[Fri Aug 26 16:48:38 2016] >Input file: TMQ63RA9M1D.pdb >TM segments: 206-288 MAIDEN score = -22.3480 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- K212 -K217 1.89347173479535 K206 -K217 1.29662434362953 A207 -K217 0.894254046312311 R222 -I229 0.575372988726303 N269 -G274 0.561272085125667 N208 -K214 0.433373390618358 V271 -R276 0.414286819580214 A224 -I229 0.398794688209684 K212 -E218 0.393809804781313 K217 -Q225 0.382955744756223 I270 -R276 0.367153413106907 K206 -E218 0.359693324109272 I229 -S234 0.336225687795928 K261 -K267 0.314755062569676 P268 -E275 0.309911854816814 D277 -V282 0.262473524746362 K206 -Q220 0.256478526286267 K212 -R219 0.252607320818024 K206 -K214 0.250512214499194 G231 -G239 0.24951975786829 L226 -G231 0.24753965961606 G250 -Y258 0.245504916213907 G236 -G244 0.233296529581771 V262 -K267 0.232082115008218 Q227 -G236 0.224742798694595 G248 -S255 0.221782949678679 G244 -N252 0.221116940428661 E275 -V280 0.220215998754898 K214 -R222 0.215620369113641 L240 -T247 0.206513198054386 A207 -D216 0.206406574835624 K206 -A221 0.201712059233989 R264 -N269 0.197741940495249 N269 -D277 0.197738484852741 S234 -S243 0.194328120805958 L240 -G248 0.17962179210014 P256 -R264 0.177507421639474 P268 -A273 0.172173194300486 R222 -Q227 0.171324116682967 E218 -Q225 0.17101910136629 Q225 -G231 0.166503678740064 A221 -G232 0.16512678326008 K206 -R219 0.164349518410145 S255 -R263 0.163987668392734 A209 -D216 0.163308241358027 G239 -T247 0.156733584530558 K206 -Q225 0.150188372115389 R276 -A284 0.14463701872368 A259 -R264 0.143239898784394 N269 -S278 0.140133706548406 N208 -K217 0.139084718050604 D277 -R286 0.137091018403297 E238 -G246 0.133758333248806 P256 -R265 0.132934464988841 A210 -D216 0.132520233155744 G237 -T245 0.132374535744362 P268 -D277 0.13227813323699 Q225 -S234 0.128296656724342 G237 -G244 0.126386117263369 A207 -R219 0.124556933434745 G228 -E238 0.123240126774684 D216 -A221 0.119957284360607 G257 -R263 0.119448178305651 N208 -A213 0.106779360999266 A213 -A221 0.10584289894396 Y258 -R263 0.103260828220661 K267 -D277 0.101209267045293 A207 -A224 0.101093013863096 I270 -L279 0.0982542981016632 N208 -E218 0.0979394448210629 V266 -G274 0.096019686447643 S278 -C287 0.0956906496514509 G228 -G237 0.0945716297952552 K242 -G250 0.0931135182089673 A209 -L215 0.0915937136527416 G235 -G244 0.0903331613626221 I229 -G237 0.088571642012246 G251 -A259 0.0863915783641733 V262 -I270 0.0841757915249497 A241 -G248 0.0820599848722985 G239 -G248 0.0806823842535271 A221 -G228 0.0788541400394678 A213 -L223 0.0780301094348754 R263 -V271 0.0767267598754958 E238 -S243 0.0762224276631898 A221 -A230 0.0752656693517828 R264 -V271 0.0751487682087122 A209 -E218 0.0748514538298277 A207 -K212 0.0742941357047506 G248 -G257 0.0740219710808803 A207 -L215 0.0730193544555471 G237 -G246 0.0713482456067816 L215 -Q220 0.0695919422269269 N208 -A221 0.069257543667832 V266 -A273 0.0689422656634275 A209 -A221 0.0682581901491095 S278 -R286 0.0671253828833533 K267 -E275 0.066494092239334 T247 -S255 0.0651814280909386 R219 -A230 0.0647551582396508 A253 -R263 0.0645984034372113 S243 -S249 0.0631461384851213 A213 -E218 0.062468860989009 Q220 -I229 0.0609582435607643 A210 -L215 0.0604990726497157 G236 -S243 0.0600850037387755 V262 -N269 0.0594628803395205 A241 -S249 0.0586746744111322 S243 -N252 0.0562943572416588 R263 -A273 0.053563898113969 G244 -A253 0.0494094116401209 S243 -G251 0.0476856692852679 I270 -V280 0.0461865315067929 A230 -E238 0.044137686606188 A241 -G250 0.0433875639921526 G244 -G251 0.0432983365925246 Q220 -G228 0.0416458065134044 K267 -G274 0.0398137518020221 Q220 -G231 0.0362473967514063 G228 -G239 0.0358117587504498 R265 -V271 0.0353999722042382 P268 -R276 0.0337609695956862 S249 -G257 0.0334136378584244 G235 -S243 0.0332199291252073 N252 -D260 0.0286248135538863 G250 -A259 0.0273579898796843 E275 -V283 0.025911502907183 G233 -A241 0.0232647374878772 Q225 -G235 0.0224783691754125 S249 -Y258 0.0224307254292162 G274 -T281 0.0224232433924656 L223 -G232 0.0189538367947222 V266 -W272 0.0186967145548393 G246 -S255 0.0180528446199038 L223 -I229 0.0174915423276119 K206 -L223 0.0146859428567643 G250 -P256 0.0137329069218217 R264 -A273 0.0129047965404512 G232 -A241 0.0124450381788739 D216 -A224 0.011654135401348 P256 -V262 0.0114922053364781 S234 -K242 0.0113035983304637 A253 -K261 0.010002633096768 G228 -G233 0.00954970330950711 A211 -Q220 0.00723158377664923 R222 -G228 0.00636490769314291 A259 -P268 0.00612128659504552 A209 -Q220 0.00571718161997925 L226 -G235 0.00480589864719239 G233 -K242 0.0043312737304515 G250 -D260 0.00335567039993664 K206 -A211 0.00325469157800928 A211 -K217 0.00290245898906805 L226 -G237 0.000428998447270401 E218 -L226 -0.00138541375305512 A254 -V262 -0.00279789870449365 Q220 -A230 -0.00429838668535343 G246 -A254 -0.00574613154658543 A230 -G239 -0.00884098172648073 E218 -Q227 -0.0100851685403648 A224 -G233 -0.0105492917099261 R264 -I270 -0.0110275916740079 R219 -A224 -0.0110829149415326 G232 -L240 -0.0114396132232497 Q225 -G236 -0.0114627045348263 G236 -T245 -0.0120826473108693 Q227 -G237 -0.0127850104382721 Y258 -K267 -0.01362607123838 G257 -R265 -0.0157108660337406 A210 -Q220 -0.0210579926853205 Q227 -G235 -0.0212770618111766 R222 -G231 -0.0219605974611565 K261 -I270 -0.0220082052137931 V271 -V280 -0.0269732197933026 K212 -A221 -0.0281747597232029 L279 -T288 -0.0291835501569881 D260 -I270 -0.0291968211773631 R219 -Q227 -0.0345834328880601 G235 -K242 -0.0357458604598764 G248 -P256 -0.0367352180802136 K206 -L215 -0.0378346459385135 N208 -Q220 -0.0389785484257545 I229 -G239 -0.0408913704519662 A211 -E218 -0.0414007298674463 V262 -P268 -0.0425141779858631 S278 -V283 -0.042741176348853 T245 -A254 -0.0431100039793713 I270 -D277 -0.0434093202362837 W272 -T281 -0.0444758305038264 A273 -V282 -0.0445390935455952 S249 -S255 -0.0470283999046677 Q227 -S234 -0.0494265722847798 A273 -L279 -0.0494785448037742 N269 -E275 -0.0509922477493232 K242 -S249 -0.0514892697544272 A253 -D260 -0.0515840184413969 P256 -V266 -0.05425938476295 D260 -P268 -0.0568591495217836 K206 -K212 -0.0572982937455713 A253 -V262 -0.057355538366537 Y258 -V266 -0.0585634163539659 S255 -K261 -0.0606450818351695 A221 -G231 -0.0608052073178342 K267 -A273 -0.0612644300974874 I270 -S278 -0.0622990702880308 I229 -E238 -0.0635297595541662 A213 -Q220 -0.0648946808210979 A207 -L223 -0.0656328362397574 L215 -R222 -0.0685250243097029 G232 -G239 -0.0689096105388494 Q220 -Q227 -0.0689703102256791 A213 -R222 -0.0698918404538595 K217 -L223 -0.0702684369076394 D277 -A284 -0.070570017893151 T247 -P256 -0.0722411889842143 A230 -G237 -0.0725004455708596 T245 -A253 -0.0737049404830885 S255 -D260 -0.0737379410043937 K267 -R276 -0.0743081628209108 A209 -K217 -0.0747477242776369 K206 -R222 -0.0748932763397896 G274 -V282 -0.0749430028041083 L215 -L223 -0.0756792717917705 G251 -D260 -0.077005683522382 N252 -A259 -0.0770458875711109 Y258 -R264 -0.079399252250608 V280 -T288 -0.0806449218121151 A210 -E218 -0.0813009720942626 S255 -R264 -0.0824634204063328 G246 -A253 -0.0838561726391167 R222 -G232 -0.0843361309659603 K214 -R219 -0.0845085872140365 T247 -N252 -0.0860131893923722 R219 -I229 -0.0871940636090116 L240 -T245 -0.0879982944282585 K242 -G251 -0.0880220270327756 L223 -G233 -0.0882047852695464 E275 -A284 -0.088743370646325 L226 -G236 -0.0896422973469289 A207 -Q220 -0.0903497714130808 K217 -R222 -0.0907879538271601 D216 -Q225 -0.0912843870967518 K261 -V266 -0.0928643553898016 N269 -V280 -0.0933482807965054 G257 -V266 -0.0941703086593817 G274 -V283 -0.0942393877415086 L240 -S249 -0.0947128693918247 A224 -G232 -0.0950243828685842 K242 -G248 -0.0951553713200206 Q225 -A230 -0.096904451900949 Y258 -R265 -0.0981476974083796 A207 -K214 -0.0987498979007086 G246 -N252 -0.100645144011154 G244 -G250 -0.105907116782847 E218 -L223 -0.107015525651017 G231 -L240 -0.107787573444602 G228 -G236 -0.109149045773935 T247 -A254 -0.109604358909406 G251 -Y258 -0.113284578992736 A273 -T281 -0.113843026730092 G257 -R264 -0.114516115895965 G233 -G239 -0.114767928050545 R263 -N269 -0.115565995089199 G231 -G237 -0.118018511553914 G239 -G246 -0.118868942534672 R265 -A273 -0.119160116844446 R222 -G233 -0.119354976390206 G232 -E238 -0.120516124977973 S243 -G250 -0.12281516688473 L240 -G246 -0.123339671362826 A224 -S234 -0.125294509035456 L215 -A224 -0.12802950029593 G251 -G257 -0.128144266366239 N252 -K261 -0.128658240993433 W272 -V280 -0.12998949706416 E238 -T245 -0.131610120192618 R263 -I270 -0.133752574709701 V271 -L279 -0.136217171717931 R263 -W272 -0.136352254156587 N208 -L215 -0.136389852247547 W272 -D277 -0.138517394916426 N269 -L279 -0.139541799044079 G236 -K242 -0.142651943484478 T245 -G251 -0.142776017800206 L223 -G228 -0.14440386325331 N208 -D216 -0.145061804417087 D260 -K267 -0.145188340809154 K242 -T247 -0.145395905925128 D216 -R222 -0.145567325605393 A207 -R222 -0.145952515045372 A209 -K214 -0.146479058369187 A207 -E218 -0.147062154379323 L279 -C287 -0.147568280959336 R219 -Q225 -0.150022825831213 G237 -S243 -0.150285933412004 G233 -L240 -0.155467632554325 A211 -D216 -0.156491503620057 G251 -P256 -0.156614753317457 T281 -R286 -0.156792916078577 A221 -L226 -0.157807654620305 D277 -I285 -0.160871916740918 E238 -G244 -0.160977175985404 E218 -A224 -0.161030161494034 R264 -W272 -0.16183898864384 N252 -G257 -0.163231415314063 R276 -V283 -0.163234632492527 R276 -T281 -0.164553007197079 D260 -R265 -0.165734994434245 K212 -L223 -0.166087444459471 V280 -R286 -0.166872353002767 G237 -K242 -0.168257486310373 G250 -G257 -0.170695090075877 S278 -I285 -0.170925027611194 Q220 -L226 -0.170976995067216 R276 -V282 -0.171063225468768 V282 -T288 -0.173359361789644 L279 -R286 -0.17391446750352 K206 -D216 -0.173965418014662 G257 -V262 -0.176279825648406 L223 -G231 -0.176320725322601 G231 -E238 -0.176359304953575 I270 -E275 -0.177028485845892 A209 -R219 -0.179605664031669 R222 -A230 -0.180719238629834 A210 -K217 -0.181562777436117 R265 -W272 -0.181792830979711 G228 -S234 -0.182358414358021 A207 -A221 -0.18266766965949 R276 -I285 -0.183026574836182 N269 -R276 -0.183731619868988 A254 -R263 -0.186023708233744 A211 -R219 -0.186303961069092 G239 -T245 -0.187017216303356 V283 -T288 -0.187051191978243 T245 -N252 -0.187133357069956 G248 -A254 -0.188294504889265 K212 -Q220 -0.188660222005169 A241 -T247 -0.190769317130801 K214 -Q220 -0.191756645120376 A259 -R265 -0.193296784813936 V280 -C287 -0.19768574305775 S234 -A241 -0.197879799796417 A259 -V266 -0.197989901681122 T247 -A253 -0.19891394142041 K212 -R222 -0.199176653374774 E238 -T247 -0.200809490400133 P268 -G274 -0.201173532442759 K206 -A213 -0.201574417670281 I229 -G236 -0.202201126883252 R219 -L226 -0.202815065078527 S243 -G248 -0.203705109473423 L226 -S234 -0.204022822996296 A213 -R219 -0.204640491745872 Q220 -Q225 -0.204926088760256 E275 -T281 -0.205281413639865 W272 -S278 -0.205676851852194 Q225 -G233 -0.205873156318308 G274 -V280 -0.205983708256721 G239 -G244 -0.206069932375863 A221 -Q227 -0.209953894879194 G233 -E238 -0.218088222749383 K214 -L223 -0.219049947485787 W272 -L279 -0.22359495616708 G250 -S255 -0.224910062009265 K261 -P268 -0.225372538143231 S278 -A284 -0.227732731256354 A253 -A259 -0.228346258503083 T281 -T288 -0.229383988331234 A254 -D260 -0.229582336031043 A207 -A213 -0.22966811888083 Q227 -G232 -0.231452604324419 G235 -A241 -0.233095296784298 A221 -I229 -0.234865497968886 G244 -S249 -0.234912480977993 K217 -L226 -0.238443368860723 A224 -G231 -0.238655855262182 L279 -A284 -0.248815070241483 A230 -G236 -0.252765067020645 R263 -P268 -0.255885808304237 I229 -G235 -0.257654210067122 S234 -G239 -0.258841225966064 L226 -G233 -0.260617805839771 D260 -V266 -0.263552659709991 K206 -A224 -0.266810704445813 K217 -A224 -0.274027762546122 L215 -A221 -0.27538230687808 G228 -G235 -0.276612321700354 S249 -P256 -0.276739250601772 A253 -Y258 -0.28056552648017 V282 -C287 -0.281851555648053 E275 -V282 -0.283871335572373 D277 -V283 -0.28414906001839 L223 -A230 -0.285993401051726 V266 -V271 -0.288251020748639 V271 -D277 -0.291516969296293 Q227 -G233 -0.292883057543589 D216 -L223 -0.299077751767668 A273 -V280 -0.302786586779953 K267 -W272 -0.313328151883793 S255 -V262 -0.31519313596207 P256 -K261 -0.331027131097631 G248 -A253 -0.331732119574061 S234 -L240 -0.334000677246047 V271 -S278 -0.335016052526129 R265 -I270 -0.3385038509675 A254 -K261 -0.348783889213376 A259 -K267 -0.349177911537782 K214 -A221 -0.354438154075585 T281 -C287 -0.359072027046396 T245 -G250 -0.362267442961863 Q225 -G232 -0.36415248786293 G235 -L240 -0.391573332170349 G232 -G237 -0.399687149593543 A254 -A259 -0.40866312634981 V280 -I285 -0.411352193016743 G246 -G251 -0.414027933199893 G231 -G236 -0.41456582257321 G274 -L279 -0.417360443989616 L279 -I285 -0.417773011898353 N252 -Y258 -0.419052094227563 A273 -S278 -0.420366106356926 L226 -G232 -0.422390954749476 A224 -A230 -0.423329560438622 A241 -G246 -0.470397139148446 G236 -A241 -0.476133277862475 P256 -R263 -0.477702220870029 A230 -G235 -0.478585583817206 S249 -A254 -0.541204791891698