[Fri Aug 26 18:15:24 2016] >Input file: TMB5H259M1D.pdb >TM segments: 370-413 MAIDEN score = -5.0895 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- I376 -I396 1.6566674359851 F379 -I396 0.91892120045045 F383 -V391 0.880262154929126 L372 -E403 0.861549804494048 F383 -T392 0.831329855902754 L380 -I396 0.807190352921253 F379 -T392 0.796463253970066 A408 -E413 0.761610632230839 L397 -K402 0.729195022301673 F379 -V395 0.657586127584394 G375 -V400 0.651669003019686 I376 -V400 0.61573936462672 L372 -V400 0.521100696528072 F379 -S399 0.513105585929367 F379 -D394 0.509291244475591 L380 -V395 0.491234800020591 F389 -D394 0.466593743839587 G375 -S399 0.458788568267848 P371 -I376 0.434611979781987 L372 -S399 0.41280416402553 A373 -K402 0.327766077378937 L387 -T392 0.312070163970355 F379 -E403 0.293746706453559 L372 -G398 0.289818501913456 G406 -S412 0.270652558625779 G370 -S399 0.253632249683445 P371 -K402 0.236413084323415 L378 -G398 0.236373601797037 K402 -S409 0.232438145806965 I376 -S399 0.220244839013805 G384 -F389 0.197817765126993 P371 -G382 0.196561996943307 M374 -L397 0.194341503162355 L380 -A385 0.193862663921326 P401 -A408 0.191907005113057 P371 -V400 0.190842811295554 G370 -V400 0.189987110972944 L380 -A393 0.189986604967608 I376 -G398 0.188857495257789 G375 -Q404 0.188664158469682 F383 -V395 0.185025182078988 P371 -P401 0.175839699519261 G375 -T392 0.175330429023633 F379 -A385 0.172495045440233 G384 -T390 0.171719735042107 G370 -I376 0.169013150522886 F383 -T390 0.168069917371372 A385 -V395 0.160393364388564 M374 -G398 0.159181593198923 G381 -S399 0.154489149077821 I396 -P401 0.154310658931132 G382 -S399 0.150600584659459 G381 -V391 0.138275182529127 I376 -V395 0.138105755950552 A377 -A393 0.137313093289173 A373 -Q404 0.133481747618505 G370 -G381 0.132228180532663 A373 -V395 0.124375730894807 F379 -Q404 0.120055389383911 G381 -G386 0.119305032686388 G375 -A393 0.114068519575678 G381 -A388 0.111075518386799 L397 -E403 0.110887150888485 A405 -S412 0.110014393947232 A405 -V411 0.108289285956946 G382 -A388 0.106734602407132 A373 -G398 0.106678946163512 G398 -A408 0.106302167235391 G381 -F389 0.103464519961117 P371 -V395 0.101647706638117 M374 -V395 0.101321061007307 P371 -E403 0.0965995475728088 S399 -A407 0.0962074364150221 A377 -F389 0.0961993123654055 G381 -A393 0.0946233862542591 T390 -V400 0.0925293660809401 P401 -S409 0.0897813331290376 T390 -G398 0.0883522953949574 I376 -V391 0.0869665451066544 E403 -S409 0.0860156974560704 G381 -G398 0.0853701230083828 T390 -S399 0.083034574091411 G375 -P401 0.0763592231070873 L378 -V391 0.0752633213376066 G375 -F383 0.0746168640963667 Q404 -E413 0.0709757223638885 G406 -E413 0.0709490779931434 G382 -G398 0.0701764896290303 I376 -Q404 0.0692346540769627 P371 -G381 0.068856382683697 L378 -V395 0.0688350959660244 L380 -T392 0.0683489041489018 S399 -A408 0.0681965325958682 Q404 -A410 0.0678902984313856 L380 -D394 0.065953108098177 A377 -L387 0.0653351010941572 L397 -A407 0.0645697239234737 P371 -I396 0.0639940461839217 G370 -P401 0.0633355418424273 L380 -S399 0.0629917238855171 A393 -P401 0.062932503800722 S399 -G406 0.0622440820153178 L387 -V395 0.0619414053724787 L378 -E403 0.0613308805498121 F379 -K402 0.0599492482063018 L378 -K402 0.0598955889922346 M374 -P401 0.0595344406054885 A385 -T390 0.0578206676207085 P401 -S412 0.0574707163152031 L380 -T390 0.0563028567849155 G375 -G384 0.05528338147752 L387 -I396 0.0521628664906393 L397 -A405 0.0519262845472419 Q404 -S412 0.0514749051812258 G384 -A393 0.0490538339325894 L378 -A393 0.0488055241587109 A385 -A393 0.0485920761200658 G382 -L397 0.0461099826862927 I376 -D394 0.0455730813982367 L372 -A407 0.0445957123166041 G381 -L397 0.044451729238205 V391 -S399 0.0429119265623084 M374 -F383 0.0425155421693035 I376 -T390 0.0402065840108965 A377 -A385 0.039990251129236 P371 -A405 0.039790269475124 F383 -L397 0.0386989410765644 F379 -P401 0.0372715860659618 G382 -A393 0.0364644587107747 P371 -A407 0.0349711448440155 P371 -L397 0.0345452342067993 G398 -G406 0.0332498640258758 L380 -G386 0.0309506463119291 L372 -V395 0.0285701117434769 V395 -E403 0.0273881911048152 L372 -Q404 0.0267970977572212 L378 -D394 0.026034485576679 F379 -A388 0.0235837596393358 L397 -G406 0.021841594662694 M374 -G382 0.0217207012571627 G386 -A393 0.0177792424576094 A373 -P401 0.0172732333499015 G375 -A405 0.0161648725127614 L378 -L387 0.0156054059274435 G384 -I396 0.0149192745696642 P371 -L380 0.0137361241780116 A405 -A410 0.0117898412122423 F379 -T390 0.0102070410773833 F383 -S399 0.00965053907285408 K402 -A408 0.00662327769361992 L387 -D394 0.00630472463324638 A388 -V395 0.00195200281156138 I396 -K402 0.00180986961973417 K402 -A407 0.00157654267997853 A407 -S412 0.00135187801835235 L372 -G382 0.000428998447270401 M374 -T392 -0.000500823457938449 V391 -P401 -0.00210071357556796 P371 -G398 -0.00331027725913868 M374 -E403 -0.00352474452202634 G370 -K402 -0.00427400434466851 A388 -I396 -0.00478067512748748 L380 -V400 -0.0053913044915106 L372 -A405 -0.00635178798867653 I376 -G384 -0.00657848446534159 V391 -V400 -0.00838961725199461 G382 -F389 -0.00899301543352449 G375 -I396 -0.00919135359760759 G382 -D394 -0.0100912113493318 I396 -Q404 -0.0109309570660598 G370 -L380 -0.011104343705945 L378 -A385 -0.0121587585067235 Q404 -V411 -0.0122660243116222 F379 -A393 -0.0151807193500946 F379 -L387 -0.0168565991584 M374 -F379 -0.0169731284605348 T392 -V400 -0.0180890964364178 A377 -G398 -0.0198562404123888 G398 -A407 -0.0199686496791154 A373 -G381 -0.0203674467980268 G370 -G375 -0.0224119961639496 A373 -T392 -0.0248299274262369 L372 -A393 -0.0268129048163228 A377 -V391 -0.0271221335725478 P371 -S399 -0.0282486034566025 L372 -L397 -0.0298290871130331 L380 -A388 -0.0301177418612824 G370 -F379 -0.0312502074394443 I376 -F383 -0.0315987933920043 L378 -I396 -0.0321377372761091 L397 -A408 -0.0323116272749093 V395 -P401 -0.0325549932418676 Q404 -S409 -0.0328194564527375 G384 -S399 -0.0346028830113001 G384 -D394 -0.0360287035641491 A377 -P401 -0.0363391335569698 D394 -Q404 -0.0366987451287559 V400 -S409 -0.0379369414844821 A373 -A393 -0.0388844058857174 A405 -E413 -0.0425067191239008 G375 -D394 -0.0446331385095449 D394 -S399 -0.0449028364590493 V395 -Q404 -0.0456268374455202 A393 -K402 -0.0461785634055412 L378 -F383 -0.0465138486575576 F383 -G398 -0.0488505667874293 V400 -A408 -0.0489340269048064 G382 -T390 -0.0497918069284237 G381 -T390 -0.0523955264675844 L372 -G381 -0.0527119407383774 G384 -V395 -0.0569529288219863 F379 -L397 -0.0578165510196174 A373 -G382 -0.0604318770249908 P401 -A410 -0.0616125618935102 M374 -G384 -0.062491232936364 G382 -V395 -0.065576025231489 A377 -E403 -0.0672332745866706 A377 -D394 -0.0679483721138312 G386 -T392 -0.0680829895719439 L378 -V400 -0.0705315298396858 T390 -I396 -0.0707846040851408 A377 -S399 -0.0711587103516678 F383 -F389 -0.0715683641923732 F379 -G386 -0.0757580969436193 A377 -G384 -0.0766497993505189 A377 -L397 -0.0777909681643596 G382 -V400 -0.0835287927047199 F379 -V400 -0.0844785514599131 M374 -Q404 -0.0951445212842323 A385 -T392 -0.0954146885403522 A373 -L397 -0.0986271585523544 G386 -V395 -0.0987227937012753 F389 -G398 -0.0990652234471101 G398 -A405 -0.0995926092286048 G381 -V400 -0.100348867310364 G370 -Q404 -0.100840950095468 D394 -K402 -0.101165806492386 G381 -V395 -0.101659876372798 G370 -E403 -0.104114634843819 L380 -P401 -0.10529743235919 G382 -L387 -0.105861171463011 G370 -I396 -0.109233944020513 G375 -G398 -0.113558800193287 L380 -K402 -0.116213106786939 G381 -D394 -0.116883015358731 L378 -L397 -0.117661602277987 G386 -V391 -0.117857651560007 G382 -V391 -0.118735152250268 G375 -K402 -0.118865084410514 L378 -P401 -0.124080962423343 I376 -A385 -0.125061034669148 V391 -G398 -0.125073459862582 A373 -S399 -0.126332806567408 L380 -F389 -0.127786124907546 G375 -G381 -0.128760008338912 E403 -A408 -0.12947420432797 A377 -V400 -0.131231845880198 I396 -A405 -0.133127763958159 F389 -L397 -0.134600334424556 L372 -L380 -0.138151435428146 G381 -L387 -0.138338168309771 A373 -L380 -0.138703539127808 F383 -A393 -0.138762529203665 G382 -T392 -0.139865762365138 I376 -F389 -0.141352794107419 A377 -K402 -0.142923827224754 L372 -D394 -0.143761787880523 T390 -V395 -0.146637428588009 A377 -T392 -0.146756179271688 D394 -E403 -0.147621952073351 I376 -G381 -0.148635160572228 L372 -K402 -0.14879926182644 A385 -I396 -0.149293572178057 V400 -A407 -0.150478629437484 V400 -G406 -0.1510182552731 G375 -G382 -0.153628837122045 S399 -Q404 -0.156028626219071 A388 -D394 -0.157478801162074 F379 -F389 -0.157980118888012 A393 -V400 -0.159060595391926 F379 -G384 -0.15909919494625 A388 -L397 -0.160069096582634 G406 -V411 -0.1627726330643 F383 -D394 -0.164027569522562 A385 -V391 -0.164990978107216 F383 -A388 -0.165271850359984 A385 -D394 -0.165423014028316 L372 -F379 -0.16717325041179 M374 -K402 -0.167245914815803 I396 -E403 -0.16978905041801 G375 -L397 -0.170785977901677 L380 -G398 -0.174412490151279 A377 -F383 -0.175119685347926 A373 -L378 -0.177708498367968 P371 -Q404 -0.183074479256096 I376 -T392 -0.184099753792371 L380 -L397 -0.188102890645147 G381 -I396 -0.188510415101298 F379 -G398 -0.188869089756447 M374 -G381 -0.189242213674546 V391 -L397 -0.191676830727239 P401 -E413 -0.192657134726385 M374 -S399 -0.192807707411555 G382 -I396 -0.19366839999317 I376 -E403 -0.193942376748004 S399 -A405 -0.193996042554458 F383 -I396 -0.199985777967721 F389 -I396 -0.201556666210709 G384 -V391 -0.202078107598405 L378 -G384 -0.206687373194666 G398 -Q404 -0.207928126755961 G375 -V395 -0.20824614248227 T392 -S399 -0.212486808629496 I376 -G382 -0.216011506396371 T392 -G398 -0.21958001524739 I376 -K402 -0.223970998327203 I376 -P401 -0.225706327257744 A393 -S399 -0.227754841437944 L378 -T392 -0.228155715591878 P371 -L378 -0.228242637150916 G370 -L378 -0.229897785185978 T392 -P401 -0.229957075998069 V395 -K402 -0.239862822933229 P401 -G406 -0.246875224293982 P371 -F379 -0.247078007547093 G398 -E403 -0.247237628755789 M374 -I396 -0.25628026349519 L380 -V391 -0.266121623572211 T390 -L397 -0.267605030863502 G370 -A377 -0.270806056581397 L387 -A393 -0.273697874205676 G375 -E403 -0.274366182575815 A373 -F379 -0.281610502772131 D394 -V400 -0.283179851936922 G381 -T392 -0.284937911845588 A377 -I396 -0.290028737795689 V395 -V400 -0.296319750846199 A373 -E403 -0.296815506019158 A407 -E413 -0.30091251630911 L372 -A377 -0.30279969333641 L397 -Q404 -0.317071386571871 M374 -V400 -0.317252540500064 P371 -A377 -0.32192912989754 T392 -L397 -0.322258040928681 G375 -L380 -0.329149229030532 L378 -S399 -0.3348768000557 F379 -V391 -0.335462193115365 I376 -A393 -0.336528853528309 A373 -I396 -0.3377417304252 I376 -L397 -0.354210595392447 G384 -T392 -0.356157258843354 L372 -L378 -0.356985396667399 V400 -A405 -0.359931763255874 L372 -I396 -0.365175791280857 F389 -V395 -0.36604276417863 V391 -I396 -0.369062720301002 A377 -V395 -0.372024563921892 A377 -G382 -0.37870178923457 D394 -P401 -0.406898526629274 A388 -A393 -0.421483791944285 L380 -L387 -0.426604584303734 P401 -A407 -0.427120017727479 A373 -V400 -0.457195287151032 M374 -L380 -0.457821818873136 L372 -P401 -0.461168453813909 A393 -G398 -0.477935391927145