[Mon Aug 29 17:56:48 2016] >Input file: TMM4MTC0M1G.pdb >TM segments: 20-38_ 48-62 MAIDEN score = -8.1939 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- E38 -I50 1.30025578442885 I33 -E38 1.28314349744231 R37 -I50 0.864431653596434 I33 -L54 0.811564915481718 A26 -V62 0.64923190183028 L29 -I58 0.534430655154359 R37 -L54 0.529476540393854 I33 -L51 0.512974420044641 E38 -L51 0.488602489567743 R22 -V27 0.422101099583967 L28 -I33 0.404049194085457 E36 -T48 0.391247143922792 H49 -S56 0.368783848207994 A31 -A55 0.349106329583175 G25 -G34 0.314930225797645 E38 -V52 0.303534891095219 E38 -L54 0.284161552867617 A31 -E36 0.277347003313256 M32 -V61 0.274263130164551 G34 -F59 0.237642329542203 V35 -I50 0.231942920460322 G30 -A57 0.231215753209333 G34 -L54 0.229178045174589 I33 -A55 0.229175913359009 R22 -L28 0.219836822601829 S53 -A60 0.211471621194675 F20 -V27 0.207816958690844 G34 -A55 0.192879334784181 E36 -H49 0.186211993144357 M32 -S56 0.183069957827792 L29 -G34 0.180130145409819 V52 -A60 0.167760134985344 E36 -A55 0.165600876799171 G30 -I58 0.164812959456441 G34 -L51 0.163805881752269 E38 -T48 0.15436582334607 R37 -A57 0.150426569574238 H49 -A57 0.147322981772151 M32 -A55 0.145151409542099 I33 -I50 0.14324350505653 E36 -S53 0.139809671912126 V52 -V61 0.132993368116347 M32 -V52 0.130591276496512 G30 -S56 0.122573518004813 R37 -H49 0.118556506947909 E38 -S56 0.116385152715333 G30 -A60 0.115879965543856 A26 -V35 0.115548725172814 L28 -L54 0.112805995660005 L29 -L51 0.111125048203462 A31 -S56 0.11070786311902 G25 -I33 0.105397512104007 G25 -F59 0.102949169485419 A31 -V62 0.100430942810756 V35 -A57 0.0995412672457223 G25 -A55 0.0990839039840496 L29 -V52 0.0975014037475892 G34 -V62 0.0969183589703226 V27 -A57 0.0944074024106025 L29 -E36 0.0940276256875582 L23 -I33 0.0938017842234385 G34 -A57 0.0926110421190272 G30 -R37 0.0919900466644163 T48 -S56 0.090976892412838 G30 -V61 0.0893736548123591 A31 -L51 0.0859274861755379 S53 -V61 0.084224115548031 L28 -L51 0.0828676103906973 G34 -V61 0.0826111879799085 M32 -S53 0.0778703849059617 L29 -I50 0.0688606190161298 A31 -I58 0.0655252547958436 L23 -I58 0.0642806068563715 H49 -I58 0.0608813981943561 S56 -V61 0.0554941682635777 A26 -A57 0.0533757019207437 L29 -S56 0.0516783617303598 F24 -I58 0.0471534054602163 L28 -A55 0.043446030030561 M32 -I50 0.0423230771348689 V35 -H49 0.0404934781772299 L28 -A57 0.0388535682630584 L28 -F59 0.0364335284014086 A26 -L54 0.0360257210436126 G34 -S56 0.0359428243897018 F24 -V61 0.0348873925927862 I33 -V61 0.0341987968655086 A26 -A55 0.0334711591293018 V35 -I58 0.033109035665511 I33 -H49 0.0328613116358538 A26 -A60 0.0328038970318412 G30 -S53 0.0325467469396652 F20 -L28 0.0315452321528396 R37 -I58 0.0310046798812844 R37 -S53 0.0300160684101693 V35 -S53 0.0281577913808353 E36 -V52 0.0276667619275864 V27 -E36 0.0274480650946918 T48 -A57 0.026721337340442 M32 -F59 0.0253847161683129 L28 -V61 0.0216401282791949 G30 -V35 0.0192202452666925 L28 -G34 0.0176077891096069 E36 -L54 0.0165542748854799 S53 -I58 0.0126061342609738 E38 -I58 0.0115184706340612 M32 -T48 0.0108657569851687 V27 -V62 0.00969669039646903 V27 -A55 0.00869478381097011 G34 -T48 0.00707221913337652 I33 -S56 0.00572817549057092 G25 -E36 0.00525523515358817 V52 -A57 0.00404169669620758 R22 -I58 0.00312268536578575 V35 -V52 0.00179715056154572 A26 -V61 0.000864192704122857 G34 -H49 8.58443870674908e-05 G25 -L54 -0.00172971899185936 V27 -F59 -0.00206113970448785 E36 -L51 -0.00263117533830659 M32 -A57 -0.00435254025423859 V27 -I58 -0.00687378456374343 F24 -I33 -0.00693753409660225 F24 -V62 -0.00753795458183459 A21 -V61 -0.00759835881462934 G34 -I58 -0.00932462887436181 I33 -A60 -0.0117097907465573 V35 -T48 -0.0119991800070194 L23 -A31 -0.012181212327679 G34 -A60 -0.0128290744983319 I33 -V62 -0.0143730084166234 A31 -R37 -0.0148591137829025 I33 -I58 -0.0179632683863002 L29 -E38 -0.0202990939757309 V52 -F59 -0.0210053868000415 R37 -T48 -0.0210384593988788 A21 -V62 -0.0213197273590153 A31 -L54 -0.0229574276360474 L28 -V62 -0.0233374103311537 R22 -G30 -0.0239715875095444 E38 -H49 -0.0295877936518218 A21 -G30 -0.0318506389105764 V35 -F59 -0.0357135343942039 G25 -A57 -0.0357998655081486 A31 -V61 -0.0364986567748522 G34 -V52 -0.0367462101788192 A21 -L29 -0.0370086689431819 I33 -F59 -0.0388335530120782 M32 -I58 -0.0416264430559998 G25 -A60 -0.0419918463645503 A26 -E36 -0.048387051901198 F24 -G34 -0.0563122677662411 L29 -A55 -0.0571377733968941 A31 -V52 -0.0573598083865798 G30 -I50 -0.0574177433513459 A31 -A57 -0.0615906038469758 S53 -V62 -0.0619760198089723 V35 -S56 -0.0647220236145474 L29 -A60 -0.067573763376128 A26 -G34 -0.0676873055476763 R37 -S56 -0.069051883362546 E38 -A57 -0.0693539104703658 E38 -S53 -0.0702443677329487 G30 -V62 -0.0714671933420101 L29 -S53 -0.0736961473859807 R22 -F59 -0.078567935055587 F20 -A26 -0.07969549278838 A26 -S56 -0.0820013279082232 G30 -V52 -0.0840321607761494 H49 -A55 -0.0904328016918128 S53 -F59 -0.0926029577887131 I50 -A57 -0.0931952665356661 V27 -V61 -0.0934742862652369 L28 -R37 -0.093577241768541 L23 -M32 -0.0965916946270117 A31 -E38 -0.0979362712744196 L29 -L54 -0.0982091647120029 A31 -I50 -0.0994014486074963 V27 -L54 -0.101672595555272 G25 -V35 -0.104498327099226 F20 -L29 -0.110484808959699 G25 -V62 -0.113717568523359 L23 -F59 -0.118533958920954 G25 -V61 -0.122690384811803 F20 -V62 -0.123388239267504 R37 -V52 -0.123734587197383 E36 -I58 -0.132917781135681 I50 -F59 -0.134195983067823 L29 -V35 -0.135321224848942 L28 -E38 -0.135367940145048 V35 -A55 -0.136295069647005 T48 -A55 -0.14208024147639 L28 -I58 -0.142176813518541 G30 -F59 -0.142785475637447 L51 -F59 -0.146810532314424 F24 -G30 -0.147730814307343 G25 -M32 -0.148012354344272 I33 -T48 -0.148757193516296 E38 -A55 -0.149388932002426 G34 -S53 -0.152264563884072 L51 -S56 -0.154016414219148 R22 -V61 -0.154889559290135 L29 -F59 -0.156244875990286 L23 -G30 -0.156279885229171 F24 -A31 -0.161586590728275 L51 -A60 -0.163326527768625 E36 -I50 -0.164409853137121 V27 -I33 -0.165756915638433 R22 -V62 -0.167356178370781 A21 -L28 -0.168113301856168 L54 -V61 -0.169017593670674 R22 -A60 -0.169085216803692 R22 -A31 -0.170342030152073 R37 -A55 -0.170735064978207 L28 -E36 -0.173598812815968 G30 -L51 -0.174821066805942 A31 -F59 -0.175936337723116 A26 -F59 -0.176015937407768 G30 -E38 -0.179057696255266 V35 -L54 -0.182288523586919 V27 -G34 -0.195423078858135 V27 -R37 -0.202033703123018 M32 -E38 -0.205203614167868 L29 -A57 -0.214938691886075 I33 -S53 -0.219128127661639 G34 -I50 -0.22269901932312 F24 -M32 -0.224881725999684 I50 -I58 -0.22556467848657 L54 -V62 -0.226049856230378 L23 -V61 -0.23306162252417 L29 -R37 -0.238584525486761 T48 -S53 -0.246057028130481 S56 -V62 -0.247559573562896 G25 -I58 -0.251433132666381 M32 -R37 -0.258199216630008 F20 -G25 -0.258231366788112 I50 -S56 -0.258707486022292 I50 -A55 -0.27082324870975 G25 -A31 -0.272224095395355 L23 -V62 -0.272909724150527 G30 -E36 -0.273631683519087 A55 -V62 -0.278003819163827 V27 -M32 -0.278193377482174 M32 -L51 -0.279797232330645 T48 -L54 -0.284294398103913 R22 -L29 -0.285041844031921 A26 -M32 -0.291686361860541 M32 -L54 -0.294721457472093 V27 -V35 -0.295408474504223 L54 -A60 -0.29763600312533 L29 -V61 -0.303846663683094 G30 -A55 -0.305110397018096 I33 -A57 -0.305852928883274 V35 -L51 -0.310090727844797 A26 -I33 -0.314324207503495 R22 -M32 -0.317844840668792 L51 -A57 -0.319435515913878 A21 -A26 -0.322701468120131 G30 -L54 -0.324456220290706 L29 -V62 -0.355558238106696 A55 -V61 -0.356809041146938 A21 -V27 -0.363023389713494 F24 -L29 -0.368627657356369 L28 -V35 -0.36951883591809 L51 -I58 -0.376020843328975 L54 -F59 -0.383666600256541 L23 -L28 -0.400683655418537 A26 -A31 -0.401824570063458 G25 -G30 -0.402978064746773 H49 -L54 -0.416326873007954 A55 -A60 -0.417278270818934 I33 -V52 -0.42238171229772 A57 -V62 -0.445648329294601 L23 -L29 -0.465022047249412 V52 -I58 -0.469045537918577 A26 -I58 -0.475226352996969 R37 -L51 -0.569717985221217