[Fri Aug 26 18:17:52 2016]
>Input file: TMC5UPU1M1D.pdb
>TM segments:  353-361_ 370-402

MAIDEN score = 1.1520

Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy
(the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs.

The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10.
See the MAIDEN software article:
Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161.


-----------		----------------
Calpha pair		Empirical energy
-----------		----------------
F390 -I395 		1.17657616955708
A356 -E385 		0.90720736450319
V355 -F383 		0.882477319146239
V389 -R394 		0.82473957150075
T378 -F383 		0.76159774935113
G359 -V382 		0.652021873743583
G360 -F383 		0.6259619438334
G360 -V382 		0.618122925431629
A356 -P380 		0.595979435054067
I395 -T400 		0.57342924330559
F379 -E385 		0.571733837814309
F377 -E385 		0.558180538953267
P358 -F383 		0.557387426821458
F377 -D384 		0.549158007416758
G359 -S386 		0.489228311661246
F379 -D384 		0.434129523592514
Q357 -D384 		0.433452514842334
Q357 -V389 		0.42453358771607
A356 -V382 		0.386415039464158
V355 -S386 		0.375382438978692
P358 -D384 		0.363098513899442
G360 -Q375 		0.36210680805389
F377 -E388 		0.303224655242998
V355 -Y393 		0.28348663767949
T378 -E388 		0.276223615183634
Q357 -M396 		0.27547300557974
D374 -G387 		0.271998897151147
G359 -N391 		0.26974932850019
Q375 -S386 		0.253189634706097
P358 -L398 		0.249347601951203
G354 -S386 		0.248866996098995
V355 -V389 		0.246706248462708
N373 -G387 		0.239306973784297
P358 -Y393 		0.236195210319649
G360 -F377 		0.234319562436711
E388 -Y393 		0.22182652263608
G359 -Q375 		0.219765394792197
E388 -R394 		0.219381192142674
G354 -D384 		0.21666769497524
P358 -Q375 		0.212087799992112
G360 -D384 		0.212014612364105
G359 -D374 		0.211438691084302
E361 -G387 		0.209004915811235
A356 -G376 		0.208259174754684
Q370 -G387 		0.204520822290715
G359 -D384 		0.200124156811287
E361 -D374 		0.191905785391259
Q357 -N391 		0.191377374814322
E361 -Q370 		0.190836773745295
P358 -N373 		0.189478199851219
P358 -S397 		0.184633768586952
Q357 -Q375 		0.178541858033517
F383 -V389 		0.177158059597788
S386 -M396 		0.176992867308564
V355 -P380 		0.174551439904832
Y393 -P399 		0.166757510253195
G360 -D374 		0.16672516196293
G359 -N373 		0.166235702348611
P358 -F390 		0.16465408675015
F390 -M396 		0.163933771864688
E361 -G376 		0.160550376238826
R394 -P399 		0.158457689687458
P358 -T400 		0.158310530369567
S397 -F402 		0.157735125837933
F371 -E385 		0.15430781634449
P358 -E385 		0.151524441381044
E385 -F390 		0.151168551554702
N391 -F402 		0.146816639560739
G359 -V389 		0.14668569944318
G360 -F371 		0.143341019222935
V382 -V389 		0.14265951757069
Y393 -L398 		0.140876400653083
G359 -E385 		0.14076142737654
L353 -S386 		0.139958197289721
N373 -N392 		0.139246744489911
P358 -L372 		0.137742311435132
G387 -M396 		0.134640189370666
G376 -D384 		0.134442737121297
G359 -P380 		0.133948808756805
S386 -S397 		0.126051546732152
F377 -G387 		0.125905661407458
G360 -F379 		0.123281044383836
G354 -E385 		0.12244829855984
P358 -P399 		0.122071539097414
D384 -N392 		0.119657326457714
P358 -N392 		0.118556434371818
Q375 -G387 		0.118331893735989
G359 -V381 		0.117008805780442
P358 -Q370 		0.115675347995264
F390 -T401 		0.113880677470684
N392 -T401 		0.112869893838208
R394 -T401 		0.112168984147876
E361 -E388 		0.111504759048273
Q357 -T401 		0.110707245539789
S386 -T400 		0.110190645476441
Q357 -F379 		0.109607774826553
A356 -N391 		0.107590742205589
E361 -V382 		0.105831180125419
G360 -V381 		0.104258667442964
D374 -E388 		0.104113235492589
N373 -T378 		0.100615454519169
G376 -V389 		0.100024768515933
A356 -T400 		0.0988573480988141
V389 -T401 		0.0982988988620621
F371 -F390 		0.097797612648888
Q357 -S397 		0.0977254732433464
D374 -S386 		0.0975159653893909
L372 -S386 		0.0974585149023675
P358 -M396 		0.0973667965380849
L353 -P380 		0.0963740727820334
G360 -T378 		0.0935228307778876
S386 -R394 		0.092514084270342
Q370 -E388 		0.0923896445906944
E361 -T378 		0.0915073053668207
P358 -R394 		0.091129736852416
E385 -R394 		0.089666633627969
G359 -G376 		0.089392411327279
S386 -T401 		0.0854365182582765
G360 -E388 		0.0848848124502157
L372 -F383 		0.082686399571517
G354 -G387 		0.0824272045011967
V389 -P399 		0.0816835084823015
L372 -F377 		0.0808764523868244
A356 -P399 		0.0797809886052638
Q357 -G376 		0.0783091673508935
V389 -L398 		0.0774577203392797
A356 -L398 		0.0774208266351941
E385 -N391 		0.0760294664150862
V355 -E388 		0.0712917352239337
Q357 -F390 		0.0706598221539307
L353 -D384 		0.0705280563523907
P358 -S386 		0.0702246935144268
F383 -F390 		0.069673023559357
L353 -T400 		0.0670680147192602
V355 -T378 		0.0662448045156601
A356 -F377 		0.0627098059499327
Q357 -F402 		0.0627001931263944
F371 -F383 		0.060677083087965
V381 -S386 		0.0594905885652621
N373 -D384 		0.0562742293359548
V355 -P399 		0.0548734893018263
L353 -V389 		0.0547976712008174
G354 -P399 		0.0522175082068621
S386 -I395 		0.0521816797513667
N373 -V382 		0.0519780252818989
G387 -S397 		0.0512735099593553
G360 -V389 		0.0505887199987626
V389 -T400 		0.0499801919814535
G376 -N391 		0.0457918261749182
G354 -T400 		0.0448378502745626
N391 -S397 		0.0447103372077455
M396 -F402 		0.0446515483035606
Q357 -L372 		0.0432954374165879
P358 -D374 		0.0418737683722261
N373 -F383 		0.0403763230804006
P358 -I395 		0.0397998398302932
Q375 -P380 		0.0396306354841052
V389 -M396 		0.03918591224389
F383 -P399 		0.0380635433970715
S386 -F402 		0.0379938670691109
L353 -F383 		0.0368100155941455
A356 -S386 		0.0364122494493406
G387 -L398 		0.0326983485338275
N373 -E388 		0.0309316293306382
M396 -T401 		0.0308296480909647
G359 -N392 		0.0283991835389794
V382 -G387 		0.0276912443740223
G354 -F390 		0.02753245949744
P358 -G376 		0.0264131481569407
Q357 -F371 		0.0261165581480942
Q375 -E388 		0.0247385734365504
L372 -E385 		0.0244339020291404
G359 -L398 		0.022844072391988
G354 -L398 		0.0227634273699575
V355 -L398 		0.022696006233768
D384 -F390 		0.0212157199232292
Q357 -V381 		0.0206319897509653
V355 -I395 		0.0195871888216264
N392 -S397 		0.0186859711190563
N391 -T401 		0.0165238997851711
N373 -N391 		0.0143936877537932
R394 -F402 		0.0131611447665025
G359 -G387 		0.0130707939743397
P358 -V381 		0.00864373114903705
F390 -P399 		0.00683832387770589
V381 -G387 		0.00522181790643739
L372 -F390 		0.00228731989526576
L372 -T378 		0.00149579439581804
G387 -R394 		0.000733824759464596
G376 -G387 		-0.00141604294403375
V355 -G360 		-0.00183076622320222
L353 -V381 		-0.00261174352719085
V355 -E385 		-0.00463891882892931
G360 -Q370 		-0.00595120551678674
T378 -G387 		-0.00631831725834875
Q357 -Y393 		-0.00824736850034835
F371 -N392 		-0.00878922806415083
Q375 -V381 		-0.00984202054164851
G354 -V381 		-0.0101317912747989
F371 -R394 		-0.0105467588926409
F371 -S386 		-0.011549137815547
V355 -N391 		-0.0121081425446681
Q357 -S386 		-0.0139982879621594
G354 -V389 		-0.0147754357914014
T378 -V389 		-0.0152744456430893
E388 -M396 		-0.0155056459878917
E361 -L372 		-0.0165679199228288
A356 -N392 		-0.0168645890169892
T378 -S386 		-0.0172957660226252
G360 -P380 		-0.0185148051062546
G354 -F379 		-0.0190161832452493
A356 -F383 		-0.0190684754532269
F390 -F402 		-0.0227075005268595
F371 -V389 		-0.0260302449726313
V355 -N392 		-0.0263531426688963
G360 -G376 		-0.0263771749626027
F371 -G376 		-0.0294949436023306
A356 -N373 		-0.031246854889222
N392 -T400 		-0.0319519709636427
A356 -Q375 		-0.0322556778669876
A356 -I395 		-0.0324300659693257
R394 -T400 		-0.032522158598784
G387 -F402 		-0.0352673210135461
E361 -F377 		-0.0360839409789779
F379 -E388 		-0.036209764511506
Q357 -I395 		-0.0362747780001866
N392 -F402 		-0.0369570929332008
N391 -L398 		-0.0374049005983039
L372 -N391 		-0.0378695806858032
E385 -N392 		-0.0391546594887028
Q357 -V382 		-0.0429032838872132
G354 -T378 		-0.0429601384825964
A356 -Y393 		-0.0450848266001485
Q357 -R394 		-0.0454965802121916
A356 -E361 		-0.0487897383802636
G387 -T400 		-0.0504893312578838
G354 -V382 		-0.0508136698871375
L372 -G387 		-0.0519525017168236
F379 -G387 		-0.0526782200351978
P358 -F377 		-0.0540108536548134
P380 -G387 		-0.0540298868407478
G360 -F390 		-0.054825500259712
P358 -F371 		-0.0584356047435772
D374 -F379 		-0.058632373475743
E385 -I395 		-0.0628276021827681
F383 -E388 		-0.0629279360718815
Q357 -N392 		-0.0635253104372964
Q375 -D384 		-0.0641161501497083
Q357 -N373 		-0.0682286910829208
V355 -G376 		-0.0694992396434886
F371 -N391 		-0.0695982496079577
E361 -D384 		-0.0704180743822511
G376 -E388 		-0.0727521102916056
P380 -V389 		-0.0737015695342077
N373 -F379 		-0.0759033758884122
Q370 -N391 		-0.0761374566603665
L372 -N392 		-0.0766464842800545
E361 -Q375 		-0.0775406888762642
G387 -P399 		-0.0779646712235917
D384 -Y393 		-0.0783916101838056
Y393 -T400 		-0.0784521609968669
V355 -V381 		-0.0784961338061354
E385 -Y393 		-0.0818220439482173
N373 -V389 		-0.0827650044153448
V389 -S397 		-0.085531833638183
F383 -L398 		-0.0859900550690877
F390 -L398 		-0.0866084785628143
D374 -F383 		-0.0870857667200771
E388 -T400 		-0.0881097098262371
N391 -T400 		-0.0884039089618935
T378 -F390 		-0.089818787320878
S386 -L398 		-0.0899853525100571
P358 -V389 		-0.0924690065838085
G387 -Y393 		-0.0929421563462833
Q357 -D374 		-0.093124984823817
F379 -S386 		-0.0931749399949422
F390 -S397 		-0.0941274278337532
L372 -D384 		-0.0950945335594211
E361 -S386 		-0.0958578466027942
G359 -Q370 		-0.0963342949704211
A356 -F390 		-0.0972634878747272
Y393 -F402 		-0.099140252122937
D374 -E385 		-0.102393551571299
A356 -V389 		-0.103794880174843
A356 -V381 		-0.103908456735102
A356 -S397 		-0.104068879368531
S386 -N391 		-0.104239132615061
G359 -I395 		-0.105471648087585
L372 -V389 		-0.105482268968923
G354 -F402 		-0.105968654023476
G359 -F390 		-0.106422262895808
G360 -G387 		-0.107263746262873
Q370 -F390 		-0.10785818568024
A356 -F402 		-0.108457956644677
E361 -V381 		-0.109059230757108
V382 -F390 		-0.109648457206983
A356 -R394 		-0.110166550431802
E361 -E385 		-0.111074345422178
L353 -F379 		-0.111401866262717
G376 -F390 		-0.111841404270733
Q370 -N392 		-0.113630486933765
V355 -G387 		-0.113992029693771
N391 -M396 		-0.115657120502156
F377 -S386 		-0.116514180147367
F383 -N391 		-0.116675936057077
G376 -V381 		-0.116784662139793
E361 -N373 		-0.116888002526738
F377 -V389 		-0.118910960945968
G359 -F377 		-0.11986287951682
G360 -S386 		-0.119959266502895
G359 -E388 		-0.120134881544792
V355 -F377 		-0.120256457118656
D374 -V382 		-0.120686383730198
A356 -T378 		-0.120851473721992
N373 -F390 		-0.120877098747912
A356 -F379 		-0.12231047645149
N373 -S386 		-0.12647637181316
P358 -V382 		-0.1268287466686
G360 -L372 		-0.127405539691448
L353 -E385 		-0.12810081963999
N391 -P399 		-0.128769301995442
F379 -V389 		-0.129135607684983
P358 -F379 		-0.131437853125219
A356 -T401 		-0.131777867030029
G376 -S386 		-0.133171482395378
E361 -F390 		-0.135590758548086
Y393 -T401 		-0.135672516568283
L353 -P399 		-0.140456549655438
F371 -I395 		-0.140474914932604
D384 -N391 		-0.140873950951366
E388 -F402 		-0.143328464783687
D374 -D384 		-0.145746230751194
P358 -E388 		-0.146803340961974
G354 -F383 		-0.151430700036232
N373 -E385 		-0.153401133106764
G360 -N373 		-0.153705318835899
G359 -F371 		-0.15577454129821
D384 -V389 		-0.157161053065368
Q357 -F377 		-0.158412980244956
S386 -P399 		-0.158447041225664
E388 -I395 		-0.158763428711784
V382 -E388 		-0.1635573316863
G359 -F379 		-0.163948132330849
G354 -P380 		-0.1665195724206
G387 -N392 		-0.169334173810144
P358 -P380 		-0.169687447449735
F377 -F383 		-0.170109609355563
G376 -F383 		-0.173725790835601
V355 -T400 		-0.174359480164022
Q357 -G387 		-0.174643794030221
P358 -T378 		-0.17815317925163
Q357 -T378 		-0.178680737781779
Q357 -T400 		-0.184932793890408
G387 -I395 		-0.193412849741752
G376 -V382 		-0.194435327561847
V355 -F379 		-0.20044322972811
L372 -E388 		-0.211521808087795
G354 -T401 		-0.213482225562136
V355 -T401 		-0.217285287945369
P380 -E385 		-0.218683653329669
L353 -T401 		-0.221183476630581
I395 -F402 		-0.226698928881164
Q357 -E388 		-0.226762085355154
D374 -V381 		-0.230176544853424
Q375 -F383 		-0.236673935360604
G359 -T378 		-0.237700795557663
A356 -E388 		-0.259221533994154
F371 -G387 		-0.266251369548761
G359 -L372 		-0.266896998931065
Q375 -E385 		-0.268314165586635
G360 -E385 		-0.273406396850184
V355 -R394 		-0.278566616252536
L353 -F402 		-0.281318106023296
F377 -V382 		-0.285782038035249
A356 -G387 		-0.289307471322365
S386 -Y393 		-0.304456724364293
S386 -N392 		-0.304914636434734
V355 -F390 		-0.306403988475759
V355 -D384 		-0.32203707020124
T378 -E385 		-0.322708272384537
P380 -S386 		-0.326057378607412
P358 -N391 		-0.336330150209218
A356 -D384 		-0.348262414372931
G359 -F383 		-0.349818065199119
V355 -V382 		-0.351339030239142
V389 -F402 		-0.35298245620802
P380 -E388 		-0.363121616310606
F371 -E388 		-0.365767563230988
I395 -T401 		-0.368953737408281
V355 -F402 		-0.374751453410305
G376 -E385 		-0.378763811632831
F390 -T400 		-0.380588966991732
T378 -D384 		-0.393333232712358
Q357 -E385 		-0.400722353365827
Q357 -P399 		-0.405683039146012
Q375 -V382 		-0.411643931102105
Q357 -F383 		-0.416090314931157
P358 -G387 		-0.434396730966738
E361 -F371 		-0.446880222519634
Q357 -L398 		-0.451028389476772
E361 -F383 		-0.460186630366596
V389 -I395 		-0.471414984593137
Q357 -P380 		-0.614529285727832