[Fri Aug 26 16:46:43 2016] >Input file: TMF4I3K0M1D.pdb >TM segments: 848-859_ 864-901 MAIDEN score = -1.1483 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- I866 -H886 0.946960148773715 R869 -I874 0.9097143412883 L877 -D892 0.876620835865669 A878 -K890 0.852129857900804 I866 -L887 0.807199359540898 Y876 -A895 0.752817403336019 E880 -L887 0.715449826857169 T868 -T873 0.714709049819351 Y876 -F896 0.691565184549486 G875 -V898 0.683537425895302 H865 -L887 0.646739415757985 L877 -Y894 0.626530452934093 H865 -T888 0.595836431903725 S867 -L887 0.587409982374681 Y876 -V899 0.5678512836938 K857 -H865 0.552218024234491 H865 -H886 0.541447516219879 R869 -Y876 0.46915054432357 L877 -T891 0.456241713006696 A878 -D892 0.447795795656804 A878 -T891 0.440080466989288 S867 -A882 0.430479496816203 Y859 -T888 0.425595293805149 L855 -T868 0.415494736504984 Y881 -T888 0.413091792141685 P879 -K890 0.394494995110861 I866 -R884 0.390996346238891 E880 -K890 0.375152638178669 L877 -A882 0.361421844328638 A878 -A895 0.344751491065328 Y876 -V898 0.324688482768693 T864 -E880 0.322416870730621 K857 -E889 0.31925883151852 L855 -V870 0.315974624646886 S867 -Y881 0.312426423870891 S851 -G872 0.282045026163777 T868 -P879 0.281894590283376 A856 -G872 0.280724440062554 D852 -V870 0.277838126889974 P879 -R884 0.268824902364719 Y876 -D892 0.264115147127338 L877 -H886 0.261770415122632 Y876 -Y894 0.232745965630301 A856 -S867 0.230519959077833 Y881 -A895 0.220474933211184 T864 -L887 0.212216866346761 H865 -K890 0.212048026786984 S867 -K890 0.21203908853178 A856 -H865 0.207830113025946 P879 -T891 0.205229992285584 Y859 -K890 0.195329172189478 E880 -A895 0.194524785441016 L877 -V898 0.194424615741131 L887 -D892 0.193952721125787 T873 -D892 0.187633465343854 K857 -R869 0.186371310875473 Y876 -T891 0.180802058915047 T873 -P879 0.178971031104439 A856 -T864 0.178695458644989 D852 -R869 0.176913401240725 Y859 -S867 0.174213691140631 S867 -H886 0.173328584918362 T868 -D892 0.171942945768749 L877 -A895 0.170723744451002 Y876 -E889 0.16780403683227 G854 -T873 0.167179758276287 P879 -H886 0.164581541280354 T864 -A882 0.159586229252017 G875 -M883 0.159245886807872 V870 -D892 0.157606165073764 H865 -G885 0.157031288641577 A856 -A871 0.154699821149642 D852 -T873 0.151729420439989 G875 -A895 0.150907805613728 A856 -I866 0.148582209907291 Y859 -Y881 0.147831403210988 A878 -L887 0.146162130969376 G872 -T891 0.144962372431537 L877 -T888 0.144298517189807 S851 -F896 0.139543490820853 V850 -V898 0.137040749327766 F853 -V870 0.134143262161068 Y881 -Y894 0.129362934194948 K857 -I866 0.126874706298111 V870 -A882 0.12559347669233 T868 -L887 0.12536580917877 R869 -D892 0.123284090560954 Y859 -H886 0.123189589603855 I866 -E889 0.12230364768017 G854 -R869 0.120849947470498 E889 -G897 0.119717028177477 G875 -L901 0.119501489128895 T888 -G897 0.118499859997576 I874 -E880 0.11667265533752 R869 -F896 0.116349047877656 K857 -V870 0.114726525552963 Y876 -M883 0.112817479493566 S851 -A871 0.112391785655599 L877 -V899 0.112033297779311 A856 -L887 0.111925352361749 A871 -A895 0.109480085499194 K857 -T891 0.109249124616325 A856 -K890 0.106826314668615 H865 -T891 0.105819814602396 T868 -G875 0.104604752352199 Y876 -A900 0.102370108461823 A856 -T888 0.10195885137905 G875 -T891 0.101033191866576 S867 -I874 0.100460050364181 F853 -G872 0.100102464557565 G872 -G897 0.0986187592139462 L855 -A895 0.0970994536757518 R884 -E889 0.0967125985881712 A878 -V899 0.0944387328944218 I874 -A882 0.093696810724841 A871 -L877 0.0936835617536778 A856 -H886 0.0932515850800399 M883 -Y894 0.0926309447544713 A871 -V898 0.091745379043271 Y881 -K890 0.0913084508306259 L887 -V893 0.0911657158368158 G885 -Y894 0.0911285743075307 T864 -D892 0.0910850552745313 A882 -A895 0.0906317478904475 S867 -L877 0.0903879880123881 K857 -L887 0.0902703660124096 Y876 -T888 0.0897855631948775 R884 -T891 0.0888932535984754 V893 -L901 0.0885729517603284 L858 -S867 0.088178432086556 E889 -Y894 0.0873590003483429 L855 -F896 0.086988267539341 Y859 -E889 0.0862867194800718 L855 -A878 0.0854305128563855 A882 -Y894 0.0844132423861028 L887 -Y894 0.0842763627225018 G875 -E880 0.0840104472974605 E880 -D892 0.0839727853973464 G872 -V893 0.0833422981580522 K890 -V898 0.0827998610443799 A871 -F896 0.0806014246581048 A878 -L901 0.07797506967594 D852 -F896 0.0776683851571032 K857 -H886 0.0774335014783798 I874 -G897 0.0768383023856485 T888 -F896 0.0765511176795424 T868 -R884 0.0758063583665279 M883 -T891 0.0757717287552633 Y894 -L901 0.075710358893156 R869 -M883 0.0729850283905886 P848 -V899 0.0722715601382058 L855 -E889 0.0708029414309993 G885 -T891 0.0704612304489833 P879 -D892 0.0699721667746339 G872 -Y894 0.0693337954953481 T864 -V893 0.0688169264570222 R869 -R884 0.0679797121366397 G872 -D892 0.0674792934304511 H886 -A895 0.0672301149790799 R869 -T888 0.0671855353022929 T868 -M883 0.0657977510994965 L855 -I874 0.0655858085421668 I866 -A878 0.0643568805841266 V850 -A895 0.06383220773722 E880 -E889 0.0637144454180709 T873 -V899 0.0614335100926335 L877 -R884 0.0613993711431302 F853 -F896 0.060677083087965 V850 -F896 0.0601922352037754 P879 -F896 0.0591559226026566 V850 -V893 0.0587363207203859 S867 -Y876 0.0582507971266946 E880 -G885 0.0578901185371826 V870 -Y881 0.0576537566972437 L855 -T891 0.0565311295553075 T868 -K890 0.0563753015397335 I874 -F896 0.0559726835513201 T864 -A878 0.0555088813040165 R869 -V898 0.0527735956677215 Y881 -T891 0.051814454356041 G872 -F896 0.0513923095877562 A856 -A895 0.0491404355718201 K849 -F896 0.0461763518704891 T864 -M883 0.0453412279126282 V870 -V899 0.0450223613301119 S867 -D892 0.0442017105544303 A882 -K890 0.0441751093415013 R869 -V893 0.0437740690579409 Y876 -Y881 0.0421475524433372 A882 -V893 0.0414585412589865 V870 -A895 0.0405334770017856 K857 -T873 0.0399285266993277 S867 -G872 0.0393645958899731 T888 -A895 0.0369369462515561 L858 -T891 0.0361603995353859 R869 -G897 0.0359766930279966 R884 -K890 0.035757991295875 G875 -A900 0.0333527755407745 A856 -L877 0.0330697695665557 L855 -H865 0.0330647485145531 L858 -E889 0.0326146941681404 I866 -M883 0.0323976339635133 R869 -P879 0.032356517591072 T873 -A900 0.031035553235216 S851 -D892 0.030897909874061 L855 -H886 0.0299005253482951 F853 -R869 0.0298474551535753 G885 -K890 0.0289443494157124 L877 -L887 0.0288483567105118 E880 -V893 0.027415454068082 R869 -V899 0.0268101705729027 T888 -V893 0.0261328248848511 L858 -D892 0.025508137829672 F853 -T873 0.0244866879887962 T868 -E880 0.0233064068472979 A882 -T888 0.0222834268944441 D852 -A895 0.0215379591020528 L855 -G885 0.0200742734836903 Y876 -H886 0.0198156583200095 S851 -K857 0.0171857164692155 K890 -G897 0.0163331101215118 H865 -A882 0.0160566741725097 V850 -A856 0.0149193677821016 K857 -K890 0.0141854199992659 G854 -T868 0.0139001378881476 V870 -G885 0.0104011238336952 T864 -T888 0.009086067857631 T868 -I874 0.00746227170412039 G875 -V893 0.00722698766043228 A856 -T873 0.00586158396421332 T873 -L901 0.00550959910587179 R869 -G885 0.00452790286652482 E880 -G897 0.00445312131405196 G875 -D892 0.00401440469492659 D892 -G897 0.00352345690223377 F853 -T868 0.00346956205475335 G872 -A878 0.00266705120973398 H886 -Y894 0.00234656986939719 T864 -L877 0.00223239324197277 A878 -A900 0.00222439708240962 F853 -T891 0.00172013552716432 V850 -L855 3.63092424073841e-05 I866 -T873 -0.00113520790297628 L855 -T864 -0.00160037708422056 T868 -Y881 -0.00188536498076974 A856 -T891 -0.002115989321819 I874 -V893 -0.00273159371386456 D852 -D892 -0.00283340716732683 G854 -V870 -0.0028455582164586 G875 -L887 -0.00310084424917889 P879 -V898 -0.00357431085374449 T873 -E880 -0.00623079239427682 V850 -A871 -0.00636607058593963 T873 -G885 -0.00655901939474735 A856 -V893 -0.00720842147876199 P848 -A900 -0.00734511320770048 Y876 -G897 -0.00792680747787355 K857 -G885 -0.00873985338560229 T864 -E889 -0.010101846110032 V870 -A878 -0.0110309736494183 G872 -A900 -0.0111970067383957 T868 -Y894 -0.0129364733903941 L855 -T888 -0.0132498289053622 T868 -H886 -0.0132781362282124 L887 -A895 -0.0147895041170703 A871 -V899 -0.0152140153140237 V870 -G875 -0.0153789750597166 S867 -G875 -0.0156665908048272 I866 -E880 -0.0160872639036627 D892 -A900 -0.0161135639658081 G854 -S867 -0.017156737875033 I874 -M883 -0.0176144812328203 M883 -T888 -0.0188630204786459 L855 -Y876 -0.0192627227244806 Y859 -T868 -0.0196921699091939 K890 -F896 -0.020199084337972 R869 -Y894 -0.021102069228581 G872 -V898 -0.0235016359980449 I874 -T891 -0.0244486148073033 I874 -Y881 -0.0257471038170051 L877 -E889 -0.0257478815632854 G872 -Y881 -0.0258417378154032 R869 -K890 -0.0260397109992367 K849 -V899 -0.0265970011485424 V850 -A900 -0.0266954173031411 Y881 -V893 -0.0294120283960151 K890 -A895 -0.0301740680845333 A856 -Y881 -0.0316326096975024 K857 -G872 -0.0316326571628518 S851 -V899 -0.0317457987356238 L855 -D892 -0.033479222310408 V870 -T891 -0.0345827808702261 Y859 -H865 -0.035221561252792 G872 -A882 -0.0381708309781494 G875 -Y881 -0.0402075447930481 S867 -E880 -0.0407401639393075 S851 -T873 -0.0414996411010326 T873 -V893 -0.0415464221791053 T891 -A900 -0.0416106323852093 K857 -Y881 -0.0422392631796131 Y876 -L887 -0.0437553034787799 L858 -T868 -0.0460803035409461 T873 -Y894 -0.0476046913833044 L858 -H886 -0.0476173306788921 T873 -A882 -0.0476175844145565 F853 -Y859 -0.0480356629195082 Y859 -G885 -0.0499241776538666 I874 -D892 -0.0501917150759288 I866 -D892 -0.050711357219098 P879 -G897 -0.0512842632092787 V850 -Y876 -0.0518491087393382 Y876 -K890 -0.0523438618064196 T864 -R884 -0.0537141814819186 T864 -P879 -0.0566237345581801 V850 -D892 -0.0574024825309998 S867 -Y894 -0.0581143063605971 Y881 -V898 -0.0581719293571639 K857 -S867 -0.0596213662743929 A882 -L887 -0.060350456753941 L887 -F896 -0.0611596712569771 Y859 -D892 -0.0620209586715268 T864 -Y881 -0.0655129778202028 S867 -A895 -0.066445879588664 T873 -F896 -0.0674263437414759 T868 -L877 -0.0684943734946373 S867 -R884 -0.0685644272946866 P879 -Y894 -0.0697032856944195 T873 -G897 -0.0702997974806263 I874 -L887 -0.0705133529552011 Y859 -T891 -0.0705409366139067 L855 -L877 -0.0706984325142006 G854 -D892 -0.070864316911198 H865 -E889 -0.0711743164584907 T891 -V899 -0.0727595423811713 V850 -V899 -0.0729646656882812 G854 -Y859 -0.0732292336935991 H865 -A878 -0.0739671762936727 A878 -G897 -0.0740349427831994 G875 -A882 -0.0744209213748706 P879 -V893 -0.0750743942102653 D852 -K857 -0.0755209074622876 T864 -G885 -0.075925443790108 T873 -L887 -0.0759710587497953 S851 -R869 -0.0769519026463574 V870 -L887 -0.0779504874646362 A856 -Y894 -0.0788979423536909 T873 -V898 -0.0803591799273331 Y859 -L887 -0.0805378596573614 V850 -G897 -0.0815733575746274 G875 -F896 -0.0824757573234223 Y876 -L901 -0.0827962021260653 R869 -Y881 -0.0831646682275236 A856 -Y876 -0.0834577237905354 G885 -D892 -0.0841242571880474 A882 -D892 -0.0844582595805099 A856 -T868 -0.0853212622568648 P848 -F896 -0.0854049864543391 L855 -R869 -0.0861048170648342 D852 -A871 -0.086602588545289 T868 -A895 -0.0868831412148732 Y876 -A882 -0.0880821725118895 A871 -Y876 -0.0893125139865045 R869 -G875 -0.0915367411749525 A878 -H886 -0.0919317665759625 A882 -E889 -0.0922355566984329 L855 -Y881 -0.0933327775330595 S867 -E889 -0.094829269273109 G854 -G872 -0.0949921733459806 Y881 -E889 -0.0951089440888415 I874 -L901 -0.0954683271811358 V850 -K857 -0.0960863968969257 P879 -E889 -0.0974676332579616 R869 -T891 -0.0980045401879064 L858 -L887 -0.0986679264048913 I874 -V899 -0.0989629435045174 I874 -Y894 -0.0993603447431637 H886 -T891 -0.0994468825466381 A882 -T891 -0.100519872469198 E889 -V898 -0.101776409903966 A856 -V870 -0.101979951902376 T873 -T891 -0.102254635687235 G854 -I866 -0.10279988742242 F853 -A871 -0.103360027169759 M883 -K890 -0.103980458493319 S851 -V870 -0.105641689924271 G872 -L901 -0.105651937411385 L858 -I866 -0.106703764129077 L855 -I866 -0.108768140840181 Y876 -G885 -0.109095140751325 I866 -K890 -0.109382564144145 L858 -R869 -0.109908080547992 G875 -K890 -0.112702858795942 D852 -L858 -0.112978049134516 R869 -L877 -0.113015402688855 K857 -T888 -0.113664364679424 Y894 -A900 -0.115042659338286 Y881 -H886 -0.115290351874285 L877 -A900 -0.115592580160446 T873 -M883 -0.115876328554191 L855 -A871 -0.116161926333238 I866 -T891 -0.118501904019164 G875 -G897 -0.119390053157682 A878 -T888 -0.119761862731568 I874 -A895 -0.121316425808612 I874 -G885 -0.121918640075727 I866 -L877 -0.124381163511943 S851 -A856 -0.124925412214905 I866 -P879 -0.125029149690026 T888 -Y894 -0.125110550819106 L855 -G872 -0.125260288860016 S851 -A895 -0.125410111847146 T868 -Y876 -0.125591604216331 D852 -T868 -0.127890447483176 F853 -D892 -0.128284142736097 A856 -F896 -0.128650087913931 V893 -V898 -0.130752788047333 A856 -D892 -0.1310301328803 F853 -A895 -0.131430245933643 A856 -R869 -0.136589931590808 T873 -Y881 -0.138172811065887 K857 -A878 -0.139709834334079 K857 -A895 -0.140080782294677 G875 -Y894 -0.141626103093022 T868 -A878 -0.142595760888617 V893 -A900 -0.145470586622012 H865 -E880 -0.146623761843365 S867 -M883 -0.146774100308856 E889 -A895 -0.146778737080071 K857 -L877 -0.14867575699521 L858 -K890 -0.148852517701984 G854 -A871 -0.150140541577115 R869 -L887 -0.151862928639471 L877 -L901 -0.151960026676996 Y881 -F896 -0.153140068715877 I866 -G885 -0.153523387996885 S867 -T873 -0.154563514374228 H865 -R884 -0.155779048301217 R869 -E880 -0.156775026165961 T868 -G885 -0.15884011050868 E880 -T891 -0.159056087246701 Y881 -D892 -0.160661526906214 L858 -T864 -0.161325500710458 K857 -A871 -0.161997320028804 A871 -D892 -0.162309835158489 V850 -G872 -0.162677612766074 K849 -A900 -0.162816778648532 T873 -A895 -0.16391323366259 L877 -G885 -0.1644527823508 D852 -G872 -0.165653823972692 A878 -F896 -0.166254286775861 D892 -L901 -0.168034913453819 P879 -A895 -0.168732927208117 A878 -R884 -0.171796157725991 R869 -A878 -0.172810261941189 K857 -D892 -0.173746615004395 Y859 -I866 -0.174413026690901 T873 -A878 -0.175383696210379 G875 -V899 -0.175513818749471 L877 -G897 -0.175976777739398 R869 -E889 -0.176121980347476 E880 -Y894 -0.17625397611079 P879 -G885 -0.183765825607746 T868 -E889 -0.184073077241017 F853 -L858 -0.184680702079338 G872 -V899 -0.188240182138321 F853 -E889 -0.188547743278575 K857 -V893 -0.188735550374193 K890 -V899 -0.190025096441623 K857 -T868 -0.190069786754504 S867 -P879 -0.193811049755535 T891 -V898 -0.194673989911609 R869 -A882 -0.194785613320414 S867 -A878 -0.198363799071367 L877 -K890 -0.198652499513799 I874 -V898 -0.199957030089649 S867 -T891 -0.20021872578162 E880 -T888 -0.20150692595123 V893 -V899 -0.201949060473877 S867 -T888 -0.203987438319549 R869 -A895 -0.21062283011794 A878 -G885 -0.211126171224249 D852 -V899 -0.211447353540431 F896 -L901 -0.211704543701707 T868 -T891 -0.211810493955982 T891 -G897 -0.212389359284023 P879 -T888 -0.217150394023195 R869 -H886 -0.218021712075396 T891 -F896 -0.220138214726346 H865 -M883 -0.221066688110572 T864 -K890 -0.225644024895006 L855 -L887 -0.226727657521136 T864 -T891 -0.227120152141125 A878 -E889 -0.228320323976992 A895 -L901 -0.22941146154046 H865 -L877 -0.231986371087567 K857 -T864 -0.238196313739961 L877 -F896 -0.240502204801119 Y876 -V893 -0.241061092945175 T868 -A882 -0.241257571031567 Y894 -V899 -0.243687923164435 L877 -V893 -0.251140871671485 D892 -V899 -0.254339054987534 H886 -V893 -0.255779325177384 I866 -Y881 -0.256604206174883 D852 -Y876 -0.258058488435114 I874 -P879 -0.258811435648504 E880 -H886 -0.26540706161907 L858 -T888 -0.269551837130407 H865 -P879 -0.271910740000273 A878 -Y894 -0.274742399082363 Y881 -L887 -0.280361497091199 L855 -T873 -0.283461837480593 V870 -L877 -0.28361853151155 H865 -D892 -0.291306778556229 D892 -V898 -0.293890763738792 A856 -E889 -0.300339006613246 G872 -L877 -0.304262657149946 H886 -D892 -0.304912156753678 A878 -M883 -0.307088063579512 E889 -F896 -0.309356157861025 I866 -A882 -0.31743089442937 L855 -S867 -0.318598986368265 V870 -Y876 -0.33489666721636 G872 -A895 -0.350490033857659 A878 -V898 -0.371668623414348 A895 -A900 -0.398738433716958 H865 -Y881 -0.402596750989379 I866 -T888 -0.403235498391794 L858 -H865 -0.419529344594023 Y859 -T864 -0.421838487920314 L877 -M883 -0.436797999882924 A878 -V893 -0.462653362828689 T868 -T888 -0.495703485869686 P879 -L887 -0.564322032641132 S867 -G885 -0.620345853586846 T864 -H886 -0.655908654188846