[Fri Aug 26 17:42:17 2016] >Input file: TMQ0K2E5S1D.pdb >TM segments: 295-335_ 467-507 MAIDEN score = -24.0934 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V300 -D479 0.861632288133654 T303 -V475 0.694233138650465 T311 -I468 0.67799784165352 L478 -Q483 0.615402633998681 V300 -A305 0.505541277266592 M310 -I468 0.484123477845085 S304 -V475 0.472279511703613 A474 -D479 0.377236040072521 A297 -A486 0.376099373737319 T303 -T482 0.321085771185661 V300 -M310 0.304282732945412 Q309 -V314 0.29765433675929 S304 -A474 0.294169657520245 A308 -S469 0.289740420416977 M307 -D477 0.27614756891971 S306 -G472 0.275895792091881 M310 -Q470 0.267095643203134 Q295 -T482 0.246401287078728 G472 -D479 0.244199229539434 M307 -G472 0.24237092647742 L488 -A493 0.232017788345225 A318 -K326 0.230182928486466 Q483 -E490 0.228392994982633 N485 -S492 0.22587666161973 Q309 -G472 0.22336174040684 Q301 -Q483 0.218085202185564 N485 -Q491 0.21740209298105 A322 -S330 0.213633007918791 S304 -V471 0.210257880860305 A324 -S332 0.210205845510245 Q295 -E302 0.20963402632958 A296 -D479 0.206205703670592 D479 -A486 0.205757784975265 Q484 -V489 0.205688085836618 G467 -A474 0.2056468818757 V314 -E319 0.204231375525023 S492 -K500 0.200857482837589 T313 -A318 0.198780975865022 G472 -N480 0.197890575410518 M307 -S316 0.187027105629676 S298 -N480 0.184747086166139 S316 -A324 0.178342413396896 S316 -N325 0.176954114799122 D479 -N485 0.174070771440129 S498 -L506 0.173877836329104 T311 -T320 0.172541395225071 N317 -Q323 0.166105201255429 M307 -L478 0.164987205451572 S298 -M307 0.161764635874437 A305 -T313 0.16021370517343 V314 -A322 0.158331872207771 V314 -S469 0.150471247603916 Q295 -Q483 0.147787565813053 A494 -Q502 0.145995402757226 M307 -G473 0.14525044509953 S304 -G473 0.142297600626548 A322 -G329 0.141541419283114 Q484 -S492 0.138203692901867 T303 -D477 0.137177079162244 A297 -I481 0.13558653414276 A296 -N480 0.133073212604778 M310 -V475 0.127741067041272 S306 -I468 0.125490518042533 E319 -A324 0.124736482922984 E302 -S476 0.124310762723451 S298 -D479 0.122291472014529 S304 -Q470 0.121986068066029 A322 -S332 0.119063752116114 S298 -A486 0.118505044129235 T303 -G473 0.117854575792425 A305 -S469 0.115215156518861 Q295 -T303 0.115117330210206 S306 -V471 0.1128221295387 A297 -S306 0.112372602312377 S476 -Q484 0.112306661086624 Q323 -S328 0.110909045653822 S312 -T320 0.110133740105638 A297 -N480 0.109988856114295 S304 -L478 0.108737199060411 Q483 -L488 0.10867175519147 Q491 -L499 0.107583615500921 E319 -S328 0.104070503141005 E302 -D479 0.10405410397874 A305 -S476 0.103917886651712 A321 -G329 0.103586789439349 T303 -N480 0.102615941588088 E490 -A495 0.0962793814738125 A308 -S476 0.093712810446219 T303 -I468 0.0896984062181978 S328 -V333 0.0893418494272025 T320 -S328 0.0890179075172819 A305 -V314 0.0882112790333425 A297 -L478 0.0874273566928712 A318 -N325 0.0866403750896745 Q483 -S492 0.0850504491029627 A297 -N485 0.0845818144049479 T303 -S469 0.0839899393485012 A318 -G467 0.0838771410168073 T313 -S469 0.083522864674465 T303 -S312 0.0817367422459384 L478 -A486 0.0805523544690856 S304 -T482 0.0802778557980879 I468 -L478 0.0800917489795094 V314 -G472 0.0774375806608252 A296 -I481 0.0770567019035511 V300 -G473 0.07705229888687 S492 -Q501 0.0760502317808553 E497 -R505 0.0754884327173957 T311 -Q470 0.0752627802340058 M307 -I468 0.0748787339783306 G473 -D479 0.0742202315285656 E302 -Q309 0.0735373045266288 Q323 -A331 0.0734716083839708 S312 -G467 0.0732217633485497 G467 -V475 0.0732058388660106 Q501 -L506 0.0725887398503406 S498 -R505 0.0717740209183326 A487 -A495 0.0713462632540898 S492 -S498 0.0692913306875265 S306 -V314 0.0687617335441315 M307 -A474 0.0685410669961648 A296 -A487 0.0679565546164209 S476 -I481 0.0675055502298036 Q301 -T482 0.0671324209132411 A493 -Q501 0.0670845709272747 L327 -A335 0.0652077839429399 E302 -G472 0.0635531961706586 S299 -N485 0.062234418118579 A296 -N485 0.0621315778728104 N317 -N325 0.0604043467794324 A296 -A305 0.060244838612415 S312 -A321 0.0601800262920928 A305 -G472 0.0593847598879513 A324 -A334 0.0585916405077147 Q295 -S304 0.057876822117962 S306 -S476 0.0571287528257165 A305 -L478 0.0559721426534683 M307 -Q470 0.054970725316108 S476 -N485 0.0547930888041268 N485 -A493 0.0536297222322477 A494 -Q501 0.0502029398375166 A305 -V475 0.0498536231564404 Q309 -V471 0.0491458956051196 S306 -S469 0.0478501163178531 A308 -S316 0.047779946332839 G473 -N480 0.0465120956441969 S469 -D477 0.0431435388722201 S304 -D477 0.043140776420477 Q301 -V475 0.0399532122532484 T303 -Q483 0.0389732184142672 A297 -A305 0.0385287366842171 A305 -S312 0.0371193866996631 A486 -A494 0.0368326745201593 S304 -N480 0.036754733916049 Q315 -A322 0.0360527396761716 Q301 -G472 0.0358787163552376 V475 -Q483 0.0353022291911032 A296 -L478 0.0329974800157888 V300 -N480 0.0318282301543737 I481 -Q491 0.0291796596020841 S312 -I468 0.028954141955575 V489 -E497 0.0275231271723097 S299 -I481 0.025161767525177 D477 -N485 0.0243954662238257 S312 -E319 0.0240866929290062 G473 -Q483 0.023903901810689 S304 -Q483 0.0233373930266461 A296 -V475 0.0224832676635884 G329 -A334 0.0219360092949668 Q491 -A496 0.0217674741835019 S306 -D479 0.02148448928988 T482 -Q491 0.0213898878460104 S299 -D477 0.0208208780772661 V314 -V471 0.0183021974307489 M310 -A318 0.0178684280915817 A296 -T303 0.0177537576721285 E302 -M307 0.0175258751406018 T311 -G467 0.0162957510928128 T311 -A474 0.0159601534837202 A322 -A331 0.0159369746356846 S299 -N480 0.0158717957154269 A495 -A503 0.0142430162648672 A308 -G467 0.0123862614585777 T482 -V489 0.0111364710588049 A486 -Q491 0.0108923500874907 A305 -D479 0.010117537673187 S306 -T313 0.0099271771529299 V300 -A308 0.00981756978172732 A308 -V475 0.00979429047308256 S299 -M307 0.00955900768746298 A493 -Q502 0.0094612567482395 Q295 -A305 0.00780620812702382 Q301 -A474 0.00694856153573647 A297 -V475 0.00660972687354722 G467 -S476 0.00643612960833551 T303 -I481 0.00497687803951319 A296 -Q484 0.00457393948143103 S306 -S312 0.00284414660135024 E302 -A308 0.0019870967260287 A322 -L327 0.00104610283855955 S306 -A474 0.000930961777102723 Q470 -L478 0.000347328793131041 V314 -Q470 -0.000655936522300227 A324 -S330 -0.000755121513249413 S306 -L478 -0.00123437370027113 Q323 -S332 -0.00197858088890479 A296 -S304 -0.00293881453327316 S304 -S469 -0.00304859271642366 V475 -Q484 -0.00373771681171942 N485 -A494 -0.00466935741562384 T311 -V475 -0.00522111200287756 A305 -V471 -0.00558568632569134 G473 -I481 -0.00619611818388988 Q315 -S469 -0.00720799910844772 A296 -V489 -0.00752057895901659 V300 -Q484 -0.00794716766847969 G473 -L478 -0.00957547483502097 T311 -S476 -0.012865743077151 T311 -A318 -0.013758701467566 A305 -A474 -0.0138012969676495 A495 -T504 -0.013913024838764 I468 -S476 -0.0146555216002634 Q315 -I468 -0.0152101083936429 Q309 -S469 -0.0154982826768826 A474 -T482 -0.0156406653222607 A305 -I468 -0.0158975172661213 Q301 -S476 -0.0159728059321353 M307 -G467 -0.0160527078975963 S312 -G472 -0.016648380606841 S298 -S304 -0.0166844892017264 Q484 -A494 -0.0172004232080694 Q301 -A308 -0.0187128862983243 K326 -A334 -0.0204461870214048 S298 -Q483 -0.0211666415044467 Q323 -V333 -0.0212218041251446 Q484 -A493 -0.0218227778824538 S312 -V471 -0.0218382508239608 N480 -V489 -0.0223172013277333 A487 -A496 -0.0226017079797378 V300 -A474 -0.0231637489564128 N325 -A334 -0.0235938327312641 S306 -G473 -0.0246971896857577 A308 -V471 -0.0253208588288629 E302 -M310 -0.0258488666113119 Q309 -G467 -0.0271752398824906 I468 -G473 -0.0282167618266893 S304 -D479 -0.0291883672950479 T303 -A308 -0.0292940047859016 Q309 -A318 -0.0301134288850187 Q309 -V475 -0.0308130035122094 V300 -Q309 -0.0309937476246462 A296 -E490 -0.0313442731960721 N325 -A335 -0.0316935829170424 S298 -T482 -0.0319245681731399 Q470 -V475 -0.032170692178268 V471 -S476 -0.0332555575800304 T320 -S330 -0.033380747643877 T303 -Q309 -0.0333963702891837 T303 -Q470 -0.033660356046598 V489 -A494 -0.0339231670776208 A297 -A487 -0.036794908292145 S304 -T313 -0.0368176834943206 V300 -V471 -0.0370405048140858 Q323 -S330 -0.0382157449088192 Q470 -S476 -0.0389486771023151 A496 -R505 -0.0402421025114581 A495 -Q502 -0.0404221645922034 E302 -L478 -0.0411635442094891 Q502 -V507 -0.0413408472271474 T313 -A322 -0.0426672668828977 V300 -A486 -0.0433214180397385 L499 -R505 -0.0434175266404644 M307 -Q315 -0.0441674142301114 A324 -V333 -0.0445296454612745 V314 -A321 -0.0457438328599249 N480 -A487 -0.0458664943615624 L478 -A487 -0.045954431511003 A297 -Q484 -0.0462845504028699 Q301 -S306 -0.046630195972353 G472 -D477 -0.0466840599760445 S299 -G472 -0.0471003861037054 V300 -D477 -0.0474965759347477 T313 -G467 -0.0484319413754309 L499 -T504 -0.0491992346063004 T320 -G329 -0.051985547342524 A308 -Q315 -0.052125789537123 L488 -A494 -0.0521295096193999 I468 -D477 -0.0523990388155848 Q309 -S316 -0.0524129243083207 E302 -A474 -0.0538323835394912 A308 -G473 -0.0542563453006517 D477 -Q484 -0.054360179444301 I481 -V489 -0.054685779897353 A496 -Q501 -0.0551501683477152 E490 -S498 -0.0552013235232054 G473 -T482 -0.0552659295462002 Q315 -A324 -0.0558521859404619 S304 -I468 -0.0559874689063493 Q295 -A486 -0.0560299241811038 Q491 -E497 -0.0565684403550115 A474 -Q483 -0.0570286474293591 L488 -A496 -0.0571274420374142 D479 -A487 -0.0600523758451539 Q309 -N317 -0.0608256230581776 E319 -K326 -0.0612013830144553 S316 -I468 -0.0612442084136902 S304 -S476 -0.0622948574979896 S299 -A308 -0.0632535187534984 N317 -L327 -0.0633377374672073 Q470 -D477 -0.063500540618424 M310 -A474 -0.0641278181982126 M310 -G467 -0.0643361703096659 A494 -K500 -0.0647640577615496 E319 -N325 -0.0654871891221953 Q301 -D479 -0.0656662868683742 S498 -V507 -0.0657039303567268 E302 -T482 -0.0661004902254305 N480 -L488 -0.0667735612110028 S299 -A486 -0.0678339175887182 S312 -S469 -0.0685493551534679 Q301 -L478 -0.0686132539467538 T311 -G473 -0.0701036398598602 S299 -S476 -0.070209348368091 N325 -A331 -0.0702753270974203 A318 -Q323 -0.072011213923844 A297 -S304 -0.0725592217225515 A308 -N317 -0.0735853510027853 Q483 -Q491 -0.0736521024168491 Q315 -Q323 -0.0756305429833797 A494 -A503 -0.0759339346933784 Q491 -S498 -0.0760491620223046 S476 -Q483 -0.076078770573267 N317 -A324 -0.0765244292110312 A308 -A474 -0.0768127004670793 A486 -A495 -0.0769318587257719 A496 -T504 -0.0788201846818466 S298 -S306 -0.0790264753432701 A308 -G472 -0.079047944214274 A296 -E302 -0.0809041749267407 S304 -S312 -0.0814053975929057 A305 -M310 -0.0820908465873993 N325 -V333 -0.08277530946804 T482 -A487 -0.0828878142673225 K326 -A335 -0.0840387078305183 E319 -L327 -0.084121345340975 E497 -T504 -0.0849232671346307 Q470 -D479 -0.0860422166487095 T320 -N325 -0.0867509880655412 T482 -E490 -0.0867583655568094 V489 -S498 -0.0892288366722123 Q295 -D479 -0.0907792654567661 S298 -V475 -0.0913232117493075 Q315 -G467 -0.0936614471829849 M307 -S476 -0.094379964608051 S299 -A474 -0.0975752052092105 A308 -Q470 -0.0979435033383975 K326 -A331 -0.0984570860441629 V471 -N480 -0.098547176162878 T311 -V471 -0.0992029845091338 A495 -K500 -0.0996067626713648 A321 -K326 -0.100318099902068 N325 -S332 -0.100627702657967 V300 -L478 -0.10101637210586 S316 -Q323 -0.101261089814552 A321 -S330 -0.102676841069674 A297 -E302 -0.102976755792563 Q301 -Q309 -0.103204322815255 A296 -T482 -0.104533654586447 A296 -Q301 -0.105015077639782 T303 -A474 -0.105219212335719 A305 -T311 -0.106033799905541 S492 -E497 -0.106810796335687 E302 -V475 -0.107194691772328 V300 -N485 -0.107537206712356 S299 -D479 -0.108112869864611 E490 -A496 -0.108127723930565 Q484 -E490 -0.108389029077155 G472 -I481 -0.111462334824625 M307 -S312 -0.113484548562945 G329 -A335 -0.113565555581172 N317 -K326 -0.118712083159002 V471 -D479 -0.120401632503195 V314 -G467 -0.120463872168415 D477 -T482 -0.120783167816822 M307 -D479 -0.121798495954175 N480 -A486 -0.122159237030085 S304 -G472 -0.124166407156022 N317 -I468 -0.124250124390143 V314 -I468 -0.126926728746648 A297 -S476 -0.12727690433511 A318 -I468 -0.129305820656243 L478 -N485 -0.129306976955811 N480 -N485 -0.129426666485316 T313 -A321 -0.130921586923899 D477 -Q483 -0.131905056624368 A322 -S328 -0.133030738133882 K500 -R505 -0.134067682445486 T303 -D479 -0.134496125303122 S299 -S306 -0.136377217486974 V300 -G472 -0.136876468265682 T313 -I468 -0.136890989907535 S469 -S476 -0.137066815859853 S492 -L499 -0.137789070933539 S299 -Q483 -0.137857499870485 E497 -A503 -0.137899399266498 I481 -A487 -0.13929860515702 Q301 -M310 -0.139327445086447 A297 -T303 -0.139601089192877 A474 -N480 -0.141186441134687 Q315 -A321 -0.143861581183085 T313 -E319 -0.144374657017774 Q315 -T320 -0.145796378049025 D479 -Q484 -0.148189257127594 A321 -L327 -0.14872984294268 Q301 -N480 -0.149608894869 S299 -L478 -0.149952369040239 E302 -V471 -0.151287790856608 S304 -Q309 -0.152322728859592 V475 -N480 -0.154165407676034 A496 -A503 -0.156572416259737 L488 -E497 -0.157836664830732 K326 -S332 -0.15801802594963 E497 -L506 -0.159712298228754 A318 -L327 -0.160502264201838 I481 -E490 -0.160880263293155 V489 -A496 -0.160881112314292 M310 -G472 -0.163088571207839 I468 -V475 -0.164618492523707 D479 -L488 -0.164640723757817 E490 -L499 -0.166185240077412 D477 -A486 -0.166361487724919 T311 -N317 -0.167183610689064 T311 -E319 -0.170335883107191 V475 -T482 -0.172068011100858 A487 -A494 -0.172794901905693 A496 -Q502 -0.172855189984769 G467 -G473 -0.172890204065457 V300 -T482 -0.178198596757212 S469 -L478 -0.178299550723034 A486 -A493 -0.178891780382761 N325 -S330 -0.1838879781849 A297 -D479 -0.185687976763578 M310 -S469 -0.188014452771744 L499 -L506 -0.188635304634793 S298 -L478 -0.188909058594903 M310 -S316 -0.191126355059617 A474 -I481 -0.191979716161404 M307 -S469 -0.192459795199741 A321 -S328 -0.192734907334714 S304 -M310 -0.192736319177775 S328 -A335 -0.193237233172978 M307 -V314 -0.193381465792753 V471 -L478 -0.195627586115676 L327 -A334 -0.196752885150265 T313 -T320 -0.19739080200306 A324 -A331 -0.197698379314362 S316 -A322 -0.200088937115099 V300 -S306 -0.200912557773277 N317 -A322 -0.20131603528821 N485 -E490 -0.201549468839746 S298 -A305 -0.201979682090221 S312 -N317 -0.204199443433406 S304 -T311 -0.204911116971795 Q309 -I468 -0.206299251749662 M310 -G473 -0.206897439948726 A318 -A324 -0.207631472151006 E497 -Q502 -0.210304508427571 G472 -L478 -0.212837080615751 E490 -E497 -0.213445074835992 E302 -T311 -0.21626916317086 T311 -G472 -0.216581236079251 T311 -S469 -0.216607580359735 K500 -L506 -0.217121409484862 A487 -A493 -0.218218975546193 V300 -V475 -0.218569230444809 S476 -T482 -0.21943626023288 T303 -S476 -0.219964108961838 V300 -I481 -0.220996331069554 A487 -S492 -0.221979633162643 A297 -T482 -0.223048428674489 V300 -Q483 -0.223225825244099 Q491 -K500 -0.223433295661623 A495 -Q501 -0.224603272771326 A296 -Q483 -0.224676110374265 T303 -G472 -0.225378921886621 A297 -Q483 -0.225522216264735 S299 -A305 -0.226703024059405 A494 -L499 -0.227273330446582 Q295 -V300 -0.227394945473863 S328 -A334 -0.227736805989809 A486 -S492 -0.227746539697485 S312 -A318 -0.227756308937127 A308 -I468 -0.227871259601518 M310 -N317 -0.229522473156655 L499 -V507 -0.2329504017777 Q295 -Q301 -0.236051957927043 S299 -T482 -0.236630341213814 S498 -T504 -0.240995631848548 T482 -L488 -0.242713018794121 K326 -V333 -0.243609055096924 K500 -V507 -0.245158086087744 M310 -V471 -0.245215273114729 A296 -A486 -0.247038388391095 L478 -Q484 -0.252235557641938 G467 -G472 -0.254100198567889 V314 -T320 -0.254659710837616 A493 -L499 -0.25656894356993 S298 -T303 -0.257865182874117 I468 -A474 -0.261617002551583 T320 -K326 -0.261784565656991 M307 -V471 -0.267555003627439 T303 -V471 -0.268737457959792 L327 -V333 -0.272285118124662 Q484 -Q491 -0.27231009511627 T303 -L478 -0.273670103004368 L488 -A495 -0.276777319400814 T311 -S316 -0.278998392942902 S306 -T311 -0.281225182023445 S299 -V475 -0.292142924591599 Q309 -Q315 -0.29775964638422 S469 -A474 -0.298891647988413 V471 -D477 -0.300533292882074 A308 -T313 -0.303725573232645 T303 -M310 -0.304216879532568 T320 -L327 -0.309917403165238 V489 -A495 -0.310488900391698 A493 -K500 -0.313553130146315 S306 -V475 -0.325062735747513 M307 -T313 -0.329357366716148 Q301 -M307 -0.330129532778997 V475 -I481 -0.336162573010718 M307 -V475 -0.342588773762976 A493 -S498 -0.346963735008833 M310 -Q315 -0.348020384637505 I481 -L488 -0.352186873336382 V300 -S476 -0.354387209348484 S469 -V475 -0.357027232190513 V300 -M307 -0.357031775407804 L327 -S332 -0.358405698897872 Q323 -G329 -0.365075404434192 A308 -V314 -0.368098849708659 Q501 -V507 -0.419292464891067 A324 -G329 -0.442983766759789 T303 -T311 -0.45002044117471 Q483 -V489 -0.456366136376522 I481 -A486 -0.478528233782969 S498 -A503 -0.51212506741322 S316 -A321 -0.531717452296393 S330 -A335 -0.532203418831578 S299 -S304 -0.545577838620841