[Fri Aug 26 18:00:22 2016] >Input file: TMQ12G43M16D.pdb >TM segments: 341-356_ 369-409 MAIDEN score = 15.0000 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- A354 -N380 10 F397 -I404 1.20124428293982 F353 -F381 1.11315897100103 F387 -H407 1.06065406360212 Y396 -F406 1.03114625371699 Y391 -F409 1.02685330850223 Y396 -I404 0.874235093659135 F397 -F406 0.790217800523312 H395 -H407 0.719246010301494 E352 -F381 0.659314975068669 E352 -I383 0.62278932241578 V398 -I404 0.62258932889597 E356 -D378 0.604051914377468 N389 -A394 0.558255542596477 P393 -F409 0.540429868380385 Q341 -V346 0.509083117732401 W384 -N390 0.50686326159673 D378 -I383 0.502742298986041 F397 -H408 0.488098318405395 F355 -D378 0.468701437312906 E352 -W392 0.466874261421168 I383 -S388 0.465484123498009 N389 -F409 0.397441874434031 Q341 -Y396 0.385735658838326 N379 -W384 0.382226353964408 S388 -H408 0.382144826707393 F353 -W384 0.340197318534029 P351 -N379 0.331836097731286 E352 -H407 0.2998604292053 F355 -F381 0.297722942811287 Q341 -G347 0.288120679623302 E352 -R385 0.272967489099866 P351 -N390 0.250180211261902 A386 -R403 0.24825445253432 N380 -P393 0.243443969350748 S350 -F355 0.242748566881175 P351 -N389 0.241834967885336 A354 -A382 0.241069624878326 D378 -R385 0.235154476224627 A386 -Y396 0.233558056996392 V348 -D378 0.226140783169049 W384 -P393 0.219523893965881 P351 -S388 0.214992216894996 P393 -H407 0.213063690895319 H349 -A354 0.212516811756417 R385 -R403 0.210050073330663 H395 -F409 0.209435112042195 F397 -H407 0.20927809846025 G342 -H349 0.20657749833988 V398 -F406 0.203199678774458 H349 -P393 0.202753279368409 P351 -H395 0.198906944568496 V345 -H395 0.194119439707569 E356 -A376 0.193091893870126 I377 -A382 0.184770527203117 R385 -Y396 0.183565093365864 N389 -F406 0.182337305662085 W384 -Y396 0.174323461812952 I383 -H395 0.173557164401512 A354 -I377 0.172648247220705 A394 -F409 0.169546084513935 Y396 -R405 0.162690912301754 W384 -H408 0.162184822914947 D378 -A386 0.161568126340445 V348 -D399 0.159059915801901 H349 -V398 0.158463584525747 V346 -H395 0.157839308360786 E352 -Y396 0.1568977815227 F353 -F387 0.154444716474782 H395 -H408 0.1543679703006 S388 -P393 0.154195755292038 A386 -V398 0.151950052836095 S350 -W392 0.151151500454761 F387 -F409 0.147773596144553 H349 -A382 0.147061220363324 E352 -H408 0.142657388300689 A386 -H407 0.139653615617072 V375 -R385 0.139372414887102 I383 -H407 0.139126661216137 E352 -A394 0.137927268858983 Y391 -H407 0.135974484796382 S350 -F387 0.135240874812806 F397 -R405 0.135142262758866 S350 -V398 0.133125700213291 S350 -A382 0.132093320458214 S388 -F406 0.131779059193897 N379 -N389 0.131598481617594 D378 -V398 0.129102789349913 A354 -F381 0.12888173211919 Q341 -H349 0.127063272613932 D399 -R405 0.127020436638424 I383 -I404 0.126375523360428 A382 -N390 0.123619934021064 A394 -H407 0.122377860837894 S350 -N390 0.120864706301044 I377 -G402 0.119970914289579 F397 -F409 0.117870190327785 W392 -H408 0.117607238766539 N380 -W392 0.116039586724484 G347 -A400 0.115956484298492 A386 -G402 0.115889226351176 A386 -Y391 0.114929983851876 W384 -H407 0.112656930016107 A376 -G402 0.111289888862557 R385 -A394 0.109888114443244 F353 -S388 0.109718065743241 Q341 -F397 0.109099928630162 G402 -H407 0.108542505959905 A386 -A394 0.107453144993464 A376 -S388 0.107010870467251 V348 -G402 0.10447452672373 F387 -F397 0.104012531588189 E352 -D378 0.10383096282888 F355 -A386 0.103377030517148 A376 -F387 0.0988625864296706 P351 -R385 0.0986045528636077 E352 -F409 0.0975738271347435 V345 -G402 0.0970341051994112 E352 -A382 0.0970210086420429 V398 -H407 0.0965095329799233 F355 -W384 0.0951732943118899 W384 -F409 0.0930086718170116 A394 -I404 0.092514820904352 V345 -V398 0.0878478192387835 G347 -A394 0.0877196812753835 H349 -W392 0.087328145722914 A354 -S388 0.0856988690640961 E352 -H395 0.0855904661171321 H349 -A394 0.0854399327748379 S388 -H395 0.083029858172103 S350 -I383 0.0820861746309243 P374 -R385 0.0810262858945658 L343 -V348 0.0785638626622687 V375 -I383 0.0785109713354819 A382 -Y396 0.0757143136062766 F397 -R403 0.0747866879258972 A376 -I404 0.073971906426789 A376 -A382 0.0731206776323183 G347 -G402 0.072080807617795 Y391 -H408 0.0719047701361353 P351 -D378 0.070121168476082 E352 -W384 0.0692171822135557 Y391 -Y396 0.0678665856085541 V344 -A400 0.0673530826051456 H349 -I383 0.0662562746328064 A386 -F397 0.0660109994967213 I377 -F387 0.0657994067319718 F353 -A386 0.065599042745214 A354 -A376 0.0655033139712486 W384 -H395 0.0646502978767209 E352 -F387 0.0625360934946771 N380 -S388 0.0623981054689349 A394 -F406 0.0615557708004779 P374 -F381 0.0598357328149011 E352 -Y391 0.0592995278245825 H349 -W384 0.0588017588069691 I377 -W384 0.0579221370731817 I383 -V398 0.0567874504220987 F381 -N390 0.056427116361133 N380 -Y391 0.0562394759296873 I383 -F409 0.0553746896702975 I383 -F406 0.0552226937493208 F355 -A376 0.0548665390237586 I383 -N389 0.0540454062629463 N380 -N390 0.0539955302229411 F381 -P393 0.0518982838318789 V345 -Y396 0.051617226366498 H395 -G402 0.0508758935525693 N380 -A394 0.0506295634437957 P374 -S388 0.0502147937843027 A354 -A386 0.0499950304973348 V345 -R405 0.0495751918346157 I383 -H408 0.0486873437743172 F397 -G402 0.047598120510413 V375 -G402 0.0475877096086796 G342 -F397 0.0463926005123163 A382 -G402 0.0457266237382461 S388 -Y396 0.0448982670585112 F353 -N390 0.044803067349758 V346 -G402 0.044308295929703 P374 -F387 0.0438053459254606 E356 -W384 0.0431575158362711 N380 -Y396 0.0426306255336515 F381 -A394 0.0424066920338841 P351 -W384 0.0423665373828608 E356 -N379 0.0417361646180847 F373 -A386 0.0404153840214621 E352 -A386 0.0400466165943261 G347 -Y396 0.039879083544707 Q341 -V398 0.0377901491471473 E352 -N390 0.0375422391388088 K401 -F406 0.0374429623857138 F353 -I383 0.036338310947011 V346 -Y396 0.0355020635384475 P351 -F387 0.0344258860852573 I383 -P393 0.0323472917918308 V344 -F397 0.0310452116577533 A354 -R385 0.0309242868352548 W384 -F406 0.0284224991574495 S388 -I404 0.0282467146407033 A354 -D378 0.0279453702528967 A376 -R403 0.0275304921311346 A400 -F406 0.0244897013068108 L369 -P374 0.0236286668797909 R385 -H408 0.0217643904391628 A386 -F409 0.0215854274933402 E352 -N379 0.0210330664735312 H349 -Y396 0.0205895914290437 P393 -F406 0.0182818645635923 R385 -H395 0.0179853939314496 W384 -I404 0.0176585625822296 V398 -H408 0.0176184698914215 P351 -E356 0.0172424579409411 G342 -H395 0.0170358087267327 V348 -N379 0.0168549043931103 Q341 -H395 0.0166066743559124 V348 -I383 0.0164763063721466 N389 -H395 0.0160104307157178 S350 -N380 0.015986831353122 D399 -H408 0.0150753643158348 S388 -A394 0.0146651855902142 L369 -V375 0.0120840846068533 V375 -W384 0.0114800764992253 N380 -N389 0.0114431578923786 S350 -F397 0.0113282014049666 G342 -G347 0.0088996338418057 S350 -E356 0.0073499537731164 P351 -F409 0.00726145875766337 Y396 -K401 0.00642699774060063 F387 -R403 0.00330421254158098 G342 -D399 0.0032275451629343 V344 -Y396 0.00215620027521446 P351 -F381 0.00146757565807931 D399 -I404 0.00052757825350902 P374 -I383 -0.00142311151142627 V345 -I404 -0.00258300336071038 A382 -A394 -0.00346314054038288 A354 -N390 -0.00397089324846922 A394 -H408 -0.00430283418626498 A354 -N389 -0.00453767416202007 F373 -A382 -0.00488393958542765 R403 -H408 -0.00513368697460059 A354 -W392 -0.00626315972578773 I383 -G402 -0.00668609305363177 F353 -A382 -0.00687281553781061 I383 -R403 -0.00698699179043105 F355 -R385 -0.00916201237514347 F353 -A376 -0.00937619558072278 P351 -W392 -0.00959223797872744 S388 -F397 -0.00972783427657808 D378 -G402 -0.00979173463569438 N390 -F409 -0.0100481952818094 F387 -R405 -0.0107322234153293 N379 -S388 -0.010801505708224 A354 -P393 -0.0131066273085132 V348 -A354 -0.0138386212794366 P351 -I377 -0.014039783968431 F353 -I377 -0.0178029888305531 V348 -A394 -0.0180120576500036 V375 -F381 -0.0194212046036579 A386 -F406 -0.0197944013624824 E352 -N380 -0.02066025322575 R385 -F409 -0.0210933813243033 I383 -R405 -0.0231638173486761 A382 -V398 -0.024087856775342 F381 -Y391 -0.024847952679024 A386 -H408 -0.0256966692774707 F353 -A394 -0.0262017689266623 N379 -G402 -0.0268681748424431 F381 -N389 -0.0271569796135771 S350 -F409 -0.0272821198692059 E352 -S388 -0.0274161715084782 V348 -A400 -0.0275769972090696 I404 -F409 -0.0280391836350198 P374 -W384 -0.0287073346009947 V375 -S388 -0.0287806644208026 I383 -D399 -0.0288771882025562 N380 -F387 -0.0306733182438843 A382 -S388 -0.0327695631821667 D378 -W384 -0.0331557793794627 S350 -N389 -0.0346381433497377 V375 -N380 -0.0348882443001894 W392 -F409 -0.0349944137067526 G347 -D399 -0.0350521849890817 V348 -N380 -0.0350714667978584 S350 -D378 -0.0351699637865169 E356 -N380 -0.0366057672242279 D399 -F406 -0.0381396090290576 N390 -Y396 -0.0391410290696497 V348 -P393 -0.0408770102193698 S350 -H408 -0.0416872629792477 S388 -H407 -0.042547252192298 A354 -A394 -0.0439771697158009 H349 -N380 -0.0454509752442892 P393 -H408 -0.0456605674714275 A386 -H395 -0.0477457504325303 N379 -Y396 -0.0494967478729231 N390 -H395 -0.049653519842491 R385 -P393 -0.0515502018208003 G342 -Y396 -0.052309773386388 W392 -H407 -0.0523180613458143 E352 -I377 -0.0526570517423899 S350 -H407 -0.0541086073645598 S350 -R385 -0.0546894432197577 W384 -F397 -0.0569490316713703 L343 -F397 -0.0575617499073893 I383 -N390 -0.0575670433781514 R385 -W392 -0.0578466404060212 D378 -I404 -0.0594447240256547 F353 -D378 -0.0597454959614143 P351 -A386 -0.0598560175012466 H395 -F406 -0.0604654813469629 G347 -H395 -0.0631874431621844 A382 -W392 -0.0663024571796905 A386 -W392 -0.0663116407403533 N380 -F397 -0.0670684947287459 F353 -P393 -0.0674760449380791 F387 -P393 -0.0682082496891692 Q341 -D399 -0.0692947020570764 D399 -H407 -0.0722704357764314 F353 -Y391 -0.0732035273579674 S388 -F409 -0.0749681878443831 I383 -F397 -0.0775691190015459 F387 -G402 -0.080115134655129 H349 -N379 -0.0810736154694296 F381 -S388 -0.0814603563259388 F387 -V398 -0.0816039521330891 H349 -F397 -0.0816640285687198 N379 -A386 -0.0837147202973725 N390 -H407 -0.084159702901383 S350 -I377 -0.0844782264340098 F381 -W392 -0.0848277358590428 A382 -N389 -0.0850234152672686 F387 -Y396 -0.0856599701599769 S350 -A386 -0.0859231359622799 A354 -Y391 -0.0885061810077472 V344 -D399 -0.0887837442480901 G347 -P393 -0.0896987771682338 P351 -Y396 -0.0913046346210216 H395 -R403 -0.0915512671632137 S350 -F381 -0.0927624678789341 A386 -I404 -0.0930570671454323 S350 -P393 -0.0931857379783398 V375 -A382 -0.0936285098760115 Y396 -G402 -0.0940790437504606 G342 -V398 -0.094635852522857 N380 -V398 -0.0946851882814495 V344 -V398 -0.0962873992414374 F387 -I404 -0.0981821350425083 Y396 -R403 -0.0988341636182275 A376 -R385 -0.100050170515285 S350 -Y396 -0.100087452061928 D378 -F387 -0.100166707705903 F353 -N379 -0.100314571183444 V348 -F355 -0.100397934848743 G347 -I404 -0.100978205066164 R385 -Y391 -0.101505967892335 N390 -H408 -0.107896857615234 A382 -Y391 -0.1082271447931 H349 -F355 -0.108917995571509 V375 -F387 -0.109948652027633 V345 -F397 -0.112198806906493 N389 -Y396 -0.112818058325916 A354 -W384 -0.113003190584928 P374 -N379 -0.113751597339496 P351 -A394 -0.115566154588692 W384 -Y391 -0.115718369842226 W384 -R403 -0.116635209774733 A354 -F387 -0.116823596589525 F353 -R385 -0.116911295355661 V345 -F406 -0.117628685887958 D378 -R403 -0.118018889417344 P351 -Y391 -0.118142324435469 W384 -A394 -0.118243978482197 P351 -I383 -0.120225848584663 V398 -F409 -0.121004426507889 I383 -W392 -0.121040928915055 P374 -A382 -0.121516970494848 S350 -Y391 -0.121970578804643 S350 -H395 -0.125862046177906 G347 -V398 -0.126227408611736 V346 -I404 -0.127259757816125 N380 -H395 -0.12755065219541 E352 -N389 -0.127969137458852 A376 -A386 -0.128735871133369 I383 -Y396 -0.129079339731414 F381 -Y396 -0.131682119703594 V348 -I404 -0.131866081728727 G347 -F397 -0.132372170292701 N389 -I404 -0.132862661520973 Q341 -V348 -0.134425014751143 V344 -R405 -0.137771761574922 V346 -K401 -0.139267859850113 A386 -R405 -0.139610085590083 N379 -F387 -0.14208482665898 F373 -R385 -0.144074644969254 V345 -K401 -0.145694675218254 F353 -N389 -0.146520217518012 P374 -A386 -0.146531496121966 P351 -A382 -0.150309381458751 L343 -D399 -0.151070490123187 A382 -I404 -0.151316075179654 H349 -E356 -0.151512089237617 F387 -W392 -0.15272755371326 I383 -Y391 -0.15544798822734 V345 -A400 -0.155488868714567 V346 -A400 -0.157844691373995 A382 -R403 -0.158664506356897 V348 -E356 -0.159314904595742 I377 -R385 -0.160651084415972 I377 -I383 -0.162385084408031 F387 -H408 -0.163248920109972 H395 -R405 -0.165248633796692 F387 -A394 -0.165835348218907 V346 -R405 -0.16679199212648 I377 -A386 -0.172376295138089 I377 -R403 -0.176475452244015 F355 -A382 -0.177392864970248 E352 -P393 -0.17859351591844 S350 -N379 -0.17983288962629 A394 -R405 -0.182144541559106 V345 -D399 -0.183484714489472 R385 -I404 -0.183558319942202 I383 -A394 -0.183786887564079 E356 -I377 -0.184374918291986 H395 -I404 -0.184805647032325 V398 -R405 -0.186650195127732 Y396 -F409 -0.186931353377397 H349 -F381 -0.187041312868762 F387 -H395 -0.187169688811617 N389 -F397 -0.189400480674186 V346 -V398 -0.190092522347626 E356 -I383 -0.190238046538696 Y396 -H408 -0.193584254703459 N389 -H408 -0.193671447570849 V375 -R403 -0.19852624399241 G342 -V348 -0.199572283999363 A376 -W384 -0.200835726369005 F355 -I377 -0.201663458221676 W384 -V398 -0.209560915403641 R385 -H407 -0.210710937059414 F381 -F387 -0.211950033726386 W384 -W392 -0.216924535565624 N380 -A386 -0.221714893079745 S350 -A394 -0.223599597409843 E356 -A382 -0.228078504035762 N389 -H407 -0.236822481910763 S350 -W384 -0.238424239690694 D378 -Y396 -0.241762492064749 A376 -F381 -0.244704381346305 A400 -R405 -0.245662363725844 E356 -F381 -0.247300565129652 F355 -N380 -0.24730484291408 F387 -F406 -0.249107533541021 V344 -H395 -0.25148528937716 V346 -D399 -0.252600236451959 V346 -R403 -0.254125644881771 F355 -I383 -0.26037155455045 N380 -R385 -0.26433859861861 N379 -R385 -0.267584056817125 A376 -I383 -0.26937696469775 V348 -F397 -0.269859564889118 F353 -W392 -0.271578662458793 F353 -N380 -0.279035041666432 Y396 -H407 -0.280950069021747 V348 -H395 -0.28136136637181 V345 -R403 -0.281708676322411 W384 -N389 -0.282663655875802 H349 -D378 -0.28859887064009 F355 -N379 -0.289930480122395 V375 -A386 -0.318672590251925 V348 -Y396 -0.334969567743874 V348 -V398 -0.348132819742634 V346 -F397 -0.35205377818527 A382 -F387 -0.375527412185313 A354 -I383 -0.376585648805762 R385 -N390 -0.396929622090667 F381 -A386 -0.398638833055989 P351 -N380 -0.466242573471106 A354 -N379 -0.487689117517404 P351 -P393 -0.511127132065297 V398 -R403 -0.610355838062024 H349 -H395 -0.74657039991375