[Fri Aug 26 17:09:25 2016] >Input file: TMP60509S1D.pdb >TM segments: E373-398_E401-410 MAIDEN score = -3.6547 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- C395E-C402E 1.34023864172232 H374E-N408E 1.20210352829458 C395E-E401E 1.17444789181212 E391E-L397E 0.960606514047113 E391E-A396E 0.900918494900916 I386E-G393E 0.561602252290715 T394E-E401E 0.441300448553601 D385E-C395E 0.367952372513326 H374E-I406E 0.346062751963997 E375E-P407E 0.327268601312111 R381E-T394E 0.321875095636006 H374E-Q379E 0.305957115515233 M373E-N409E 0.272076204714779 T388E-L397E 0.259572924139457 G392E-L397E 0.255281460078933 D376E-D385E 0.23837239468291 Q379E-T394E 0.22762675346315 A389E-T394E 0.220220017928915 L384E-G392E 0.219542074906292 N380E-G393E 0.218828139152539 M373E-R381E 0.217558300414035 R381E-A389E 0.206456424647791 M382E-V404E 0.200130636504069 L378E-I406E 0.19637707855018 D385E-G393E 0.196273670947754 L384E-T394E 0.187579405658541 L384E-G393E 0.187530635657233 I386E-C395E 0.184249218733355 G393E-I398E 0.183463031917272 L397E-C403E 0.183034749147934 M382E-G392E 0.176701147455556 C395E-C403E 0.16732087359118 L384E-C402E 0.154130718081048 L378E-C402E 0.150546457018384 G393E-C403E 0.150302755981 R381E-A396E 0.149073906183065 C395E-I406E 0.146557943844236 A390E-A396E 0.145628801378741 E375E-Y405E 0.143847916791036 I377E-T394E 0.14278477979617 A389E-I398E 0.140700100248796 L378E-P407E 0.135528861667607 H374E-Y405E 0.128770833927657 G392E-C402E 0.125753247121314 L387E-G393E 0.124729935451466 Q379E-L384E 0.124507978192755 E375E-A383E 0.11713857797929 M382E-C402E 0.108561040675163 A389E-C403E 0.108327011723578 D385E-V404E 0.103835849839577 E375E-R381E 0.103528594809464 L378E-V404E 0.102475725427887 L384E-A389E 0.100683505383008 D376E-L384E 0.0965077269367121 D385E-G392E 0.0950124547146318 Q379E-Y405E 0.0948192256449136 I377E-L387E 0.0926863716247173 D385E-I398E 0.0907099881527706 I377E-V404E 0.089824863070922 A389E-C395E 0.0875893559311082 G393E-C402E 0.0875606640355002 R381E-V404E 0.0872728300608516 L384E-A390E 0.0856499414554266 E375E-S410E 0.0852956831337166 A383E-C395E 0.0796940110393856 N380E-I406E 0.0789653456254612 M373E-Y405E 0.0764372949853349 G393E-V404E 0.0745369298322183 T394E-V404E 0.0696186006231716 E375E-M382E 0.06636441470974 L387E-I398E 0.0650041653277886 A383E-A396E 0.0649815059120482 A383E-I398E 0.0621615544901903 R381E-G393E 0.0599848149132187 D385E-C403E 0.0576213071692386 A390E-C395E 0.0549870072712872 T394E-Y405E 0.0509900329594077 R381E-I386E 0.0500447031570923 N380E-Y405E 0.0485362563546806 N380E-T388E 0.0483433909457709 R381E-G392E 0.0482357619721459 A383E-A390E 0.0476287636416324 L378E-T394E 0.0442938749945503 M373E-P407E 0.0414239147775087 L384E-A396E 0.0401324644032135 L387E-A396E 0.0398559100049569 M382E-T394E 0.0397251839701269 Q379E-L387E 0.0371837867741629 H374E-M382E 0.037119708620839 L384E-C403E 0.0359187824685385 I377E-P407E 0.0359041248485672 R381E-E391E 0.0356586405653907 E401E-I406E 0.0320988039691756 D376E-S410E 0.0268744435003214 Q379E-I406E 0.0223312214934568 I398E-V404E 0.0163438474139554 T388E-C402E 0.0139264575616421 E375E-N408E 0.0136132272756795 I377E-N408E 0.0133624454638888 L384E-V404E 0.0120840846068533 M382E-A390E 0.0112525526814586 Q379E-G393E 0.0097716011911162 Q379E-A389E 0.00694856153573647 A396E-V404E 0.00592535384896298 H374E-V404E 0.00542575894180608 I377E-C402E 0.00512489921425541 R381E-I398E 0.00129718835791648 D376E-A383E 0.00114664230490735 D376E-I406E -0.000253695732976844 N380E-A389E -0.00250528348610585 M382E-G393E -0.00441843602890435 Q379E-V404E -0.00563113377205759 L378E-S410E -0.0079680996021787 T388E-C403E -0.00904823702415269 D376E-P407E -0.00931972869705011 I386E-A396E -0.0125497236744576 Q379E-T388E -0.0143177672290671 T394E-I406E -0.0147106216496344 A383E-G392E -0.0160517547348427 E375E-N380E -0.0174401961295931 A390E-L397E -0.0183858965429566 H374E-P407E -0.0195042465184772 L387E-L397E -0.0212949426495852 G392E-C403E -0.0234628916874868 T388E-T394E -0.0234725927433068 I377E-I406E -0.0250495965266104 Y405E-S410E -0.0263301793464246 I377E-A383E -0.026853300908332 I377E-S410E -0.0277738185942722 M382E-C395E -0.0303040561295733 L378E-L387E -0.0347004724644631 H374E-N409E -0.0355251784427819 A390E-I398E -0.0361558592836797 R381E-E401E -0.037752317024077 H374E-A383E -0.0389240125521013 R381E-Y405E -0.0442268227342213 G393E-E401E -0.0448983747725875 M382E-I406E -0.0456684602470995 M373E-S410E -0.0507797448018026 D385E-E391E -0.052951720703589 A383E-E391E -0.0556217491879205 M382E-A396E -0.0561827033832427 L378E-G393E -0.0576355361253089 L378E-C395E -0.0576577373274532 M382E-E391E -0.0597873462794816 L378E-N409E -0.0627864184929688 E375E-N409E -0.0666450100830114 I386E-E391E -0.0670442562516569 D376E-N408E -0.0683276272139164 D376E-R381E -0.0720657674542642 R381E-P407E -0.0736857103102948 M382E-I398E -0.0743041025890072 L384E-I398E -0.0746589548486865 Q379E-D385E -0.0749851587391843 M382E-C403E -0.0763207338060456 A383E-G393E -0.0779814659563409 N380E-D385E -0.0794637751956632 N380E-C402E -0.0801624307729982 I377E-N409E -0.0835751077719076 N380E-V404E -0.0887521328631649 M382E-L397E -0.089500818373659 H374E-N380E -0.100952383223408 D385E-C402E -0.103459283670605 L378E-I386E -0.105001800014383 L384E-E391E -0.105142324019248 T388E-A396E -0.109675751733907 Q379E-P407E -0.111944002993664 D385E-A390E -0.116045321998955 L378E-N408E -0.118625798947695 M373E-N380E -0.119117637157227 R381E-C395E -0.120150909682343 R381E-L397E -0.120380854688368 M373E-I406E -0.120573969574893 L378E-C403E -0.120865245908069 L387E-T394E -0.122154806391453 D376E-Y405E -0.128942591774149 D376E-M382E -0.129105019567189 N380E-I386E -0.129325319657243 A383E-L397E -0.140111732740737 L387E-C395E -0.140674631118161 N380E-I398E -0.140899260195555 L378E-Y405E -0.142672441118636 R381E-T388E -0.144093004707663 H374E-S410E -0.14901771072606 I386E-G392E -0.149111488135659 Q379E-C403E -0.151870426198549 R381E-L387E -0.152260499849186 I386E-I398E -0.157019472208125 E391E-I398E -0.157268154050775 A396E-C403E -0.158447337981496 M373E-N408E -0.159216662987294 E375E-L384E -0.159846130122177 I377E-Y405E -0.15984973642206 M382E-Y405E -0.160032932223774 I386E-L397E -0.162705699491104 I377E-I386E -0.165344973332699 I377E-D385E -0.167953046359713 E375E-I406E -0.1687012807165 Q379E-N408E -0.170798486479927 N380E-C395E -0.17197181711417 I386E-T394E -0.182819312114001 A389E-L397E -0.184143584782604 A383E-T394E -0.185072415456539 L387E-G392E -0.187211996173625 L384E-L397E -0.187425392533476 I398E-C403E -0.192994799765679 N380E-T394E -0.195838278361256 M373E-M382E -0.205932628610145 D385E-Y405E -0.210601342932025 C402E-P407E -0.222428608138691 A383E-T388E -0.223298776322272 L378E-D385E -0.224203995507323 M373E-Q379E -0.224887189559056 D385E-L397E -0.228161226409868 T388E-I398E -0.230211334605548 D385E-A396E -0.233313805770618 N380E-L387E -0.239288980917505 A389E-A396E -0.239914122703488 I377E-C403E -0.243388932927425 A383E-A389E -0.243880842348089 T394E-C403E -0.256496666224715 H374E-R381E -0.258299649786544 M382E-A389E -0.258762852164311 E401E-P407E -0.264228122080361 T394E-C402E -0.273382863402065 A396E-E401E -0.275602170379395 Q379E-I386E -0.275710812388521 G392E-I398E -0.289758067818987 N380E-C403E -0.29384454151286 T388E-G393E -0.293937763367944 L378E-A383E -0.296277154388889 M382E-T388E -0.296474840638784 I377E-M382E -0.300383343473204 C395E-Y405E -0.313847945658739 I377E-L384E -0.339538444958571 A396E-C402E -0.341936187751795 R381E-I406E -0.357279978221875 L378E-L384E -0.368131282250351 M373E-L378E -0.400163039273759 C395E-V404E -0.400473197085624 M382E-L387E -0.401543014599913 T388E-C395E -0.424247974573866 D385E-T394E -0.44289093097786 R381E-C402E -0.507100880181091 L384E-C395E -0.526839608998088 L397E-C402E -0.527375261116179 R381E-C403E -0.536170831560728