[Mon Aug 29 17:46:49 2016] >Input file: TME8TIR3M1G.pdb >TM segments: 442-455_ 531-579 MAIDEN score = 3.4411 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V454 -V534 10 V454 -L535 1.25613207907106 M453 -V534 1.02513382710316 K531 -A538 1.00301021939876 V454 -D536 0.853981121865263 L442 -L447 0.706237625251499 T572 -I579 0.697909404479353 L455 -L535 0.683514905795826 M548 -A571 0.678284755432972 V454 -L533 0.669663875678689 L455 -I532 0.59884230017719 V454 -I532 0.560403693229347 L455 -V534 0.556822249594264 R569 -I579 0.545349134729701 I566 -T572 0.543195900765213 Q444 -N449 0.533947148202217 K552 -A576 0.517369912610629 V454 -A538 0.499586581574311 I532 -A538 0.489582463699116 L554 -E559 0.478074042015034 L549 -R574 0.452484157764251 S544 -H568 0.396020886876023 Y545 -A571 0.388643822251886 K552 -E559 0.378694377269249 A553 -A576 0.377668941907101 R561 -D577 0.351801542627521 M453 -L535 0.33828356116336 M548 -G575 0.324886787572838 L455 -L533 0.311297910358501 L564 -A576 0.308604240163287 I573 -I579 0.295331735672153 Y545 -R569 0.294089303813612 K556 -R561 0.289324490020093 G555 -L564 0.283200654797518 G555 -T562 0.280180443924692 L549 -G575 0.260510649408239 Q551 -E559 0.257109509438491 Y545 -R574 0.252690995450325 T546 -T572 0.246788943183969 A553 -G560 0.246669308233574 Q450 -Q551 0.244685680465817 K556 -A563 0.242944900958002 T443 -Q450 0.239714669318542 A553 -R574 0.237268477637793 M548 -R574 0.235494137321281 K552 -L557 0.230317316132331 M453 -D536 0.23005613494326 L554 -T562 0.2293562958363 S541 -H568 0.229214817462883 L549 -T572 0.22615633236153 M548 -R569 0.224222567996464 V565 -D577 0.221872797636669 K552 -R578 0.220837324653917 K556 -R574 0.2190391014498 G555 -R561 0.212332646788441 V454 -E537 0.208439693009092 M548 -V565 0.196849836055216 D536 -K552 0.19333822770828 I566 -A571 0.190226564432987 R561 -A576 0.188140412537977 D536 -T572 0.172554802828519 M548 -H568 0.169393084762097 K531 -S544 0.167024787593734 Q551 -G575 0.166326443506851 E559 -A576 0.165873975560914 G448 -T562 0.164063959736028 H568 -G575 0.164006365473558 K531 -D543 0.162779334702639 D536 -T546 0.157748994243571 T562 -T572 0.157218138310856 D543 -R574 0.155433446040186 V454 -V565 0.153421865854361 E537 -V565 0.152869044328663 A540 -H568 0.151130839578383 V534 -I566 0.150738238851869 A567 -R574 0.150340578681775 I550 -A576 0.150231590060023 A452 -E537 0.145866123982445 N449 -E559 0.14069240103681 L554 -G575 0.139277260969667 G555 -D577 0.138471459467517 Q551 -K556 0.138055690670041 Q551 -G560 0.138052878654205 D536 -E547 0.137640474518982 L533 -A538 0.136899434704956 V534 -A567 0.136891355229454 A571 -R578 0.134615887997502 R561 -G575 0.134569571873596 G555 -R574 0.13144998935483 A538 -H568 0.130851622327928 A538 -A571 0.129762200046592 T539 -H568 0.127717620882438 V565 -G575 0.12682546995072 E559 -G575 0.125420909627563 D536 -Y545 0.121417874255202 A563 -H568 0.121401748145474 T443 -I451 0.12120389740042 I532 -A540 0.120101424777851 A571 -D577 0.118969738443676 L564 -L570 0.118925953319367 L535 -Q551 0.117646151104146 D543 -H568 0.117621778161644 S544 -L570 0.115545949723317 N449 -L564 0.115241411857216 S544 -K552 0.113174484061663 Y545 -A553 0.112453858098225 L549 -L564 0.111838743175567 G555 -A563 0.110991213677689 I451 -G560 0.110892596477517 M453 -S544 0.110788634996362 S544 -R574 0.108493579722926 A538 -V565 0.107730823059433 A540 -A571 0.107091474640016 L558 -A576 0.106989528237169 A553 -D577 0.106440394590095 G560 -A576 0.105876729151924 L535 -S541 0.105839300911661 D543 -K552 0.105397715690952 L535 -L564 0.103669844306448 V534 -S544 0.100920620992461 A567 -G575 0.100397801774957 Q450 -L558 0.09715014897079 Y545 -I566 0.0969841289944915 Q450 -L455 0.0936699568978321 A567 -I573 0.0936379938801006 T546 -G575 0.0935754704119466 M548 -L564 0.091771306211502 E547 -T572 0.0915988277330069 V534 -L564 0.0911280582123581 A553 -R561 0.0891216286692735 Q551 -A563 0.0889524786639448 H568 -I579 0.0888994357491928 E547 -G555 0.0885012957230287 Q551 -T572 0.0871959552258179 E537 -Y545 0.0861757109996697 L570 -R578 0.0860345715907361 G448 -G560 0.0860310055244899 S541 -T572 0.086009984717011 Q450 -R561 0.0859086375699105 A563 -A571 0.0858728183540416 L570 -G575 0.0835015260353534 L533 -T539 0.0834417765165298 A553 -E559 0.0826628029547956 L447 -A452 0.0812458720214462 V454 -A540 0.0806430643957414 M453 -A563 0.0791539691087757 T539 -A571 0.0779042630776647 I542 -I550 0.0778090333743098 M453 -T539 0.0756207696718387 Y545 -H568 0.0753729698623998 D543 -M548 0.0747679686796765 T539 -I566 0.073982771258418 K531 -E537 0.072949128766834 A538 -A567 0.071913043559352 E537 -L564 0.0714363768299513 L535 -L549 0.0709930847256111 I573 -R578 0.0709690579589424 L447 -R561 0.0708623538590185 V565 -R578 0.0706241217749932 L564 -R574 0.0701477868864848 L535 -I550 0.0700087982936584 T546 -L554 0.06908339376482 E537 -L570 0.0687849845286994 A452 -A538 0.0678956895153981 L564 -I579 0.0667692074719336 Q551 -R561 0.0651790145069202 S544 -G575 0.0643334812149381 L535 -I542 0.0617448538050753 A563 -R569 0.0606792520857732 D536 -H568 0.0579427876394512 L554 -A576 0.0568941456134162 E547 -K556 0.0549628049351374 G560 -G575 0.0540356203962018 L455 -T539 0.0535614175976278 A563 -I579 0.0535365515436492 I550 -T562 0.05323523906833 D543 -Q551 0.0529853478834683 D536 -L549 0.052312195888689 G555 -V565 0.0521415366101368 S541 -L549 0.0510241055138125 L535 -A567 0.0503687312505006 Q551 -A576 0.0499494509250341 A540 -L570 0.0486626574600773 D536 -L570 0.0463470048873109 Q450 -A563 0.0460735827932544 M453 -T562 0.0451973926098161 E547 -H568 0.0451935410735762 A567 -A576 0.0450251482654763 A452 -Q551 0.0448463652351168 Q551 -V565 0.0427835397592089 D536 -A567 0.0423355916005193 M548 -I579 0.0410948492608263 A553 -A563 0.0401438686498485 E537 -I542 0.0375960696422259 R569 -R574 0.0370156477766155 L549 -H568 0.0365014689912595 L535 -A571 0.0363752689575736 V565 -R574 0.0350612439458579 M548 -T562 0.0326069456884686 Q551 -D577 0.0319786090529393 T562 -R578 0.031818809385979 N449 -G560 0.0316955502307166 Q551 -R574 0.0291879857572326 V534 -M548 0.0290377645326831 K552 -G560 0.0287800214693192 N449 -T562 0.0270970359274361 A538 -T546 0.0264760658202745 E537 -E547 0.0253812722495681 D536 -I566 0.0250529862879145 H568 -R578 0.0248944961420586 A538 -Y545 0.0235099983399061 M453 -A567 0.0233607265391039 D536 -M548 0.0220599128054406 L554 -G560 0.0217173376730493 I542 -H568 0.0216248742378267 T539 -I550 0.0211808448830393 S541 -Q551 0.0210236018560648 A538 -M548 0.020690200191404 D536 -I542 0.0200284875209396 N449 -G555 0.0194415523347531 L564 -R569 0.0188278199400593 E537 -A567 0.0162257702694815 T546 -A571 0.0156933789219034 L554 -R561 0.0154010442415706 E547 -L570 0.015117024019931 L554 -L564 0.0144708357369172 G555 -G560 0.0141713959214067 H568 -A576 0.0140124858433572 S544 -T572 0.0133602797913954 Q450 -G560 0.0111745727152588 T562 -A571 0.0109041474134211 A563 -D577 0.00965340087057598 L549 -A576 0.00906041142546599 L549 -D577 0.00870257694266097 V534 -A540 0.008372503266461 A452 -G555 0.00832363549822723 D543 -I550 0.00807767449240027 G448 -R561 0.0077867188781377 L533 -I566 0.00643334015214947 M548 -T572 0.0049965827799654 K556 -R578 0.00472870636316181 Q450 -V565 0.00416205908330936 I542 -A571 0.00345841731968638 A567 -I579 0.00289919302299366 T539 -L570 0.00168278371101827 T562 -G575 0.00156573136032656 K531 -S541 0.00151289773233065 L442 -Q450 0.00131437820766056 I550 -I573 0.00103155715250303 I451 -L535 0.000950805812182764 T539 -Y545 0.00017079891293692 A452 -I566 9.81741597954056e-05 L533 -S541 -0.000842936929917566 T539 -Q551 -0.000998049644463705 L549 -T562 -0.00189693319369244 T546 -G555 -0.00215810415880213 A452 -L554 -0.0036133554203861 E547 -R574 -0.00479726318397189 A538 -E547 -0.00644103994631484 S541 -E547 -0.0068205737495789 E537 -Q551 -0.0089831301601403 V454 -I566 -0.00901147799374336 Y545 -G575 -0.00959990506305264 Q450 -E559 -0.00966815750895555 L447 -T562 -0.011683206143946 E537 -S544 -0.0121529100760585 L535 -T546 -0.0121840580914911 T546 -R574 -0.0127721190499583 Q551 -I573 -0.0130737413627084 I566 -R578 -0.0132948822650203 E559 -D577 -0.0138855546657131 G555 -T572 -0.0140640218587738 Q444 -A452 -0.0156687394035764 L447 -G560 -0.0159009497047071 L535 -V565 -0.01696916795078 A563 -I573 -0.0176122882283193 A563 -T572 -0.0194231240000704 V454 -Q551 -0.0205347083196146 A540 -L549 -0.0210387680136197 I451 -V565 -0.0212815745664692 L535 -M548 -0.0221098560514781 I451 -R561 -0.0227307449186598 L455 -E537 -0.0232045928067262 I566 -R574 -0.0233748479996305 E547 -A553 -0.0253805146812827 L558 -A563 -0.025618659703702 S446 -I451 -0.0258325344323005 M548 -I566 -0.0258862927041608 V454 -S544 -0.0259196676117281 M548 -A563 -0.0264792743256814 K552 -T572 -0.0264849296209801 V565 -L570 -0.0266911363102498 K552 -I573 -0.0267170899117155 T562 -I573 -0.0269649530065652 I550 -A571 -0.027029033615146 A553 -I573 -0.0271988303583637 T546 -L570 -0.027846566069039 A538 -I566 -0.0285794998809905 D543 -A571 -0.0290768563078503 A571 -I579 -0.0293758064666623 A452 -L564 -0.0300939792093722 T539 -M548 -0.0301606335629323 I550 -D577 -0.0304737587515131 S544 -V565 -0.0309881422030918 E559 -R578 -0.0311414835900861 Q450 -T562 -0.0312795715368053 A452 -L535 -0.0323836304096381 L442 -N449 -0.0327567930591716 T546 -I573 -0.0331750302437914 S541 -I573 -0.0333558766956145 T539 -A567 -0.0337139530817769 L557 -T562 -0.0338179784127366 L535 -H568 -0.0341247543592456 E445 -A452 -0.0356047201047479 V534 -A571 -0.0359523607094951 I566 -D577 -0.0361201489933092 L557 -G575 -0.0365423527169918 A540 -M548 -0.0400712500291074 A553 -T572 -0.0412182568222759 Y545 -T572 -0.0415009964647822 E537 -D543 -0.0420604532239452 Q551 -A571 -0.0423215728250341 A452 -G560 -0.0441718512125382 I550 -T572 -0.0441763308938678 S541 -G575 -0.0454609467066628 S544 -I566 -0.0458203532343928 D536 -I573 -0.0460519090501006 K531 -T539 -0.0465590103916846 S544 -L564 -0.0466527498486329 I542 -L549 -0.0484002978889506 I550 -E559 -0.048808415542676 L549 -I573 -0.0498285412863206 T562 -R574 -0.0498853636269073 L564 -I573 -0.0509184557803241 R561 -I579 -0.0515109054466789 S544 -R569 -0.0523291983296108 M548 -A567 -0.0524548285097104 E537 -H568 -0.0530179054066857 L570 -I579 -0.0534987924136257 A452 -M548 -0.0562142746960332 M453 -E537 -0.0590504753411754 A553 -A571 -0.0594287235556266 Q450 -G555 -0.0594328817150451 K552 -I566 -0.0602284349765276 G448 -A563 -0.0607232644867664 D536 -G575 -0.0613869771197817 Q444 -Q450 -0.0622215329742761 Y545 -L554 -0.0634112846325254 L535 -I566 -0.0635484577018808 V534 -T539 -0.0643171578881079 Y545 -A567 -0.0665672208377821 D536 -Q551 -0.0670394975651157 I550 -K556 -0.0678430728547346 L533 -A540 -0.0702871562583822 L570 -D577 -0.0704547542130656 E547 -A576 -0.0705270027069065 E537 -M548 -0.0706769943468466 M453 -E547 -0.0726755511870643 A452 -E547 -0.0729028912624061 K552 -V565 -0.0740378141723079 Q444 -I451 -0.0748153616802645 K552 -A563 -0.0752793483540994 E547 -L564 -0.0763596646484657 A553 -T562 -0.0778732163274567 S544 -Q551 -0.0787975829965356 L455 -K531 -0.0794288926187807 A563 -G575 -0.0800821305108483 S541 -I566 -0.080630741584361 S541 -I550 -0.080976537961495 S541 -R574 -0.0825207937070834 Q551 -L570 -0.0831848109077713 S541 -R569 -0.0835296570608264 E547 -K552 -0.0839846120015637 L554 -D577 -0.085371806847404 T572 -D577 -0.0863244496642541 T539 -L549 -0.0870095885051896 E537 -R569 -0.0871088943976943 N449 -A563 -0.0879914854893422 R569 -R578 -0.0881180404777751 L549 -L570 -0.0882096405757622 D536 -L564 -0.0890960276862369 I532 -S544 -0.089404906787239 I451 -D536 -0.0897184758860148 L533 -S544 -0.0898343985946841 L557 -D577 -0.0898547862392672 L535 -Y545 -0.0905383766399732 M548 -G555 -0.0911087282386474 L554 -R574 -0.0915210420571171 I542 -Q551 -0.0923453379231542 D536 -R574 -0.0924347360295363 L558 -G575 -0.0924865630934937 I542 -L570 -0.0926468625297598 D536 -R569 -0.0927091911404374 E559 -L564 -0.0927315719943591 R561 -R578 -0.0935896471781978 Y545 -A576 -0.0958927117319612 A452 -T562 -0.096439501508276 M548 -L557 -0.0965773316318347 N449 -V565 -0.0971886698223964 R569 -D577 -0.0983707535836857 I550 -G560 -0.0984950341303463 A452 -L533 -0.0986088077219547 I550 -L564 -0.0987910386429984 T546 -Q551 -0.0992752371963048 Q551 -L564 -0.0996194055838213 I550 -R574 -0.0997111015718115 G555 -R578 -0.100253963307184 G555 -A576 -0.100471603369108 L442 -G448 -0.100555939843899 V534 -S541 -0.100780991588448 A540 -T546 -0.101089457448384 I451 -I566 -0.101717890408521 L535 -E547 -0.103023239727815 S544 -A553 -0.103206727545052 K531 -D536 -0.103424077965284 K556 -G575 -0.104253582165354 V454 -L564 -0.104759367662105 V534 -H568 -0.10493832085981 D536 -S541 -0.105394669098189 T562 -A576 -0.108788674986557 G560 -D577 -0.108801024092824 V534 -V565 -0.109225930230773 M453 -M548 -0.109353958616268 L557 -A576 -0.109750761518779 S544 -I573 -0.110772238022078 M453 -I566 -0.111879669642141 S541 -A567 -0.112053101660488 D536 -I550 -0.112296750086521 I451 -G555 -0.112723418420602 Q551 -I566 -0.113126528508349 H568 -R574 -0.11713490134613 E537 -T572 -0.117257883252649 G555 -G575 -0.117454713582636 V454 -T539 -0.118041351896728 K552 -I579 -0.118100942881874 L554 -A563 -0.121969510430161 S544 -A567 -0.12201078275696 A563 -R574 -0.122632642381514 I566 -I573 -0.12291909171218 T539 -S544 -0.126093563261191 M453 -L533 -0.129385646526126 K552 -R561 -0.13007018510605 G560 -R578 -0.130861104868388 S544 -L549 -0.13140016019436 Q450 -L564 -0.132482072647139 A452 -D536 -0.132524235061369 M453 -K531 -0.133517748181906 K552 -R574 -0.133847634924301 A452 -R561 -0.136377617551535 E547 -L554 -0.13736733264456 E547 -I573 -0.137422826584519 I451 -Q551 -0.138275983638709 T546 -A553 -0.138895296365249 K552 -L558 -0.138895520351512 Y545 -I573 -0.139569715914572 D543 -L570 -0.141369577388496 D536 -A576 -0.142662208147991 A538 -D543 -0.142883003019873 A452 -K552 -0.142901327389055 E445 -I451 -0.143887470660953 A553 -L564 -0.144088950031573 M548 -K556 -0.145403000320921 N449 -L558 -0.145481811909397 L564 -T572 -0.146551246803666 A540 -Y545 -0.150349361102887 I550 -L558 -0.153664838652737 A452 -I532 -0.154188116186317 T562 -I579 -0.155059012248228 M548 -D577 -0.155123657453157 L447 -A563 -0.156836741851733 M453 -Q551 -0.157994001461636 L535 -D543 -0.158756258130432 I542 -R574 -0.159097251552181 A567 -T572 -0.159691302605177 R574 -I579 -0.160654131050412 E547 -I566 -0.160956533605734 L549 -E559 -0.162114413412706 I451 -V534 -0.163472166769045 T562 -D577 -0.163661736325152 Y545 -K552 -0.164751895942708 L455 -E547 -0.165331691103992 L549 -L558 -0.165734900112963 T443 -N449 -0.165776924395689 D536 -A563 -0.167588106002638 K552 -D577 -0.167816527189137 A553 -G575 -0.169515135169293 S544 -I550 -0.17166292486651 M453 -I532 -0.17167961918862 L558 -D577 -0.174294844894874 V454 -E547 -0.174359706219341 K556 -D577 -0.174994323292912 A563 -R578 -0.176992827025863 E547 -A571 -0.179558885641355 T539 -E547 -0.180402360160035 I566 -A576 -0.182787313731221 V534 -E547 -0.184113849567697 L455 -S544 -0.184661474884011 R569 -G575 -0.185484371047351 S541 -T546 -0.187431890077475 D536 -S544 -0.190402196088298 L549 -L557 -0.190452967582131 I550 -L557 -0.19101524431859 S541 -M548 -0.19186622771565 I566 -I579 -0.195447717324882 N449 -R561 -0.196224737503953 I532 -E537 -0.197222128409823 A452 -A563 -0.197819033174674 L564 -R578 -0.199205513686189 L564 -G575 -0.199669251187135 K552 -L564 -0.200561426732496 K556 -L564 -0.203315949203074 T572 -R578 -0.204234121056183 I566 -G575 -0.204910972301509 E547 -G575 -0.205461296185474 D536 -A571 -0.207173730872275 V454 -K531 -0.213068368979493 S541 -L570 -0.215075408968411 T539 -T546 -0.215096662982585 V565 -I573 -0.215467235546399 E537 -T546 -0.216261817510957 D536 -D543 -0.216441021053457 K552 -L570 -0.21754840800331 Q551 -T562 -0.218789323949152 V534 -D543 -0.220201604932347 E537 -I566 -0.220773065749529 L564 -D577 -0.224713456079543 I451 -T562 -0.224807974580973 V565 -T572 -0.225959457613315 S541 -A571 -0.22775496813782 E445 -Q450 -0.227925341526968 I542 -E547 -0.229361116656102 Q551 -L558 -0.230371486598995 L549 -K556 -0.231605565650525 L570 -A576 -0.234627419608995 T443 -G448 -0.23498326202568 I550 -G555 -0.23787397369241 D536 -V565 -0.238800570518719 Y545 -L570 -0.240081020000017 R569 -A576 -0.242102726837536 L564 -A571 -0.247316175946668 M548 -A576 -0.251527961174484 K556 -T562 -0.253655561896783 A452 -V534 -0.25571733509706 Y545 -I550 -0.25796895164905 T546 -K552 -0.262642359220894 A571 -A576 -0.263195396608062 E537 -A571 -0.26402395741828 H568 -I573 -0.264674243998748 K552 -T562 -0.265250149675699 I550 -G575 -0.27323954634658 A553 -L558 -0.275281040168806 M453 -A538 -0.278661577200474 M548 -L570 -0.279759015469263 L455 -A538 -0.283345569336301 K552 -G575 -0.290714761247026 L535 -S544 -0.29407124589891 L455 -D536 -0.296377168931189 A540 -E547 -0.296621088731518 L535 -A540 -0.301133414306186 D543 -L549 -0.301482582457051 L549 -A571 -0.305085861879257 S544 -A571 -0.307765175114637 M453 -L564 -0.31018789109506 V565 -A576 -0.322571448173526 M548 -A553 -0.329767345798814 L549 -G555 -0.338932622256624 I451 -A563 -0.342924744737858 M548 -L554 -0.346227626877782 K556 -A576 -0.356622797896465 K552 -A571 -0.356869205295643 K531 -A540 -0.35695738417602 V565 -A571 -0.359265125580493 M453 -V565 -0.361834934668507 A452 -V565 -0.367288428810096 A538 -S544 -0.382466861973205 I532 -T539 -0.388094434782584 M548 -I573 -0.400656961936916 I451 -L564 -0.407781424711529 I542 -M548 -0.410574135630075 A563 -A576 -0.41261155004192 L549 -L554 -0.415904864712536 Y545 -Q551 -0.461752575917551 V565 -I579 -0.465301320934049 Q551 -L557 -0.522307301267547