[Mon Aug 29 17:49:30 2016] >Input file: TMD6AYY0M1G.pdb >TM segments: 343-398 MAIDEN score = 1.6458 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- L368 -V394 1.25899661983797 V350 -F355 0.997475974001343 I371 -V377 0.896118579095842 D370 -V394 0.885678309838555 L372 -D398 0.820780363609421 I371 -M378 0.818645332015432 V350 -F367 0.747826943065743 V350 -T366 0.684607708600803 I371 -S395 0.656485762883289 A351 -F367 0.630995091350954 L368 -A393 0.615371868997346 I371 -G381 0.56252113709972 G365 -S391 0.556698140579352 F355 -A390 0.554609662379154 F355 -F367 0.521388288691199 F355 -G365 0.504817368084908 F355 -A363 0.499045959948656 F355 -T366 0.473471334049487 L372 -M378 0.472085969033524 L384 -S395 0.448005326666698 A351 -T387 0.440075657227115 W357 -A363 0.428406448798464 G354 -T366 0.412606144301334 F367 -V394 0.400788042296828 D370 -M378 0.399384654245611 I371 -A397 0.37936514980996 A349 -A390 0.376970262486578 A351 -A363 0.372403153579921 M378 -A397 0.371816257927217 L372 -A397 0.355807847881724 A351 -L389 0.354508312435937 L384 -A393 0.352004079242143 G347 -A390 0.330362506004301 A349 -G356 0.327502386157777 A351 -P388 0.321380432637781 G381 -S395 0.316634569773856 G375 -G383 0.314181460623357 T366 -L392 0.313391829616112 G373 -M378 0.301889510351088 G354 -R362 0.293278019941162 F367 -T387 0.290505545901535 G386 -L392 0.286244020934939 G383 -G396 0.282407175747605 G369 -L392 0.278005565202063 D364 -A390 0.27027343307189 V343 -D370 0.262516930969222 G375 -D398 0.260908805013816 G356 -R362 0.256517644503343 A353 -Q358 0.252699621576374 G347 -T387 0.25126051056625 T366 -L384 0.238367467637303 L345 -G386 0.236569096712667 L368 -G383 0.235196518153082 G373 -D398 0.229357575790726 T348 -T387 0.226167764091745 G356 -T366 0.217631174720394 G383 -V394 0.216991773845398 M379 -V394 0.21433107052977 F367 -G396 0.212229587908208 T366 -P388 0.21129149333048 T348 -G369 0.206813435120391 G369 -L384 0.206406163593216 G354 -D364 0.205909772423024 F355 -D364 0.203618968484823 G369 -G386 0.201339464541364 F367 -A393 0.200375382546159 A349 -F355 0.199687695362258 T387 -A393 0.195787764870856 L368 -G396 0.194801035774001 A382 -S395 0.189051390412763 F367 -P388 0.18401324544931 G347 -G356 0.183617114826316 G365 -V394 0.181205838225924 L384 -G396 0.180952612915881 G373 -A380 0.17993390059086 A351 -G386 0.179324359334917 G356 -L389 0.179322267158393 A353 -D364 0.178942442167882 G369 -A393 0.178627561902734 A380 -T387 0.177093991958216 L346 -T366 0.175322593132117 A351 -G383 0.165525213042825 G383 -A393 0.165283155515795 T348 -G383 0.165117851584402 G347 -G383 0.162248350117061 G347 -A385 0.15792246532032 G375 -G396 0.157214256382305 T387 -L392 0.156921211617666 G347 -G381 0.156642702402365 A352 -G365 0.154545140411491 D364 -V394 0.152450511727009 D364 -A393 0.15164071218476 T348 -P388 0.151184647500516 G381 -A393 0.149735174279846 A351 -D364 0.147490075382624 A385 -S391 0.144876508171141 F367 -G381 0.1445608486874 G347 -G354 0.141668564541903 A351 -R362 0.140281641949376 A352 -R362 0.139014035124311 V343 -G386 0.138166431255111 I371 -M379 0.138027328474553 L346 -P388 0.137903895364577 G373 -G396 0.136399417348972 W357 -G365 0.136090757079866 I371 -V394 0.135984957775365 A352 -S391 0.134759017133492 T348 -L389 0.1334969857953 P374 -G381 0.132419894500134 V377 -S395 0.130052608194775 I371 -G396 0.129644746954129 G347 -L392 0.126945882519061 G347 -G365 0.125913505741048 G369 -M379 0.125646238186647 A351 -S395 0.124891682016846 A351 -S359 0.124714829085012 R362 -S391 0.12398479114153 G369 -V377 0.123357850779412 V343 -A382 0.121517952676802 A353 -T360 0.121480072443637 A351 -L384 0.120169874469603 G365 -A390 0.118356699865076 G354 -T387 0.117560404206808 V343 -V377 0.117212275362171 P374 -A382 0.116695460355622 A351 -V394 0.116392320934476 A352 -G386 0.115939928004238 T348 -L368 0.115348533267586 A363 -L368 0.114895204784129 T366 -S395 0.114871585307596 L368 -A390 0.11450432427017 G354 -T360 0.114421076627969 G369 -A390 0.11436795507764 G356 -A393 0.11388828380397 L368 -A397 0.11371847119827 A352 -A390 0.113313481180291 G369 -G381 0.112237223642447 G373 -A382 0.11078833014528 A380 -A397 0.110760611713342 G354 -A390 0.110401433800766 L345 -L384 0.110339578719184 A351 -A385 0.109618819667653 T348 -V394 0.109559918644128 A385 -G396 0.108783383431349 G369 -V394 0.108457037414387 A352 -A363 0.10732850911644 A353 -L392 0.107246298693717 A382 -L389 0.10711425046367 G347 -A382 0.106161991814955 L346 -L384 0.103783227303755 A352 -A393 0.103664108548718 A349 -G386 0.103258024158897 G347 -F367 0.102762097461619 V350 -L392 0.102755904313522 V344 -G369 0.101662880052148 A385 -A390 0.100296231953297 V350 -G386 0.0991317163744072 V344 -V377 0.09887373558254 A380 -G386 0.0966347041906541 L368 -L389 0.0964759469177006 V344 -L389 0.0959476265107959 T366 -A390 0.0959326113964947 L372 -A382 0.0955326366033307 A382 -L392 0.0951314739748131 G354 -A393 0.095127142057695 A351 -G369 0.0949604909374455 L384 -A390 0.0943438322957371 A385 -A393 0.0917971742568513 V343 -A393 0.0916720625678007 L346 -F367 0.0882278211815544 F367 -L389 0.0876240683054255 V350 -A393 0.087399986327299 D364 -L389 0.0867028985458891 S359 -D364 0.085673629289482 T348 -G365 0.0854156323804158 M379 -G396 0.0853936712202534 V377 -A385 0.0833427898946741 G369 -T387 0.0832034438339038 A353 -M361 0.0829342704810653 A349 -G365 0.0823036661290022 G365 -S395 0.0803864641555767 L368 -S391 0.0770631489056175 T348 -A385 0.0770578180407693 L345 -A380 0.0769164567216478 F367 -G383 0.0757225024013648 A349 -L389 0.074054164468734 A349 -L368 0.07291937544047 Q358 -T366 0.0722324777610925 V350 -A385 0.0718664050848208 F355 -L384 0.0713292363361342 L345 -F355 0.0684218719209149 I371 -A382 0.0674696652173736 T366 -A385 0.066527166540931 L346 -L389 0.0661580377759794 A352 -L392 0.0657141771887104 M378 -A385 0.0653360290842655 A349 -A363 0.0650664176807454 A353 -S391 0.0644267031781043 A349 -A385 0.0643286253897983 A363 -L392 0.0639194779716568 V344 -A380 0.063629531615915 A351 -T366 0.0635787737979763 G381 -T387 0.0633750524731664 I376 -L384 0.0625066303040653 T348 -S391 0.0612858788074533 V350 -G365 0.0596505973304495 A385 -A397 0.0593812696089728 L372 -G396 0.0587418424980255 L368 -G386 0.0586571601851155 L346 -G369 0.0585210131759735 G369 -G375 0.0575656300991438 G375 -S395 0.056230723599978 F367 -A382 0.0556740735509829 G369 -P388 0.0539952252686264 G347 -S391 0.0532677140534313 V350 -R362 0.0530562937373622 Q358 -S391 0.0505029923482905 V344 -A385 0.0495841616712438 A352 -Q358 0.0491720973637481 G347 -F355 0.0478914807636777 G373 -G381 0.0467001706260399 A380 -P388 0.0458293497055022 A349 -L384 0.0454539386665735 G386 -S395 0.044900845757549 G386 -S391 0.0447611503311551 G347 -V394 0.0446003153903298 Q358 -A390 0.0433780808148549 F355 -G369 0.0432311116582027 L368 -M379 0.0428693903702957 V350 -S391 0.0417614702542597 V343 -A385 0.0411556205479133 G347 -S395 0.0399938698984404 M379 -L384 0.0398818281080784 L368 -L384 0.039310457788897 A352 -L389 0.0389259015071737 G369 -S391 0.0375167523548904 L372 -M379 0.035418788552704 G354 -L389 0.0351938262241314 A353 -P388 0.0350887924560359 G373 -S395 0.0348634882554141 L345 -P388 0.0345928367910009 D370 -T387 0.0344796138010941 I371 -G383 0.0343920878058781 T348 -L392 0.0343889006565177 L345 -A353 0.034181804030569 G347 -A380 0.0334248097442744 T387 -S395 0.0330277261444114 L368 -A380 0.032724501738474 L384 -A397 0.0327044992608263 D370 -A382 0.0322243656657699 G354 -P388 0.0319624589700989 L368 -S395 0.0305873511166403 V350 -Q358 0.0294387740654261 L384 -S391 0.0278842065831252 G369 -A385 0.0264874336651593 D370 -D398 0.0251025021209133 A382 -D398 0.0250861561648725 L345 -G381 0.0235594384895599 T366 -A382 0.023407825737372 G365 -L392 0.0227258922884488 M379 -G386 0.0226208940380195 V343 -G383 0.0222881474521817 F355 -T360 0.0209479681363248 I371 -A380 0.0208080765236662 T348 -A382 0.0205171861410149 G365 -P388 0.0204784113736771 L346 -G386 0.0202525300212475 A349 -G369 0.0186807587813913 V343 -I371 0.0181103642383107 F367 -A380 0.01804051731696 T366 -G381 0.0175065286816853 L345 -G383 0.0159560779745966 F355 -P388 0.0157261014060468 I371 -D398 0.0132017749254989 G369 -M378 0.012733028512766 A351 -A390 0.0123705193015731 M379 -A393 0.0122533474942719 I371 -A385 0.0117415135551191 D364 -P388 0.0116827832879167 G354 -L392 0.0115107961838139 T366 -G386 0.0114626687811095 V343 -A353 0.0114203656722589 G383 -L389 0.00962616769719649 G356 -P388 0.00931764894537679 G375 -L384 0.00828967179175732 A380 -G396 0.00714864046438457 A349 -A393 0.00689010526901956 D370 -A380 0.00682358326877885 T366 -V394 0.00456823391075911 G369 -D398 0.00369503209194622 D370 -G381 0.00356716939435664 G347 -L368 0.00344282124321271 L346 -F355 0.00278572402153276 D370 -G386 0.00192130633257259 A363 -L389 0.00139396036255146 F367 -A397 0.000545444786314242 G365 -L384 1.17316085604946e-05 A385 -S395 -0.00047747611063631 V344 -M379 -0.00132877002161003 G381 -G396 -0.00164556670168131 S359 -G365 -0.00180365319980647 V344 -T366 -0.00182520173744738 Q358 -A363 -0.00206250210738945 G354 -L368 -0.00360357915191223 L346 -G383 -0.00381380844370582 L346 -G354 -0.00386316407148235 G369 -P374 -0.00388284931576255 G365 -T387 -0.0048465831480895 A349 -W357 -0.00583431721567804 V344 -A353 -0.00597280667794919 V344 -A393 -0.00774734159751067 V343 -A352 -0.00783439587450729 V343 -A380 -0.00909336833000651 V350 -V394 -0.00948556452877991 D370 -G375 -0.00950884464028223 D370 -G383 -0.00968205092570196 V344 -A352 -0.0105104718576354 G383 -P388 -0.010740489926226 G356 -L368 -0.0119843973296712 V343 -A351 -0.0131542919077519 G354 -A363 -0.0132080393891942 L368 -V377 -0.01388978573915 G356 -L392 -0.0139071061384737 G369 -G396 -0.0149100823238772 I371 -A393 -0.0149743326506869 V344 -A382 -0.0175130247825428 A352 -W357 -0.0178818904701155 A349 -Q358 -0.0184657765453129 L346 -G381 -0.0191490219567578 V350 -S359 -0.0191946892598536 V350 -D364 -0.0199082702085818 A382 -V394 -0.0205918038531401 G383 -L392 -0.0207555703711613 V350 -A363 -0.0223538547963831 A380 -V394 -0.0225548895132459 V377 -A397 -0.0228554112048007 L345 -G369 -0.0233412639248396 W357 -D364 -0.0264447062442574 F367 -S395 -0.0271494003139323 A352 -L368 -0.0294334809268291 V344 -T387 -0.0297590333199658 V377 -D398 -0.0301174930938313 P388 -A393 -0.0310251625596609 I376 -G383 -0.031181360216042 F355 -M361 -0.0314444453154623 P388 -V394 -0.0316545492942897 A349 -S391 -0.0329756617377184 M378 -V394 -0.0331432783213428 V344 -S395 -0.0331755373706493 F367 -G386 -0.0334154477799888 D370 -M379 -0.0356302042982137 A349 -P388 -0.0367518720731073 A382 -P388 -0.0370724724634668 G347 -D370 -0.0375345348234686 G381 -P388 -0.037638299984696 V377 -G396 -0.0381973324786502 V343 -S395 -0.0384927169774283 D370 -A393 -0.0405757208309101 A385 -L392 -0.0419708364856395 P388 -G396 -0.044409488827545 F355 -T387 -0.0447671664100948 T348 -G381 -0.0484734313338889 A351 -Q358 -0.0487064841949819 T348 -G356 -0.0493234846098285 D370 -P388 -0.0493882846839706 I376 -A382 -0.0496354981294722 L346 -A352 -0.0501111298446117 A363 -A393 -0.0503477231000051 L346 -L368 -0.0524117553593353 L346 -A385 -0.0527693140700336 G383 -A397 -0.05486354153253 D364 -S391 -0.0553408908180486 L368 -M378 -0.0554725694724771 M378 -A393 -0.05636214534956 M361 -A390 -0.0574131873626949 V344 -L368 -0.0595742273005246 W357 -A390 -0.0596473493124978 T360 -G365 -0.0627086185428327 A352 -S359 -0.0631583809467857 A385 -V394 -0.0636060554562086 W357 -F367 -0.0637906704384159 A380 -A393 -0.0645431298666801 V344 -P388 -0.0654680903486722 A353 -T387 -0.0655925649775706 P374 -G396 -0.0685158258942618 A349 -F367 -0.0701802348514704 A353 -L389 -0.0730381552624921 T366 -G396 -0.073085479732435 L345 -L389 -0.0750885708953888 P374 -M379 -0.0756095199736675 V343 -P388 -0.0760837640207852 I371 -L384 -0.0760930300494862 A353 -A393 -0.0764877439430992 D370 -A385 -0.0770401949674886 L346 -G356 -0.0771416333956134 G347 -G369 -0.0789678887073366 I376 -D398 -0.0792830897837196 G381 -L392 -0.0822437760130859 A352 -T366 -0.0823400678608637 M379 -T387 -0.0836010710496531 A352 -F367 -0.0841050625486632 A352 -D364 -0.0848195929898826 L345 -A385 -0.0861504083767821 G347 -A393 -0.086510162235947 L346 -G365 -0.0888197287867012 P374 -G383 -0.0896987771682338 A351 -W357 -0.0902036392925991 T366 -A393 -0.0902720365894218 D370 -L392 -0.0910455986118146 P374 -S395 -0.0920105487288296 V343 -T366 -0.0925128517945408 I376 -A397 -0.0930115903760603 L372 -A380 -0.0932360957598664 F355 -A393 -0.0949329636134038 V377 -L384 -0.0969734114371388 G369 -A380 -0.0981252271512156 V343 -F367 -0.0988669458898785 G356 -D364 -0.100001431430231 A353 -L368 -0.101091322683927 V343 -M379 -0.101310551524532 G386 -A393 -0.102318108357367 G381 -D398 -0.102618309036685 M378 -G383 -0.102714856003015 G369 -I376 -0.102766806975267 L345 -G354 -0.103577161299051 G383 -S395 -0.104159908027806 L372 -V394 -0.105272536700017 T348 -A390 -0.105276449696999 A382 -T387 -0.105376840386417 V350 -P388 -0.105691747676061 G381 -G386 -0.105892596728257 L346 -A390 -0.106141537348654 G365 -L389 -0.106307961665757 F355 -L392 -0.106424338281428 F355 -V394 -0.106428620603868 G381 -A397 -0.107407065439008 G369 -L389 -0.107562633825884 L345 -T366 -0.108087016539963 D370 -I376 -0.110535235942907 L345 -F367 -0.110682895541287 A353 -T366 -0.111406847037667 V344 -G381 -0.111815626874603 V343 -F355 -0.112329526174636 I376 -S395 -0.113131713668034 P374 -A397 -0.114496286247993 A349 -T366 -0.114957192211819 G347 -G386 -0.115739923542144 P374 -A380 -0.115956910687469 V344 -F355 -0.117724617338568 V350 -G369 -0.118331776590495 G373 -A397 -0.11928275867521 V343 -G369 -0.119669410334412 I376 -G396 -0.1203932056975 A353 -S359 -0.123168984875485 V350 -T387 -0.12420024539661 L368 -D398 -0.126487879010827 T348 -A393 -0.126654799299132 V344 -A349 -0.127248023300762 L345 -L368 -0.127887818271414 G365 -A393 -0.128120050442506 G375 -G381 -0.129188523839888 V343 -T348 -0.129621937032543 G381 -V394 -0.12999882972085 G375 -A382 -0.131567509162347 T348 -G386 -0.13399073050885 W357 -S391 -0.134674515242332 T387 -V394 -0.135321539181724 G354 -S391 -0.137688783385856 G373 -M379 -0.138315789781859 G354 -M361 -0.138946896672917 M379 -D398 -0.141591492483397 M361 -T366 -0.141672573318069 V343 -M378 -0.143377557654286 V344 -A351 -0.144081049999658 D370 -G396 -0.144301060685645 F367 -L384 -0.144907350179038 F355 -R362 -0.145125429369433 A380 -S395 -0.145201831482606 L372 -S395 -0.145350431709721 L368 -G381 -0.145879511464377 L389 -V394 -0.146184234238079 G354 -S359 -0.147051545540814 G356 -S391 -0.148311541954083 G356 -F367 -0.148347416177917 V343 -T387 -0.149955733800855 V350 -L384 -0.150667046379565 L346 -A393 -0.151567269853138 V350 -A390 -0.152113670436883 R362 -L389 -0.153129062029794 V377 -G383 -0.154543291168206 G369 -G383 -0.15543546033614 M378 -S395 -0.158143965614779 A352 -T387 -0.158949862696411 A380 -D398 -0.159393081662543 Q358 -D364 -0.161201329404256 G369 -A397 -0.161715502308739 Q358 -G365 -0.162127311603904 G386 -V394 -0.162485620787688 A352 -L384 -0.162609354972239 V344 -G383 -0.162742880223369 V350 -G356 -0.16589553311624 A352 -P388 -0.166673936120448 G354 -F367 -0.166806504835816 A353 -F367 -0.167892274720121 F355 -L389 -0.168990479356765 V344 -F367 -0.171108070599969 A351 -L368 -0.17168283932229 A382 -A397 -0.172678381519152 A351 -S391 -0.172868649494097 A363 -A390 -0.17313193248793 F367 -S391 -0.173366195936477 F367 -A385 -0.175678598718636 G347 -L389 -0.176509496587533 L372 -G381 -0.176941675556865 L389 -S395 -0.176982309965577 A382 -A393 -0.17712607727323 L345 -A352 -0.178150508970766 A349 -T387 -0.179146060825737 T348 -F355 -0.179854441544469 I371 -I376 -0.180186984371568 L368 -L392 -0.180680069696448 A380 -A385 -0.181318085872551 A353 -A390 -0.181593879048884 L368 -A382 -0.18272813706685 W357 -T366 -0.187722618098485 L384 -L389 -0.188160615602155 A353 -A363 -0.190164925274553 V350 -L389 -0.19086858723314 A382 -G396 -0.190872088723572 F355 -L368 -0.19186739015279 M379 -S395 -0.193059954531237 A353 -R362 -0.193114905970519 G347 -P388 -0.194780119732754 G356 -M361 -0.194867590671006 V343 -G381 -0.197328608900123 A363 -S391 -0.200413842807322 T348 -G354 -0.20122987844912 M379 -A397 -0.203874340422748 D370 -V377 -0.21098877975468 V343 -L368 -0.211325447679193 T366 -S391 -0.211462700549573 V343 -A349 -0.213075876177097 M378 -G386 -0.213454571848601 F355 -S391 -0.215120974354569 L384 -L392 -0.215450066593882 M378 -D398 -0.215529451246628 L368 -P388 -0.216554283705104 T348 -A353 -0.221971069410532 V344 -G386 -0.224362659316031 M378 -G396 -0.227177972949067 F367 -A390 -0.228018596194953 M379 -A385 -0.228912813235279 I376 -G381 -0.232677172444697 A351 -A393 -0.238056064181647 A351 -L392 -0.239477316615415 G354 -G365 -0.239858784522275 R362 -A390 -0.242483805608879 A353 -G365 -0.24407914364066 F367 -L392 -0.244456027101368 V350 -L368 -0.244694111002522 G347 -A353 -0.24492908625585 L368 -A385 -0.253431444432876 G356 -A390 -0.259661862704304 D370 -L384 -0.263748979785138 P388 -S395 -0.264929036198129 T348 -T366 -0.26662819660546 G375 -A397 -0.268005370764339 L346 -T387 -0.268445715216826 T348 -F367 -0.273868082478417 V344 -D370 -0.273925821796529 L346 -A351 -0.27684996823734 G347 -T366 -0.277177451686636 D370 -S395 -0.281845636020426 P374 -D398 -0.282291130262526 L346 -A353 -0.288039612705195 L345 -A351 -0.290507045848081 V344 -V350 -0.297278386438344 L345 -T387 -0.300585747426981 G347 -L384 -0.300810390265246 T348 -L384 -0.304705082924634 L368 -T387 -0.305937524033135 D364 -L392 -0.307520829195278 T366 -L389 -0.312269092271866 W357 -R362 -0.321862703453669 M378 -L384 -0.332799587802008 V343 -V350 -0.353035026525873 A351 -G365 -0.362820565799563 T366 -T387 -0.364310022689326 V350 -W357 -0.39457140702175 V343 -L384 -0.403931272824243 V344 -L384 -0.414582831787371 G375 -A380 -0.416722535644443 L384 -V394 -0.420299536771877 L345 -V350 -0.440072363920819 L372 -V377 -0.446214301097418 V377 -A382 -0.453766499324392 D370 -A397 -0.458089014009956 A349 -G354 -0.463462668532299 A351 -G356 -0.470147759973385 G347 -A352 -0.47381797926025 G369 -A382 -0.483025712054927 G369 -S395 -0.618606219454588 G356 -A363 -0.767576865027926 G356 -G365 -0.827393215183612