[Fri Aug 26 17:02:45 2016] >Input file: TMQ503X6M2D.pdb >TM segments: 36-53_ 58-73 MAIDEN score = 8.5544 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- W36 -N70 10 W36 -V71 0.726215598897444 W36 -V69 0.714602247212867 L37 -V71 0.675499442485718 W36 -G72 0.603646885821131 L37 -K73 0.59273904084826 E39 -V71 0.57370592033721 L37 -V69 0.548244378988497 V38 -V71 0.520289731545919 Y41 -C48 0.487923047546306 E39 -G72 0.483262139011934 Y41 -K73 0.482568535400376 S64 -V69 0.435726655242028 K63 -N70 0.433213990281166 F51 -E61 0.33768573716109 L65 -N70 0.335166114869815 Y41 -V71 0.32759418973973 F40 -K73 0.32239762065268 W44 -T50 0.284871805562154 E61 -P68 0.26570141352941 E39 -F51 0.262118056518382 L65 -V71 0.254164520172239 S64 -N70 0.246183305562405 V38 -G72 0.242842627681939 P53 -E61 0.226771874022987 Y47 -E52 0.217755321132136 G59 -S67 0.202662456363384 F51 -V58 0.201306931020926 G59 -P68 0.197332377359951 P43 -H49 0.188779086529194 Y41 -E52 0.180682943210013 E39 -Y47 0.179282449275744 Y41 -H49 0.160850632216185 E52 -E61 0.148625397730597 E39 -E52 0.146978766019242 F40 -F51 0.133030884992076 F40 -V71 0.126984294831713 E61 -N70 0.125939282609415 L37 -G72 0.117926431328199 E39 -G66 0.112565926438692 E39 -H49 0.108036665355076 H49 -K73 0.105838686331981 P53 -A60 0.105318069591815 L37 -S67 0.103182178849923 V38 -L65 0.0964633864687849 E52 -G59 0.090350759647269 E39 -T50 0.0899556891746558 P53 -L62 0.086499239629914 L65 -G72 0.0862138913362855 G66 -K73 0.0857185210578395 V58 -L65 0.0850188722192766 A42 -G72 0.0815077306822598 L37 -S64 0.0727954871645915 E52 -K73 0.0696807233970835 F40 -A46 0.0696015723117172 W36 -S64 0.0593559641030112 C48 -P53 0.0587916654856586 V38 -P68 0.0563267088173749 S67 -G72 0.0553549532422756 P53 -V58 0.0534302430269911 Y47 -K73 0.051682686694142 Y41 -Y47 0.0515834099203278 V38 -N70 0.0498725641436275 L37 -G66 0.0408671998388703 L65 -K73 0.0336364631514443 V38 -C48 0.0285400797746007 L62 -G72 0.0258389262336705 K63 -P68 0.0257013324827042 W36 -K63 0.0241684315453679 V38 -L62 0.0240579943535773 E61 -V69 0.0208859775506134 L37 -K63 0.0205128650889508 E39 -V69 0.0156197894368172 E61 -V71 0.0155029892533588 A42 -H49 0.00369622751434395 Y41 -T50 0.00214169528089725 A60 -P68 -0.00933193261736243 K63 -V71 -0.009431676152448 A60 -V69 -0.012105166308602 P53 -G59 -0.0130423934871683 G66 -V71 -0.0162901929927359 W36 -P68 -0.019859951425512 C48 -G72 -0.0228393689340418 A42 -T50 -0.023848319288724 T50 -V58 -0.0275860362874698 E39 -A46 -0.0300615067428268 S64 -G72 -0.0307289228473098 E61 -S67 -0.0312865409791887 A46 -P53 -0.0313668939269389 E52 -K63 -0.0325477549834631 L62 -N70 -0.0406966730552327 A42 -E52 -0.0453615232959539 L62 -K73 -0.047098491526705 C45 -K73 -0.0508612621618285 W44 -F51 -0.0513991619349392 F40 -C45 -0.0539365516980266 P43 -C48 -0.0557125645377559 L37 -N70 -0.0573075762409749 V38 -S67 -0.0595066333913019 E39 -W44 -0.0605773406428218 E52 -L62 -0.0649039811461511 E52 -G66 -0.0685987863214674 K63 -V69 -0.0687435162221854 E52 -A60 -0.0709066541801575 P43 -T50 -0.0762160837863866 E39 -N70 -0.0817860039974949 A46 -F51 -0.0826384428431677 L37 -E61 -0.0828937017846374 E39 -L65 -0.083265303525593 V58 -S67 -0.085782251113705 L37 -L65 -0.0879078710385084 F51 -G59 -0.0931353703665838 Y41 -G72 -0.100163175367582 V58 -K63 -0.103424788357618 A42 -F51 -0.106307073878905 E52 -L65 -0.10692744558969 Y41 -F51 -0.107956086390607 F51 -L65 -0.119570683877845 E52 -V71 -0.120980676814407 Y41 -A46 -0.121886451615466 W36 -L65 -0.127827731147796 W36 -L62 -0.132273739918967 E39 -L62 -0.133598402340579 G59 -G66 -0.13688602347819 P43 -K73 -0.137240159761175 G66 -G72 -0.141557459160666 K63 -G72 -0.143846984420655 F40 -E52 -0.151384238607908 Y47 -P53 -0.152629891997959 F40 -Y47 -0.1537538018465 V58 -G66 -0.156882952088376 A46 -E52 -0.158219187207291 F51 -L62 -0.159121494060205 F40 -N70 -0.160399151604909 W44 -E52 -0.161248733516667 V38 -G66 -0.162816550168659 F40 -G72 -0.185478500377407 W36 -S67 -0.189376936211325 S64 -V71 -0.191902015596799 A60 -S67 -0.202409658537183 L37 -L62 -0.204898910504165 V38 -K73 -0.205961136111868 A42 -Y47 -0.210747710710126 F40 -H49 -0.220605729167832 E52 -V58 -0.237008232469925 W36 -G66 -0.24510285245526 C48 -K73 -0.248279353608402 G59 -S64 -0.252434764222057 C45 -E52 -0.256401208277895 E61 -G66 -0.258070725121132 A60 -G66 -0.262180518630823 V58 -S64 -0.270274887681625 C45 -T50 -0.271181929829636 L62 -V71 -0.284487719627353 L62 -V69 -0.289238304311962 A60 -L65 -0.294590491886735 V38 -V69 -0.303448380660461 A42 -K73 -0.31218576684074 C45 -P53 -0.312297230510869 L62 -S67 -0.317085498027214 W44 -H49 -0.317641913899174 W36 -K73 -0.318489848070633 F51 -K73 -0.327062288156405 F40 -C48 -0.32721276834074 G59 -L65 -0.329047541309234 A42 -C48 -0.356342595148845 E39 -C48 -0.391209746396664 C45 -F51 -0.394978573048782 L62 -P68 -0.535588193372838 L37 -P68 -0.540187514925702 E39 -C45 -0.606445476217344 E39 -K73 -0.816887850391468