461 T422 -K431 -0.000485222654498463 Q413 -L418 -0.00176247669571339 V310 -P315 -0.00210071357556796 G331 -S403 -0.00625267200932367 I427 -V439 -0.00647398224989004 A428 -V439 -0.00760549456787096 I409 -F419 -0.00761415255492004 N322 -E553 -0.00772014136706711 S403 -I411 -0.00814994879753472 S403 -E437 -0.00877932947784282 T422 -D436 -0.00988759593107691 K424 -Y429 -0.0103384228966945 G303 -V310 -0.0103502168099716 V412 -Q432 -0.0104422866448113 E316 -L554 -0.0108236831213413 V318 -Q556 -0.0117084497119933 G430 -A442 -0.0119963288783911 N433 -K444 -0.0120848077832534 V294 -S305 -0.0133708387569831 N296 -V310 -0.0150134720612227 S320 -E325 -0.016689157670537 Q414 -T435 -0.0192805341991735 S420 -Y429 -0.019367679168516 T422 -Q432 -0.0196733706429324 N433 -A446 -0.0202370276413777 V412 -F417 -0.0215369939606385 V423 -Q432 -0.0219788059945227 I317 -Q556 -0.0231783453383081 G421 -N426 -0.0232720335357397 A442 -N447 -0.0233018597709558 P434 -A442 -0.0243349374266368 V294 -M301 -0.0246486193013 I333 -S403 -0.0277738185942722 E438 -N447 -0.028055394738256 D319 -I333 -0.0288771882025562 I427 -M440 -0.029160802976584 A428 -T435 -0.0295912155445484 Q402 -G410 -0.0296538656988368 S403 -I409 -0.0305996135101325 Q298 -S305 -0.0315167111631527 Q298 -E312 -0.0317490393767292 G410 -S550 -0.0346028830113001 Q413 -T422 -0.0350177637694602 G421 -T435 -0.0350330953781817 I427 -D436 -0.0355750798935952 S305 -L313 -0.0357112432737985 E295 -F304 -0.0359380669938352 T422 -Y429 -0.0371872825709154 A428 -E437 -0.0399126437784616 M440 -A446 -0.0399786837191778 I427 -A443 -0.0425225706473933 E321 -N334 -0.0427347989048681 F335 -Q402 -0.043556492996852 F304 -V310 -0.045890172902773 E295 -S305 -0.0479603122683843 R306 -L313 -0.0492035642011835 N322 -N334 -0.0494630153580529 I427 -P434 -0.0497663770839312 N426 -T435 -0.0504929048712475 K424 -K431 -0.0506312218095681 E325 -R332 -0.0512022119345967 I409 -S420 -0.0520225638111596 D319 -L554 -0.053323628662612 I317 -E558 -0.0536946846462465 F419 -K424 -0.054868715652326 E407 -V416 -0.0549885872993978 L293 -S305 -0.0550840265644403 V412 -E437 -0.0551154548374679 G303 -V308 -0.0559863886975824 G430 -T435 -0.0560042185690688 Q432 -K444 -0.0562538343081851 E407 -S550 -0.0566231728107451 Q414 -G421 -0.0566682376011958 Y297 -S305 -0.056903451617714 S404 -D415 -0.0583377397992907 D415 -S420 -0.0583726843522105 Q432 -A446 -0.060439086063842 F419 -I427 -0.0615249058996508 N296 -V308 -0.0618243887882619 R406 -S550 -0.0620476835772107 E325 -T401 -0.0630665156286101 E321 -I333 -0.0633433043255254 N334 -Q402 -0.0647651806526949 P315 -L555 -0.0649288640212848 R332 -S403 -0.0656768061950938 E295 -A302 -0.0660097328269464 A428 -E441 -0.066083825612282 E437 -A446 -0.067481712945567 G430 -K444 -0.0677650827610723 P315 -Q556 -0.0689616287889545 S420 -E425 -0.0692836485048123 Q413 -A428 -0.0698691268933995 G300 -E312 -0.071262467996017 S320 -F335 -0.0714626492698325 N322 -E552 -0.0720724927952175 V439 -A446 -0.0731879479077882 D319 -Q556 -0.073200740298264 V412 -S420 -0.073274718037569 I411 -S420 -0.0738184388952514 I409 -V416 -0.074402762366355 S404 -Q413 -0.0754677048640666 E441 -H449 -0.0763597179193809 N322 -L554 -0.0765576131056731 A323 -E330 -0.0767343671413248 Q413 -S420 -0.0778115742454623 N296 -L311 -0.0780087100775053 S320 -I333 -0.0784770085740307 S420 -K431 -0.0789678470910842 M301 -V308 -0.0791689028812224 Q414 -S420 -0.079244313273836 L313 -E558 -0.0798443477240416 E438 -K445 -0.0799708376662274 D314 -Q556 -0.0804461090158013 F335 -S404 -0.0805186187120602 V439 -K444 -0.0806949477910042 Y429 -A442 -0.0810880410989863 L313 -Q557 -0.082569445904074 D319 -E325 -0.0832039985219115 G410 -F417 -0.0838360070672159 E321 -M326 -0.0842869366720089 K324 -E330 -0.0846261600553213 S305 -E312 -0.0856296556950915 E309 -D314 -0.0860156276405051 A428 -E438 -0.0909741421560408 S550 -L555 -0.0912890356808638 Q402 -D415 -0.0931751252480544 A302 -E309 -0.0938098785019212 E316 -L555 -0.0939473793500512 K424 -N433 -0.0947765611524224 L405 -K431 -0.094816836403961 G300 -V310 -0.0949242070603811 V294 -E309 -0.0957178166807617 M326 -T401 -0.0981578458538435 V318 -N334 -0.0986343735965766 S403 -Q414 -0.0989307989718706 Y429 -K445 -0.0992462862173148 N334 -T401 -0.0999496223863634 T435 -M440 -0.10052138902128 L293 -F307 -0.102315099528072 Y297 -L311 -0.103869656183738 F417 -V423 -0.105521207832821 A302 -F307 -0.105819545441185 I317 -L554 -0.106188305520208 V416 -V423 -0.106545672576646 V416 -N426 -0.107043160819393 L405 -S420 -0.107563906545807 D314 -E558 -0.10792766359513 V294 -V308 -0.108203295135977 S403 -G410 -0.108264173803172 L405 -D436 -0.109094608455399 I427 -E441 -0.109458011631429 K299 -V310 -0.110272227790597 G421 -D436 -0.111390738480745 V294 -K299 -0.112480359935478 Y429 -E441 -0.112560231965455 V412 -T435 -0.11276617732184 M440 -N447 -0.11288134421056 S404 -E437 -0.113238833901532 Y297 -F304 -0.113904623371794 V423 -K431 -0.115050249303309 N296 -A302 -0.115731224288019 L293 -G300 -0.116285707141585 Q402 -I411 -0.116435262097227 V294 -G300 -0.116602477367368 V423 -G430 -0.117322281806019 F419 -Q432 -0.117848804065064 N433 -E438 -0.118061416638849 V318 -E325 -0.120968129407534 I427 -N433 -0.121885283582574 Q298 -E309 -0.12365946438258 M326 -G331 -0.124592622829866 G430 -V439 -0.124662650767464 F335 -S403 -0.124764721257739 L293 -K299 -0.127083877756393 K431 -M440 -0.129238060229556 I317 -N322 -0.129555950266733 K299 -R306 -0.130146657775517 E295 -V310 -0.131928794867706 V416 -T422 -0.132173372054645 P434 -V439 -0.13226003575179 Y429 -T435 -0.133286648641912 Q413 -Q432 -0.133364616212189 K324 -R332 -0.135831544709703 S420 -T435 -0.136228328374525 I317 -Q557 -0.137959133913735 R406 -Q414 -0.13844961536727 A428 -M440 -0.139729306280874 V423 -A428 -0.140553734736732 L405 -Q413 -0.140643906193787 D415 -E437 -0.143355664737651 Y429 -P434 -0.144340764827159 T422 -N433 -0.144804187841011 A442 -H449 -0.146078759874243 F419 -N426 -0.146438472144158 K431 -E438 -0.146463778040168 S420 -Q432 -0.146867875219751 M301 -F307 -0.148157311414318 P434 -M440 -0.148268545630982 E425 -G430 -0.148374945023181 V439 -K445 -0.148598768273768 K299 -E309 -0.149040443877883 N322 -L555 -0.151028272606746 T435 -A443 -0.154188309765944 A323 -R328 -0.156109613163387 N426 -K431 -0.158314423118521 M301 -R306 -0.158938777610602 G410 -D415 -0.162360095523403 K324 -N334 -0.162671395399 V294 -R306 -0.163303518492751 R328 -N334 -0.165044291002824 A428 -P434 -0.171147309040417 T422 -G430 -0.172388623347703 N408 -Q413 -0.17277600692471 L293 -R306 -0.172994519856406 V439 -H449 -0.173094081313732 K431 -D436 -0.173539713221721 Q298 -V308 -0.175048518111112 S420 -P434 -0.175645641634465 Q432 -M440 -0.17588990138953 I317 -L555 -0.178082785487205 K431 -K444 -0.178266611928286 T422 -A428 -0.180270970141852 Q414 -K431 -0.181903053231597 G327 -N334 -0.182718142750818 R332 -T401 -0.182939041735509 N433 -A442 -0.185833541202154 I317 -E553 -0.188455644272492 D436 -A443 -0.188787841938442 G421 -K431 -0.189509339567236 A428 -A443 -0.190383915674103 K431 -A443 -0.191701583030457 Y297 -E309 -0.193847151631563 N426 -M440 -0.19444236818173 G430 -A443 -0.195705511456151 E441 -N447 -0.197556441421005 E325 -E330 -0.199380820312004 T435 -E441 -0.20428006699213 E325 -G331 -0.205328050814484 N433 -E441 -0.207945757987607 F417 -K431 -0.208885346320647 E437 -K444 -0.209897935466693 K299 -F304 -0.210431258496691 E441 -A446 -0.212997999565242 V318 -K324 -0.21311013036869 S305 -L311 -0.214939549790866 S404 -V412 -0.215991966791361 A329 -N334 -0.217419597040345 V308 -D314 -0.220154446744724 D415 -T435 -0.225343765121057 P434 -K444 -0.226036423649787 A323 -N334 -0.227530574041156 N433 -K445 -0.228617572589671 E438 -A446 -0.22945606314039 A428 -N433 -0.230019198055899 P434 -E441 -0.232694805937918 N296 -S305 -0.235441029011253 D415 -V423 -0.236704380612765 I333 -T401 -0.237203649768194 K424 -P434 -0.23754647424906 K299 -L311 -0.237623564493649 G421 -P434 -0.239001282680767 E295 -G300 -0.246341858131877 G300 -R306 -0.255119489471985 R406 -V416 -0.257437938251258 D319 -E552 -0.263192430245667 F417 -T422 -0.265203787347265 Q298 -L311 -0.267099498023759 K324 -G331 -0.268115172713121 Q432 -E438 -0.268699374026242 E295 -V308 -0.295102919110151 I427 -Q432 -0.298438413098358 E407 -Q413 -0.301300388664164 P315 -E321 -0.303326185141109 K299 -S305 -0.303712197872976 V439 -N447 -0.306944085599147 I411 -V416 -0.310829496664995 T422 -T435 -0.313836833113272 A323 -I333 -0.321088788472996 L293 -M301 -0.329661196810932 Y297 -V310 -0.331964113427544 E295 -F307 -0.337999130458974 Q432 -V439 -0.343360125093618 N426 -P434 -0.347439605026509 Q432 -E437 -0.357461582843642 E425 -P434 -0.35838183722666 Y429 -V439 -0.366906622192249 V294 -F307 -0.367219815850741 K324 -A329 -0.368767277594728 Q298 -V310 -0.387348890396337 A323 -A329 -0.400764655856674 F307 -E312 -0.447747789705951 G300 -V308 -0.531659929792301 G300 -S305 -0.583825826768765 Q298 -F307 -0.58689312912159 Y297 -R306 -0.665109509984087 E325 -N334 -0.819946799489435