[Fri Aug 26 16:45:38 2016] >Input file: TMQ63ID6M1D.pdb >TM segments: 236-290 MAIDEN score = -1.9675 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- C269 -E274 10 L284 -F289 0.636717873435178 F265 -A290 0.52909571379547 I267 -M280 0.516483578389936 L252 -M280 0.51477368349051 V266 -A281 0.496220420278159 E249 -M280 0.444163693868687 R253 -L284 0.440817544148553 Y239 -A244 0.408328978767663 C269 -M280 0.401349817658596 I267 -A281 0.393696059139658 M280 -K285 0.392079843588839 L252 -R283 0.386156078938315 Y259 -F289 0.379464705223544 Y268 -S276 0.3785892006784 A247 -A277 0.377191009754272 K264 -A290 0.357091631060955 A244 -K264 0.327470909362588 D237 -C271 0.326572974762561 D248 -V256 0.323861740566157 E274 -Q282 0.323134262310734 V256 -A287 0.313318889688617 I267 -A277 0.309721283740904 C269 -V275 0.30925553596664 L284 -A290 0.305699881774659 N273 -M280 0.296490232519496 A247 -L252 0.29477027381525 P238 -P272 0.291907842669563 E249 -R283 0.287600603470298 E249 -Q282 0.285972045142368 P238 -Y268 0.264455453812667 V256 -L284 0.255858384979584 Q263 -A290 0.236927438513755 Q245 -Q263 0.23502337377664 L252 -H258 0.233434666598583 Y259 -V266 0.232446801639259 D251 -V256 0.231023358766794 Q245 -P260 0.230985850999844 E249 -A277 0.22887692963516 L236 -P272 0.226461633771047 Y259 -K285 0.222345691164824 Q245 -R253 0.217041926513571 R253 -A287 0.215757358182225 A247 -S276 0.215138440113571 D254 -Y259 0.213949017815176 E249 -N273 0.205062848356857 R250 -A277 0.20476439004698 D254 -A287 0.202300073217232 Y239 -P272 0.200999323088526 V266 -F289 0.200539143765607 T262 -G288 0.199590067437291 I241 -V266 0.199266251156916 D251 -R283 0.191908169209403 Y259 -Q286 0.190770877588999 A277 -Q282 0.188069074637886 G243 -V266 0.184384852966805 H258 -G288 0.179415451487898 R253 -P260 0.17606328126816 A247 -I255 0.174290696950816 R253 -A281 0.173519382477204 I267 -E274 0.173022264157122 Y268 -A278 0.171899257776296 Q245 -C269 0.170117362735552 D237 -P242 0.168912535585186 K264 -K285 0.166420471939597 V256 -V266 0.165264333443397 V256 -F289 0.164321320020929 Y239 -Y268 0.158072834101548 R250 -V256 0.15210888800643 H258 -K264 0.149361403432549 V266 -V275 0.148889642176498 A257 -R283 0.145521589814698 C269 -S276 0.145353770755648 L252 -L284 0.144108052509057 Y259 -I267 0.142591773422262 H258 -A290 0.141205322253505 I255 -A261 0.140832070069598 Y239 -C269 0.140671918622399 R250 -Q282 0.133925793747738 P238 -C269 0.129442099451873 R250 -A281 0.125535189512744 P260 -A287 0.124703753277796 V256 -F265 0.124561798259429 E249 -V275 0.12037623961381 S270 -A281 0.120344860718248 A244 -A277 0.119453399788196 R253 -K285 0.119118535994414 F265 -A277 0.118179662981584 E249 -L279 0.116569415372183 A247 -Y259 0.116086634965827 Q245 -R250 0.11525573318412 C269 -A277 0.114280995139185 R250 -C269 0.113608999843606 Y239 -S270 0.112166321671426 H258 -A287 0.111287970612532 D248 -S270 0.109634121667373 A247 -A281 0.109153518746851 A247 -S270 0.10793910897476 Q245 -S270 0.106834333741648 S270 -A278 0.106812947274582 E249 -S276 0.106725308382297 A244 -S270 0.105754704383894 P238 -C271 0.1056573953097 F265 -Q282 0.104559330341483 L252 -V266 0.103381236076659 C271 -S276 0.0998309248785705 E274 -M280 0.0987411736002608 A247 -P260 0.0987127050798788 I267 -A278 0.09819868335041 A261 -G288 0.0981651045497216 G243 -F265 0.0976959148756427 D251 -A257 0.0973070867905443 A240 -I267 0.0972681663162112 V256 -A277 0.097086152978803 K264 -G288 0.0944495844748032 V256 -A290 0.0927557963348491 F246 -Y259 0.0924688824436357 D254 -K285 0.0919728130222736 P238 -A244 0.0918523321038354 V256 -K264 0.0904998504181802 C269 -A281 0.0894391385614045 D248 -C269 0.0883515002848423 I241 -C269 0.0874193772548327 Y268 -Q282 0.0857071628922306 A247 -C269 0.0851765481744897 F265 -L284 0.0848984717856442 V256 -A281 0.0841366613842469 D248 -A277 0.0834624384332097 L252 -A278 0.0831764640839394 M280 -A290 0.082727488747718 F265 -G288 0.0820139888074234 A278 -Q286 0.0815908292843874 A240 -F246 0.0782066054647244 R253 -Y259 0.0777943245975425 P272 -A278 0.0763267859870398 D237 -F246 0.0734113679070636 A244 -I255 0.0732991366481536 I241 -A277 0.073009237199571 E249 -E274 0.0716877025811091 I267 -S276 0.0716547622342292 V266 -R283 0.0716402557079172 P238 -A247 0.0712759283611932 A247 -A257 0.0703207338170069 D237 -P272 0.0701598741073534 D254 -P260 0.0698918261908701 Y268 -L284 0.0690816121115736 Y259 -M280 0.0686956789135363 I255 -A290 0.0681333870851697 Q245 -V256 0.0681085024923047 A281 -Q286 0.0679444973553771 D248 -V266 0.0678935936471339 P242 -V266 0.067362326380759 Y259 -R283 0.0660228567192922 D254 -R283 0.064801710953756 V256 -Q282 0.0645928655241446 A257 -Q286 0.0644980671530829 I241 -S270 0.0638977703655152 T262 -K285 0.0635744438834231 V266 -Q282 0.0628267359300062 R250 -S276 0.0613874667752003 L252 -S276 0.0609819529847482 F265 -L279 0.060099162703422 A277 -F289 0.0600815102391419 I255 -G288 0.0591831327650043 A244 -A281 0.0587699503177752 A240 -A247 0.0562451445566698 L252 -G288 0.0551538033762249 A257 -A290 0.0549259235516972 V266 -S276 0.0548666277383254 I267 -N273 0.0548295785428881 H258 -L284 0.0545885065502323 A277 -A290 0.0544814536190463 R253 -A278 0.0530315233122098 D251 -S276 0.052759462664103 I255 -R283 0.0523971675135249 M280 -G288 0.0518462746423447 A240 -N273 0.0517486051842022 R253 -H258 0.0509576132301879 D248 -L279 0.0508359205617368 R283 -A290 0.0485819137476042 Q245 -Y259 0.0482732679633617 S276 -K285 0.0475774408260072 Q282 -A287 0.0471678293334064 A261 -L284 0.0457948388039109 F246 -M280 0.0444522575929547 L279 -F289 0.0441458016757039 S276 -R283 0.0439604779797256 I241 -I267 0.0436135555079504 Q282 -F289 0.0435339576048408 A240 -C269 0.0434245797788995 I241 -F265 0.0426822318297635 V256 -Q286 0.0425376137721516 P242 -Y268 0.0425218751040877 A244 -C269 0.0424338415821723 A240 -C271 0.0416436747710858 I255 -A287 0.0409304420548673 I255 -M280 0.0409201065223854 F246 -A281 0.0405950133108295 Y259 -A281 0.0402503924741184 R250 -R283 0.038076761990506 C269 -R283 0.0377201065847368 Q245 -I255 0.0371324439106079 P242 -F265 0.0370943850574763 Y268 -N273 0.0352143170764523 V275 -R283 0.0349083485594435 V256 -A261 0.0337878481901579 V266 -K285 0.0333749280419469 D237 -C269 0.0318338256912121 P238 -F246 0.0317369685536477 G243 -I267 0.0309840629770277 A261 -V266 0.0302652431097794 H258 -Q263 0.0294711739553701 R250 -A287 0.0289793540640426 P260 -G288 0.0282261013931713 S276 -L284 0.0273778303830504 A261 -I267 0.0271413959673161 R250 -I255 0.0263541911422713 L236 -C269 0.0262243981471557 Q245 -I267 0.0258351787793512 D251 -A287 0.0248470858467553 Y239 -E249 0.024002447403749 G243 -Q263 0.0230193679068353 V275 -Q282 0.0223529847315591 A244 -M280 0.0204255226473755 E274 -L279 0.0200325374882713 E249 -K285 0.0187209250528237 H258 -R283 0.0177623525723418 E249 -V266 0.0177222788868076 D251 -A277 0.0176380653674193 P242 -S270 0.0171298595033154 F246 -S270 0.0145460028292038 Y268 -R283 0.0144574118794996 F246 -R253 0.0138823193935016 Y239 -A247 0.0133124379493269 R253 -G288 0.0122806006723672 L252 -C269 0.0113396069885516 V266 -E274 0.0105316646786271 V256 -Q263 0.00894477132508875 A257 -Q282 0.00694856153573647 D248 -I267 0.00641473862797248 F265 -R283 0.00532444424745893 D251 -M280 0.00402857436606618 I255 -I267 0.00374719592063411 Q245 -A281 0.00370584891488313 D251 -A281 0.00347610318326819 F265 -A287 0.00289459245356283 A240 -S270 0.000926464267596905 I241 -C271 0.000599428365048338 R253 -R283 -0.000971653701455022 L252 -A277 -0.0016316909724825 A247 -F265 -0.00181421370589741 Q245 -A277 -0.0025570183532756 I267 -A287 -0.00360707791868364 Q245 -A261 -0.00435576046439323 R253 -Q282 -0.0043741069593497 N273 -A281 -0.00499727293158414 I255 -F265 -0.00508280341845513 D248 -L284 -0.00618529984653149 A247 -A278 -0.00643975624530313 A240 -V266 -0.00755662993747852 M280 -F289 -0.00779163473706612 C271 -A277 -0.00866520629849332 A257 -T262 -0.00936652180946052 A247 -V266 -0.0102044544190325 R250 -I267 -0.0105765219879486 A244 -Q263 -0.0112555028155841 D248 -Q282 -0.0113254896138004 P260 -V266 -0.0122479423028334 K285 -A290 -0.0123738664028714 L252 -Q282 -0.0127309778275981 E249 -Q286 -0.0133145100033814 F265 -S276 -0.0135929456511226 S270 -V275 -0.0136469293348505 Y239 -V266 -0.0142485729614217 F265 -A278 -0.0144523339632934 I241 -A247 -0.0149229104581169 A278 -R283 -0.0149764086687199 I255 -A281 -0.0155592933821602 R253 -Q286 -0.0161957210643844 F246 -V256 -0.0162647376635956 R250 -L279 -0.0166682856105593 A257 -F289 -0.0168334305641347 L252 -F265 -0.0175805087608722 I267 -A290 -0.0183920326927538 P238 -D248 -0.0186986098754892 Y268 -K285 -0.01904228323093 A277 -Q286 -0.0193171884311876 G243 -K264 -0.0197692701252619 R283 -G288 -0.0212445744654459 V266 -Q286 -0.0237191813127233 I267 -K285 -0.0262225370168085 Q263 -A281 -0.0265192552392466 I255 -V266 -0.0267858307808755 V256 -T262 -0.0268397436977881 G243 -Y268 -0.026880844179705 D248 -S276 -0.0283369855358877 R253 -I267 -0.0286769448189474 C269 -L284 -0.0297533585981968 A247 -L279 -0.0297684289675324 D248 -A278 -0.0305641529446765 S276 -Q282 -0.0312197261561435 Q245 -D254 -0.0315200808206324 C271 -A278 -0.0315319987251806 I267 -L279 -0.0323611734070441 P238 -Q245 -0.0338326851489095 Q263 -F289 -0.0342390535586024 L252 -Q286 -0.0365204642298487 Q263 -K285 -0.0366321685123978 A244 -A261 -0.0367955090298944 K264 -F289 -0.0370103696344684 A257 -K285 -0.0372037568101486 V266 -G288 -0.0372996220204485 L279 -A287 -0.037761800639716 Y259 -G288 -0.0378691758952643 E274 -R283 -0.0390806806437043 A277 -K285 -0.0391494076343067 V275 -L284 -0.0396905037680897 A247 -I267 -0.0407094125565663 Q245 -D251 -0.0407960153749949 Y239 -E274 -0.0409968212331933 D251 -L284 -0.0412278030544472 A240 -E274 -0.0414174929638395 L252 -P260 -0.0418734083985948 L252 -Y268 -0.0422979145543785 P242 -A247 -0.0429621744318966 D251 -Y259 -0.0435748424296083 D237 -S270 -0.0449833885987786 Q263 -G288 -0.0517285346759833 A257 -M280 -0.0525366118995421 A240 -Q245 -0.0526219473135091 V266 -A287 -0.0526831051892822 Y239 -D248 -0.0527493186295525 A278 -A290 -0.0542696269187832 A261 -A287 -0.055093154897508 A247 -L284 -0.0559258888058869 D251 -L279 -0.0563310867808871 P238 -G243 -0.0569245774288751 L279 -A290 -0.0574226272911478 Y268 -L279 -0.0590060215043251 F246 -D254 -0.059346689020833 Y239 -I267 -0.0597989889348751 I267 -F289 -0.0598010709293125 Y259 -A287 -0.0606440479971853 A244 -Y259 -0.060748336397296 N273 -L279 -0.0609285447498347 A244 -F265 -0.0610447161447306 A244 -V266 -0.0610648702628183 V266 -N273 -0.0618143271524985 Y239 -N273 -0.0625200813036515 L252 -K285 -0.064663555756348 A247 -R283 -0.0659461741798237 Y259 -A290 -0.0669791208664146 A240 -P272 -0.0672253490189774 Q263 -L284 -0.0679717148624703 F246 -C269 -0.069495159324811 K264 -Q282 -0.0703918865434234 E249 -S270 -0.0704341455468518 R250 -Y268 -0.070540959540331 E249 -C269 -0.071452710029023 G243 -C269 -0.073325931869201 T262 -L284 -0.0737622254333634 A278 -A287 -0.0757237107951706 F246 -S276 -0.0761773830493863 A281 -G288 -0.0763294776287138 A257 -A281 -0.0765452851983673 A244 -E274 -0.0769332884488412 D251 -Q282 -0.0772355026274256 E249 -A287 -0.0780430083327492 R253 -S276 -0.0806023005258041 A247 -E274 -0.0821403652245749 A247 -Y268 -0.0836650251548906 P242 -I267 -0.0843846748358508 D248 -A281 -0.0844205746295753 A240 -Y268 -0.0849205442342358 D248 -I255 -0.0857915171867392 D237 -Y268 -0.0873899086873489 D248 -F265 -0.0908923198847029 A281 -F289 -0.0915748513046459 A244 -E249 -0.0922793086464306 D254 -Q286 -0.0926911964619221 H258 -K285 -0.0937729165215674 F246 -A277 -0.0939603511903089 E249 -A257 -0.0949770222913949 R253 -A277 -0.0951441772520765 E249 -D254 -0.0956131934050884 E249 -Y259 -0.0964071484361884 F246 -V266 -0.0980320309383298 F246 -F265 -0.0990319091623926 I267 -L284 -0.09948469633974 R250 -L284 -0.0995059496357804 R253 -F265 -0.0996995019571765 I255 -F289 -0.100102037242718 D251 -I267 -0.100993913363669 S270 -L279 -0.101255008158531 P272 -M280 -0.102244411654655 D254 -F289 -0.103019885998187 L236 -I241 -0.103636099892103 D248 -R283 -0.104894244806317 L279 -G288 -0.105559676641452 E249 -I267 -0.105563408292625 Y239 -A277 -0.106541270935268 D248 -V275 -0.10663968241031 D248 -Y268 -0.108966499025554 A247 -H258 -0.109656265399796 E274 -L284 -0.110291003518436 V256 -L279 -0.111002937314987 L252 -L279 -0.111311665251045 P260 -A290 -0.111568346554267 P260 -L284 -0.112744584085459 R250 -A257 -0.11345185671719 S270 -M280 -0.113924304522689 P260 -F289 -0.113925105299805 I267 -Q282 -0.114255314581689 I255 -K285 -0.114430977743404 A261 -F289 -0.115208678173742 I255 -Q286 -0.117489469361868 Q245 -M280 -0.118464637298765 Y239 -F246 -0.120400051995476 L252 -A290 -0.121722203402731 I267 -P272 -0.124025970434272 E249 -V256 -0.124211931424767 D254 -G288 -0.124501821953254 K264 -M280 -0.125433243413675 D237 -N273 -0.126882791135564 R253 -F289 -0.128439047246531 L252 -F289 -0.128694626171746 R253 -L279 -0.128912904081868 I267 -Q286 -0.131532440275749 Q282 -A290 -0.131683563212276 A247 -V256 -0.132878230693802 D254 -L284 -0.133467866745602 F246 -D251 -0.134756256968659 D254 -M280 -0.135521256632223 R250 -A278 -0.13715865486353 A261 -K285 -0.137434173838856 K264 -A287 -0.138008615519654 L279 -K285 -0.142177691821657 D248 -E274 -0.142430088663974 A257 -F265 -0.143362107521587 K264 -A277 -0.143697989632517 E249 -A281 -0.146696367710405 R283 -F289 -0.14989505532011 F265 -E274 -0.150627317071987 I241 -E274 -0.151427026309305 Y259 -K264 -0.152057334882859 P272 -L279 -0.153191602161526 R250 -M280 -0.155115667701985 F265 -M280 -0.155239829698226 K264 -R283 -0.15616213860963 H258 -F289 -0.157836903669916 F265 -Q286 -0.158646938657685 V256 -I267 -0.159116062310334 F246 -Y268 -0.159175672716178 Y259 -F265 -0.160795758483352 I267 -V275 -0.161481062995507 V256 -M280 -0.161538087597087 K264 -A278 -0.162154258725077 P272 -A277 -0.164038671124203 Q245 -L252 -0.165351756254403 A244 -L252 -0.165358657446167 D248 -R253 -0.165581606233924 C269 -Q282 -0.166963846589495 P260 -F265 -0.170322191707002 D254 -A281 -0.170852884025476 V256 -R283 -0.17164226034056 A257 -G288 -0.17182171042827 D248 -A257 -0.172054141414617 D237 -A244 -0.172154098591565 A277 -L284 -0.172254731733959 E249 -F265 -0.173731702304061 H258 -F265 -0.174995555728977 F246 -I255 -0.176162195056027 A278 -F289 -0.177515953112954 E274 -A281 -0.179611659156816 R253 -M280 -0.181980023465186 E249 -L284 -0.187853847861298 A247 -R253 -0.188379972108984 Y259 -L284 -0.191584323683129 D248 -D254 -0.191896213341278 A281 -A290 -0.192084769798445 R253 -A290 -0.192925407240119 E249 -I255 -0.19518673606944 F265 -K285 -0.195908070505263 A261 -A290 -0.19648063052557 V266 -L284 -0.197703154424452 L236 -S270 -0.198240497579404 L252 -Y259 -0.198516690630126 K264 -Q286 -0.200326141948049 I241 -Y268 -0.201271252175598 Q245 -K264 -0.201317832365372 E249 -Y268 -0.203663310982954 V256 -G288 -0.205237855106841 I241 -F246 -0.205437558248734 K264 -L284 -0.207440347310598 A277 -R283 -0.209908726653522 D251 -C269 -0.210070979065207 P260 -K285 -0.210305783719958 N273 -A278 -0.216561566204203 Y268 -M280 -0.216778955857834 D248 -M280 -0.219255039020348 M280 -A287 -0.221887262058137 F246 -L252 -0.222848345257111 Y239 -C271 -0.224803617419412 V266 -L279 -0.228755631174144 A247 -M280 -0.229048746487099 A247 -D254 -0.231353023210328 Q245 -F265 -0.235534650155816 L279 -Q286 -0.235876770550562 P242 -C269 -0.236598499400661 A244 -I267 -0.242936606010851 V256 -K285 -0.245727065286976 A281 -A287 -0.249001351801819 L252 -I267 -0.251914527630596 D251 -Y268 -0.252424166569671 Q282 -G288 -0.259382271075555 D237 -E274 -0.261936281269298 I267 -R283 -0.262111698687487 Q245 -V266 -0.263408658206826 F246 -I267 -0.264004861908305 E249 -P272 -0.264805398125502 Y268 -V275 -0.265714447415693 A244 -Y268 -0.265762094649068 D251 -H258 -0.266431120842788 I255 -P260 -0.270459405531869 D248 -Y259 -0.273663726825676 Y268 -A281 -0.277052521874899 L252 -A287 -0.277362171038725 A257 -L284 -0.283553142542571 P238 -S270 -0.284555532718156 R250 -V275 -0.287157707294183 E249 -A278 -0.28744947972618 A278 -L284 -0.289796973765217 I255 -L284 -0.290106287856005 V266 -A290 -0.29441274524088 V266 -M280 -0.299311366717065 L252 -A257 -0.302649029554087 Y239 -Q245 -0.306698176197638 F265 -A281 -0.311944168211319 L252 -A281 -0.313019854665178 M280 -Q286 -0.314643483090433 V275 -M280 -0.320570400168886 V275 -A281 -0.322381117837574 T262 -A290 -0.328422476113848 A278 -K285 -0.333333227675449 V266 -A278 -0.353000893002637 A257 -A287 -0.353765135145946 Q245 -Y268 -0.354851119084366 K264 -A281 -0.358267091742187 Y268 -A277 -0.359359347687708 F265 -F289 -0.371591229093368 T262 -F289 -0.373525488123747 C269 -A278 -0.38035490376795 L279 -L284 -0.405155323027078 V266 -A277 -0.443116280618201 L236 -C271 -0.449161960859747 S270 -A277 -0.472294994262004 H258 -Q286 -0.481567240577565 S276 -A281 -0.493717532459666 S270 -S276 -0.525213746287585 C269 -L279 -0.527383784676586 Y268 -E274 -0.692827531530654