[Fri Aug 26 17:57:49 2016] >Input file: TMQ6YI46M1D.pdb >TM segments: 32-75 MAIDEN score = 0.4164 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- R35 -A64 1.03524965833131 L33 -L65 0.908506440640596 R35 -A56 0.908236489064087 L33 -L66 0.904692510198365 P34 -A54 0.903179471825564 P34 -R45 0.877216260707696 P34 -A59 0.821515164483205 P34 -A64 0.777414414276439 R35 -P42 0.699940875149888 R48 -S53 0.643095806957657 P34 -L66 0.588047803008626 D44 -A54 0.584897721351535 P34 -L65 0.531542504459972 R35 -A55 0.507257527715838 R45 -S53 0.471514985123642 P34 -A43 0.44947347064337 R35 -L65 0.438735896469663 A37 -A55 0.384677573484091 P47 -A54 0.36273086628321 A55 -A68 0.361492406142931 A59 -L65 0.356488409078793 A32 -L66 0.354996397784205 S53 -A58 0.354207244637608 A54 -G63 0.329973712716977 S53 -L70 0.326567676551639 A55 -G63 0.311231946832852 A58 -G67 0.296716168500442 A54 -A64 0.295860840566787 A60 -L65 0.289401769872271 P47 -Y69 0.286536192301932 L33 -A61 0.286238143085766 R48 -L70 0.284182829207871 R45 -A55 0.283324696018993 A59 -A64 0.270387728925508 G49 -L70 0.258263822320553 G38 -A57 0.250741327866831 R35 -A68 0.244649680778295 P47 -L70 0.244195286627896 G38 -G63 0.243908019352444 A37 -A57 0.243437972794055 S53 -A60 0.233728745896023 L46 -A52 0.233699800059116 A59 -Y69 0.231823643208645 A43 -A52 0.231699674738985 G38 -D44 0.228896382722598 L33 -A64 0.22528042141236 R48 -A68 0.222600290305651 G38 -S62 0.221625068963176 A52 -A57 0.208467574941396 G36 -A68 0.205746455410749 A56 -A64 0.203906554480032 A32 -A43 0.198281763724404 L33 -G38 0.195704145609817 A37 -A60 0.192508850767245 L33 -D44 0.189515282249213 Y69 -G74 0.17943420874603 S53 -G67 0.178421281480359 G38 -A56 0.177577113894349 L46 -G51 0.177262365415671 R35 -P47 0.175780867888293 R35 -A52 0.174091494564509 D44 -A61 0.173438145753365 D44 -A60 0.172842858935861 G63 -Y69 0.172053819184901 A37 -D44 0.169187716698756 L70 -P75 0.167470270863188 G39 -A58 0.167365960101692 A52 -G67 0.166173438315181 R45 -A58 0.165257982482554 P42 -S62 0.164485387044302 A57 -G67 0.164113443787353 G49 -A55 0.163095485729125 G41 -A55 0.161636831452177 G41 -A54 0.161636831452177 G36 -D44 0.16160541680645 Y69 -P75 0.161110735528245 A32 -A61 0.160719298466079 G36 -R45 0.158078744180856 L33 -P42 0.157685484893291 L46 -A54 0.154561912802229 A54 -G67 0.151246440752678 P47 -A52 0.148868557851516 G51 -L70 0.146761727770137 A55 -A60 0.142653029905623 G41 -A61 0.137529042035063 G39 -S62 0.132133071213393 R48 -A55 0.128544418816971 P42 -A59 0.123796456112667 A52 -Y69 0.123560205549127 P42 -A55 0.123486037054191 A32 -A60 0.118966060847469 P42 -A60 0.117766285485086 R45 -A57 0.11734176047384 G51 -E71 0.117066246361161 G36 -G51 0.116216622505058 G41 -A60 0.115920394799757 L33 -L46 0.115467099638665 P42 -A61 0.113775780293121 A55 -L65 0.113739612671683 A43 -A58 0.113667861595655 A61 -G67 0.113113110823821 A43 -A57 0.113072857091751 R45 -A68 0.111694219275267 A55 -Y69 0.10885969438171 A56 -L66 0.107946981533654 A32 -R45 0.107859070781108 G51 -A58 0.106769520259286 G49 -A54 0.106552556946329 A60 -G67 0.106269460729158 R45 -A60 0.104420153487014 G39 -A57 0.104411166482961 S53 -A59 0.104157647327263 G36 -G67 0.100657396290078 A37 -A59 0.0996284191777154 L46 -A58 0.0991419088460193 A43 -S62 0.0973965498733405 A37 -L46 0.0973132755922166 S53 -A64 0.0960699096362099 A57 -A68 0.0959704865082265 L33 -A56 0.0953655984590785 A37 -A56 0.0951672130022878 A55 -A64 0.0932594253353458 A61 -A68 0.0912675162302761 A55 -L70 0.091039894968336 A52 -L65 0.0902304778550196 G36 -G41 0.0894444964899881 G36 -A58 0.0878259480365378 L33 -A55 0.0872839653508211 G39 -A55 0.0866096455561567 A54 -Y69 0.0855710027261845 A56 -L65 0.0843951214289964 A32 -A59 0.082214200690474 S53 -G63 0.0817129731919686 D40 -A60 0.0807292095815382 A56 -A68 0.0801581631659487 G38 -S53 0.0779979362044172 A55 -S62 0.0778009333998617 S53 -H73 0.0766466837982274 S53 -L65 0.0762909862505037 P34 -D40 0.0753016415870555 L46 -A64 0.0734439517743208 P47 -A59 0.0720989107700261 A68 -H73 0.0718076092811764 A32 -P42 0.0713232042440524 L46 -A61 0.0687143509444459 A43 -A64 0.0678855211965956 L46 -A57 0.0662213950034896 G41 -S62 0.0661600780394513 L46 -A60 0.0658173483395767 G36 -L46 0.0634555557884875 A52 -R72 0.0629418946107015 L46 -G67 0.0628111026700839 A52 -A60 0.0622167709717258 G51 -A57 0.059821141153064 A57 -A64 0.0584518024075011 G49 -E71 0.0579308754448615 D40 -S62 0.0576394477977533 A54 -L66 0.0573519603673334 A32 -A68 0.0570579007063916 G50 -A55 0.0532912601276081 P42 -A54 0.0529381831762974 A57 -L65 0.0526101971789801 D44 -S62 0.0518051771211367 G39 -G63 0.0504966215685747 A37 -A52 0.0484201672453811 A32 -A54 0.0472567105584477 G49 -R72 0.046192669970428 A32 -L65 0.0460048100875348 R35 -S53 0.0430327821367653 A60 -L66 0.042338545856984 P34 -A52 0.0421155740392187 L33 -G39 0.0418267492468567 A60 -A68 0.0402432498251608 G38 -A58 0.0370559254522789 L33 -R45 0.0365676176642449 R45 -L65 0.0338980450359028 A32 -G41 0.0329453952512382 A54 -S62 0.032359967632881 L65 -L70 0.031966909198637 L33 -G41 0.0308289836966034 D44 -L66 0.0292088729279965 A32 -L46 0.0278072316762943 A43 -S53 0.0262961406742508 G51 -R72 0.023689662100371 A37 -S53 0.0195320505045684 A43 -G63 0.0177946318384816 D44 -A57 0.0176959844861924 P34 -L46 0.0175599947684617 G39 -D44 0.0150323157784649 A37 -A43 0.0128814524230343 A32 -A37 0.0127676954191589 A43 -L65 0.0120562233487798 A52 -A68 0.0118037533725452 D44 -A55 0.0117472919642951 G36 -A61 0.011441523223386 R35 -G67 0.00979908623386513 L46 -L66 0.00851926494909883 G41 -A56 0.00754333914601046 R35 -A54 0.00695266025877217 R35 -R45 0.00680788629108209 A32 -S62 0.00621382793497283 A54 -A61 0.00452915517583463 R45 -Y69 0.00381543690309383 R35 -Y69 0.00205935909905366 R35 -G63 0.00199525927817978 A56 -A61 0.00189064786539461 P34 -R48 0.000999627614936216 A37 -L65 0.000615626719153717 G36 -L70 0.000428998447270401 G41 -A59 7.70206038440691e-05 S62 -G67 -0.000147285796947116 D40 -G63 -0.000213201937147578 R35 -D40 -0.000600714897607268 P47 -G67 -0.00180480188519905 P34 -Y69 -0.00331763301483878 G38 -A64 -0.0037375987190984 A52 -L70 -0.00554104854545123 P34 -G41 -0.00624483763596229 A37 -A68 -0.00665806861192753 G36 -P47 -0.00760038809190955 S53 -E71 -0.00911992870654998 G50 -L70 -0.0116301951220663 A32 -G38 -0.0126281257431282 P42 -A64 -0.014382238911602 G36 -L66 -0.0150933558765474 R48 -E71 -0.0161298644645003 G36 -A57 -0.0182813586868944 A32 -G63 -0.0185790734998623 A64 -Y69 -0.0185791427839481 G39 -A64 -0.0208185126668727 S53 -R72 -0.0209528620613106 D44 -G51 -0.0217467320227437 D44 -A58 -0.0221495870120729 G39 -A59 -0.0242442505610576 P47 -A58 -0.0242619908203389 D40 -A64 -0.0250605552675056 D44 -A68 -0.0253010416112298 A61 -L66 -0.0256938996736977 G41 -A64 -0.0281795239138596 D44 -S53 -0.0282149374347092 D44 -L65 -0.0284071545302731 G50 -E71 -0.0295444937083817 S53 -Y69 -0.0307214981505912 G38 -L65 -0.0324768513034354 D44 -A56 -0.0336154093707126 R45 -G51 -0.0349013584454427 G38 -L46 -0.0362095643307696 A58 -R72 -0.0406620903435737 A52 -E71 -0.0410652192726422 D44 -A64 -0.0421917147030308 A55 -G67 -0.0424054657650785 G51 -A56 -0.0453609455309918 A59 -L70 -0.0462989167901764 P34 -A57 -0.0465538729866274 P42 -A56 -0.0466455494220206 P47 -A68 -0.0466853584459706 G51 -Y69 -0.0483589280797192 S53 -A61 -0.0485768669418789 G51 -A59 -0.0488508681725426 P34 -G67 -0.0493317043169159 R45 -A64 -0.0507862450629695 L46 -L70 -0.0515665777031762 G38 -A52 -0.0519222839246316 D44 -G50 -0.0550351332620851 R45 -L66 -0.0565432757968631 G38 -A61 -0.057277456384428 G51 -A68 -0.0577894535531138 R35 -A58 -0.0584359518123552 D40 -A56 -0.0593678780103084 G39 -A54 -0.0603011057930417 R48 -R72 -0.0638026760701176 P34 -G39 -0.0651256150804489 P47 -A56 -0.0668668105172121 G36 -Y69 -0.0682875834168444 A58 -E71 -0.0685725204256418 A54 -L65 -0.0694887757654561 A60 -Y69 -0.0708430650160832 G63 -A68 -0.0710997952212962 L33 -A58 -0.0733164011583884 A56 -G63 -0.074032230827604 L33 -D40 -0.0743010517194391 L46 -A56 -0.0745901570935867 A59 -G67 -0.0747363598185389 R45 -A61 -0.0757462864571776 A54 -E71 -0.0768675626967306 R35 -G41 -0.0780310984988901 P34 -A61 -0.0818374537764903 S53 -L66 -0.0819356402323494 L46 -S53 -0.0834006429611502 A58 -Y69 -0.0860994613254479 G49 -Y69 -0.0880603851880499 P34 -A55 -0.0884014683203042 G36 -S62 -0.0887021802819081 A57 -Y69 -0.09181758368881 D44 -G63 -0.096664279425756 S62 -A68 -0.0970815587446188 R48 -A59 -0.0989559870798118 L33 -S53 -0.101239102258225 G38 -A54 -0.104266756647243 L46 -Y69 -0.104880567098195 R35 -S62 -0.10509751304541 A58 -L66 -0.106890569885805 P34 -A56 -0.113057230364435 A58 -L70 -0.115724426959817 G36 -G63 -0.118244922252214 P34 -L70 -0.122045386752287 R48 -Y69 -0.122630438126382 A58 -H73 -0.122747657415449 A37 -L66 -0.123570674224235 R45 -G67 -0.124348583954052 A32 -D44 -0.125914225014011 D40 -A59 -0.127222644712288 G39 -A60 -0.128884942637574 A55 -L66 -0.129357210737621 D44 -A59 -0.13009110050151 G38 -R45 -0.130299296280046 D44 -G67 -0.132654188287969 P47 -A55 -0.136095262813336 A57 -S62 -0.139465551849733 G39 -R45 -0.145434987700688 P34 -A58 -0.145643673618487 R45 -L70 -0.150007357994207 R35 -L46 -0.150277853902642 G36 -A64 -0.151866937199047 L33 -A57 -0.153986720072057 L33 -Y69 -0.154671949853389 G36 -R48 -0.157880011371418 R48 -G67 -0.163641162546464 A57 -L70 -0.165384486770394 L46 -E71 -0.16544767801826 A43 -L66 -0.166482937751726 G36 -P42 -0.167446700695808 R35 -A57 -0.170460924873156 L46 -A59 -0.175640062816521 G36 -A52 -0.177845236982439 A52 -A58 -0.181011728881342 A43 -A59 -0.181672813379568 L33 -A68 -0.18222340069951 G39 -A56 -0.183182577974544 R48 -A58 -0.185722791602618 P34 -D44 -0.18575761305206 A37 -A64 -0.186903638134511 A55 -A61 -0.190445250847637 R45 -A59 -0.190583088268148 A56 -S62 -0.192457917332824 A52 -A59 -0.193825784235921 G38 -A55 -0.195751783700864 G36 -A43 -0.195830305852772 A58 -A64 -0.196861988733823 G36 -A54 -0.200038585048131 L46 -L65 -0.204489955359263 P34 -P47 -0.20568334451446 R48 -A54 -0.206605531984039 R45 -G50 -0.207036308899726 A43 -A55 -0.207081385971216 G38 -A59 -0.213455738133376 A43 -A61 -0.215871823041419 P34 -S62 -0.216702524531506 A58 -L65 -0.222762612542184 R35 -L66 -0.227739858424927 A43 -A60 -0.232826976484077 D44 -A52 -0.233343152294069 D40 -A61 -0.233573809927579 A32 -G67 -0.233900314418494 G39 -A61 -0.235838921734592 A43 -A56 -0.245510863769642 A37 -A58 -0.246137666510058 R45 -A56 -0.246987791148712 G36 -S53 -0.250695966636216 A37 -R45 -0.250808309491448 G36 -L65 -0.25346550505341 L33 -A59 -0.254864773364312 L33 -S62 -0.25582653014606 P34 -G63 -0.256249744706018 A54 -A59 -0.259952412153434 A37 -G63 -0.265530671438346 A54 -L70 -0.267416574182607 L46 -A68 -0.268472133194594 A57 -G63 -0.269561444918238 L33 -A54 -0.276550013923141 L46 -A55 -0.278511858719471 R35 -D44 -0.300039140138952 G36 -A60 -0.301467849435474 L33 -A60 -0.306655053169418 L33 -A43 -0.312637120579197 P47 -E71 -0.318534338850291 A58 -A68 -0.318682141926113 A59 -L66 -0.318769093513738 P47 -S53 -0.321640724485524 P34 -A68 -0.328128122926745 P34 -S53 -0.32894019116508 L33 -G67 -0.330326006791742 R35 -A60 -0.33077031939191 R45 -A52 -0.330944764221024 A37 -P42 -0.332035824672761 A37 -S62 -0.358970371297067 L33 -G63 -0.360223318531609 A37 -A54 -0.401439444771019 A43 -A54 -0.406098761983826 G36 -A59 -0.40620907224552 P34 -A60 -0.420100045362859 A58 -G63 -0.420188740433037 A54 -A60 -0.422501571181295 A54 -A68 -0.423858677271536 A59 -A68 -0.424775820185358 A32 -A64 -0.427826887561528 R35 -A43 -0.4510321640103 S53 -A68 -0.459648061599427 G38 -A60 -0.464042996462958 A37 -A61 -0.47665575074929 G36 -A55 -0.567078692062524 P34 -P42 -0.578087445935071 R35 -A61 -0.603601086696963 R35 -A59 -0.63361813170526 G36 -A56 -0.647922272008426 R45 -A54 -0.663953942834159 G38 -A43 -0.742441248164133