[Fri Aug 26 16:45:11 2016] >Input file: TMQ9D806M4D.pdb >TM segments: 50-68_ 72-99 MAIDEN score = 5.6300 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- W72 -V88 10 I64 -I77 1.85939312477531 I77 -P82 1.16408405264689 T63 -V78 0.994784835691157 I64 -V78 0.956080020085435 V74 -R95 0.894422496698793 W80 -F99 0.862451748892911 W66 -V74 0.74532655445649 V74 -V88 0.645710416265287 Q75 -V96 0.644246048447265 G60 -V78 0.624173667530904 K67 -W72 0.560389292162933 W72 -A86 0.524226906113276 E65 -P85 0.480013425321367 K67 -G73 0.444017280311336 I57 -P62 0.443786110949099 Q75 -P82 0.436448099652204 I50 -R95 0.414534899655033 Y68 -Q90 0.402873788729198 V74 -H92 0.393961704791264 E65 -I77 0.39309501615923 Q75 -H92 0.389575609685642 N87 -H92 0.373564082654969 P62 -V78 0.373348783814487 G83 -C97 0.369124681139883 Q75 -T84 0.360187376325182 P62 -K81 0.359599609438503 Y56 -V78 0.351878829432279 R76 -N87 0.35187382782348 E65 -G73 0.337827218124801 Q75 -G83 0.334403023412201 K67 -R76 0.32592731799215 I77 -C97 0.323665715700028 T63 -T84 0.322719941359204 I64 -Q75 0.315813381062187 V74 -Q90 0.308023380831868 T63 -T98 0.301546852989878 H59 -W80 0.29753828037564 E65 -V74 0.287864392337967 W66 -Q75 0.279005166531123 H59 -C97 0.27828242484674 W72 -S89 0.274011687757881 P62 -T98 0.26826419721939 E65 -V78 0.259678691223497 K67 -Q90 0.255786897546252 P85 -S91 0.250470470636747 K67 -Q75 0.244298963048536 P85 -Q90 0.238711014521614 T63 -C97 0.235331894158058 Q75 -V88 0.228089480910503 T84 -C97 0.226411574515262 S53 -K67 0.225650927913243 P82 -C97 0.222877261687695 C58 -C97 0.218304016010963 K67 -D94 0.20628312195504 T63 -R76 0.204645543422912 T84 -Q90 0.203016104816128 H59 -F99 0.201364626845123 I57 -C97 0.198529880047396 K67 -S89 0.192528715956741 T63 -G73 0.191523453038117 W66 -W72 0.184028059259771 Y68 -S91 0.182854641599497 D55 -R76 0.178928344893068 Q75 -R95 0.174247662639525 T84 -T98 0.173220433228171 T63 -I77 0.167558853630785 V78 -A86 0.165386008390609 D55 -T63 0.161835533191611 K67 -N87 0.161355527853893 P85 -R95 0.157634564858431 P62 -Q75 0.15207313211204 E65 -E79 0.149284170382068 W66 -T84 0.145951040319123 K67 -H92 0.143405657913717 L52 -Y68 0.143161659128428 K67 -T84 0.142093214953587 C58 -K81 0.141290031028561 P85 -H92 0.13907878082142 P62 -E79 0.138987591811448 H92 -C97 0.136714762434361 P82 -D94 0.13582857143437 P85 -R93 0.135683560814766 P82 -T98 0.130097772251666 Y56 -E65 0.128204451780425 G73 -C97 0.128169702152729 R76 -T84 0.127976453318388 N87 -D94 0.127608638693048 I77 -N87 0.127102436102734 G73 -A86 0.127024558416591 C58 -I77 0.125932081685622 K67 -C97 0.123943819931256 I57 -T98 0.122273194923697 W66 -R95 0.121527475451499 A86 -R93 0.120427909447401 K81 -R95 0.118241625371458 W66 -A86 0.117919396750818 W66 -G83 0.116447677174825 P62 -I77 0.113059889177525 T84 -D94 0.112236012507555 K67 -A86 0.111871073807107 V54 -P62 0.110125474852502 P82 -R93 0.109414554533541 I50 -C97 0.108347231083389 R76 -T98 0.107730454986237 W66 -H92 0.107143694837667 W66 -P82 0.10630828129436 D55 -E65 0.104027597555209 L51 -V74 0.103683491817637 H59 -T98 0.101338900866542 R76 -S91 0.101100797448315 D55 -W66 0.100244712299108 I57 -I77 0.098895952686775 D55 -C97 0.095342524785088 E65 -H92 0.0937183614479298 G73 -R93 0.0919514653388607 I77 -V96 0.0919228153102587 Q75 -K81 0.0918408148251437 R76 -R95 0.0915360771009553 C58 -I64 0.0901273503475214 V54 -E65 0.0900997458471231 D55 -P62 0.0881755777949947 I77 -T84 0.0869060744789358 G73 -V78 0.0865054346243372 S89 -R95 0.083940760996374 R76 -Q90 0.0833228713397722 Y68 -V88 0.080942688637925 I57 -I64 0.0798697320218755 V78 -F99 0.0777440855346203 L52 -V74 0.0772751688871161 L51 -Q75 0.0749055714706417 V54 -Q75 0.0736047858229147 V78 -V96 0.0733109644807524 Y68 -N87 0.0704832228487235 G83 -S89 0.0695487822217933 I64 -A86 0.0695141887837654 C58 -T98 0.0693681423091732 V54 -K67 0.0672232505448358 V88 -V96 0.0643666606341133 C58 -V78 0.0638456076273426 I77 -H92 0.0630776795920673 S53 -F99 0.059983469076438 Y68 -Q75 0.0585765045325926 G83 -F99 0.0577593880117755 E65 -W80 0.0562825560213888 L52 -I77 0.0549534518607562 E65 -V96 0.0515128332494541 V74 -P82 0.0509198021131043 I50 -S91 0.0503850002196053 L51 -K67 0.0488992372153638 H59 -E65 0.0468063309652432 K81 -F99 0.0466262117514784 V61 -G83 0.0466038153873323 E65 -V88 0.0435689790801597 Q75 -F99 0.0427596909526431 G83 -R93 0.0404902196232886 V54 -V96 0.0401808838921802 G60 -R76 0.0401327542526886 H59 -G83 0.0388753578993026 I57 -E79 0.0384079445903387 H59 -P82 0.0377346083834862 E79 -T84 0.0362372992935907 G83 -S91 0.0353705655480416 S53 -V96 0.0350517328366092 V61 -W80 0.0344212728171616 A86 -V96 0.0332485997068499 T84 -H92 0.0320517399992362 P62 -R76 0.030349899378517 I77 -A86 0.0288128080743504 V61 -K81 0.028160649963424 W72 -G83 0.0274792153469097 H59 -V78 0.0266764221372107 V54 -T63 0.0265774267616269 I50 -T98 0.0245584284970093 S91 -C97 0.0235693898877618 I50 -K67 0.0227918665707947 G73 -P82 0.0216245606914529 K67 -V88 0.0213256950500877 I77 -P85 0.0195827904426968 L51 -F99 0.0192415050556329 E65 -R95 0.0190695536777512 V61 -E79 0.0182782762135139 V78 -N87 0.0166109535335421 T63 -P82 0.0162890174314545 V54 -V74 0.0161439303061695 E65 -T98 0.016022359444654 W66 -V96 0.0137921204403111 W66 -D94 0.0132539525728821 P62 -F99 0.0120982951362842 I77 -F99 0.0118490499264068 G83 -R95 0.0096531650384233 L52 -I64 0.00960605585626784 G60 -G83 0.00948149637880821 I64 -F99 0.00857195745509243 Y68 -R76 0.00569294100735451 V61 -F99 0.00419668194404821 W72 -P85 0.00382372214890259 W72 -N87 0.00357815088250835 L52 -D94 0.00152007569774604 V54 -F99 0.00141420450045837 T63 -F99 0.00123004201535171 V54 -R76 0.000584514082397902 R76 -A86 0.000436807125979266 E65 -K81 -5.17958898367255e-05 I50 -D94 -0.000678001992394428 T63 -V74 -0.00118852413366222 G83 -H92 -0.00344966635854654 I64 -W72 -0.00373232848327998 D55 -G60 -0.00389093765717763 Y68 -G73 -0.00431181930420321 D55 -Q75 -0.00431700200366469 A86 -R95 -0.00488034203416099 S53 -Q75 -0.00713910720071631 W66 -Q90 -0.00890757591996039 R76 -C97 -0.00926391736577115 R76 -F99 -0.00994915603274449 Q75 -S91 -0.0100796455394132 N87 -V96 -0.0114294012783427 G60 -P82 -0.011592175311253 E65 -P82 -0.0130396842700149 W66 -G73 -0.0149410009815467 Q75 -W80 -0.0162710747524448 I57 -V78 -0.018057135417441 T63 -A86 -0.0186144669631583 W72 -P82 -0.0200165314756543 V78 -G83 -0.0205206821184012 L52 -G73 -0.0216598217702595 Y56 -F99 -0.022077138849415 L52 -E65 -0.0224233382186165 I64 -R95 -0.0239591496922973 W66 -T98 -0.0243422145055661 Q75 -A86 -0.0251150689198272 G73 -V96 -0.0252361938787784 Q90 -V96 -0.0252628214955983 Y56 -W80 -0.0254730937268708 G73 -D94 -0.0276243245113665 W66 -N87 -0.02766669454201 I77 -R93 -0.0294052404531771 Q75 -Q90 -0.0341489836391089 V54 -I77 -0.0342215532371188 K67 -V96 -0.0352187860391044 L52 -R76 -0.035253005680671 I77 -S91 -0.0352996865989099 Y56 -P62 -0.035893991162962 V54 -Y68 -0.0370984211153953 E65 -T84 -0.0379594605662978 L52 -W66 -0.0386983421363887 D55 -F99 -0.0387543774385302 L51 -D94 -0.039502539826773 V74 -S89 -0.0416872049311099 L51 -R95 -0.043526864175206 Y56 -W66 -0.0438549898268642 V61 -P82 -0.044269827728173 P82 -H92 -0.0458151686884314 R76 -S89 -0.0486465781980057 L51 -R93 -0.0492035642011835 Y56 -V61 -0.0493694231557198 G83 -T98 -0.0496896621158531 I64 -N87 -0.0514390626171206 P85 -D94 -0.051550962668207 G60 -T98 -0.0517625153808643 P82 -V88 -0.0525032486694119 D55 -I64 -0.0527607536421377 I57 -F99 -0.0527665985386392 T84 -R95 -0.054189225225004 W66 -R76 -0.0542328397987828 V74 -N87 -0.054937594288798 E79 -V96 -0.0549885872993978 K67 -S91 -0.0555389294855015 S89 -V96 -0.0558566338252029 I50 -V74 -0.0559550845652996 Y56 -T98 -0.0574555640380843 I77 -D94 -0.0577019259929107 T84 -R93 -0.0584962535864944 T63 -E79 -0.0585159085453841 R76 -R93 -0.0600515909979173 I77 -R95 -0.0603564172747264 G60 -E65 -0.0615980850474225 R76 -D94 -0.0628812292133341 Y68 -A86 -0.0642158784078033 P62 -G83 -0.0644791099586666 V78 -P85 -0.0647201673073068 E65 -W72 -0.0648558515257234 Y68 -S89 -0.0660863949046143 S89 -D94 -0.0668400858920752 I50 -W66 -0.0676642222386046 P82 -V96 -0.0676803123541809 Y56 -R76 -0.0688056181078034 E79 -C97 -0.0719676896901369 W72 -S91 -0.0727569246406188 I64 -P82 -0.073561662615544 Y56 -I77 -0.0735851984297948 T63 -P85 -0.0744376598435763 L52 -S91 -0.0749766954400233 L52 -Q75 -0.0752083121262075 Q75 -R93 -0.0755906062128084 R76 -H92 -0.0770170761758393 P85 -V96 -0.0773714161366502 W72 -R95 -0.0774369915520419 L51 -S91 -0.0776285012748668 Y56 -T63 -0.0781366194168418 G83 -V88 -0.0787510042287076 K81 -C97 -0.0790495362757526 V78 -T98 -0.0794163023639143 R76 -P85 -0.081187247501763 S53 -R95 -0.0816567493459578 S53 -W66 -0.0818252343086874 K67 -I77 -0.083202158152214 I77 -G83 -0.0835803309086289 Q90 -R95 -0.0842703587478741 W72 -D94 -0.0844161836839437 W66 -V78 -0.0846506806611178 W80 -V96 -0.0863536665227314 L52 -F99 -0.0872784210561859 S53 -I64 -0.0883081551264014 W66 -K81 -0.0899161506950499 V61 -R76 -0.0899445640844325 S53 -I77 -0.0903903486997362 W66 -R93 -0.0910613458694693 R76 -V96 -0.0927518649914263 G60 -W80 -0.0941626322643785 W72 -I77 -0.0943132418940538 L51 -C97 -0.0954023496258873 D55 -I77 -0.0977271466954215 V61 -I77 -0.097914222008666 S53 -E65 -0.101747016635707 I64 -T84 -0.10553791752022 Y56 -E79 -0.107329886681934 T63 -W80 -0.109787495447078 S53 -V74 -0.109848893478127 I57 -E65 -0.109997600746463 W66 -S89 -0.111573876337546 T63 -K81 -0.111719623219161 S53 -R76 -0.111937607860301 A86 -H92 -0.112188817488216 E65 -S91 -0.113011610775517 E79 -F99 -0.114016684360331 V74 -G83 -0.114454468842202 W66 -P85 -0.116791374233923 V74 -C97 -0.116967494521501 Q75 -D94 -0.11726036860627 V54 -C97 -0.11818836031906 I50 -V96 -0.118537656807962 E65 -F99 -0.119127064484005 T63 -N87 -0.122439163090625 G83 -V96 -0.122637312108599 G60 -C97 -0.123281615385345 W72 -Q90 -0.123944946356731 G73 -S89 -0.124729739734538 V61 -V78 -0.125345086746933 I50 -Q75 -0.12695890679671 V74 -D94 -0.12778862366829 G73 -G83 -0.128094970722641 Q75 -N87 -0.128932497331773 L51 -V96 -0.131368939886709 I77 -V88 -0.131752327869896 I57 -W80 -0.132311378766328 I64 -P85 -0.134011846237846 G73 -R95 -0.134289895447791 I64 -T98 -0.135576074947479 R76 -K81 -0.138012170495483 K67 -R95 -0.138056089601293 G83 -D94 -0.138754232549028 Y56 -I64 -0.139330537743398 V78 -R95 -0.139530403870597 A86 -D94 -0.139767988728686 K67 -V74 -0.142092521089666 K81 -A86 -0.142380670170851 R76 -V88 -0.142392302480166 V74 -T98 -0.143302784335807 T63 -V96 -0.144258650100774 V74 -P85 -0.144965393434794 C58 -F99 -0.145419419554332 V88 -R95 -0.14716071815743 A86 -S91 -0.147254204350087 V74 -K81 -0.147290451238969 K67 -G83 -0.148334674053359 G73 -K81 -0.149143604641318 E65 -G83 -0.150054507172525 V74 -R93 -0.150752079652846 P82 -S91 -0.151562531505317 N87 -C97 -0.153014062053278 V78 -C97 -0.153464051082984 P62 -P82 -0.15478198336506 L51 -E65 -0.156692204859388 H59 -R76 -0.156731640241822 G73 -T84 -0.159053608044675 D55 -V61 -0.159263189807993 K81 -N87 -0.161669291751701 V88 -R93 -0.163710902328603 G60 -F99 -0.163841735065225 T84 -V96 -0.16453969940846 Q75 -T98 -0.165533492511373 V74 -V96 -0.167743718108872 W72 -R93 -0.168664744887424 V78 -T84 -0.170545217856558 K81 -T98 -0.170791326183196 W66 -S91 -0.176102948505052 I50 -R93 -0.178868673307522 Q75 -S89 -0.179670630330061 I64 -E79 -0.181759995990963 Y68 -V74 -0.182034507660824 I64 -V74 -0.182670549909153 N87 -R95 -0.183364233464113 I64 -R76 -0.183554185507221 H59 -K81 -0.186467877896952 I64 -G73 -0.190719510743201 I64 -V96 -0.19247068702227 E79 -T98 -0.194979080723733 T63 -Q75 -0.197789582748845 I64 -C97 -0.202646163032172 D55 -V96 -0.20453056051362 L52 -R95 -0.210211582735404 I57 -T63 -0.212151720906157 S53 -T98 -0.220673563838139 V54 -I64 -0.224490610090186 T84 -S91 -0.225327993474985 L51 -W66 -0.225662348691907 L52 -K67 -0.225881217235528 T84 -S89 -0.227807555190159 D55 -T98 -0.228759139709898 G73 -P85 -0.232868825618683 V74 -T84 -0.232989703861337 T63 -G83 -0.236049410162766 K81 -V96 -0.239220831914301 V54 -T98 -0.239450105272681 G60 -K81 -0.239913657245323 V54 -H59 -0.241252067294597 G73 -Q90 -0.241898679537186 L52 -C97 -0.24190559503065 V88 -D94 -0.243383318437739 G60 -I77 -0.243666884707138 L51 -T98 -0.24770688949755 G73 -N87 -0.249020686341121 V54 -R95 -0.249332933269673 I64 -G83 -0.251347798813314 G73 -H92 -0.251936623244717 P82 -F99 -0.254619839977976 C58 -E79 -0.25526088114798 N87 -R93 -0.255891407514186 P82 -R95 -0.262092296212154 E65 -D94 -0.262573514987943 W66 -C97 -0.264314952775795 G73 -S91 -0.264793675886672 L52 -T98 -0.271236301538472 Y56 -C97 -0.275894006559061 P62 -C97 -0.279101251821368 E65 -N87 -0.280864501147891 E65 -A86 -0.281928064881893 Q75 -C97 -0.293201230804118 L52 -V96 -0.295715382129877 W72 -T84 -0.296024690671643 W72 -H92 -0.296261459788494 W80 -T98 -0.298199855659701 I64 -K81 -0.315730066991397 C58 -T63 -0.317294740875321 W66 -I77 -0.324875203866084 E79 -P85 -0.325622871826485 W80 -C97 -0.330440115374514 I64 -W80 -0.331989312927332 R76 -G83 -0.333599370102047 S91 -V96 -0.343720797609049 P82 -N87 -0.347982073234832 V54 -W66 -0.354060501573925 G73 -V88 -0.355174962696246 E65 -C97 -0.35756284923759 W66 -V88 -0.375612118294432 V74 -S91 -0.380410680354803 E65 -Q75 -0.383841338269659 P62 -W80 -0.386647292821234 C58 -W80 -0.396601293377846 I77 -T98 -0.418186253645889 S53 -C97 -0.423559735916492 V74 -A86 -0.432584477543975 H59 -E79 -0.447590662379118 G60 -E79 -0.449778684694416 R76 -P82 -0.450394985824879 Q75 -P85 -0.455610391739185 H59 -I64 -0.460921512671237 H59 -I77 -0.522914510189763 E65 -R76 -0.835548365251707