[Fri Aug 26 18:23:11 2016]
>Input file: TMD8P2I3M1D.pdb
>TM segments:  298-319_ 323-339

MAIDEN score = -4.0518

Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy
(the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs.

The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10.
See the MAIDEN software article:
Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161.


-----------		----------------
Calpha pair		Empirical energy
-----------		----------------
V308 -S333 		0.413128986386916
S303 -A338 		0.359161427292924
A309 -S333 		0.355585756014637
G304 -A338 		0.342705884438512
G311 -A316 		0.327700467347823
G306 -A338 		0.32514063046462
G310 -A316 		0.325116480606617
G310 -A338 		0.313702926249148
V308 -M317 		0.29594459574138
I305 -A336 		0.26635631109244
I305 -A338 		0.235335238850823
G310 -A336 		0.234682298319552
G301 -A338 		0.221354420349239
I305 -G311 		0.21613359525329
I305 -V332 		0.208737618971197
G311 -S333 		0.201001955838327
V308 -F330 		0.194271771627658
L327 -C334 		0.181664243052587
G306 -S333 		0.181390650094864
G310 -A315 		0.180859797472557
G311 -L339 		0.179115492870305
E300 -A336 		0.1747638741967
G306 -L337 		0.167399335503269
M307 -L337 		0.167294637144874
G311 -C334 		0.16666332243099
A315 -G329 		0.166196955013828
S303 -V335 		0.165760192798469
G301 -L337 		0.161492858080284
L313 -W325 		0.158488005002572
G311 -A318 		0.154772995713824
G301 -G306 		0.147010535013355
V323 -C328 		0.145729496007965
V314 -V323 		0.145544377575658
G310 -M317 		0.145076358570195
I305 -V335 		0.1420800326009
G310 -A331 		0.141194282536587
G306 -G311 		0.134733062556416
I305 -C334 		0.12904834429829
S324 -S333 		0.127599614184763
G304 -G310 		0.127411192877787
W325 -S333 		0.118882572258329
V308 -V314 		0.117075359358237
L313 -S333 		0.115537123164397
A309 -L337 		0.114463999352665
S333 -L339 		0.114165764528251
G306 -V335 		0.112756519068538
L312 -A318 		0.110106299000872
L327 -V332 		0.107493309854156
V314 -S333 		0.103854228367924
V323 -A331 		0.101806717003379
G311 -A336 		0.100858577867304
L313 -L327 		0.100716082647666
E300 -G306 		0.098709547893729
V308 -L313 		0.097990111183111
A316 -G329 		0.0978415866366864
S303 -C334 		0.0935896064861371
L302 -L337 		0.09302641425516
I305 -L313 		0.0929242737880553
V326 -V335 		0.0920393827008548
G304 -V332 		0.0912880639318572
M299 -L337 		0.0911678576332671
M317 -L327 		0.0911063895579462
E300 -A338 		0.090336541356494
L327 -V335 		0.0898034836585859
A309 -A316 		0.0865938369993478
A309 -A331 		0.0856355280586305
M299 -L339 		0.0835749990399841
A309 -C328 		0.0811200772050988
A309 -C334 		0.0807646525655834
A318 -G329 		0.0792761148171914
A318 -V326 		0.0773506311387608
I305 -A331 		0.0768077361042494
L302 -M307 		0.0760201134411118
A318 -V323 		0.0753927762542856
C328 -A336 		0.0741144907979923
F330 -L337 		0.0736657208000477
A309 -V314 		0.0724132822218762
L312 -F330 		0.0717368934254163
S303 -L337 		0.0716191200094922
G310 -G329 		0.071264950704815
L298 -L337 		0.0709990168289671
M317 -S333 		0.0651540747305948
V308 -C328 		0.0635776345067269
A315 -V326 		0.063383960816096
S303 -V308 		0.0586003012541787
G329 -A336 		0.0565471004661511
G311 -M317 		0.0522871621301402
L298 -A338 		0.0496107046334768
A309 -L327 		0.0482196009017493
G304 -S333 		0.0480101852122101
S324 -V332 		0.0466038851230266
G306 -C334 		0.0448338865955495
M307 -F330 		0.0446619621741914
M299 -I305 		0.042644413456946
S303 -S333 		0.0385996637276858
M307 -L313 		0.0325750267757523
G311 -G329 		0.0324921809652317
L312 -S333 		0.0310423549894623
A309 -V335 		0.0304626985846466
V323 -V332 		0.0302203564622543
G310 -V335 		0.0293786480419245
M317 -G329 		0.0277118819197222
L313 -A331 		0.0255648388389442
M307 -A338 		0.0249634879308793
V308 -A316 		0.0244606440321871
L302 -V308 		0.0214642141406252
V308 -L339 		0.0174869265812947
G310 -F330 		0.0172896674755787
S303 -A309 		0.0169174039223194
A309 -L339 		0.0168328718212329
L313 -V323 		0.0150648726334506
G306 -G329 		0.0148529887751361
V308 -A331 		0.0145339273351439
M307 -G329 		0.0129060707093709
A316 -V323 		0.0123179801251156
S324 -F330 		0.0104678786911869
G304 -G311 		0.00962858913793635
L312 -P319 		0.00800098108587477
M317 -V326 		0.000754904172424631
A309 -F330 		-7.04733042535821e-05
L298 -I305 		-0.000119267674439705
V314 -V326 		-0.000185871413398875
V308 -A336 		-0.00622731451963365
L312 -M317 		-0.00667418112327667
A318 -F330 		-0.00781670742346385
G310 -L337 		-0.00792670018539265
L312 -C334 		-0.00884146870372793
M317 -F330 		-0.00911368659140002
F330 -A338 		-0.00937619558072278
W325 -F330 		-0.00965698654715919
G311 -F330 		-0.00994326679911595
E300 -L339 		-0.0107145116824556
V308 -C334 		-0.0114334380198589
A309 -V326 		-0.0120006825116898
M307 -A331 		-0.0144184930277318
M299 -A336 		-0.0156580666659525
L302 -V335 		-0.0165332245296383
G311 -A338 		-0.0170110062198969
I305 -L312 		-0.0212039028169375
V308 -A338 		-0.0230283838134784
V332 -A338 		-0.023432065605353
L313 -C328 		-0.0237799370149876
V326 -A331 		-0.0249237796117647
L312 -G329 		-0.0266141890320626
V308 -L337 		-0.0268935563198838
G310 -L339 		-0.0272002613717195
A309 -M317 		-0.0290038340279049
M307 -W325 		-0.0304153439293013
A331 -L337 		-0.0329430445555117
A316 -F330 		-0.033069454397995
G310 -C334 		-0.0341899412954767
I305 -G329 		-0.0352008965453265
G310 -V326 		-0.038984390871474
S303 -G310 		-0.0403199649579573
G310 -V332 		-0.0437554922967758
L302 -A338 		-0.0439535843518799
V314 -L327 		-0.0549081114669434
G301 -A336 		-0.0549575499012454
A316 -W325 		-0.0581401877509462
V314 -G329 		-0.059094682489258
A309 -W325 		-0.061232140165395
V314 -P319 		-0.0627128695429908
L313 -C334 		-0.0641203743006722
M307 -V335 		-0.0644923098850256
M307 -C334 		-0.0657198817009688
I305 -L339 		-0.0685068196563035
G329 -L337 		-0.070911657519293
P319 -V326 		-0.0756038611347433
A331 -A338 		-0.0759411512408368
A309 -A315 		-0.0770790347650643
G311 -L337 		-0.0780338107606502
L313 -V332 		-0.0801878376322147
L313 -F330 		-0.0827380686261092
V308 -V326 		-0.0872408492541314
A318 -L327 		-0.0905287701647257
G311 -V332 		-0.0937128121963768
L302 -A336 		-0.09460364661494
V308 -W325 		-0.0950930297097243
V332 -L339 		-0.0957809020163447
G306 -A336 		-0.0996497496389999
V314 -F330 		-0.100216509079685
G304 -L339 		-0.103074279883088
S303 -V332 		-0.10334096959348
L312 -V326 		-0.104269760585747
G301 -L339 		-0.104614642305143
A309 -V332 		-0.10479755157052
V308 -L327 		-0.105004638361701
G310 -S333 		-0.107532536501338
S303 -L339 		-0.107713794800595
A316 -L327 		-0.11317112111406
G304 -L337 		-0.117943800508433
V308 -V332 		-0.124002006419492
L298 -G304 		-0.124600178150851
I305 -G310 		-0.130530255680744
G306 -V332 		-0.135344933794086
A318 -W325 		-0.137681207071172
I305 -L337 		-0.137857932610204
S324 -A331 		-0.14698456808074
A316 -V326 		-0.148930198978168
C328 -V335 		-0.149599885469193
M299 -G306 		-0.150541647164007
G304 -A309 		-0.151668399059732
W325 -A331 		-0.153191278516318
M299 -G304 		-0.156961375640218
M317 -S324 		-0.159250421047805
F330 -A336 		-0.160989137722713
G304 -V335 		-0.162809995821622
P319 -W325 		-0.163348196988663
C328 -S333 		-0.164625968206628
L302 -L339 		-0.165674299535898
E300 -L337 		-0.166418797523646
L313 -G329 		-0.168065784197065
M307 -S333 		-0.169646840211105
M307 -C328 		-0.169677220280845
V308 -V335 		-0.170750499143454
L313 -A318 		-0.173806936453882
C328 -C334 		-0.187046790690369
A309 -A338 		-0.187555323943263
M317 -W325 		-0.18853894184647
G329 -C334 		-0.191770094236987
I305 -S333 		-0.196023331075314
E300 -I305 		-0.197030886468518
M317 -C328 		-0.198091689144505
V314 -W325 		-0.199623381320122
A331 -A336 		-0.202517839107617
V326 -C334 		-0.202642488138855
M307 -A336 		-0.206635627817521
V323 -G329 		-0.207377902965545
G329 -V335 		-0.207894755595372
S333 -A338 		-0.211877441833115
M299 -A338 		-0.21197886546483
W325 -C334 		-0.22436449236694
G301 -M307 		-0.227453350953129
M317 -V323 		-0.236002895379686
V308 -G329 		-0.236282654414919
G304 -C334 		-0.237113486337257
V326 -S333 		-0.250374932470948
A309 -G329 		-0.262814345960017
M307 -V332 		-0.265009956971469
S324 -G329 		-0.265100403056461
W325 -V332 		-0.26610377595153
V323 -F330 		-0.268016440395336
L327 -S333 		-0.268489860852977
L313 -V326 		-0.29563164462419
F330 -V335 		-0.321997231410236
V332 -L337 		-0.328779832605127
L298 -S303 		-0.333799453730182
V326 -V332 		-0.344353968581964
A309 -A336 		-0.370535544593759
L313 -P319 		-0.390471615749158
C334 -L339 		-0.467380159096941
G304 -A336 		-0.47864048314083
S303 -A336 		-0.531564992592738