[Mon Aug 29 17:36:08 2016] >Input file: TMF7X390M1G.pdb >TM segments: 9-24_ 49-83 MAIDEN score = 1.4389 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- L11 -S17 1.05220409779532 T61 -L66 1.02324274010522 F14 -V79 0.913570882535383 H60 -L66 0.820529104941391 P15 -L20 0.740369530783141 V13 -L20 0.735915341377995 T9 -F14 0.73431352615841 F14 -A76 0.682363546161616 L57 -V62 0.681497295966476 F14 -A19 0.673304777665788 L11 -L18 0.666228426777127 I10 -F16 0.658387365761593 V13 -L18 0.576416863268407 V12 -L18 0.575686707077214 L57 -A63 0.551796901862446 F14 -F75 0.510278289182534 F14 -L20 0.501476435393538 F16 -A21 0.491321922110753 V62 -I67 0.467326002308914 A55 -H60 0.442019977004963 A63 -F68 0.43226285191672 L11 -F16 0.417469121137733 L66 -S71 0.346578794875472 A19 -A69 0.32008216509494 I10 -S17 0.316508538387458 L59 -A64 0.297597620730419 L57 -A64 0.293017361915678 A22 -G65 0.28781359727817 P15 -S24 0.2825807093622 L18 -L23 0.275674031236863 I10 -P15 0.271590760577461 T61 -I67 0.270410195736075 S71 -N78 0.249010166329767 A69 -A76 0.229296764441703 S17 -L23 0.224960295116123 A64 -A69 0.222425616944477 F14 -A22 0.203859282278399 F72 -V79 0.203338867769089 S71 -M80 0.187858067056681 F16 -A76 0.187789429263007 A73 -G81 0.184647593067933 F14 -A73 0.18350759836099 P15 -V79 0.182928616722296 L74 -G82 0.182519478680113 S17 -N78 0.182127618208307 G51 -L59 0.170447315875592 A55 -G65 0.166811574439279 V12 -L20 0.166456760783635 V12 -A76 0.165124718277051 N78 -G83 0.163424722591485 V13 -M80 0.159751568815224 H60 -F72 0.158200841158384 F14 -S71 0.157266363025126 T9 -N78 0.152277997904716 G51 -G58 0.146656177660069 H60 -V70 0.14566434849636 I10 -G83 0.144050381857891 F14 -G81 0.143056064714921 S24 -F72 0.142976735288822 V13 -S24 0.133456456572096 V13 -A73 0.130910156830431 F14 -M80 0.130280319301335 G65 -V70 0.129537336308939 A76 -G83 0.123834269420838 S24 -A69 0.12251220551884 A63 -S71 0.121255749053433 F68 -A76 0.12077241961613 V13 -A69 0.120320217520955 G51 -L57 0.117903513402343 A50 -L57 0.117053622232626 L66 -L74 0.114539092464548 G58 -F68 0.113356588136181 G58 -A69 0.112928062155517 D53 -V62 0.112420707306676 A22 -L66 0.111380504094897 V13 -G82 0.110843039046256 A19 -A73 0.108810922163411 L23 -L59 0.108297899277654 V62 -S71 0.107600871669195 A19 -L66 0.107318322875729 G65 -A73 0.106362608012803 S24 -A76 0.105009317136353 L11 -V79 0.103116121614165 A55 -F68 0.102209726693032 S17 -V79 0.101973868447916 L23 -L66 0.0997349456403356 S71 -V79 0.0996948065353598 A19 -A64 0.0991901892937799 L59 -V70 0.0975743126133679 F68 -N78 0.0952429213089445 T9 -G82 0.094091401126888 L57 -A69 0.0925320552463802 P15 -A22 0.0921822665292105 I67 -A73 0.0918996905487526 L11 -L23 0.0904276473606709 L20 -V79 0.0898143481460361 P15 -A76 0.0869941419403375 L20 -L74 0.0823680953916295 A22 -A64 0.0822845416657465 P15 -A73 0.081898998859784 A19 -V70 0.0818717712469716 L23 -V70 0.0816985175740625 D53 -T61 0.081557521673238 T9 -A76 0.0811387610113954 V13 -N78 0.0806368426211899 L20 -F68 0.0789127840649648 P15 -A77 0.0782444632023855 L23 -L74 0.0777166477530038 L59 -F68 0.076757923145369 L57 -F68 0.0759426646232249 I67 -A76 0.0754555391883304 L66 -F75 0.0753240216113433 L49 -Q56 0.0744567824956446 A19 -S71 0.0736876343008808 L20 -A73 0.0677470227662913 L20 -A69 0.0676451477984061 F14 -F68 0.0662104921242594 L18 -A76 0.0656969525132783 F68 -A77 0.0653807383295115 A63 -F72 0.0651760678221276 L18 -F75 0.0651227456138264 I10 -N78 0.0642589294621438 A55 -T61 0.0611867451453589 V13 -S71 0.0604341879792831 A69 -A77 0.0579648709243024 P15 -L74 0.0552987340714957 L11 -A19 0.0549308573997607 A19 -V79 0.0539727932529805 A55 -V62 0.0534835845460049 G58 -V70 0.0522321880129211 Q56 -L66 0.0515006261896351 F16 -F72 0.0514934178640529 L54 -A63 0.0497184694847461 F68 -L74 0.0486274156423976 P15 -G82 0.0485452945070688 A64 -L74 0.0482196009017493 A19 -L59 0.0476212340878237 T9 -P15 0.0457492227858705 V13 -G65 0.0456102399170442 A19 -I67 0.0431056427616339 F16 -M80 0.0426143186819131 A55 -I67 0.0420916755325491 S17 -F75 0.041981413730741 V13 -A77 0.0410457262599913 L54 -G65 0.0408440021523793 G51 -H60 0.0399484651545152 V13 -G81 0.0384650803567903 A19 -L74 0.038203491275127 S17 -A76 0.0373272413048058 L20 -M80 0.035395615812511 A21 -A69 0.0346507499177506 T61 -A69 0.033814130822174 L23 -A64 0.0332990642024234 I10 -G82 0.0329561553117772 I10 -A19 0.0326964482761394 A19 -N78 0.0321850674963731 S24 -T61 0.0298814724238614 A22 -A69 0.0293091633446538 F14 -L74 0.0278597625688963 F14 -S24 0.0250780407753677 D53 -A64 0.0234473763718434 A50 -G58 0.0233593260100391 T9 -M80 0.0232745190648727 L49 -H60 0.0213795332223568 L18 -V79 0.0182139874105101 A64 -A73 0.0161948255606985 A19 -A77 0.0151956075637161 V70 -A76 0.0147180832239147 A19 -G65 0.0145843014091582 T61 -F72 0.0142194236571833 V13 -F72 0.0135391407620347 V70 -A77 0.0115514437191493 G65 -F75 0.0107928275696363 L18 -L59 0.0103413076196937 L18 -F72 0.0090575788585161 L52 -G65 0.00837263734795979 G65 -F72 0.00676622792738968 L18 -A69 0.00591228436215374 T9 -G81 0.00448055987018869 L66 -F72 0.00443073067624322 A19 -M80 0.00442187828943297 L18 -G65 0.00421718488005629 I10 -A76 0.00312659427174695 T61 -S71 0.00305229608126867 L52 -A63 0.00214204759794967 F16 -G82 0.000496812518434808 T9 -L20 -9.62910799637839e-05 L52 -V62 -0.000242187987573139 F16 -A77 -0.00124722766632956 A69 -L74 -0.00167475377172677 V13 -G83 -0.00330390321822316 S71 -A76 -0.00368031257895829 I10 -A21 -0.00387751493955379 A21 -F75 -0.00431571294830491 T9 -A77 -0.00456932840082525 A69 -N78 -0.00652846416599634 V70 -N78 -0.00660384605164865 F68 -A73 -0.00677239049863565 L20 -S71 -0.00778894264657382 L74 -G83 -0.0098471616803335 A69 -F75 -0.0102753973619314 L66 -A73 -0.0114806415306168 A73 -G82 -0.0126123772336646 L11 -G83 -0.0133894139936475 S24 -G65 -0.0135312011703985 I10 -A22 -0.014688166711107 V13 -A21 -0.0148378286412107 V12 -N78 -0.0193408652262794 L23 -T61 -0.0206504319452945 V12 -S24 -0.020904581047135 S24 -F68 -0.0210472097111932 L23 -I67 -0.0211047616173277 I10 -M80 -0.0242203306572333 A22 -T61 -0.0255398219115439 H60 -S71 -0.0273573820949742 T9 -A21 -0.03064447357254 S17 -S24 -0.0309634971175194 L49 -G58 -0.0352655750676036 D53 -G58 -0.0361855591693416 A64 -F72 -0.0362137767849777 S71 -G81 -0.036552990554501 F14 -L23 -0.0371655525514916 L74 -M80 -0.0372350772456027 L11 -A22 -0.0404013497350073 G58 -G65 -0.0423920504256787 Q56 -V62 -0.0431482193202861 L23 -A73 -0.0442494590161511 L57 -L66 -0.0445621871874717 D53 -A63 -0.0457390198171086 Q56 -A64 -0.0463070619282115 V12 -A19 -0.0490658008880582 G65 -L74 -0.0501970543243049 F16 -V79 -0.0527001030804319 D53 -L59 -0.0532262356088911 D53 -G65 -0.0537359209374744 P15 -G81 -0.0558520921162011 L52 -A64 -0.0559022703284127 L49 -L54 -0.056266309929919 L23 -A76 -0.0570365221585849 A50 -Q56 -0.0571085772740274 F16 -F75 -0.0594151924813699 I10 -F75 -0.0599052733094125 V13 -A76 -0.0605951354145957 Q56 -A63 -0.0621468833762979 V13 -V79 -0.0626982056753089 T9 -F75 -0.0641969530253055 I67 -F72 -0.0645805524683105 L54 -T61 -0.0664330961020814 A19 -F72 -0.0668006894796038 A55 -L66 -0.0670646210987158 A50 -L59 -0.0673775981068232 V13 -L23 -0.0677861674547842 P15 -G83 -0.0679155827668714 F72 -N78 -0.0689578070501363 H60 -A69 -0.0690280938675008 S17 -F72 -0.0720459131426705 I67 -L74 -0.0728872156150029 L54 -A64 -0.0728969972397282 A22 -A76 -0.0736029560416851 A50 -H60 -0.076428809864014 V13 -A22 -0.0764672702285409 L54 -H60 -0.0772934314452294 A21 -A76 -0.0773190963974759 A19 -F75 -0.0774602749974491 D53 -H60 -0.0782089983225557 F14 -A69 -0.0785939388728583 L49 -L59 -0.0793158910652743 L23 -F68 -0.0793278848767596 P15 -L23 -0.0799380350321393 L20 -N78 -0.0815882951297011 L20 -F72 -0.0831127033983536 F16 -A22 -0.0838471317573877 V13 -L74 -0.0845541680502304 V13 -F68 -0.0855242283884343 A19 -F68 -0.0857232732955953 A77 -G82 -0.0870856729774623 F68 -F75 -0.0888559517501406 S17 -A22 -0.0895208903912099 Q56 -F68 -0.0934191621229039 V12 -G83 -0.0953082413408408 L57 -G65 -0.0960477595878695 L23 -F75 -0.0973269740374274 P15 -A21 -0.097713615044785 V12 -V79 -0.0981970712898985 I10 -L23 -0.0988655266559553 A22 -F72 -0.0991209988738853 L52 -T61 -0.099415114341081 F14 -N78 -0.0999553647724167 L23 -S71 -0.101180472891828 L20 -G65 -0.101590997620917 V12 -F75 -0.103213664368019 L20 -F75 -0.103587233141777 I67 -F75 -0.106645830933444 F75 -G82 -0.106812208318928 A22 -F68 -0.106953982502274 A22 -L59 -0.10756392991907 I10 -G81 -0.109763115688257 V12 -S17 -0.111063585514444 Q56 -I67 -0.113480007826569 F16 -N78 -0.113630177881516 F75 -M80 -0.113704309224294 A21 -F72 -0.115676506248025 L59 -I67 -0.11575864038574 V12 -F68 -0.116808953606757 G65 -S71 -0.118050921807568 V62 -F72 -0.118097041535153 F16 -L23 -0.118151371464032 L18 -F68 -0.124100446250549 F14 -G83 -0.12553317056447 L23 -G65 -0.126890412100169 L59 -F72 -0.127868244137612 F72 -G81 -0.12891365789632 I10 -V79 -0.128964335033697 I10 -A77 -0.128964973430974 F14 -G82 -0.129383006553702 L11 -F75 -0.129795248754019 L23 -F72 -0.130472029555821 A76 -G82 -0.130842038292471 P15 -F72 -0.131678652001685 A64 -F75 -0.135939700452509 T61 -F68 -0.136328550884075 L57 -I67 -0.137597123831704 V13 -A19 -0.138748818080962 V12 -F72 -0.140334764236267 F75 -G81 -0.142374035459103 A63 -V70 -0.145980561012055 Q56 -T61 -0.147408199731411 L52 -L59 -0.148648622923815 A77 -G83 -0.149382485267343 P15 -M80 -0.151299997907683 V12 -L23 -0.151331722653024 L11 -A76 -0.152939662508357 F14 -A21 -0.154651362576214 A22 -H60 -0.154664479273595 A22 -F75 -0.159784836638007 L49 -A55 -0.161074629011569 F75 -G83 -0.161226295293706 L20 -A77 -0.162381766157239 T9 -A19 -0.162583772016795 L54 -V62 -0.167478879085811 A50 -A55 -0.169445433231032 A55 -A63 -0.172640091789351 A19 -A76 -0.180587486980292 T9 -S17 -0.182815798439131 L59 -A69 -0.184163019128403 V62 -F68 -0.184286196540125 F72 -A77 -0.18725525473217 L49 -L57 -0.187513370144934 F16 -S24 -0.188996178923501 G58 -I67 -0.190054103571341 L59 -S71 -0.191486916728994 L11 -A21 -0.192235784521256 A64 -S71 -0.193702518889466 A73 -N78 -0.194389844856573 V12 -A22 -0.196448485382686 A55 -A64 -0.197050787248907 A73 -M80 -0.203995445164018 P15 -F75 -0.205614629601225 T9 -V79 -0.209672119722125 F72 -M80 -0.21087771677351 T61 -V70 -0.212139842955817 F14 -F72 -0.212502578861444 L59 -G65 -0.216191282542367 V70 -F75 -0.217537479277963 P15 -N78 -0.221273624947607 G58 -A63 -0.221842630096409 S71 -A77 -0.227056662212078 T9 -G83 -0.240325489567706 A63 -A69 -0.240823323822363 Q56 -G65 -0.243356756692631 L52 -H60 -0.247420149424041 L23 -H60 -0.249159096072922 V62 -V70 -0.259584040985503 A73 -V79 -0.263738307724029 T9 -F16 -0.264697795580304 L20 -A76 -0.265380601224586 G58 -L66 -0.266618560653935 F14 -A77 -0.273970238918543 I10 -L18 -0.281331839317698 T9 -L18 -0.291005293037822 G51 -Q56 -0.291933823017601 V13 -F75 -0.308216191406534 L23 -A69 -0.316281562967401 L52 -G58 -0.331865526213091 H60 -F68 -0.334090056959383 I10 -L20 -0.336326653717054 L18 -S24 -0.337942354327033 L59 -L66 -0.340225162638368 L74 -G81 -0.341240000217462 V12 -A21 -0.353206010199959 A64 -V70 -0.358700831617196 V62 -A69 -0.365640687182661 L52 -L57 -0.372399074902952 L11 -L20 -0.382395262088185 A76 -G81 -0.382629305860576 L74 -V79 -0.386642666524727 H60 -I67 -0.389063815388382 L54 -L59 -0.409494487330783 G58 -A64 -0.410370266930139 H60 -G65 -0.513807116474237 A19 -S24 -0.534056089405596