[Mon Aug 29 17:20:16 2016] >Input file: TMB8ZZ71M1G.pdb >TM segments: 62-109_ 112-131 MAIDEN score = 6.8450 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- I68 -A74 2.44662319727335 Y69 -A74 1.31777226986001 I68 -W73 1.1778563369395 C93 -S99 1.17095521500886 I86 -L102 1.12888505605803 R70 -V75 0.843605361071417 K104 -M122 0.812517503778909 W73 -L78 0.811030182057473 V67 -F72 0.776408410149771 I92 -S99 0.660190431009057 I86 -S99 0.612523818951113 Y69 -L76 0.603026725652242 W73 -G108 0.596294859291176 F89 -A94 0.595719395436915 I115 -V120 0.569339573015624 F89 -F101 0.566786394041229 V67 -W73 0.529118791311781 F89 -A98 0.524913102664202 F89 -L102 0.510290932155753 V82 -A87 0.486494281259766 V85 -L102 0.462600387416712 C93 -A98 0.436104775688307 G71 -S109 0.426582641765698 V81 -G107 0.422911940016751 I68 -M77 0.418177964673637 F72 -L78 0.396018519256012 I86 -F101 0.378803638595042 S88 -H100 0.370903095860986 F101 -I126 0.359210971238892 V85 -L90 0.357875518401099 P96 -Q129 0.350865282570051 L76 -V81 0.349172167582264 M77 -G107 0.344497793516084 G71 -L78 0.342681649034104 V81 -G108 0.341984291259127 K104 -A113 0.340442935549079 M77 -G108 0.333692091197066 A94 -S99 0.318062398622583 V84 -Y103 0.312863094144108 F89 -H100 0.309630358650363 F72 -G107 0.307381008312383 S65 -R70 0.301879915359048 I91 -A98 0.301361389649874 G80 -S88 0.29779478316963 A74 -L79 0.294145741746977 F89 -S99 0.293368553566334 Y103 -V121 0.282271915726287 F72 -S109 0.277267339663076 S65 -A74 0.274253113252778 R70 -L78 0.272715452626257 V75 -G80 0.271896338310404 I68 -V75 0.271209356860833 G107 -L116 0.270679162163863 V82 -L102 0.266346453713257 V84 -C93 0.259373617213798 D64 -R70 0.255064220090754 L116 -V121 0.254885140931051 W73 -G80 0.253771758126327 V75 -V81 0.249759592463067 G71 -M77 0.247495710345708 G106 -G114 0.247020783994289 D64 -Y69 0.243851427523289 Y63 -R70 0.243811060863816 Y124 -Q129 0.241285204303204 S65 -S109 0.229335662824482 Y69 -M77 0.22314391598241 K104 -Y124 0.222386052448273 G106 -I115 0.207232736578394 F72 -G108 0.19460637438063 G71 -L76 0.192214478846249 C93 -Y103 0.188905126695263 K104 -W127 0.18616492267493 V82 -H100 0.185233559752133 S109 -M122 0.18230232923933 S99 -V128 0.179876222505377 A94 -H100 0.179236675829039 S118 -L123 0.177319204109929 G107 -M122 0.176351703247897 Y69 -S109 0.174718926367792 W73 -G106 0.171454724233645 F89 -K104 0.169420776903449 C93 -W127 0.165449376100985 L78 -G108 0.163725235718221 G71 -A105 0.161584277890608 A87 -I92 0.161325766435141 F72 -M77 0.156666911997403 C93 -I126 0.153738244638683 C93 -Q129 0.153465113392742 A105 -V120 0.152263922203465 I92 -H100 0.151542946733976 A98 -I126 0.15031784993081 V85 -F101 0.150245645992567 F101 -G106 0.149267367706512 F72 -G80 0.148169063959125 Y103 -Y124 0.146735603981331 I92 -A130 0.144632731397163 Y103 -L123 0.143014077472631 Y63 -I68 0.142635730264774 W73 -L79 0.142582107858245 G106 -L123 0.137973715032651 V82 -S99 0.13707871092812 V84 -S99 0.135115658202713 V82 -S109 0.134479576878626 I115 -L123 0.134417072291893 Y63 -G71 0.133644778399022 I92 -A98 0.133433686947376 Y63 -Y69 0.131907392958826 A112 -M122 0.130327517700076 V67 -L78 0.130095743507132 I86 -A94 0.129755294059077 V82 -L90 0.129314303342766 L78 -V85 0.128932343391317 L79 -L102 0.127753991559509 A87 -Y103 0.126514548899523 G80 -Y103 0.12444591269984 I115 -Y124 0.123073996250159 A74 -G108 0.120745293454142 G80 -V85 0.120488941255577 F72 -A113 0.120357341930436 L102 -L123 0.119765855852028 V84 -A105 0.119381179011512 L79 -G106 0.118511825834117 A105 -S118 0.118233204210042 V75 -V84 0.118098801181882 L123 -Q129 0.118046788439776 A94 -V131 0.118037924372431 A66 -G107 0.115900576315726 G80 -A105 0.115896447749529 A83 -G106 0.115532779108379 A74 -A83 0.115236592113368 H100 -V128 0.113964420932747 G106 -V120 0.113896189389658 A94 -A130 0.113233876383387 L76 -V84 0.112134075145328 V84 -G108 0.112062560171363 A105 -G114 0.111465263700573 Y103 -A112 0.110316943737667 S88 -Y103 0.110098257401116 Y69 -G106 0.109859443567387 A74 -G106 0.108941085735966 V85 -M122 0.108777924666064 A83 -S99 0.108107019459666 S88 -F97 0.106910782466467 G71 -A113 0.104366031249105 G80 -G106 0.103709343957251 A98 -Y103 0.103029285442244 S109 -S118 0.101373596488666 A105 -A112 0.100228821065355 V81 -L90 0.0996466109751408 L76 -V85 0.0992110317028982 K104 -I115 0.0974800891754666 F101 -W127 0.0958443373082725 A66 -G108 0.0957172049227766 V81 -I86 0.0954369993722199 A83 -G108 0.0953747122614146 Y69 -L79 0.0950089548894459 H100 -W127 0.0941965045602134 G108 -L116 0.0931999557749652 L78 -A105 0.0922919448434243 A94 -V128 0.0897547492380335 L78 -L102 0.088330375062003 S99 -A130 0.0880457246924076 A83 -C93 0.0845595581082037 A83 -K104 0.083716821571187 G71 -V84 0.0820099783759418 A105 -L123 0.0819211826354742 L79 -G107 0.0817407478058385 L119 -V125 0.0811332889960745 A95 -F101 0.0805332066963285 V75 -S109 0.0804649242394593 A66 -S109 0.0804351029426276 L116 -L123 0.0802103461958197 A87 -P96 0.0798825659768161 G106 -V121 0.0797955049512584 A87 -A95 0.0797608988767728 V84 -F89 0.0785532192532381 D64 -F72 0.0768475675756067 L90 -F101 0.0758451566519032 S99 -W127 0.0737613686760685 A112 -L123 0.0736995275190679 Y69 -V81 0.0733085844209977 I86 -G106 0.0727115000028995 R70 -S109 0.0719093442671822 V75 -G107 0.0701725449369999 A105 -V125 0.0694829517040949 G80 -L102 0.0664014445658729 V84 -I92 0.065298465506558 S99 -V125 0.0650893090587079 R70 -A83 0.0647478083636416 I91 -H100 0.0633945298352419 L79 -A105 0.0629382419799451 S118 -Y124 0.0627312277650711 I86 -G107 0.0625769210314555 F101 -Q129 0.0620134445014742 P96 -V128 0.058764497037314 G107 -G114 0.0583025402167721 S65 -G107 0.057636583651683 A83 -A105 0.0569146746108755 I92 -V131 0.0567674051541145 V120 -I126 0.0562930301259863 S109 -I115 0.0562701416681146 S65 -M77 0.0547128796583278 I126 -V131 0.054343727479198 S99 -Q129 0.0541406846257502 A112 -L119 0.0519463979224497 V125 -A130 0.0516374419476744 L102 -V125 0.0507722621488655 H100 -Y124 0.0506138520481567 V67 -A74 0.0503897584607511 L90 -I126 0.04948502627074 F89 -M122 0.0481383412443182 M77 -A105 0.0471340854000895 A95 -Q129 0.0470656356841417 V75 -G106 0.0468494483730435 I86 -F97 0.0459649458873077 S62 -V67 0.0459222509128914 C93 -L102 0.0458760775177876 G108 -G114 0.0458054478178891 V84 -A98 0.0451719339667171 G106 -S118 0.0435331181700951 A105 -I115 0.0420498455037897 I86 -M122 0.0410948492608263 V85 -A94 0.0410231656978786 F72 -K104 0.0405961009333238 L78 -G107 0.0404852352739198 S88 -K104 0.0403235709281971 I86 -I126 0.0397783542607026 G80 -S109 0.0391714903003182 G71 -A112 0.0387524459379343 M77 -V82 0.0367410631390683 A105 -I126 0.0360538848330316 A98 -A130 0.0353754588768522 A83 -G107 0.0334691510637084 A94 -L102 0.0331388921031955 Y103 -V125 0.0324708465673929 I68 -V81 0.0307372964520729 L90 -A98 0.0292566728342987 R70 -G106 0.0290732085690291 V67 -G106 0.0280315545769034 V81 -K104 0.0276305385415418 F97 -L102 0.0275542944938332 F101 -M122 0.0273647804987505 G106 -L116 0.0270113054679939 V81 -Y103 0.0267149556830324 F117 -L123 0.0267050703252645 A83 -Y103 0.0260182398780171 F97 -V131 0.0259357240906013 L102 -W127 0.0257838747792709 L119 -W127 0.0255611951978738 S99 -K104 0.0253442156151283 L102 -G108 0.0250669655772304 K104 -V120 0.0235328271273528 I86 -A105 0.02257746062911 G80 -F89 0.0223256440212745 A87 -F97 0.0221848543365928 A105 -V121 0.022085425733676 Y103 -G108 0.0215330533049034 V67 -S109 0.0196962508587637 I115 -M122 0.0196094896814287 G108 -M122 0.0190325219198693 I91 -A130 0.0175799990369949 S88 -A95 0.0174928435685053 F97 -V128 0.0171216029174754 H100 -G106 0.0163929777292978 K104 -S109 0.0157986206312903 F89 -W127 0.0157484767338647 A113 -M122 0.0155580195362881 G80 -L90 0.0154306885101656 A83 -A98 0.0138271396140968 V81 -S109 0.0135595740155257 R70 -G107 0.0131946030342633 L102 -G107 0.0131534515095382 F101 -V125 0.0130121494658075 S109 -F117 0.00991366068416316 A94 -Q129 0.0092658827668104 H100 -L123 0.00916643108889018 A113 -V120 0.00861517144306512 I92 -I126 0.00545657646461262 G106 -V125 0.00539026833855516 H100 -A105 0.00463188280437765 A74 -V82 0.00389625184376796 L119 -I126 0.00360990642130865 A87 -H100 0.00267195467487946 V67 -V81 0.00246349006402724 V85 -H100 0.002383824358275 S88 -C93 5.73500716747333e-05 G106 -F117 -0.000123639592509939 L116 -Y124 -0.000847726808362204 A112 -S118 -0.000885806218361984 V75 -A83 -0.00169762961828956 V84 -G106 -0.00258108418538772 V84 -A94 -0.00260108700211159 A83 -I91 -0.00309594407804825 L123 -V128 -0.00592843934867915 V85 -A98 -0.00835327500421323 A87 -L102 -0.00870655640629248 A66 -V75 -0.00928576323668029 F72 -A83 -0.00937619558072278 V85 -L123 -0.00953770515863095 I92 -V128 -0.0107950262893737 G71 -V82 -0.0114838602050824 I68 -L76 -0.0131452715665135 A83 -I92 -0.0144604408309902 M77 -A83 -0.0145346055309448 K104 -A112 -0.0148127569167 L90 -A95 -0.0150292925590787 A66 -M77 -0.0152175783491941 M77 -S88 -0.015811147596084 C93 -F101 -0.0168602741939914 V82 -A98 -0.0170821565386969 F72 -A105 -0.01772608402079 A74 -A105 -0.0185976789073274 K104 -L116 -0.0228473056366507 A113 -V121 -0.0229756382103843 Y103 -I126 -0.023901107226334 V81 -L102 -0.0242295351347899 A95 -V128 -0.0243953035962945 F89 -V128 -0.0260216079233251 A98 -V128 -0.0260524345518032 F89 -G106 -0.0265289673127005 V84 -K104 -0.026744523317487 F72 -V82 -0.0268239555021097 A66 -F72 -0.0273168160447455 V84 -L90 -0.0278417208464568 I92 -W127 -0.0280816425146506 C93 -V128 -0.0281746710328701 L116 -V125 -0.0284992177027954 F89 -Y103 -0.0287667166897938 V81 -F89 -0.0291082054809371 I68 -G80 -0.029571947679786 V67 -A113 -0.02969860833301 F97 -A130 -0.0305629493799535 I86 -A95 -0.0307436191239265 S65 -V75 -0.0310210471325925 V84 -G107 -0.0316734762135953 A66 -L78 -0.0317288730441314 F89 -V125 -0.0357135343942039 W73 -A105 -0.0367781699503071 V82 -A105 -0.0368070339311206 A83 -L102 -0.0368423169569184 C93 -A130 -0.0374908259433759 S65 -G108 -0.0377217780739614 F89 -P96 -0.0384804983779162 L76 -G107 -0.0386793413580584 M122 -V128 -0.0388569069593343 V121 -V128 -0.0401636957012259 V82 -I92 -0.0406431824313938 F72 -G106 -0.0407940276604046 Y69 -G107 -0.0424714452116484 P96 -W127 -0.0440375671160842 R70 -L76 -0.044239031639397 G71 -G106 -0.0446513654219123 R70 -G80 -0.0469804684225519 F101 -G107 -0.0473152729910264 R70 -V82 -0.0477436089285295 A83 -S88 -0.0480410291785054 M77 -I86 -0.0492029735348547 L76 -G106 -0.0498489369364288 M77 -A87 -0.0501652801902095 A105 -Y124 -0.0507790088376154 G71 -A83 -0.0511857428423461 G107 -F117 -0.0519020920992806 F101 -G108 -0.0522816762641329 A74 -V84 -0.0523821471279082 Y69 -G80 -0.052721673173826 I92 -Q129 -0.0540086229643659 V82 -G108 -0.0542519777582573 S88 -I126 -0.0557897851778746 L102 -S109 -0.0560347851516907 G107 -A112 -0.0573448676685562 Y69 -V75 -0.0575303160298763 P96 -F101 -0.0584987409948026 L76 -S109 -0.0596352176143879 S99 -L123 -0.059647333492219 I91 -F101 -0.0599463204293598 V85 -S109 -0.0613066865985381 R70 -G108 -0.0614277274112922 W73 -A83 -0.0617289623761509 M77 -V84 -0.062643758400001 F72 -L79 -0.0648700777269449 S109 -V121 -0.0649316138820564 V81 -S99 -0.0649843331983897 I91 -V131 -0.0675921758967153 A94 -F101 -0.0679086505804998 A105 -M122 -0.0685499147944864 L123 -A130 -0.0701174631468717 V81 -F101 -0.0703718802210487 I92 -F101 -0.0705456737417292 V85 -G107 -0.0709591902586917 S65 -W73 -0.0727256217509735 F101 -V128 -0.072984368507961 G114 -V120 -0.0730138708437513 A83 -F101 -0.073844012706429 G80 -A87 -0.0751004675551625 Y103 -V120 -0.0757602491208309 S65 -F72 -0.0769091504545636 V81 -H100 -0.0769500118651756 L79 -S109 -0.0793143500951015 G108 -A113 -0.0804548717994331 G106 -A112 -0.0814587005589615 I86 -I92 -0.0817645703173273 V82 -I91 -0.0820858996019682 I68 -L79 -0.0827611419430214 G107 -V121 -0.0834048476635116 M77 -L102 -0.0834118452551671 V120 -W127 -0.085009367500556 S88 -F101 -0.0864720720155538 L79 -I86 -0.0874274356298885 W73 -V82 -0.0874944755953038 A113 -S118 -0.0876181251387802 I91 -F97 -0.087769586351107 L102 -I126 -0.0878998013837958 G71 -V85 -0.0882335499996278 L78 -Y103 -0.0892820198121802 V85 -C93 -0.0917786285312285 A74 -V81 -0.0925613053105536 V84 -F101 -0.0930049783679605 F89 -V131 -0.0930891850746987 A66 -L76 -0.0933857519041879 W73 -S109 -0.0937407181260224 L79 -A87 -0.0939890492972641 I92 -L102 -0.0944012018510047 A95 -H100 -0.0962720391245355 M122 -W127 -0.0976768224188405 F72 -A112 -0.0997363847492618 H100 -V125 -0.100206994650616 L78 -G106 -0.100728519413888 V120 -V125 -0.100845779463526 L90 -Y103 -0.102253997103703 I115 -V125 -0.102414891504601 A83 -H100 -0.102522603134121 V82 -F101 -0.102922193558965 G107 -A113 -0.104275275383469 V67 -G80 -0.105008241489006 F101 -V121 -0.105068764741085 G108 -I115 -0.105533132848525 L102 -V121 -0.10596925168447 I86 -G108 -0.106058844707641 F89 -I126 -0.10631859988109 G80 -G107 -0.106423008033779 A113 -L119 -0.106790630976835 A87 -F101 -0.107111418054272 S118 -V125 -0.10762315087737 F117 -Y124 -0.107670178537431 G106 -I126 -0.107732110639024 V67 -L79 -0.111245350469965 Y69 -L78 -0.112165152237241 V81 -A105 -0.112272782403381 Y69 -G108 -0.112965318446501 I91 -L102 -0.113501206546046 V85 -I126 -0.113628943594948 F97 -I126 -0.115914686835144 L90 -F97 -0.115962697584612 I68 -G106 -0.116501581057961 A66 -W73 -0.117856269381313 G107 -I115 -0.11912440650709 C93 -V131 -0.119404041515677 S99 -A105 -0.119419240332332 D64 -G71 -0.119976974406078 G71 -G80 -0.120018232959117 F101 -Y124 -0.120545562710711 A74 -G80 -0.120845203078416 G106 -A113 -0.121074213046147 L90 -S99 -0.122077293856208 V85 -G108 -0.123778444641689 F89 -A130 -0.127022814135135 G114 -M122 -0.128041082864314 S65 -G71 -0.129146287187011 F89 -L123 -0.129732690079571 V67 -G107 -0.130699213671162 G71 -V81 -0.131706752174495 A105 -F117 -0.131958376217586 F89 -A95 -0.133690293765093 S88 -L102 -0.134205139882507 K104 -G114 -0.134219435657169 P96 -I126 -0.134533597210505 W73 -V81 -0.136044129133033 V84 -I91 -0.136412982429713 G80 -K104 -0.136413776244285 M77 -S109 -0.137464329372648 A87 -S99 -0.137969941364021 F97 -Q129 -0.139257255863881 K104 -V121 -0.140314107525644 I86 -A98 -0.141821170579668 L79 -G108 -0.143846597228039 S99 -M122 -0.143852412441598 F89 -A105 -0.14432062354968 G114 -V121 -0.144748989936701 A98 -K104 -0.145331456362522 Y103 -S109 -0.145970800824015 S109 -G114 -0.146292371289172 V85 -G106 -0.146581609230538 A87 -K104 -0.147883441613799 P96 -A130 -0.147890779670777 F101 -V120 -0.149257327706031 V75 -G108 -0.150126909934325 M77 -G106 -0.150229622896611 I68 -S109 -0.150733342578691 V82 -G107 -0.150733409533347 I86 -Y103 -0.15153759135542 G114 -L119 -0.152041873011454 M77 -V85 -0.156402441459654 R70 -V81 -0.159214577070467 G80 -G108 -0.161132596985458 S88 -A98 -0.162168049262232 S88 -S99 -0.162185937972628 L78 -V84 -0.163142135249023 A112 -V121 -0.163853081844413 V85 -A105 -0.16404109651974 L78 -I86 -0.164753065197372 A87 -C93 -0.165155098943474 L78 -A87 -0.165559159075996 P96 -V131 -0.165641554345551 D64 -A74 -0.167993707893694 L119 -Y124 -0.168846280403548 L76 -G108 -0.170895449172341 R70 -L79 -0.171319449634793 V67 -G108 -0.171857735724895 S88 -P96 -0.172852018866428 S88 -A94 -0.173315264571503 G106 -M122 -0.174026651110955 A87 -A98 -0.179854196036187 I92 -F97 -0.180937056848467 A95 -A130 -0.181029011383548 G80 -I86 -0.182093185871425 L76 -V82 -0.18254363809043 L78 -S109 -0.182927476577822 I86 -I91 -0.183586129467916 L102 -M122 -0.183620454318062 Y103 -M122 -0.185747282792961 V67 -L76 -0.186431820587392 L79 -S88 -0.187824008715114 I68 -G107 -0.188265188161527 S65 -L76 -0.191209899444442 A105 -A113 -0.19237917593993 I86 -H100 -0.196491990320981 F101 -L123 -0.199980447307816 H100 -I126 -0.202053567221177 A83 -L90 -0.203774193287376 A87 -A94 -0.205637859161591 C93 -H100 -0.2063768190589 K104 -L123 -0.208146516316428 K104 -V125 -0.209862529840477 V82 -G106 -0.209941184480483 H100 -V121 -0.21268559250644 I91 -S99 -0.213053803280647 W73 -G107 -0.217867744384399 F89 -F97 -0.221043013803068 V81 -G106 -0.227535111331925 A74 -S109 -0.22776183173691 V85 -K104 -0.230716400519856 L90 -K104 -0.232550097571998 F117 -M122 -0.234378807183847 G71 -L79 -0.236310032895684 V82 -K104 -0.237572323755087 H100 -M122 -0.238445082134376 L78 -K104 -0.238605700073695 V75 -V82 -0.244913514844426 I91 -P96 -0.246802712106016 A83 -F89 -0.251127369708471 V82 -Y103 -0.252432957093649 V67 -M77 -0.252552395812994 G71 -G107 -0.254066012385196 L90 -H100 -0.254404982129412 V85 -I92 -0.255856728936894 A66 -G71 -0.260096807936926 V84 -H100 -0.260160672212114 I86 -C93 -0.265165304601012 I68 -G108 -0.265306618317892 V81 -S88 -0.267425689202973 K104 -I126 -0.273122344577831 A105 -L116 -0.274235718899748 L76 -A83 -0.276397589565913 V82 -F89 -0.278701166247992 L79 -V85 -0.282505994772015 R70 -V84 -0.29011136636216 S109 -L116 -0.295010446781608 L78 -A83 -0.303099899591699 I115 -V121 -0.30568237903255 R70 -M77 -0.305842766366971 F72 -V81 -0.307142721832198 I86 -K104 -0.311953913609774 G71 -G108 -0.324806498939541 A112 -V120 -0.32667412191736 V85 -S99 -0.332207656910522 V84 -L102 -0.334748794285826 V82 -S88 -0.345081452588933 A95 -V131 -0.346623867067943 S99 -I126 -0.35164081319869 L90 -L102 -0.352171747073594 V67 -V75 -0.353137192380523 V81 -A87 -0.362347576707911 I68 -L78 -0.366882011328275 V85 -I91 -0.368197065407688 V85 -Y103 -0.383209362533788 V121 -W127 -0.400314365052524 A66 -A74 -0.409487792688056 L116 -M122 -0.436968111425948 L79 -V84 -0.445546801381218 V121 -I126 -0.457374540596171 A74 -G107 -0.45997114730787 A112 -F117 -0.466479901684024 L90 -P96 -0.567856645433961