[Fri Aug 26 17:19:50 2016] >Input file: TMP86176M14D.pdb >TM segments: 68-74_ 76-101 MAIDEN score = 7.7711 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- P90 -L96 1.3528565236806 I71 -W78 0.911291181315345 L69 -F84 0.892184858213196 I71 -V80 0.883843900177997 L69 -V83 0.869910776889366 A70 -W78 0.864122898000465 V89 -T97 0.769031945189631 V89 -F98 0.76596043319271 V88 -F98 0.727993098966639 V89 -L96 0.718872714365097 V88 -L96 0.667437204681938 L68 -V83 0.648555746607945 R87 -S100 0.643088425652861 L69 -V80 0.612685046873268 R87 -L101 0.597877949853097 D86 -F98 0.511691382495314 L69 -A81 0.480813230601377 Y72 -L94 0.453323720649234 L69 -S82 0.420530332744213 L68 -V80 0.415473336414797 S73 -P90 0.330387255499966 S85 -P90 0.330325883394616 A70 -G95 0.313538679871583 A70 -P90 0.311392828775777 I71 -A81 0.309568591050546 I71 -H79 0.306173562760546 L68 -A81 0.298148245366665 V74 -P92 0.296457658465566 L68 -S82 0.287003415293217 A70 -S85 0.2778147815857 H79 -G91 0.274767774321566 H79 -P90 0.246579958378219 G91 -F98 0.241040629495212 I71 -G91 0.216834740031576 F84 -Q99 0.214846507671736 S73 -V80 0.201467874258984 V80 -D86 0.201167222191621 P90 -Q99 0.190959885790478 G91 -L96 0.188256029880741 G77 -L94 0.17926058867052 A81 -D86 0.17842694976372 S82 -P90 0.166015421932412 H79 -V89 0.163716956611273 G91 -T97 0.15613116154308 S73 -G91 0.154897526664262 G77 -G91 0.149703141769117 A81 -V89 0.149199829277707 A70 -R87 0.148823720520795 V88 -T97 0.143072152955959 V83 -V89 0.13611155318528 S82 -V88 0.133644692864391 L68 -L94 0.131757926543068 P90 -G95 0.131438931244091 L69 -V88 0.125303170414067 A70 -D86 0.124623797817723 V74 -H79 0.12405861129079 V83 -P90 0.120359243494419 L68 -L96 0.119134944652238 V89 -Q99 0.118500568222135 L96 -L101 0.118215856066127 F84 -F98 0.117643439857402 L68 -S85 0.115756408479537 L69 -L94 0.107452373596052 V80 -T97 0.106919263735924 S85 -T97 0.105233459417238 V89 -S100 0.104100184098011 V74 -G95 0.100850823718317 V89 -L101 0.0982233157418047 A70 -P92 0.0979087861077819 A70 -G77 0.0976169607343538 V80 -L94 0.0976142953202095 D86 -L96 0.097426394504242 L68 -V88 0.0931811908465954 S73 -P92 0.0836028234693584 V80 -S85 0.0832557772130595 V80 -L96 0.0813755450058224 G91 -Q99 0.0790488585771471 A70 -S93 0.0751940662640391 R87 -T97 0.073394238667861 A81 -L94 0.0732668548661781 Y72 -T97 0.0714527435680241 W78 -L94 0.0697603116066903 R87 -F98 0.0689047603631614 W78 -S93 0.068893691574622 L69 -W78 0.062215170320453 V74 -G91 0.0534076138530217 V80 -G95 0.0508743282584391 I71 -V89 0.050534143335927 V88 -S100 0.0489803073525277 L76 -L94 0.0476065520762443 W78 -P92 0.04591802826474 S73 -S93 0.0447173421694713 V83 -F98 0.0402024803214417 V80 -P92 0.0393973432914709 H79 -P92 0.0384966530594157 V80 -R87 0.0378409884686368 A70 -L76 0.0332896481215544 S85 -L96 0.0314534231018389 P92 -F98 0.0267013533274092 V83 -T97 0.0257461079670787 S73 -G95 0.0243225157201641 S73 -A81 0.0195860492359223 W78 -G91 0.0177175505467266 V74 -P90 0.0164822187856768 H79 -L94 0.0140403298918255 V80 -G91 0.0139372422968704 F84 -T97 0.00973172986083282 L69 -G77 0.00702053827909754 G77 -S93 0.00389847504959828 W78 -L96 0.000536767024607698 L68 -G95 0.000115910956896226 L76 -G91 -0.000560677500002882 L69 -G91 -0.00074493776694684 S73 -L96 -0.000806715402513081 L76 -S93 -0.000811775896428817 I71 -S82 -0.00433804366798896 A70 -F98 -0.00512617139388638 I71 -G95 -0.00550923311281848 I71 -V88 -0.010256355288254 L69 -R87 -0.0102842180298595 V83 -L96 -0.0107561099818971 G77 -P92 -0.0110001288066437 L69 -G95 -0.0134660170049037 S85 -F98 -0.0136731871245086 W78 -P90 -0.0162110229638714 V88 -Q99 -0.0172404586417065 D86 -T97 -0.0179568268017762 F84 -L101 -0.0202535063112768 L68 -P90 -0.0222163247650737 S93 -F98 -0.0234586575412324 A81 -V88 -0.0263637214874166 F84 -G91 -0.0269000341410814 S73 -W78 -0.028185351442259 A70 -F84 -0.0286718197862079 F84 -P90 -0.0288815753362704 D86 -S100 -0.0302263355656759 S82 -V89 -0.0311340502856883 D86 -G91 -0.0314345890931931 A70 -T97 -0.035830000349951 V74 -V80 -0.0367485103054346 S85 -Q99 -0.0372610311735013 D86 -L101 -0.0380558203868021 G77 -P90 -0.0406237699852643 Y72 -A81 -0.0425238218342558 A81 -P90 -0.0432837753113136 I71 -V83 -0.043651863184536 W78 -F84 -0.0441369520370536 Y72 -V89 -0.0441979426110093 I71 -T97 -0.0456798257163 A70 -V80 -0.0466151402942785 Y72 -L96 -0.0474017266521027 F84 -S100 -0.0496695337146233 V80 -V88 -0.0564885334582677 S82 -R87 -0.0591153187514349 Y72 -P92 -0.0607950190081833 H79 -L96 -0.0631170075265919 L68 -R87 -0.0663242681335539 Y72 -S82 -0.0669214413979039 Y72 -V88 -0.0686478380089808 H79 -S85 -0.0689794008410911 A81 -R87 -0.0700266564331926 S85 -S100 -0.0737505971123458 Y72 -S93 -0.0812398796695861 Y72 -G77 -0.0838797974720329 L68 -D86 -0.0858702176424223 P90 -T97 -0.0873068929383183 L76 -P92 -0.0878081026543196 I71 -S93 -0.0884551585275932 Y72 -P90 -0.0916580069216113 I71 -L96 -0.0924339701213514 Y72 -G95 -0.0937984784003376 A70 -G91 -0.0939772073160636 L69 -Q99 -0.0961251584194709 H79 -D86 -0.0986972907930292 A81 -L96 -0.103243508320003 I71 -F84 -0.104634195423407 L68 -V89 -0.10487112505809 V88 -S93 -0.105285305421948 H79 -F84 -0.111192670176822 V88 -G95 -0.11185574702612 F84 -L96 -0.112994032596617 R87 -G95 -0.115995713101847 V80 -P90 -0.119102126915522 L69 -T97 -0.12816815166695 L69 -F98 -0.128274937919169 W78 -V89 -0.131554441810699 A70 -A81 -0.132554729195084 L68 -S73 -0.133782654591679 I71 -P92 -0.143597068663871 H79 -V88 -0.147033161032128 Y72 -G91 -0.147139850534713 L69 -P92 -0.151170913896981 L68 -F84 -0.151466918438947 I71 -L94 -0.15228149416961 Y72 -H79 -0.158652236748773 L68 -H79 -0.159955107709398 D86 -Q99 -0.16006315194375 P92 -T97 -0.163758705577986 P90 -F98 -0.163887634859491 L69 -V89 -0.164407555257647 Y72 -F84 -0.181071816409239 S73 -L94 -0.182450036691687 V80 -V89 -0.188755830014237 A70 -H79 -0.193331944089889 A70 -S82 -0.200977455316023 W78 -V88 -0.208180960223049 L69 -P90 -0.216953615573081 S85 -L101 -0.217739780501963 W78 -G95 -0.217935191552256 Y72 -V80 -0.226853134179138 V88 -L94 -0.229058890444069 V89 -G95 -0.237470174319219 I71 -G77 -0.238075456230056 R87 -L96 -0.243729125352053 I71 -P90 -0.250064342253018 L68 -W78 -0.267617111333677 A70 -L96 -0.279390162811113 V89 -L94 -0.282939423845843 L69 -D86 -0.284636443106828 A70 -V88 -0.312754568058286 V83 -V88 -0.312856725702749 A70 -L94 -0.317165350608523 L69 -H79 -0.324826947269989 L69 -L96 -0.351119200744414 S73 -H79 -0.35114303982639 F84 -V89 -0.352284679106467 L69 -S85 -0.353588904694199 V74 -S93 -0.353988914652501 A70 -V89 -0.367618054071857 V74 -L94 -0.372088849161912 V88 -L101 -0.392046164862236 I71 -L76 -0.393361525489762 A70 -V83 -0.458643686370868 Y72 -W78 -0.759662154882901 R87 -Q99 -1.02351927210173