[Mon Aug 29 17:22:05 2016] >Input file: TMQ6GP81M1G.pdb >TM segments: 17-41 MAIDEN score = 15.6116 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- V23 -F32 10 L21 -M30 1.23982565685833 P19 -V24 1.20413629056621 V23 -T33 1.09406304060255 V23 -F31 1.00068579273281 V24 -F32 0.875012410153282 L25 -T33 0.826212142664608 L26 -T33 0.823400564899825 H20 -L26 0.82254690501656 P19 -L25 0.656245400577362 H20 -L25 0.576859223112714 T22 -T33 0.54399379784997 L25 -M30 0.52042945529357 L21 -F31 0.472977742729682 V23 -W35 0.339595559451073 V24 -M30 0.339518718090503 L21 -A27 0.337902136688357 L26 -A34 0.334736261513561 L21 -I28 0.288268605415801 V23 -Y39 0.286026881090656 H20 -A27 0.275630069444797 T22 -G29 0.259081133373009 G29 -W35 0.233021494303645 F31 -Y39 0.22505740584569 V23 -F36 0.210661761403768 M30 -V38 0.206832938086923 V23 -M30 0.193266258591082 T22 -F36 0.181815184688681 F18 -G29 0.181749543066871 V24 -F37 0.177011950749339 I28 -A34 0.172397256254874 V24 -T33 0.172264909650391 W35 -E40 0.155579046074373 F18 -A27 0.131985876692365 H20 -G29 0.12792539575977 V23 -A34 0.12551030687418 A34 -V41 0.120135689025934 M30 -Y39 0.118853555300308 F18 -F31 0.101514288450773 F31 -F36 0.101291105013388 F18 -F32 0.0977874906220464 T22 -M30 0.0917717758079253 V17 -I28 0.0825014078965181 L26 -V38 0.0787259015511645 P19 -I28 0.0753550937351308 V17 -G29 0.07333298543975 F32 -E40 0.0580852066151776 L25 -W35 0.0524528283784385 T22 -F32 0.0520331412154502 H20 -F32 0.0513276583224878 P19 -G29 0.0470037338208853 L21 -A34 0.0458329739637171 A27 -F37 0.0449076799490609 H20 -A34 0.0419705191435281 F18 -T33 0.0400885214884878 V23 -I28 0.0382943284580817 T22 -F37 0.0374402046725848 T22 -F31 0.0369362972834879 V23 -V38 0.0303704878898472 L26 -F36 0.0285970857923632 F18 -L26 0.0276907166288811 P19 -F36 0.0207310387791786 P19 -T33 0.0174677787760165 L25 -F37 0.0173813343295104 P19 -A34 0.016404420716345 F36 -V41 0.0150193124086014 H20 -M30 0.0138796980610616 L25 -A34 0.00401861563336214 T33 -V41 0.00222828995147051 F18 -I28 -0.00617446662989174 V24 -V38 -0.00631634671553627 M30 -F37 -0.00820150323525953 A27 -W35 -0.0108023744575996 F31 -V38 -0.0121959944368299 V24 -G29 -0.0134955599436175 F31 -E40 -0.0154447471527559 I28 -W35 -0.0173977508549612 V17 -F31 -0.0189962051387176 V24 -Y39 -0.0193283294914544 V17 -F32 -0.0231414716644558 L26 -W35 -0.0250688649697537 V17 -A27 -0.0416345936245177 H20 -W35 -0.0431594202120511 V24 -F36 -0.044983174236803 L25 -F32 -0.0508681839760765 G29 -F37 -0.0515734017613038 W35 -V41 -0.0534158405735035 F18 -V23 -0.0535257271568312 H20 -I28 -0.0611463659153348 V17 -T33 -0.0621367509671256 V17 -T22 -0.0657458414162075 V17 -L26 -0.0666941834182424 L25 -F36 -0.0714158279995702 V23 -E40 -0.0731239772168006 L21 -L26 -0.0736234910601423 T33 -Y39 -0.0742233949532523 V17 -M30 -0.0786232580988497 L21 -W35 -0.0787571505734324 T22 -A27 -0.0835278178794077 L21 -F36 -0.105519705536599 L25 -V38 -0.111099635096086 L26 -F31 -0.113646732299905 P19 -A27 -0.113689582929876 A27 -T33 -0.122465112776545 M30 -W35 -0.12343516540902 T22 -A34 -0.12752036195601 H20 -T33 -0.128840424923675 G29 -F36 -0.131214565835593 H20 -F36 -0.134445338246433 I28 -T33 -0.135006792735093 A27 -F36 -0.139885093249055 L26 -F37 -0.143721874581106 F32 -F37 -0.144349785369089 P19 -M30 -0.146243345955857 T33 -E40 -0.146394999444256 A34 -E40 -0.148234284736224 A27 -F32 -0.15176407715492 L25 -F31 -0.154045135721457 P19 -W35 -0.163765538952644 F32 -Y39 -0.170191087380151 H20 -F31 -0.172365613685411 V24 -E40 -0.177380520979094 F31 -F37 -0.181768840975562 L21 -F32 -0.200696599507715 V17 -L25 -0.20079317231945 P19 -F32 -0.205129732456437 F18 -L25 -0.206195872261945 V23 -G29 -0.20676835319416 T22 -I28 -0.211835444034228 F18 -V24 -0.212158508858569 L21 -G29 -0.212411604562382 V17 -V23 -0.232256695119945 T33 -V38 -0.233691512187273 A27 -A34 -0.233996094248595 F18 -M30 -0.241359066018759 P19 -F31 -0.254842777882646 M30 -F36 -0.255823124834605 G29 -A34 -0.267037776366048 V24 -A34 -0.267871726348566 V23 -F37 -0.268140007492107 L26 -F32 -0.306241739597089 L21 -T33 -0.306329225842745 T22 -W35 -0.317748494785078 V24 -F31 -0.330269074196677 A34 -Y39 -0.344297163589359 V17 -V24 -0.35150999979676 F32 -V38 -0.359784557287839 V24 -W35 -0.379525620370307 P19 -L26 -0.383572345947393