[Fri Aug 26 17:58:28 2016] >Input file: TMQ9RDF0M1D.pdb >TM segments: 304-321_ 323-351_ 367-387 MAIDEN score = -14.1319 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- L317 -L339 0.888123832551674 R306 -P349 0.801285385994037 F327 -V332 0.791716726038437 W331 -A336 0.76460003860585 A325 -W331 0.67627036749693 V328 -G335 0.671718279376712 L316 -L339 0.651443530232833 V326 -W331 0.626371733533596 A325 -P330 0.611734179448495 R306 -P346 0.590004501958038 G321 -V326 0.520944694547072 V313 -L339 0.49759686444688 G319 -V326 0.482656518376672 V328 -L334 0.461507616146857 F327 -L334 0.422827885969454 R308 -V313 0.411865519692821 V313 -G343 0.393425836906193 R307 -V312 0.368000847104966 I304 -P309 0.363522851493873 L317 -A336 0.357172911660237 V328 -G333 0.339859690898461 N376 -P383 0.320044861545508 C338 -K345 0.305965933614316 V310 -P346 0.302596291721082 A347 -G367 0.294121546469907 V313 -M342 0.293261612714706 C320 -V328 0.291617702806512 L324 -S329 0.290534573308701 P309 -K345 0.286189387720333 G343 -G375 0.27205773013573 L311 -G318 0.271530965551063 R306 -L311 0.27105103275652 V312 -C338 0.266601417280457 V310 -M342 0.263197942510656 V332 -M342 0.257248358254374 S329 -L334 0.256174172747533 L311 -P346 0.250248225174741 R307 -M342 0.24781646474494 N372 -G379 0.246764120293307 L316 -G343 0.24593134049753 L377 -T384 0.239672179488302 G318 -A340 0.238582517813572 L317 -A340 0.2352800151092 S373 -G379 0.231960043062148 L377 -P383 0.23129110517883 R308 -M342 0.230713901553327 L323 -S329 0.216586956988047 G375 -A382 0.210921661048331 V326 -G333 0.209472314834358 G305 -G343 0.209001805958016 V313 -G335 0.208837558241873 V313 -G319 0.207815970855498 V326 -C338 0.194876824769587 L314 -C320 0.193691181779159 G321 -V328 0.187868988690484 L316 -W331 0.185695301883296 L314 -C338 0.180919994637401 G319 -L334 0.179656264714402 L324 -G335 0.177752127966338 L339 -K345 0.175474448619486 R308 -P349 0.175376172391969 L316 -G333 0.174660457812051 N372 -L377 0.174621341293583 R307 -K345 0.172438221957232 L316 -S329 0.171284648293096 P309 -L317 0.170346635005536 V326 -V332 0.168437535550529 F380 -G387 0.166506929583734 G318 -A341 0.162314731533945 A336 -G343 0.160345648672868 G375 -P383 0.157227684791317 R307 -S348 0.15528159149716 L311 -K345 0.14731089892134 L317 -S329 0.147100305762088 G319 -G335 0.146701785220971 G379 -G387 0.140299442382195 G319 -C338 0.13988678874021 I374 -A382 0.139177821232923 G379 -F386 0.138775445772246 G319 -F327 0.137430427506624 P349 -G367 0.135646572254529 P346 -F351 0.130152922397033 K345 -I368 0.129618978476748 N376 -T384 0.128531560312388 S329 -C338 0.127529035557202 V326 -A336 0.126876530008893 G321 -G333 0.12672592879345 A340 -P346 0.124817158648338 R307 -G343 0.123624603278691 L314 -W331 0.123252436284433 L315 -A336 0.120086172200357 G319 -V332 0.119331128033338 V312 -P346 0.116772806226564 L323 -L334 0.116744490434716 M342 -A347 0.115470799917264 L370 -L377 0.114663137574625 G305 -V312 0.114591500210637 G378 -F386 0.113126344340222 V350 -G367 0.112990680188267 V310 -K345 0.112629412724749 A341 -A347 0.110368607692567 V326 -G335 0.110091254401718 S348 -A369 0.109657586278775 F351 -N372 0.109444611750261 G321 -A336 0.108372161054477 V312 -G319 0.107458708752416 R308 -F344 0.105607627008088 A347 -N372 0.104611925820205 V326 -L337 0.103936381208385 G319 -F386 0.10354526944169 A341 -S348 0.102731732223059 G305 -M342 0.102580631367513 P309 -S348 0.101369727333809 G305 -S348 0.100372058542618 A340 -P383 0.100165301465268 G335 -G343 0.0999561831053848 A341 -G375 0.0987882108998221 G318 -L323 0.0975951533353054 A347 -A369 0.097009831832072 V310 -S348 0.0969281940731959 L316 -P330 0.0962547981905351 A336 -A382 0.096180908732864 G321 -V332 0.0958823827185675 V312 -A340 0.095099133565216 L317 -V328 0.0950757245739613 G318 -V328 0.0949714312808201 L311 -A340 0.0949424581872388 G319 -A340 0.0899335115344577 V350 -I371 0.0898445262885562 S348 -G367 0.0894833496230003 A325 -C338 0.0890656405468309 A340 -A382 0.0883906989425904 I368 -L377 0.0875763843385589 L377 -F386 0.0869895968735157 F327 -C338 0.0860315796905257 A325 -V332 0.085403104313869 F344 -N376 0.0830145223053114 F327 -A382 0.0822650033163885 G333 -L339 0.0819205270707636 R307 -F351 0.0819193045706186 V310 -L339 0.0817422213396295 G343 -G378 0.0816459826806535 I371 -N376 0.0792500578049049 A347 -S373 0.0789881328133744 G367 -G375 0.0771925834615959 V328 -L339 0.076485044732663 K345 -I371 0.0748934112054167 I374 -V381 0.0742257022689765 L334 -M342 0.0741993782101404 L316 -A325 0.0735456216118258 A347 -I371 0.0733503395091306 P309 -L339 0.0719870688715289 L316 -A336 0.0711222474384297 L324 -G333 0.0710087918321882 L334 -P383 0.0698321016293457 L323 -A336 0.0693782125421465 P309 -G318 0.0684348567688264 P309 -A340 0.0678895964912849 L337 -A382 0.0677230140580809 V313 -F344 0.0673854279243074 I304 -P346 0.0673584594747703 I304 -K345 0.0672619727297521 V313 -C320 0.0665267091541448 A325 -L337 0.0662186095898444 L324 -L334 0.0661875791405739 L314 -L339 0.0660283555605181 L314 -L337 0.0659654121654487 F327 -L339 0.0651317693913764 R307 -A341 0.0648570083876329 G343 -I371 0.0644342990343985 A336 -F386 0.0643051515647395 R307 -A340 0.0619969111522809 G319 -P330 0.0616014501902278 G318 -G343 0.0614335599259817 A340 -A347 0.0601741449040596 G343 -S348 0.0599733343576343 I304 -V313 0.0598678572437885 R307 -L315 0.0593104133806932 G333 -P383 0.0589064678912359 L315 -G335 0.0555323150795264 I368 -N376 0.0540343754380632 A340 -N376 0.0536591942185654 L315 -G321 0.0527947192309881 L324 -V332 0.0516696722791696 L324 -A336 0.0516419510007533 V310 -G319 0.0504406148236358 G318 -L337 0.0497440728841303 L323 -G335 0.0494237648742537 L311 -A336 0.0482196009017493 A325 -L339 0.0472031188398994 L311 -M342 0.0471981267146315 L370 -G378 0.0461766973002542 V313 -A347 0.0456640599786757 L317 -A341 0.0448859337695131 L315 -G343 0.0448760392475149 G318 -S329 0.0434362538955506 V310 -A341 0.0429969698253574 L317 -W331 0.0424535642452337 V326 -G387 0.0422446437481439 V313 -K345 0.0410007784992055 P309 -A347 0.0404385863307581 F344 -N372 0.0402721354368503 P346 -I371 0.040001357044442 R308 -V350 0.0393428872881518 P349 -I368 0.0379737775375093 L323 -G387 0.0374041680972399 G319 -S329 0.0359338098906712 A369 -L377 0.034678101101588 L315 -W331 0.0344671421928968 A336 -G379 0.0344330929302656 G321 -G335 0.0342752367391603 L337 -G378 0.0306682168665033 A347 -I374 0.0305509520766405 W331 -M342 0.0283829050299902 L311 -L339 0.0283743068815303 G318 -L324 0.028025795403483 G378 -G387 0.0267913362245698 G343 -N376 0.0258682252017568 L314 -G335 0.0246216406931703 R306 -V350 0.0233640410538332 V326 -A382 0.02326251640336 G318 -L334 0.0222066464271595 I371 -G378 0.0197826338656429 F351 -A369 0.0186384539336037 R307 -F344 0.0172502662155796 L316 -G321 0.0160164727663314 V310 -G318 0.0146010391769407 F344 -F351 0.0144755043441522 G305 -L314 0.014380653253792 S348 -N372 0.0141524276527636 R308 -G343 0.0134771679869471 V326 -L339 0.0132538417950592 A347 -L370 0.0129953215621228 L314 -V326 0.0112339537649531 P309 -A341 0.0109070841138488 A341 -N372 0.0106111449219033 V310 -P349 0.0101213095718483 S373 -F380 0.00965026370949127 G321 -P330 0.00931837254023304 A341 -G379 0.00769183250977035 R308 -L315 0.00750471702426925 C320 -G333 0.0074204342405948 A347 -G375 0.00737612704785029 L316 -V328 0.00650736594427936 F344 -I374 0.00501230547287346 V326 -F386 0.00403157441042312 V310 -L315 0.00300716071149942 V313 -G333 0.000439802725867189 L314 -G333 -1.70047649898919e-05 I304 -V312 -0.00010076442449769 G319 -A382 -0.000127663172257542 G333 -A341 -0.000216311378299139 N372 -G378 -0.000396113169621959 L316 -G335 -0.000729363806912353 P309 -P349 -0.00118052692613529 L315 -C338 -0.00221561249754521 S348 -L370 -0.00239452981167787 A325 -G333 -0.0024225647927274 L337 -G375 -0.00265749702459239 V326 -A340 -0.00416784855130148 V310 -A336 -0.00436616089159536 A341 -N376 -0.00459100693540743 G305 -F351 -0.00492106713479901 A340 -G378 -0.00541126959313942 P330 -A336 -0.00626741673539755 L317 -L334 -0.00661676605679196 L314 -F344 -0.00815588342494822 R306 -F351 -0.00816517727771215 G319 -L324 -0.00847137137874654 V350 -I368 -0.00862666622603658 A340 -G375 -0.00899767950020447 C320 -S329 -0.00909079856543915 W331 -A340 -0.00953313026345048 V328 -A336 -0.00962444472783552 L311 -C338 -0.0107935075590864 G305 -V350 -0.0114020831701644 L337 -G379 -0.0126613884903686 G318 -P330 -0.0130723645990872 G319 -L337 -0.0134354394218843 V310 -L337 -0.0147847650364676 P309 -P346 -0.0149996725602968 L337 -F344 -0.0157779512820992 S348 -G375 -0.0168599038862158 G318 -G335 -0.0181819934696374 G343 -P349 -0.0202615528517919 G318 -F327 -0.0205579225197901 F344 -I368 -0.0212440908848839 R306 -A347 -0.0223978356949783 V332 -A341 -0.022441932165381 A340 -G379 -0.0239841938854972 V310 -G343 -0.02434211417553 V332 -A340 -0.0246109547353571 L316 -L337 -0.0248168595803282 V312 -A341 -0.0249725749036058 I374 -F380 -0.0250697149924912 G305 -A347 -0.0256014860837626 I368 -S373 -0.0261399576119441 V312 -A336 -0.0263621750941072 P309 -F344 -0.0266859519662836 L314 -P346 -0.0267162918915655 N376 -A385 -0.0272673767321345 C320 -F327 -0.0274855995457548 M342 -P349 -0.0275751954465773 G343 -F351 -0.0303461615305602 S329 -L337 -0.0305793131528134 G305 -F344 -0.0319571496563049 L317 -P330 -0.0323091258542112 L311 -G319 -0.0369786457732175 P330 -G335 -0.037160900912188 G318 -A325 -0.0373715317141867 G335 -M342 -0.037591494120754 I304 -P349 -0.0388643290645905 F351 -G375 -0.0397841910840357 K345 -V350 -0.0397915113277172 G305 -P349 -0.0400708067509892 R306 -G343 -0.0401930383918834 V328 -A340 -0.0410626120899096 G378 -P383 -0.0420738832046141 V310 -C338 -0.0425769049651912 I304 -S348 -0.0428765101527349 C320 -A336 -0.0433451732052419 L323 -F386 -0.0437716466267695 V313 -V332 -0.0441820660845324 L315 -V332 -0.0444040923920177 A340 -N372 -0.0452239308707765 A341 -P346 -0.0461101566932292 L337 -P383 -0.0467360706443638 L311 -V350 -0.0476253377622431 I304 -M342 -0.0488465593610521 G319 -V328 -0.0496048012062174 L314 -G343 -0.0500724342354921 C320 -L339 -0.0520280113712097 L317 -F327 -0.0529328372422553 F327 -G387 -0.0532971299820232 P330 -L337 -0.055091458316979 R306 -L315 -0.0554331257544767 F344 -G378 -0.056215467079351 P330 -L339 -0.0564320603013639 A336 -P383 -0.0566828261987662 L315 -A341 -0.0575310848968051 V310 -L316 -0.0578996156530849 K345 -G375 -0.0581007966678948 V313 -P346 -0.058258592884417 W331 -A341 -0.0586323149790258 V326 -P383 -0.0593255018779892 G305 -P346 -0.0595621614627313 G333 -A382 -0.06030461369178 L314 -V332 -0.0606789029048516 A341 -G378 -0.0608337791124371 V310 -F344 -0.0615777949607583 L315 -P330 -0.0616445757239443 R306 -A341 -0.0618782312240933 R307 -L317 -0.0628138483117859 V310 -A347 -0.0629406103266126 L317 -C338 -0.0636740769595681 G318 -V332 -0.0653946165266861 L311 -A347 -0.0657615421566504 V313 -L334 -0.0714117909525678 L315 -A340 -0.0725102914302607 A325 -G335 -0.0733696039645821 F351 -I374 -0.0736903567604981 G333 -A340 -0.073963974033857 L323 -P383 -0.0742271731647257 G318 -C338 -0.0744018006668848 P346 -I368 -0.0746862951719445 G379 -A385 -0.0764029225607152 P309 -V350 -0.076529715365649 L311 -L316 -0.0770524178344285 P346 -G375 -0.0776186884924033 L315 -G333 -0.0779032048299966 M342 -G375 -0.0785897934423199 I304 -F344 -0.0801316255451279 L316 -F327 -0.0804531609980237 F344 -S373 -0.0805239476419981 V312 -G335 -0.0813627249082023 S373 -V381 -0.0815647193443234 L339 -P346 -0.0837781124640031 V310 -V350 -0.0857060147754363 G319 -W331 -0.0857234085916616 L311 -F344 -0.0860311222650072 L315 -M342 -0.0870187980037302 L377 -A385 -0.0880201487738819 I304 -L311 -0.088212231378939 G305 -V313 -0.0884503925441003 L323 -P330 -0.0885517756072209 L317 -L323 -0.0887683087487119 N376 -A382 -0.0890016240844742 V313 -L337 -0.0896974079027508 P346 -G367 -0.0896987771682338 I371 -G379 -0.0908470403824317 A369 -N376 -0.0916049196828481 R308 -A347 -0.0918091211861163 G333 -F386 -0.092980645531723 V328 -L337 -0.093780412739191 C320 -G335 -0.0961702778089304 I304 -G343 -0.0966740113909959 K345 -N372 -0.0972705815645982 G321 -W331 -0.0989562351633761 V332 -C338 -0.0993800279470705 S373 -G378 -0.0998097318744467 F327 -P383 -0.101363001860784 V381 -F386 -0.10193011324241 R306 -F344 -0.101998875859698 R306 -S348 -0.1020625837285 R308 -S348 -0.103066174575714 V313 -W331 -0.103102617116384 M342 -S348 -0.103976239912768 L314 -G321 -0.104169638929881 C338 -F344 -0.104352413888543 R306 -L314 -0.10593638871142 G319 -L339 -0.10594891802003 L323 -W331 -0.105998440108659 L316 -A341 -0.106484348855635 L317 -A325 -0.106683777160783 L314 -A341 -0.107828687590706 L315 -V326 -0.109864411370906 L317 -F344 -0.11027805001958 L315 -L337 -0.110612780513852 R308 -L316 -0.112780808079235 C320 -W331 -0.113495717939893 P349 -I371 -0.115365791560175 F344 -G375 -0.115425277161409 G318 -V326 -0.115768137671632 C320 -V326 -0.116554869529997 G367 -S373 -0.116857784963776 G318 -G333 -0.118354196359496 P309 -G343 -0.119965797810363 F344 -G367 -0.122374235445208 G375 -F380 -0.123526255823607 W331 -L337 -0.123754419040515 F344 -L370 -0.126301909659993 G319 -G333 -0.12648735220037 V312 -G318 -0.127107461602718 S348 -I371 -0.12825713132608 R307 -L339 -0.129949882764986 G321 -F327 -0.130155109956015 G343 -N372 -0.130289419252396 L337 -G343 -0.130422088248872 A325 -A336 -0.132360928288236 P346 -N372 -0.133794942414329 S329 -A336 -0.135602211243613 G375 -V381 -0.137157396297971 R308 -K345 -0.137276483844783 F351 -L370 -0.138970480297105 V312 -F344 -0.140918290849772 K345 -G367 -0.141874901617126 R306 -L339 -0.142278832312659 L311 -A341 -0.14549909806829 V312 -G343 -0.14708969652336 G321 -S329 -0.148752805509546 L337 -N376 -0.151028272606746 G305 -K345 -0.151411909521962 R308 -L317 -0.151769571675566 F327 -F386 -0.15198554167932 R306 -A340 -0.152484807716132 R306 -V312 -0.153564078698893 L317 -G333 -0.154009608448483 L317 -G343 -0.155048752228234 V328 -C338 -0.156050836009999 S348 -I368 -0.156740329462936 F380 -F386 -0.156745825235677 G318 -W331 -0.156940702287525 R308 -L339 -0.157329669417601 G318 -A336 -0.157987575513327 R307 -V313 -0.159601854797271 N372 -F380 -0.159619343858829 G343 -V350 -0.162637943251519 R307 -L316 -0.162806819910474 R306 -V313 -0.163191033266541 V312 -K345 -0.164351377279558 L339 -F344 -0.164931774702747 L316 -A340 -0.164939323039858 G367 -N372 -0.165212059200457 L317 -V326 -0.16522517836878 V381 -G387 -0.168212278582579 L314 -K345 -0.169007258178162 F327 -A340 -0.169761804261043 R307 -V350 -0.171849275808598 A340 -K345 -0.174157471859881 P309 -M342 -0.174827351265311 A336 -F344 -0.177773610333763 G367 -N376 -0.177903464085853 F344 -A369 -0.178259552953437 A336 -A341 -0.178704769364019 C320 -V332 -0.179947804918109 V310 -A340 -0.180472611906359 R307 -L314 -0.181303615782125 S329 -G335 -0.181983094226847 K345 -F351 -0.183414506123439 S329 -L339 -0.187256452512664 F351 -G367 -0.188257441592162 V312 -W331 -0.189703776799561 I374 -G379 -0.189763284092478 G319 -A336 -0.189839293151117 L316 -L334 -0.189894655496031 F327 -L337 -0.190667008709773 N376 -V381 -0.198120007381028 L317 -V332 -0.203190237028704 F344 -I371 -0.206399408477765 R306 -M342 -0.207465766142283 G333 -C338 -0.208249617843687 G318 -M342 -0.210381025566267 C320 -F386 -0.215466622448959 G333 -M342 -0.215642707265031 L334 -A341 -0.217147111737143 I368 -G375 -0.21925433846767 F327 -G335 -0.219536284920576 L316 -V326 -0.228058561614082 G378 -T384 -0.228355876436845 R307 -A347 -0.229336049979575 L323 -G333 -0.229665327505829 F351 -I368 -0.230826479373759 G305 -V310 -0.231100378806117 V313 -G318 -0.233628191441126 G305 -L311 -0.234259170555548 F344 -P349 -0.234457013503913 C320 -A325 -0.237940725524031 V312 -M342 -0.239016088560814 F351 -I371 -0.239608308179247 L317 -L337 -0.240061234597707 P330 -C338 -0.242907648350181 L314 -A340 -0.247551619497422 L316 -C338 -0.247829899883554 L370 -N376 -0.248686584067616 R307 -P346 -0.248783498720471 A325 -L334 -0.250974821934767 G379 -T384 -0.251653437795884 L316 -V332 -0.253633892856715 L334 -A340 -0.254837358556811 G335 -A341 -0.255199297640523 G378 -A385 -0.265705595058874 L314 -A336 -0.267630144145503 A369 -G375 -0.267978486991864 P309 -L314 -0.269940869096635 G319 -A325 -0.269973058610488 R306 -K345 -0.270400481392034 R308 -L314 -0.271972619194788 L323 -V332 -0.274887060336908 F327 -G333 -0.274925224329184 L317 -M342 -0.27729011816641 L377 -A382 -0.279174902615253 G318 -L339 -0.282904753978338 G367 -I374 -0.284864364180007 P309 -C338 -0.290243853968205 L334 -L339 -0.291630802220768 V332 -L337 -0.293261106735358 I371 -L377 -0.29797438950939 A347 -I368 -0.299209727097032 F344 -V350 -0.301761158594814 L316 -M342 -0.303724661710554 V312 -L339 -0.309068797752259 C320 -P330 -0.30923016971751 L314 -G319 -0.316179500868691 V313 -A341 -0.318409385353389 C338 -G343 -0.328831496696993 L314 -M342 -0.333180173290291 W331 -L339 -0.341547460488864 L311 -G343 -0.341643912717588 L324 -W331 -0.343782450433445 V313 -A336 -0.353854566997796 L315 -L339 -0.361749133591776 A369 -I374 -0.362816742463535 I368 -I374 -0.365725923132163 V313 -C338 -0.370303329354435 L317 -G335 -0.370315529981498 V313 -A340 -0.37383146041906 V310 -L317 -0.380908101261331 L370 -G375 -0.381999942686622 L337 -M342 -0.389585814555166 V312 -L317 -0.397264899319387 A336 -M342 -0.401406102068583 L311 -L317 -0.406731888060759 V332 -L339 -0.409822480572693 R308 -P346 -0.412353509978797 I304 -V310 -0.415056432918841 V326 -L334 -0.419644183742713 L323 -V328 -0.444917054911375 W331 -C338 -0.451279592313292 R307 -P349 -0.460937431604916 F327 -A336 -0.46166452497081 F380 -A385 -0.466481830240436 G335 -A340 -0.474864988245966 A382 -G387 -0.478217905910969 L315 -C320 -0.538782199497084 P309 -L315 -0.548691609114197 P309 -L316 -0.55674824440936 L324 -P330 -0.565199739743439