[Mon Aug 29 18:13:35 2016] >Input file: TMD9WXB4M1G.pdb >TM segments: 326-361_ 366-381 MAIDEN score = -15.9216 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- I349 -L368 1.58260240856843 V341 -A379 1.52960332936059 V338 -C344 0.892396534525645 L353 -L368 0.689607559519418 Q361 -L367 0.68231904695903 L346 -A371 0.632566812597356 R339 -G380 0.574870853300261 R335 -A379 0.57191473436097 R334 -G380 0.54735283324363 L356 -L367 0.528196135218281 R339 -C344 0.521933302871671 V338 -A379 0.49435930807187 A348 -V374 0.489822916004661 R335 -S340 0.441148300732144 A348 -L368 0.439275880447161 V341 -V375 0.431556692836135 C344 -V375 0.390805996878023 R331 -V338 0.36226773224668 C344 -V374 0.358226488544159 I349 -T370 0.355669128987694 G350 -L368 0.315428712193195 A332 -G345 0.313445737163457 L356 -L368 0.299123220059851 V342 -V375 0.295232976493059 R331 -F336 0.295084377488333 R334 -C344 0.292038616293146 G352 -L373 0.290766148927049 L353 -L367 0.282474471458976 V341 -G378 0.282384727429541 L351 -L368 0.27621516889069 R339 -A347 0.26398077929297 R331 -S337 0.259138056641089 G345 -G380 0.257291697333862 C344 -T370 0.257141963432023 C344 -A379 0.235468697146856 I349 -A371 0.219198607157566 G360 -L367 0.218568743457168 G352 -V374 0.215722146764496 L351 -T370 0.215100481295492 G369 -G376 0.214201338543401 R334 -F381 0.211286761104263 L351 -P366 0.209707521617592 G352 -L367 0.208687556797934 V341 -V374 0.205823629674557 L346 -V375 0.201048308773619 R334 -A347 0.198111720665779 R335 -C344 0.192699196399805 S340 -V377 0.186555773271301 A332 -V338 0.181516037752026 L346 -G376 0.179411453493063 G326 -A333 0.179082949967804 G360 -L368 0.177776271869964 S343 -L373 0.177690343021315 A347 -G369 0.176885415141341 G350 -L372 0.176675384931659 Q361 -G369 0.171308419766325 A332 -A379 0.169553020213938 R335 -F381 0.165968679483858 G345 -L373 0.16169246568316 A348 -G380 0.161636831452177 V328 -A347 0.160581900968713 V342 -V374 0.159317559319231 S343 -G380 0.15693198130608 S337 -A348 0.155174179101655 L346 -V374 0.154944202745617 G345 -A355 0.154307196854886 A355 -T370 0.154206970172302 R331 -A347 0.154040963753977 G345 -L372 0.151561826292934 R334 -A348 0.150035633469283 R331 -A379 0.14899947038608 A348 -G376 0.147671532929216 A329 -R335 0.147568015178443 A329 -V374 0.145097174794815 S343 -V375 0.142454689668457 V342 -L372 0.138020983331836 S343 -V377 0.137129360014005 R335 -G345 0.13439034390853 R334 -V341 0.133947202997252 R334 -G345 0.131327021711561 I349 -V374 0.128938696576079 G352 -L372 0.12688061803284 I349 -G369 0.124719918996249 A347 -L372 0.119339444765932 A333 -G350 0.115959110533747 L351 -L373 0.115717113420802 L351 -L372 0.114685786212398 A354 -P366 0.114450606297134 A329 -G352 0.113598082291857 A347 -G380 0.110581688702662 V338 -G350 0.11031107846059 A371 -A379 0.108849326054199 S343 -F381 0.108452749202481 A348 -L356 0.108297249143307 R335 -A347 0.105649952539932 G330 -V374 0.104961402123939 G330 -G378 0.104851692264129 V328 -L351 0.104096481334458 A332 -L346 0.103768755581676 L346 -L356 0.103570557344233 A347 -G378 0.102789982871829 A348 -A379 0.101695628125641 A354 -A371 0.101280007152172 G350 -T370 0.099885813078405 A332 -V375 0.0972116877958604 G330 -A379 0.0959847635689715 L356 -A371 0.0956204110261971 A354 -G369 0.0953031302254109 G330 -A348 0.0947997421542762 G345 -F381 0.0945719451202929 V338 -V377 0.094507092777449 G352 -G360 0.0921172944535336 A329 -V338 0.0914733604584307 G330 -R339 0.0911841308530352 S337 -G380 0.0898867474931571 S343 -L372 0.0891665322618165 V342 -L368 0.085940099052932 A332 -S340 0.0849451019288292 V338 -G380 0.0844596995756692 S340 -A371 0.0818084031253257 G330 -G345 0.0810891936046876 S343 -T370 0.0804074222169728 S340 -V375 0.0803648993827517 L353 -G369 0.0800152752699005 A347 -P366 0.0779789135123794 G330 -G380 0.0770969073340584 R334 -V374 0.0765740260861562 R331 -A348 0.0756097078800524 R334 -S343 0.074713401226514 I349 -T357 0.0745471050242958 A332 -F381 0.072045882958462 G352 -V375 0.0702289830944633 V341 -L346 0.0694645474109485 V374 -G380 0.0694300814523814 R339 -L346 0.0693781203292236 G350 -T357 0.0682327735779595 I349 -L372 0.0671020400586365 A347 -L356 0.0660928536217834 A355 -G369 0.0657676103822498 L372 -F381 0.065441282484394 A332 -I349 0.0648791598934011 F336 -A347 0.0648586182767921 R335 -V342 0.0644230001096173 V342 -L373 0.0641168398742433 A348 -V377 0.0634464981334313 A333 -L373 0.0631271331227965 I349 -A379 0.0627650383161376 S337 -G378 0.0612681180367716 A333 -I349 0.0586459305694147 L353 -T370 0.0582931406391758 L327 -F336 0.0582896559667985 A332 -V341 0.0574785699383016 S337 -V342 0.0573941426817459 A333 -A371 0.0560620312274049 L353 -L373 0.0556593951079414 I349 -G376 0.0555640435894365 L346 -G378 0.0554978433363748 R339 -V375 0.0545952380774167 G345 -L368 0.0544550514036173 G326 -R334 0.0544230244331656 S337 -G345 0.0532812371729897 S340 -G378 0.0529436889847563 R334 -V377 0.0526605007367949 G369 -V377 0.0522321880129211 V358 -L368 0.0520293576747406 V338 -G376 0.0520067214037501 A329 -G380 0.0518681476808127 R339 -V377 0.0517471444660593 C344 -A371 0.0510725270068919 L327 -R335 0.0487121572365794 A347 -F381 0.047456886292407 G330 -V341 0.0470083161687938 G345 -A354 0.0454300483494126 A355 -A371 0.0453724077844812 C344 -G376 0.0452381181001762 A333 -L346 0.0447851116439635 G330 -L351 0.0445048226295719 S343 -G376 0.0441127023664774 A329 -R339 0.043986460919859 A347 -L373 0.0434394561941511 L346 -L367 0.042959075031284 G350 -V375 0.0400639133722454 I349 -L367 0.0398489421440393 A329 -R334 0.039011902458062 L346 -A354 0.038160486204033 S340 -G376 0.0371043653649901 A347 -T370 0.0370935224026789 A347 -L367 0.0370574226980382 S343 -L351 0.0363523195296269 I349 -V359 0.0360347127557539 A348 -G378 0.0355295938807059 A333 -C344 0.0352003439524231 R339 -V374 0.0341803998868916 L373 -A379 0.0340335862385777 R335 -V374 0.0339651276967003 R335 -V377 0.0328244291670324 V359 -P366 0.0319093890020499 P366 -L372 0.0316653383158148 V328 -R335 0.0315624808251022 R335 -V375 0.0314896307081693 V338 -L351 0.0314707330172883 G330 -A347 0.0310548834119713 L327 -S337 0.0306953597332622 L372 -G378 0.0282942852121106 S337 -L346 0.0282679833904497 A329 -G350 0.0265100865823196 V341 -L368 0.0264217607367256 L368 -G376 0.0262434078638965 R334 -V342 0.0256610653673488 L346 -G352 0.0250685197572302 A355 -P366 0.0245635625611476 G345 -L353 0.0235825365920577 G326 -L351 0.0229647338035937 L351 -Q361 0.0227851460043249 G330 -V377 0.0227407582990766 P366 -L373 0.0216925419184193 A329 -A354 0.0211404337782586 L351 -G360 0.0206113361151266 S340 -A348 0.0197079014124029 G350 -V358 0.0188375186921745 A333 -V377 0.0188183082874713 A329 -A355 0.0184802489429616 A333 -V375 0.0181366714196332 G345 -P366 0.0178780633703899 A332 -G352 0.0171634027399803 L373 -G378 0.01656150631141 V341 -L372 0.0165291435957009 V374 -A379 0.0145153670592393 L368 -L373 0.014505727141076 A354 -T370 0.0123993852775492 A347 -A355 0.0118094942433795 A347 -A379 0.011778400020424 L353 -Q361 0.011690308748399 V338 -F381 0.0110703638076064 F336 -F381 0.0109216141869348 A332 -G350 0.00959719958012428 G345 -L367 0.00915023935487813 L346 -P366 0.007046097676918 G330 -C344 0.00665259937259299 C344 -G352 0.00661829199878139 G330 -S343 0.00641040580271879 A329 -G345 0.00600430248265815 A333 -V342 0.0053061513215773 S337 -F381 0.00511224189975423 A329 -C344 0.00476283076820461 G330 -R335 0.00286424354917081 C344 -L368 0.00232334487064811 V342 -V377 0.00225962591920092 L351 -G369 0.00110598052576805 V328 -F336 -0.000190637610808508 A347 -A354 -0.00143026347252118 V338 -I349 -0.0014848451588132 G345 -G376 -0.00207698659223024 P366 -V375 -0.00210071357556796 V359 -L367 -0.00327691114452833 A348 -V375 -0.00331427882797652 R331 -F381 -0.00383822082044227 A348 -T357 -0.00483919397505606 A333 -V338 -0.00535857385444949 R339 -G378 -0.00537212845910595 R334 -G378 -0.00593468961812094 V338 -L346 -0.00637012045695329 V338 -A371 -0.00661331308100399 L353 -V374 -0.00664235465459928 A332 -V374 -0.00688302588624179 R331 -G380 -0.00690483163720623 F336 -G345 -0.00794913269479025 A332 -A347 -0.00799315340420836 V341 -T370 -0.00812725563975669 G352 -L368 -0.00977508963627338 A332 -V342 -0.012025569371874 V328 -A348 -0.0122646375411308 A333 -F381 -0.0123178843181098 G350 -P366 -0.0123723064174577 A332 -G380 -0.0130585688530713 R334 -A379 -0.0134452776823893 V341 -G350 -0.013637142874817 R339 -A379 -0.0156638429980607 S343 -G352 -0.0157593055593658 R339 -G345 -0.0158089217931723 S343 -G369 -0.0159082832936801 G350 -L373 -0.0188096974434293 L356 -T370 -0.0189420153586326 A333 -R339 -0.0191924119840158 V375 -F381 -0.0191990750722457 G350 -Q361 -0.0216521919499526 A333 -G376 -0.0230004631123117 G352 -Q361 -0.0250635571904434 L346 -L373 -0.0256113929649492 R335 -G380 -0.0257471664603948 Q361 -T370 -0.0301059873278833 R334 -R339 -0.0303204308522929 S337 -G350 -0.0304761053294438 V342 -F381 -0.0314750526359022 L367 -V374 -0.0320401485097737 V358 -P366 -0.0328694735045598 L346 -V377 -0.032999199573486 G326 -R331 -0.0338077855527794 A347 -G352 -0.0356718588129414 V342 -T370 -0.0364540455465505 A333 -S343 -0.0379054542053714 V341 -I349 -0.0379803541949784 V375 -G380 -0.0385718763633989 A355 -L367 -0.0385949364552347 F336 -C344 -0.0387941270151302 S343 -I349 -0.0397959346885894 R334 -S340 -0.0420613968613557 F336 -V341 -0.0422541367173861 L327 -F381 -0.0433356693331692 A347 -V374 -0.0444570091333878 R331 -S340 -0.045039897561476 G330 -S340 -0.0451419781454594 L346 -A355 -0.0452451753505549 A354 -Q361 -0.0454011928229248 V338 -V374 -0.0460380466315016 A371 -G378 -0.0461536877734456 G326 -S337 -0.0463009903040598 A348 -P366 -0.0465670936876378 A329 -F381 -0.0473867889368691 A355 -Q361 -0.0476334460033754 A332 -G378 -0.0480119560682857 A333 -G352 -0.0484491152179549 V342 -G352 -0.0485988554135872 R331 -G345 -0.0493180984411721 T357 -G369 -0.0496545082831925 V341 -G369 -0.0498890335385944 A329 -S343 -0.0513701827144484 A347 -V377 -0.0519265007651013 L356 -Q361 -0.0521345441283074 I349 -V377 -0.0524284535322757 T370 -V375 -0.0539662113619235 R335 -S343 -0.0540663300918165 A333 -L351 -0.0552479423407712 A348 -F381 -0.0562561836568989 T370 -G378 -0.0577505380569296 A347 -G376 -0.0604774685269171 R331 -S343 -0.0616482380731419 A347 -A371 -0.0628392275984622 C344 -G369 -0.0631539902587699 V338 -A348 -0.0671915838703105 G360 -P366 -0.0678463688775472 T370 -V377 -0.0697823417701755 A333 -G378 -0.0706555798227226 L346 -L368 -0.0713208133017984 R331 -R339 -0.0715358840377267 V328 -V338 -0.071601605264473 S340 -L372 -0.0719621239199171 G350 -V374 -0.0731360885736612 A347 -L368 -0.073803433972099 A332 -A371 -0.0750469569857369 A329 -A379 -0.0753588863240058 P366 -V374 -0.0757340255519641 A333 -L372 -0.0762038493708648 S337 -V374 -0.0764862088111595 L353 -V359 -0.0769925805648093 L373 -F381 -0.0778059217248765 S343 -L368 -0.0804044905804187 L373 -G380 -0.0804894345747229 S340 -I349 -0.0811312557696824 G376 -F381 -0.082685445320994 L346 -A379 -0.0827014205191254 C344 -F381 -0.0837271817781593 L356 -G369 -0.0839240521920637 C344 -L353 -0.085776682231534 L351 -V375 -0.0876440011270079 L327 -V338 -0.0878770735284924 V342 -G369 -0.0886018207349313 V358 -L367 -0.0889037241819892 A354 -L368 -0.0889404033638357 G350 -V359 -0.0902155304067329 R339 -A348 -0.0904517654198402 G326 -A332 -0.0946627828631916 V342 -L351 -0.0960908199370056 R335 -L346 -0.0965003068054742 P366 -A371 -0.0978320189537212 L346 -G369 -0.100770199778175 L367 -V375 -0.102608949391373 R339 -F381 -0.103545528953743 A329 -F336 -0.105107140592517 F336 -G378 -0.105216122967199 T357 -P366 -0.105457258005044 G345 -G352 -0.10605407616289 V338 -V375 -0.106295730260678 G330 -F381 -0.106426833214431 L372 -A379 -0.106848636397606 G352 -G369 -0.107353342936937 I349 -G378 -0.107395615763715 V342 -A371 -0.107711418046689 A329 -I349 -0.110139973293324 R334 -L346 -0.111608832458772 V328 -R334 -0.113017430594206 G352 -V359 -0.113400631469825 C344 -G378 -0.115325620748305 G350 -A371 -0.117019675115368 G369 -V374 -0.117345239558085 G350 -G369 -0.119466994676339 G330 -V338 -0.120574088531043 V338 -G345 -0.122408181610707 V338 -G378 -0.125205501286372 G330 -S337 -0.125675460620475 V338 -A347 -0.12860551570483 F336 -G380 -0.129914519679436 I349 -V358 -0.130425570532072 V342 -G350 -0.130798150807114 A329 -A347 -0.13241021716475 S337 -A379 -0.132519025020487 G345 -A371 -0.134478419390365 S337 -L351 -0.137492536323571 V328 -C344 -0.138423434948663 F336 -V342 -0.139832078977143 S340 -F381 -0.140502076700482 A329 -A348 -0.144019309014847 I349 -Q361 -0.144266440127459 G345 -V377 -0.146222043745014 V342 -G376 -0.146657062467855 R331 -L351 -0.146813419293898 G369 -V375 -0.147111644964707 A347 -V375 -0.147266976524089 S343 -G378 -0.150062109429239 S343 -G350 -0.150714132148317 V342 -A348 -0.151725462362243 R335 -V341 -0.152090238360423 I349 -P366 -0.152852054227949 G330 -F336 -0.153604096285442 A329 -L346 -0.153651645021208 R334 -V375 -0.156785600801141 A333 -V374 -0.158820296214692 A371 -V377 -0.159794680483715 C344 -G380 -0.161204939342495 V342 -G380 -0.162938894444237 L353 -L372 -0.165864633136501 G350 -L367 -0.168947851553925 G345 -A379 -0.169624697756738 A348 -T370 -0.169872239529004 G352 -A371 -0.169957375463425 V341 -V377 -0.170070895494092 R335 -A348 -0.175364786577356 F336 -A379 -0.177150298842554 R335 -G378 -0.179489863835059 A333 -A348 -0.180645315267994 A348 -A355 -0.182743063902427 L327 -A333 -0.183061826060753 R331 -V341 -0.187351547695661 L367 -L373 -0.187672627789814 L351 -L367 -0.188160426731258 C344 -G350 -0.188407365022341 S340 -L373 -0.188719601812767 L346 -L353 -0.189208496533703 V359 -L368 -0.190583680442471 L327 -A332 -0.192287377857474 A329 -S337 -0.192855842401716 I349 -V375 -0.193445136675175 S337 -A347 -0.194400643237305 A332 -S343 -0.195445992930173 S340 -A347 -0.196566786451817 A329 -L351 -0.198419147710529 S343 -A371 -0.201042471284914 V342 -G378 -0.204079082850432 F336 -S343 -0.205131999399924 A348 -A354 -0.205598877943459 A332 -R339 -0.206357791887482 S340 -G380 -0.208984547743801 G352 -V358 -0.209500963766035 L368 -V375 -0.212495096911614 L351 -V374 -0.214012550190718 L351 -V359 -0.219847873364934 S337 -S343 -0.22241902431786 Q361 -L368 -0.223468210119548 V341 -G376 -0.223831042484994 V341 -G380 -0.224159741244446 A333 -G345 -0.224176849379286 V341 -A347 -0.224345067226343 A333 -S340 -0.227750443443648 G352 -P366 -0.228166213600358 I349 -A355 -0.230450516346501 A333 -A379 -0.234745433251081 L353 -P366 -0.235370937784269 A348 -L373 -0.236813244264287 S340 -G345 -0.237502664734095 L353 -A371 -0.238256124751381 L367 -L372 -0.238915026496503 T370 -G376 -0.240251249913441 A332 -L351 -0.241558728172373 R331 -V374 -0.243397497368114 A332 -A348 -0.245346414995617 A354 -G360 -0.25085740970065 T357 -L367 -0.253757903857629 S340 -L346 -0.253794341858665 S337 -C344 -0.258042638374205 A348 -L367 -0.259269260663292 A354 -L367 -0.259792956405597 A348 -L353 -0.260876512290547 V338 -S343 -0.261626585370948 L368 -V374 -0.266656295215119 A348 -L372 -0.266803850710457 V328 -S337 -0.268246770668852 L327 -R334 -0.270811350956276 L346 -L372 -0.273659834526532 G345 -G369 -0.275521025106643 A332 -C344 -0.284534480491055 T357 -L368 -0.285692957545137 V341 -L373 -0.286289449567758 L346 -T370 -0.287721010027598 L351 -V358 -0.287774037883889 V342 -A347 -0.290657926215623 L351 -T357 -0.294347886427653 V341 -A348 -0.294538085067964 V341 -A371 -0.299503905565913 L351 -L356 -0.300451953553408 A355 -L368 -0.302828930342513 C344 -L372 -0.307303872274328 A347 -L353 -0.307894788940108 G352 -T357 -0.3114538224821 L353 -G360 -0.31568869198927 L351 -A371 -0.317624846361634 S340 -V374 -0.326167801656858 L353 -V358 -0.326411072944957 G350 -L356 -0.330040290480323 V342 -A379 -0.332796884772947 S343 -A348 -0.334187655034237 Q361 -P366 -0.343863751574323 V341 -F381 -0.344222698665231 G345 -L351 -0.345928572119745 S343 -V374 -0.351388756903999 C344 -L351 -0.352834269049207 G352 -T370 -0.352913854060261 V374 -F381 -0.3573121541136 G345 -T370 -0.362513662521058 A333 -V341 -0.369710297393153 G350 -A355 -0.383087816388507 A333 -A347 -0.393180534253537 L346 -L351 -0.397921118121924 G345 -G378 -0.39799802988272 V342 -I349 -0.405281558809149 G345 -G350 -0.406175142528027 I349 -L373 -0.408398723008517 I349 -A354 -0.409568989709369 A371 -G376 -0.41021935106371 A355 -G360 -0.414785567295736 I349 -L356 -0.416960999239927 L356 -P366 -0.418885883448441 V328 -A333 -0.430658209430717 S340 -A379 -0.43559900438061 A348 -A371 -0.441435221168129 L372 -V377 -0.445529586172968 A333 -G380 -0.446072089136262 A354 -V359 -0.447747042218112 A332 -S337 -0.468095216041748 A348 -G369 -0.487603165121139 C344 -L373 -0.49849761452192 R331 -C344 -0.514240667272574 C344 -V377 -0.528461761017713 S343 -A379 -0.530511532370134 G345 -V375 -0.553408200397924 G345 -V374 -0.556024061443344 C344 -I349 -0.683826400639226