[Mon Aug 29 16:53:07 2016] >Input file: TMQ9XVL7M1G.pdb >TM segments: 284-338 MAIDEN score = 3.4534 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- K300 -A310 0.848234158385271 I302 -D309 0.809420619932274 A327 -K336 0.792419420499014 I314 -M325 0.762734965355784 A327 -L335 0.670094940555134 I328 -L335 0.631938762038255 L316 -V330 0.622515993387678 G329 -L335 0.57028958776389 V330 -L335 0.552988198758966 L288 -R293 0.54603580096023 Q317 -V330 0.525495617574208 L295 -K300 0.507161985463545 L316 -S331 0.497142188813705 D309 -I314 0.465511056027356 S318 -R323 0.437671797730158 Q317 -K336 0.436754215855259 I328 -E337 0.431944470058123 A304 -D309 0.427976747880646 A303 -D309 0.426841472188444 L316 -R326 0.390712922433824 A319 -M325 0.385215711075691 E294 -K300 0.385033986570785 N289 -K296 0.367383923526113 L316 -M325 0.349103753031659 A304 -S312 0.348220912528384 D299 -A304 0.347189767552054 L316 -R334 0.340348698932454 D315 -R323 0.339212958213606 Q317 -E337 0.337564193182879 D315 -R321 0.331355307060518 S312 -V330 0.330140465971295 K296 -A310 0.325762286258048 R293 -K300 0.320069918777121 I302 -G307 0.31955629163113 Q317 -A327 0.309546253471339 A310 -A319 0.309478310331084 Q317 -E332 0.305508691899145 S318 -M325 0.303734669854816 V308 -S313 0.302821918733974 Q317 -G324 0.299485791520227 C320 -M325 0.29821441138306 M290 -D299 0.297480843975544 A303 -L311 0.297276916024909 K300 -S313 0.276656468023811 G329 -K336 0.276026588468738 R285 -K291 0.275465944420799 A310 -D315 0.270450983922887 M325 -V330 0.266491002689738 G329 -E337 0.257944622222257 G324 -L335 0.255258766418158 D315 -R334 0.253928058211415 I292 -A297 0.24154485387062 D298 -A303 0.237845120472376 L316 -E332 0.232475315854099 Q317 -E333 0.231503468088959 D299 -V308 0.218742807618434 L316 -E333 0.21222122035641 D315 -G324 0.20917545624319 E294 -D299 0.202594162036428 Q287 -E294 0.198143086779853 M325 -R334 0.19490537403185 R326 -E333 0.192625989652674 A310 -S318 0.192111072424443 K296 -Q301 0.185684178103476 K291 -D299 0.185456403571229 E332 -Q338 0.180697349462895 D309 -R326 0.177802879008539 K296 -D309 0.173667159060008 S313 -G329 0.166062130007909 S313 -G324 0.163719383288981 D309 -M325 0.16288709185195 A310 -G324 0.162705025135545 E305 -A310 0.160541463274108 K300 -S312 0.159223533253998 L288 -K296 0.159059096585543 A303 -I314 0.157959755933618 S318 -K336 0.154827350062701 D315 -G329 0.152704491585903 L316 -G329 0.151533714511405 A322 -G329 0.151258976421776 K300 -G307 0.148582160915013 I314 -V330 0.148008504878232 I328 -K336 0.145701309477955 S318 -E333 0.14301669730403 A304 -D315 0.140450748812762 S312 -C320 0.138528864111673 E305 -I314 0.13511442207479 E294 -Q301 0.134566047043929 V308 -V330 0.12991268338155 R326 -Q338 0.129801139452164 G307 -E332 0.125343835859432 D309 -S331 0.124909325942759 A304 -A310 0.124454976941654 D315 -K336 0.124408150398498 R293 -D299 0.123779287839758 D298 -V308 0.118779943208721 A310 -V330 0.118329141527157 Q287 -L295 0.118127706949002 E333 -Q338 0.117004846256281 A297 -I302 0.116696584283019 S313 -L335 0.116421927702608 Q317 -R323 0.114750840323227 L311 -S318 0.112273186090006 D315 -I328 0.109272711858551 V330 -K336 0.107658147655908 I314 -A319 0.106992011703014 G306 -I314 0.106478855197916 Q317 -G329 0.105480666034075 G306 -E332 0.10508305101177 A327 -E333 0.104792424886931 N289 -A297 0.103338945688233 A304 -S331 0.102069438894678 I314 -R326 0.101550145731544 E332 -E337 0.100829350189648 L311 -S331 0.100804540377466 S313 -E333 0.0966554273328772 L311 -V330 0.0961844277274078 D299 -L311 0.0956910741414254 R321 -R326 0.0942309266003566 G324 -Q338 0.0936326916551482 V308 -Q317 0.0921813382350434 S312 -E333 0.091986953526588 A304 -L316 0.0912671655880029 I328 -R334 0.0900848622028358 Q301 -S313 0.0899756118955692 L311 -C320 0.0878210867603428 L311 -G324 0.0866856298459702 S318 -Q338 0.0861625634794034 I314 -S331 0.0857100106486381 I314 -G324 0.0831311121720688 A319 -V330 0.081661463871872 A310 -S331 0.0815268418805299 I314 -E333 0.0810661567003992 A304 -L311 0.0788668447734584 A310 -M325 0.0778704921481708 K296 -E305 0.0769956613631444 L316 -R321 0.0768612139762535 L316 -G324 0.0759607187294938 S313 -A327 0.0752637569170802 D315 -C320 0.074891216609112 D299 -G306 0.0709062209859308 S318 -E337 0.0702970101550768 L316 -I328 0.0663947226852837 L311 -A327 0.0644535877024186 G324 -K336 0.0632641852823506 G306 -S331 0.0627587999823209 L284 -N289 0.0624949725901498 V308 -E332 0.0617693213957482 I314 -L335 0.0596314179672124 A303 -L316 0.0585818835899623 C320 -V330 0.0571577660519442 D298 -D309 0.0569637552838773 I314 -A327 0.0564302737339957 R293 -Q301 0.0548208889984214 L288 -E294 0.0539055843211012 I314 -R323 0.0532446791648455 S313 -I328 0.0519810514424066 S313 -S331 0.0507767629314364 S312 -A327 0.047988987177134 A304 -A319 0.0466739832103062 A297 -A310 0.0464580309444922 C320 -A327 0.0457338569398864 A319 -R326 0.0444100920258688 A319 -L335 0.0437446353280477 I292 -K300 0.0431406191525383 D315 -A327 0.0430301144347793 L288 -A297 0.0400654677344572 S312 -G324 0.040044395166408 A310 -C320 0.0399783898005412 L311 -R326 0.036113267393064 I302 -S313 0.0346038536352413 R285 -M290 0.0345219710250326 I314 -E332 0.0328932650706597 V308 -S331 0.0296140716723232 F286 -E294 0.0284254224077075 Q301 -S312 0.0279827141738958 G307 -L316 0.0272749441687301 G307 -I314 0.0270843750748107 V308 -D315 0.0262605640658959 D309 -S318 0.0256737600343817 I328 -Q338 0.0243518026271357 M325 -E337 0.0236995419009536 D315 -Q338 0.0234239396451357 S312 -S331 0.0216901171130299 I292 -D299 0.0214440604406922 S331 -K336 0.02081177019328 R323 -I328 0.0193572034997112 D315 -A322 0.0193039501707792 R321 -I328 0.0179661373946587 G306 -S313 0.0157195889032735 D299 -S313 0.0134136391772847 D299 -S312 0.0125814299287664 L316 -Q338 0.012066388867586 S318 -S331 0.0115094333305197 A319 -Q338 0.00847971881342291 R323 -E337 0.00810545075447378 R326 -R334 0.00740235984627713 L311 -E332 0.00661373128172293 S313 -E332 0.00520031918272212 Q317 -Q338 0.00370111478692836 S312 -L335 0.00185574121150545 S313 -V330 0.000807500180669773 K300 -I314 -0.000358678845309601 G324 -S331 -0.000496488669325057 A303 -S313 -0.0010974631551065 R323 -G329 -0.00136246500507564 S313 -C320 -0.00136914275159961 F286 -K291 -0.00380260301031488 A310 -L316 -0.00412508351818985 D309 -Q317 -0.00435949497320554 E305 -S313 -0.00464056471424623 L311 -G329 -0.00653039273192491 D299 -G307 -0.00853769974088714 S318 -E332 -0.00952539628951632 K300 -G306 -0.012398432665794 L316 -R323 -0.013627802527143 S312 -R326 -0.0146941997662542 R326 -E332 -0.0148679946036312 L316 -E337 -0.0155054430790024 C320 -I328 -0.015559590276734 G307 -D315 -0.0158025886407716 L288 -L295 -0.0165458544357162 D309 -A319 -0.0170298429618505 A303 -D315 -0.0170420050239803 I302 -S312 -0.0177296291699931 E294 -I302 -0.0177845593515049 R326 -E337 -0.0192012837608986 Q301 -G307 -0.02064335618783 Q317 -I328 -0.0228810478722314 A319 -G329 -0.0237705750097392 A304 -Q317 -0.0247404995556995 S312 -G329 -0.0261931074366206 C320 -R326 -0.0275374344601271 R323 -Q338 -0.0302781491107607 Q317 -R334 -0.0304203682543132 R323 -V330 -0.0310539516298904 G307 -S331 -0.0376844729251968 E305 -S312 -0.0391427251311871 G329 -Q338 -0.0396831066589926 L311 -A319 -0.0397379872900357 V330 -Q338 -0.0397416912118372 R323 -L335 -0.040889174162726 K291 -K300 -0.0408945425997147 A322 -I328 -0.041969645618475 A310 -E332 -0.0427554077540869 D299 -I314 -0.0439056067705919 I302 -V308 -0.0449247098776429 A319 -E337 -0.045851151952391 R326 -K336 -0.0466150805213958 D309 -E332 -0.0472403342685457 A310 -R326 -0.0516742823938472 D315 -S331 -0.0550602897486594 Q317 -A322 -0.0566309886808498 K300 -L311 -0.0566983320081365 K291 -A297 -0.0573288981651299 Q301 -V308 -0.0597345158813312 I292 -Q301 -0.0603296276102956 A297 -G306 -0.060499584914607 A327 -E332 -0.0656134888973932 G324 -E337 -0.0660659626721909 S318 -A327 -0.0683236829744925 G324 -R334 -0.0683926248390465 L295 -A303 -0.069842004376198 D298 -A310 -0.0702853201866303 Q301 -A310 -0.0705786869941394 L311 -R321 -0.0723351423089058 S312 -R334 -0.0730267448706903 D298 -G307 -0.0756691543758308 Q317 -L335 -0.0764517669814548 L295 -A304 -0.076511818625919 L295 -I302 -0.0774455571204906 E294 -A303 -0.0778715275254069 S318 -R334 -0.078076974696205 N289 -D298 -0.0787377929826265 L316 -K336 -0.0793198593493649 K300 -V308 -0.07964280683714 D309 -V330 -0.0804453356861679 S313 -R334 -0.0811193135744713 Q301 -G306 -0.0820488506551946 S331 -Q338 -0.0824647747715628 Q287 -R293 -0.0825403482972424 R285 -R293 -0.084943377162916 D315 -E333 -0.086545343425349 S312 -I328 -0.0883781232414649 Q301 -I314 -0.0886145034043215 R326 -S331 -0.0912396744059347 D298 -E305 -0.0945283312970515 D315 -E332 -0.096333260302037 K296 -A304 -0.0964886564257794 I292 -D298 -0.100030385256883 V308 -L316 -0.100137360205798 S331 -E337 -0.100288747658343 A304 -E332 -0.100735572694683 L311 -I328 -0.101274610582344 G306 -L316 -0.101465200384896 S313 -R326 -0.103299433281973 D315 -E337 -0.103524492610579 R326 -L335 -0.103908557761995 M325 -E333 -0.105143542574647 D299 -E305 -0.106103431324392 D298 -G306 -0.106246953729985 A297 -E305 -0.108980571854286 A319 -S331 -0.110144531665636 S313 -R321 -0.110592786914703 S312 -Q317 -0.113338385418739 D315 -M325 -0.113880003552893 L316 -L335 -0.115859114630549 K300 -E305 -0.116278831743431 G306 -D315 -0.116351826275265 S312 -S318 -0.116366321958499 M325 -E332 -0.11981028087441 D298 -A304 -0.123075477319925 E305 -L311 -0.124688111189514 N289 -E294 -0.126448746954069 M290 -A297 -0.126641878591686 G306 -S312 -0.127304160659582 F286 -L295 -0.127374853504479 A303 -A310 -0.127896587676728 A310 -Q317 -0.128745974341057 Q301 -D309 -0.132824466268527 I302 -I314 -0.136096302896059 R285 -E294 -0.137831412336502 S318 -I328 -0.137973111427533 I302 -L311 -0.138836098695985 S312 -E332 -0.140050558639444 I314 -A322 -0.14032426965567 M290 -K296 -0.143993622257626 M325 -K336 -0.144809120385199 I328 -E333 -0.145425513231429 G324 -V330 -0.146597692783809 G307 -S312 -0.146744152165505 R321 -G329 -0.147681532192845 D309 -E333 -0.148826810764368 K291 -D298 -0.150659424219112 S312 -M325 -0.151195264216773 M325 -L335 -0.152096512880076 R293 -I302 -0.152378148648578 G307 -S313 -0.152380449415139 E305 -D315 -0.153022792838989 A297 -D309 -0.153460862091409 D299 -A310 -0.154114729120562 L311 -E333 -0.155182953160342 M325 -Q338 -0.157828929164218 Q317 -M325 -0.158369341984147 L284 -R293 -0.162956084024122 K300 -D309 -0.163002576538292 I314 -R334 -0.163177041665634 A297 -L311 -0.163473430268124 D309 -L316 -0.164355564014561 A303 -S312 -0.164835738983548 L284 -I292 -0.165505177797162 V308 -I314 -0.166630420489986 S313 -M325 -0.168149958122573 K296 -L311 -0.169841209558196 D299 -D309 -0.173924513347621 D298 -L311 -0.174851743356493 A327 -R334 -0.17917940763337 A297 -A304 -0.183568410554144 D315 -R326 -0.183917922419301 Q317 -S331 -0.184834595036038 F286 -R293 -0.187717580438706 I314 -I328 -0.189344293596495 L311 -L316 -0.189552326223907 L316 -A327 -0.192289943062153 V308 -E333 -0.192319970892682 M325 -S331 -0.192707705930276 S312 -A319 -0.192881706626123 R323 -K336 -0.193298671512584 M290 -D298 -0.195231107231801 L284 -K291 -0.19727358642544 A322 -A327 -0.197300965979181 S318 -V330 -0.204830894288872 R293 -D298 -0.206284591833721 D309 -D315 -0.209271694638276 S318 -L335 -0.217719348672888 G306 -L311 -0.221507057668557 Q287 -K296 -0.226205889290957 R321 -A327 -0.226246219324118 Q301 -L311 -0.229608920325958 S318 -G329 -0.230546189602015 S313 -A319 -0.230561469400881 A297 -A303 -0.235392601896903 C320 -G329 -0.244254153679356 I314 -R321 -0.247871812184727 N289 -L295 -0.24970220531335 F286 -I292 -0.26626492450107 I314 -G329 -0.275767502811484 S313 -S318 -0.279416266415415 M290 -L295 -0.281503667831343 L295 -Q301 -0.284873754565148 K296 -I302 -0.287424603109411 A319 -I328 -0.291020778992463 A327 -Q338 -0.299916312488387 K291 -K296 -0.300945617475943 D315 -L335 -0.304982409263862 A327 -E337 -0.307909498295517 G329 -R334 -0.322561764866014 Q287 -I292 -0.324035316853902 R285 -I292 -0.324719446440845 A304 -S313 -0.336833923185182 V330 -E337 -0.33971143561158 A304 -I314 -0.340089548173218 L311 -M325 -0.353044589761746 K296 -A303 -0.358235806594643 A319 -G324 -0.368011275146485 A319 -A327 -0.375661369720929 G324 -G329 -0.415870367734635 S318 -R326 -0.46276904650197 I302 -A310 -0.470391648654014 L311 -Q317 -0.472958952117878 L284 -M290 -0.476527984457974 A303 -V308 -0.496780337932222 S318 -G324 -0.568912578317849 D315 -V330 -0.591400239315628 I314 -C320 -0.762464738134204 Q317 -R326 -1.04662051318851