[Fri Aug 26 16:39:33 2016] >Input file: TMK0XWZ8M2D.pdb >TM segments: 448-474_ 477-492 MAIDEN score = 4.6971 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- R460 -G465 10 A456 -I466 1.91690364584554 I466 -Q481 1.13241936400146 E472 -L477 0.968084953398199 I466 -L485 0.806799769522196 R460 -I466 0.792401079836498 A456 -Y467 0.746257539500897 I466 -L484 0.739736582867553 A456 -D464 0.73093045748906 T452 -V492 0.708094772514675 A459 -Y467 0.59604727822706 L455 -V492 0.519909939892923 G474 -K482 0.476046600037649 Y467 -Q473 0.456744785765566 P469 -Q481 0.43589428166457 L455 -Y467 0.425775721361964 R460 -L484 0.420954078355992 L455 -R489 0.415689145123416 L484 -R489 0.381806748485598 A456 -L470 0.340821710267739 S463 -P469 0.339205736022679 Q454 -Y467 0.33207376024928 A459 -I466 0.326559005451728 P469 -K482 0.321318719798006 L455 -R460 0.314477933818601 A456 -G471 0.310292455048443 A449 -Q454 0.30079748032366 L458 -Y467 0.300628953210998 A456 -L485 0.299841317517516 A459 -L485 0.299415780385717 K482 -L487 0.286483957934087 K482 -R489 0.256678517901254 Y467 -R489 0.242682598064668 L458 -T468 0.242221977919278 T468 -L485 0.241998484664334 G465 -L487 0.240613539069 L458 -S463 0.228298421124315 T452 -G471 0.199986812525946 A459 -L484 0.196452907753749 L455 -M462 0.194922917191123 D464 -K482 0.194310782155603 I466 -K482 0.194201725196239 A459 -L487 0.193567528222072 R460 -Y467 0.193136918406924 L458 -G465 0.190447986859891 L458 -D464 0.189256915325678 G471 -Q481 0.187239005349248 E457 -I466 0.182288395829936 Q454 -A459 0.180490009722398 L484 -V490 0.17440745609868 T468 -L477 0.17413092117247 G465 -G474 0.170913770972343 Y467 -V492 0.168210893331026 P469 -R489 0.166777893330702 T468 -K482 0.164905388700277 S461 -P469 0.163078771169679 G474 -G480 0.162437579634653 G471 -A486 0.161636831452177 L455 -L491 0.160056809158064 G474 -L484 0.159394955802346 E451 -A456 0.159377311530013 A456 -A488 0.159044511282441 G465 -L484 0.158774202318293 S461 -L487 0.158402324476214 Q481 -A486 0.151708116531356 G465 -G471 0.151464065722653 L458 -I466 0.15118001764658 Q454 -P469 0.147285821030279 A459 -G480 0.144733402123647 E457 -Q481 0.14219667565912 E451 -I466 0.140948540766717 T468 -A488 0.14012974850606 A456 -E472 0.139044872109068 Q483 -A488 0.138617111903327 E457 -S463 0.138163528046229 A456 -A486 0.136045848500208 Y467 -L487 0.13554067580415 G474 -R489 0.130830510821607 Q454 -S463 0.129180055013184 Y467 -L477 0.127660762689325 G465 -E472 0.127371156666891 A456 -G474 0.125863230556525 P469 -A486 0.125557592309711 P469 -V479 0.123796233286273 T452 -G465 0.123517337724004 E457 -E472 0.123257764262401 S463 -Q481 0.1222253136241 G465 -K482 0.121527084599164 R460 -Q483 0.121430217498557 A459 -G471 0.120474029865801 E457 -M462 0.119167166131121 L450 -L491 0.118499006216036 Q454 -S461 0.11788581400549 A449 -E457 0.117124614453862 S478 -A488 0.112621218826769 A449 -R489 0.112560396317985 Q473 -A486 0.111509658873548 L450 -L470 0.110851982302825 E451 -R489 0.110799962156453 L470 -L487 0.110705463981262 R460 -A486 0.108326941130172 A459 -A488 0.106766339545168 Q454 -R460 0.10539617568169 T452 -D464 0.103923104010659 L485 -V490 0.102740435329711 L455 -A486 0.100616801792849 V453 -A486 0.0972049148888057 A456 -Q483 0.0963555803242016 G465 -R489 0.0963521972485346 Q454 -L485 0.0957814143145912 A456 -G465 0.0950187307244015 E457 -Y467 0.0938689217627058 R460 -P469 0.0936378729326934 L455 -A488 0.0933966363306817 L477 -A486 0.0928978233149325 L458 -V490 0.0901077513154194 Q473 -V479 0.0879688380279533 G474 -A488 0.0876096915880527 E457 -R489 0.0872316514752058 L458 -P469 0.086619342420537 Q473 -R489 0.0848151766994434 S461 -T468 0.0846025749653724 G465 -V479 0.0844070562192342 T468 -S478 0.0814542375937739 I466 -V479 0.0783658280914574 E451 -Y467 0.0765634111484148 L477 -Q483 0.0762602932514334 V453 -L484 0.0751653042702403 R460 -L491 0.0749403363712482 A456 -M462 0.0746720110747203 R460 -L470 0.0746613820079711 A456 -T468 0.0742239437397281 E451 -L491 0.0726427209066758 G471 -L485 0.07140835378351 E472 -L484 0.0710744477080522 E451 -L470 0.0709911132787056 L458 -L470 0.070100377682659 A449 -A488 0.0697802741140707 G471 -A488 0.0695240941507422 I466 -S478 0.0684828960671091 L470 -R489 0.0678257348825673 L450 -R489 0.0676340703340741 I466 -L491 0.0674457509093298 V453 -L487 0.0660438940495274 A449 -A459 0.0614034306776756 Q448 -A456 0.0582638542138934 E472 -R489 0.0561943860215859 A449 -Y467 0.05475379363688 V453 -R460 0.0535640684612474 G471 -S478 0.0530448229245151 Y467 -A486 0.052390876200755 T452 -A486 0.051751369102778 S461 -G480 0.0505266396840844 S461 -Y467 0.0498090248106147 L470 -Q483 0.0495219380498746 G465 -A486 0.049487485707453 L455 -I466 0.0489246721821175 Q473 -Q483 0.0482794251794449 A459 -V490 0.0481602837330444 Q473 -G480 0.0477780128261251 L455 -L487 0.0473244121027698 E472 -S478 0.0469907878863669 E457 -P469 0.0461756321372615 E457 -L470 0.0455878768891287 A449 -L470 0.0442925281950264 L477 -L487 0.0441067826643025 G465 -S478 0.043568031296773 V453 -Y467 0.0412023190548698 D464 -Q481 0.0376545873183411 Q448 -V453 0.0376283748688069 D464 -L485 0.0368192425006648 I466 -G474 0.0367160035680212 S461 -Q481 0.0349535126171281 V453 -R489 0.0347729848202087 G465 -L485 0.0334830655790945 L458 -A486 0.0334469462206459 L450 -A488 0.0332470623277847 I466 -Q473 0.0332000290682357 S478 -A486 0.0312436915662992 S463 -A488 0.0291334001612444 L455 -S463 0.0290369140156743 A456 -K482 0.0287646289231978 T452 -P469 0.0281314561590698 L470 -L484 0.0279545993399699 T468 -Q483 0.0276300714423543 S463 -L484 0.0270706951003966 L458 -G480 0.0269999167461106 K482 -V490 0.0268482404547126 G465 -Q483 0.0260040744318943 E457 -V492 0.0252160945702178 Q454 -V490 0.0250247777367973 L455 -G471 0.0248399854788031 M462 -G480 0.0246416909890339 E457 -G471 0.0231495934577084 S461 -A488 0.0227023349344497 Y467 -Q483 0.0226519527774975 V453 -G471 0.021886130672355 E451 -V490 0.0216399640850892 T452 -V490 0.0204260301809454 L450 -A459 0.0188071514788497 A449 -T468 0.0182641091866005 A459 -D464 0.0182419987569205 A449 -P469 0.0173394258219064 A456 -V490 0.0157831243526465 L470 -A488 0.0154098962164468 E457 -L491 0.0143569776008352 L455 -S461 0.0142931874826457 L455 -Q481 0.0124418883975439 I466 -V492 0.00978864639598021 Q454 -A486 0.00725861107826931 K482 -A488 0.00696067867004596 E457 -L485 0.00592340936405211 T452 -E472 0.00525867285814385 Q448 -L470 0.00504068985146233 R460 -K482 0.00410582162828366 V479 -A488 0.00394837158773242 E472 -Q481 0.0011163144730304 Q483 -V492 0.000527167639832626 T452 -Y467 0.00050784601248921 A459 -L470 0.000169033783515182 E472 -G480 9.92770817169752e-05 D464 -Q483 -0.000700800967657678 G471 -K482 -0.0008762221044194 T452 -R460 -0.00251498608783285 L470 -G480 -0.00279073054110679 L450 -T468 -0.00443619786413163 S461 -Q483 -0.00516349147720363 V453 -S463 -0.00533827251148633 Q454 -L491 -0.00790338095501811 T452 -L470 -0.00790630355162669 E457 -L487 -0.00886551959841164 M462 -L484 -0.0106189827327219 L450 -L458 -0.0116689540154091 G465 -L477 -0.0128639300335958 P469 -G480 -0.0129844815756864 A459 -V479 -0.0144499758043395 V479 -L487 -0.0148434646967388 Q448 -L491 -0.0150003515685837 E457 -Q483 -0.0161489586456235 A456 -Q481 -0.01673059306576 M462 -T468 -0.0172103162570492 L458 -R489 -0.0174897851858464 I466 -V490 -0.01869079680782 S463 -G480 -0.0188905765533132 Q448 -V490 -0.0198956234051568 E457 -K482 -0.0204273510240405 L455 -T468 -0.0215575423148167 L470 -A486 -0.0238590569384005 E451 -A459 -0.0252667873332868 G480 -A488 -0.0262912180409887 E472 -A488 -0.0318836919970458 Q448 -E457 -0.0319141590410474 E472 -Q483 -0.032066622605942 T468 -Q473 -0.032512052016699 Q448 -V492 -0.0328547864177 Q454 -V492 -0.0337010886511237 L477 -L485 -0.0338882608903979 G474 -L487 -0.034957604532021 V453 -V490 -0.0350826459559173 A459 -L477 -0.0367156907080055 R460 -R489 -0.0369894083398171 Q473 -Q481 -0.0372354485756663 P469 -A488 -0.0373549336995582 A459 -V492 -0.0385458434653314 E451 -L458 -0.0389215806622039 G465 -V492 -0.0389683123122877 Q454 -R489 -0.0394610504440887 T452 -L484 -0.0394838053878743 D464 -L484 -0.0409033916960439 G474 -Q483 -0.0416345934572733 V453 -S461 -0.0428089756653844 L455 -Q483 -0.0466943281323506 L477 -A488 -0.0478244164093304 Y467 -K482 -0.047993802006264 E457 -A488 -0.0486411633238699 E451 -G465 -0.0487547873494862 R460 -S478 -0.0489799313055159 E472 -A486 -0.0515304426282885 P469 -Q483 -0.0515473806675988 Q483 -L491 -0.0521782088776961 L458 -Q483 -0.0525572687396378 T468 -G480 -0.0538850492363088 Q473 -L484 -0.0538940815028841 Y467 -S478 -0.0540438609307121 A456 -G480 -0.0540681011621036 L458 -L485 -0.0543288385752483 A449 -G471 -0.0543889256757382 Q481 -V490 -0.0546643740328814 T452 -R489 -0.0560938507217248 Q448 -A488 -0.0567228938869966 G471 -L477 -0.0573555846826412 L458 -Q481 -0.058287866451868 Q473 -A488 -0.0584929745617488 I466 -A488 -0.058781149990482 Q481 -R489 -0.0591656093144191 A456 -R489 -0.0599839891930034 L477 -R489 -0.0605104266912208 Y467 -G480 -0.061136912298267 A459 -E472 -0.0619434755852524 Q454 -L487 -0.0644531385644983 L450 -Y467 -0.0658837409544528 E451 -V492 -0.0663699247514549 D464 -A488 -0.0666128096129148 Q454 -I466 -0.0671658268387936 Q448 -R489 -0.0672890602321441 Q454 -L484 -0.0683167747149102 L470 -L485 -0.0685004488496492 L458 -K482 -0.0696255256736817 T468 -G474 -0.0729454529057012 D464 -L470 -0.0732767615698009 E451 -L487 -0.0734142556522634 Y467 -L491 -0.0736917280875131 E451 -L485 -0.0760502998408459 G471 -L484 -0.076246931303384 T452 -E457 -0.0780250660393733 Y467 -G474 -0.0788645149163023 L450 -I466 -0.0789082303269613 E472 -K482 -0.0797972314558595 A449 -L458 -0.0812658552180938 E457 -D464 -0.0815717971014573 Y467 -A488 -0.0825231337593345 D464 -G480 -0.0840439898605112 Q473 -S478 -0.0874879285835735 A456 -Q473 -0.0884372150150421 L470 -S478 -0.0892892092171405 G465 -L491 -0.0893246799971088 Q454 -T468 -0.0908225708369352 T452 -A488 -0.0910047623264116 L455 -P469 -0.0910137235757036 S461 -L485 -0.0929060079315738 E457 -A486 -0.0933333334031536 L470 -Q481 -0.0933638661448439 L470 -K482 -0.0941327731036932 A456 -V492 -0.0942318829455258 Q481 -A488 -0.0942416396444008 S461 -L491 -0.0944478226791103 I466 -E472 -0.0945142950672775 T452 -L485 -0.0972029657745601 Q454 -L470 -0.0987975050380889 A459 -Q481 -0.0996956732092453 P469 -S478 -0.10018052667729 V453 -A459 -0.100218511091856 L455 -L470 -0.100382479152592 D464 -G471 -0.101309943373695 L470 -V492 -0.101754542025722 L455 -L485 -0.102854369871743 Q454 -G465 -0.103019633645649 P469 -L485 -0.103572537616031 S478 -Q483 -0.103963028405354 P469 -L477 -0.104381380142865 Q448 -Y467 -0.106401389941621 Q454 -M462 -0.10718835428467 V453 -L485 -0.108098566398008 G471 -R489 -0.110223450592407 Q454 -D464 -0.1108806333697 V453 -G465 -0.112166103258411 G465 -G480 -0.113129914147818 E451 -E457 -0.11583654554448 V453 -P469 -0.117009059252611 T468 -L484 -0.117735620932669 T452 -A459 -0.119645661342255 A459 -P469 -0.120515906622458 A449 -V492 -0.121409063479524 E457 -V490 -0.122094246030529 A459 -S478 -0.122423163064905 A456 -S461 -0.12288170549656 T452 -L487 -0.123137854198852 Q483 -R489 -0.123926649503189 E472 -V479 -0.125917911172427 R460 -Q481 -0.126129529563504 V453 -L491 -0.1297816308674 L455 -D464 -0.131098200858656 I466 -G471 -0.133491913159427 R460 -V479 -0.135091474857511 G465 -Q481 -0.136282358285927 G474 -Q481 -0.137823841162223 I466 -Q483 -0.143042771390789 Y467 -Q481 -0.143433218603738 R460 -T468 -0.146999556306268 Q473 -K482 -0.149358163218451 Y467 -L484 -0.150178165357898 S461 -I466 -0.150732030727992 P469 -L487 -0.151419861630776 R460 -L487 -0.152797809539511 V479 -A486 -0.15357412994332 R460 -L477 -0.154276149146143 A449 -I466 -0.154916288745963 E457 -T468 -0.156093420490479 A486 -V492 -0.15696832832975 P469 -G474 -0.157775909845391 E451 -A488 -0.159610602847836 G480 -R489 -0.161329554026446 A456 -L477 -0.163342752777312 M462 -Y467 -0.163838827793823 A449 -L491 -0.165629075356261 L450 -V492 -0.167541679572433 R460 -A488 -0.17119280485871 L450 -A456 -0.174455397764678 Y467 -E472 -0.174662630250712 R460 -G480 -0.174798145152978 A449 -A456 -0.175047919110186 G480 -L487 -0.175098256910088 A459 -A486 -0.175802326848591 A459 -L491 -0.175943342655733 D464 -L487 -0.176780747463647 L458 -L487 -0.177763834701469 M462 -Q481 -0.177897755131258 L450 -E457 -0.179660001998739 E457 -L484 -0.181134021971944 L450 -D464 -0.18220298558784 L458 -A488 -0.183336905439917 S478 -L487 -0.184289940464856 G474 -V479 -0.18431141891455 E451 -D464 -0.185202142682614 A459 -R489 -0.188454845686788 V453 -E472 -0.188525294771315 L470 -L477 -0.188648281558763 S463 -L485 -0.189689567504421 S463 -L470 -0.190341982957333 L458 -L491 -0.191478516410328 A456 -S463 -0.195150014616429 G474 -A486 -0.195726648616961 V479 -L484 -0.198182566646407 Q454 -A488 -0.199134056573284 I466 -G480 -0.199511086129395 S478 -L485 -0.201144846085783 V453 -T468 -0.201701844003172 A459 -T468 -0.210040909606356 E472 -L485 -0.21015446458184 L455 -K482 -0.212474104205855 Q448 -L455 -0.213023168551453 S461 -L484 -0.213600583570844 L455 -G465 -0.215494280559426 L484 -V492 -0.217710853455544 L484 -L491 -0.217808277523112 T468 -Q481 -0.220190873385946 I466 -A486 -0.222603464585544 R460 -V490 -0.22360741660988 A459 -Q483 -0.226431887562956 K482 -L491 -0.232321950883386 L455 -V490 -0.234262561975811 Q473 -L485 -0.239102724551344 S463 -T468 -0.240275759129359 Y467 -L485 -0.240497182253173 R460 -L485 -0.250335657362101 L485 -V492 -0.251229582817881 A456 -L491 -0.252656150742589 T452 -I466 -0.257669161330313 L458 -V492 -0.259633488609205 D464 -E472 -0.26099504913084 G465 -A488 -0.265926661089075 G480 -A486 -0.269911825445141 A456 -L487 -0.280854486762939 R460 -V492 -0.286833873712081 E457 -G465 -0.290089470228495 Q483 -V490 -0.292167346677806 A456 -L484 -0.2985323214916 V453 -D464 -0.299071351780983 A486 -L491 -0.302929624160738 I466 -L487 -0.305120354560986 Q448 -Q454 -0.306432249976314 A459 -K482 -0.307617081185924 T452 -L458 -0.308825075247508 T452 -L491 -0.30977942595488 D464 -P469 -0.310974016513145 G480 -L485 -0.311459903788954 S478 -L484 -0.315846856423924 A449 -L455 -0.318709365492912 I466 -R489 -0.319726224769386 V453 -L470 -0.321009874413964 V479 -L485 -0.325855743360716 V453 -V492 -0.33145921799537 T452 -T468 -0.337153679631989 G465 -L470 -0.340803231903512 P469 -L484 -0.343277017021318 L477 -K482 -0.35873770910109 L450 -L455 -0.367583533559971 V453 -A488 -0.369577644564136 G474 -L485 -0.371675015476931 V453 -I466 -0.374192318498654 V453 -L458 -0.398423371813932 I466 -L477 -0.409707149608462 L455 -L484 -0.414871681436857 L485 -L491 -0.420614106987419 A456 -P469 -0.432461586309524 L458 -L484 -0.448019441904004 L487 -V492 -0.45181258941925 L477 -L484 -0.465262874231834 Q481 -L487 -0.516005091757497 A459 -G465 -0.677352920767588