[Mon Aug 29 16:55:17 2016] >Input file: TMQ9Y3Q3M1G.pdb >TM segments: 26-72 MAIDEN score = 32.2083 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- C40 -D54 10 K38 -V57 10 C40 -L53 10 H42 -F51 1.44724787810608 C40 -F51 1.19747598697823 K38 -L53 1.18747217843412 D35 -V57 0.950404822277878 H42 -K50 0.894065901606308 F41 -F51 0.838319582223519 Q39 -V57 0.729515502793885 F41 -L53 0.705233233340237 L33 -Y63 0.691680745828618 K38 -I58 0.682378440246413 E43 -F51 0.665748998062245 E44 -V49 0.582609369139304 V57 -H62 0.506507795978258 E28 -P34 0.492041597687711 Q39 -Y63 0.474492669287833 E43 -C67 0.469287660835628 Q39 -Q56 0.460479666099891 P34 -G61 0.398239290729403 L33 -H62 0.388597209809993 E32 -G61 0.382522930734143 F41 -S52 0.377080959778373 L53 -V65 0.370637544684075 Q39 -E44 0.337240528102094 C40 -S52 0.316938787776932 N36 -G60 0.283985412984947 D35 -Y63 0.275494983981505 E46 -C67 0.274178472043884 E44 -L53 0.273815107159779 D54 -G60 0.270879675596203 H42 -Y55 0.268887005037603 V49 -C67 0.262958185392015 V49 -Y68 0.252960363908956 P34 -Q56 0.251170248249206 F31 -Y63 0.234708432089419 L29 -P34 0.230126289119001 L33 -V57 0.207058810488495 H42 -V49 0.203228065208354 V49 -D71 0.201508021231441 Q39 -G61 0.185626124178571 Q39 -C67 0.185349848630935 T30 -D35 0.184878237783553 E32 -K38 0.183846928593207 N36 -Y63 0.182874973016521 F41 -V49 0.182601051488824 E28 -T59 0.178677194975257 N36 -F41 0.177351227003358 D35 -G61 0.174710237262811 N36 -Q56 0.172754937439555 T30 -K38 0.169491623698882 D66 -D71 0.165425331685379 Y55 -D66 0.160951158450487 E46 -Y68 0.160521762759011 P34 -D64 0.150138779492272 F51 -Y68 0.148638065652342 A37 -H62 0.148572180304718 T30 -I58 0.147159441424903 L33 -Y55 0.146865294773287 Y55 -H62 0.145950876042735 N36 -D54 0.143809915575093 N36 -D66 0.142654086067685 E44 -V69 0.139619516243755 I58 -V65 0.138379154903104 N36 -Y55 0.130382675893155 L33 -G60 0.130178909663111 T59 -D64 0.125389361041706 E28 -N36 0.125321175216988 K50 -D66 0.124720584154507 E28 -G60 0.124403102075815 A37 -Y63 0.119198920413826 E46 -E70 0.114120055558923 K38 -T59 0.11135909860665 E28 -A37 0.109584059429323 E44 -E70 0.105641297388794 F41 -Q56 0.105237695349968 K38 -V65 0.105160923212974 S52 -D66 0.0994394903138816 E44 -S52 0.0981057881028983 K50 -D71 0.0954869867644113 S52 -C67 0.0938465157291177 S52 -V57 0.0929467714464565 I58 -D64 0.0888704685071771 D35 -H62 0.0849633540818351 C40 -V49 0.0790365694667461 E46 -V69 0.0786032989536332 V45 -S52 0.0783222149925127 E44 -D54 0.077593387947815 C67 -P72 0.0775594086181375 E32 -V57 0.0763024988197754 E44 -Y68 0.0716965343854411 P34 -Q39 0.0699052769725661 Q39 -Y55 0.0694456859431636 F41 -K50 0.0687134658376229 C40 -Y55 0.0661399029888088 S52 -I58 0.0658879142507489 F41 -E46 0.0637775661203594 Q39 -V45 0.0600192514924991 P34 -D54 0.0598209941368744 H42 -D54 0.059309759515294 Q39 -D66 0.0588661170909763 L53 -G60 0.0581123757951158 E32 -G60 0.0570282909577211 A37 -T59 0.0562393715707656 N36 -G61 0.0529890369694921 C40 -E46 0.0518775336228074 D35 -I58 0.0512120997008232 A37 -V57 0.0510885440007494 Q47 -V69 0.0504266111323211 L33 -Q56 0.0490078694121259 C40 -V69 0.0488369187431186 K50 -V69 0.0466445612014876 L53 -Y63 0.0450131164418854 A37 -D54 0.0436447802464865 F41 -D66 0.0426868972077306 N36 -D64 0.0417093606101853 H42 -G48 0.0385265019792067 L29 -A37 0.0368743375251039 T30 -H62 0.0355031268642145 F31 -K38 0.0342519964203978 G48 -V69 0.0334872563315045 Q47 -S52 0.0330314069667934 P34 -T59 0.032499293590913 A37 -V65 0.0313751993175018 Q56 -V65 0.0312442083354911 F41 -V65 0.0307514707784948 N36 -I58 0.0304741925783745 F41 -D54 0.0279228185480651 L53 -T59 0.0276806686546971 L29 -T59 0.0269934373977971 L53 -Y68 0.0262425388382921 H42 -Q47 0.0246634299645329 T59 -V65 0.0243070179135638 Y55 -Y63 0.023861081103429 L29 -G60 0.0212585629351594 A37 -D64 0.0182594199172441 F51 -V69 0.0164458628544879 E44 -F51 0.0162986540619388 Q56 -D64 0.0158740782819606 H42 -C67 0.0147567651519211 K50 -Y68 0.0138026247413296 T30 -N36 0.00995973772853631 S52 -D64 0.00881759701603974 P34 -V65 0.00869483499410312 E43 -L53 0.00769972068261016 F31 -I58 0.00655172014157923 F51 -V65 0.00598980811226912 T30 -Q56 0.00418723337994376 P34 -L53 0.00308438991738846 Y55 -G60 0.00305415044637924 Q47 -Y68 0.00131651238921293 Q56 -D66 0.000938561408120542 C40 -Y63 0.00012691870961401 F41 -C67 -4.24426152410007e-05 F31 -N36 -0.00177506317586484 A37 -L53 -0.00411928441087017 F41 -V57 -0.0062746840872725 F31 -V57 -0.00755312195962832 T30 -V57 -0.00799503427612444 D35 -L53 -0.00853036494120518 V45 -K50 -0.00950426250833214 V45 -F51 -0.0125027105936315 K38 -S52 -0.0126301865197265 V45 -Y68 -0.0129438691772297 C40 -I58 -0.0146972070801468 G61 -D66 -0.0148182168608795 P34 -D66 -0.0161737608548904 Q56 -H62 -0.0188592240941077 G48 -D71 -0.0199987145787018 K38 -F51 -0.0206465461547509 A37 -Q56 -0.0208814578098266 C40 -Q56 -0.021050087625754 Q47 -E70 -0.021073929732174 K50 -E70 -0.0213605392166705 E43 -S52 -0.0250081789654797 S52 -V69 -0.0257837014786841 Q47 -D71 -0.0267603058387018 Q56 -Y63 -0.0287148852182093 E32 -Q56 -0.0295836779209615 I58 -D66 -0.0297097715300401 N36 -T59 -0.0307095971401923 V57 -C67 -0.0322513737233887 L53 -D64 -0.0344527353120698 L29 -G61 -0.0350227007484566 C40 -T59 -0.0356286407791624 K38 -D66 -0.0381927726138978 V57 -V65 -0.0382416986097276 L33 -G61 -0.0390316135456259 E43 -V49 -0.0390970618367246 E43 -D54 -0.0410386441825663 F41 -Y68 -0.0436484036485076 V57 -Y63 -0.0450629816746808 D35 -Q56 -0.0452713422241674 D54 -Y63 -0.0453594035673683 Q39 -D64 -0.046447801305034 E44 -Y55 -0.0471783335583722 N36 -C67 -0.0485311335307745 P34 -H62 -0.0500301122664219 H42 -S52 -0.0502118968235437 Y55 -G61 -0.0521934055363324 F41 -G48 -0.0526363315270013 F51 -C67 -0.0543374337910985 L33 -D64 -0.0563255357405525 L29 -N36 -0.0588665854295396 D54 -D64 -0.061991978576851 L33 -Q39 -0.0635219990796927 D54 -G61 -0.0641239476903901 C40 -D66 -0.0661030388944663 N36 -L53 -0.0668471897369853 E32 -T59 -0.0677032607204673 D35 -Y55 -0.0703269195994034 D35 -F41 -0.0732659173441084 E28 -L33 -0.0737749345449123 T30 -G60 -0.0739437773230942 C40 -G60 -0.0745098593392988 L53 -G61 -0.0748830627156822 D35 -T59 -0.0750405959129901 E28 -G61 -0.0753359663237589 F41 -Q47 -0.0758741774411268 L53 -C67 -0.0759233540998214 E46 -S52 -0.0775471335161981 N36 -V65 -0.0784522568593131 S52 -V65 -0.0787125037255922 G48 -E70 -0.0787933716414784 D35 -G60 -0.0812195890503327 V49 -V69 -0.088624892450563 L33 -V65 -0.0891805330061999 Y55 -C67 -0.0893279530042559 F51 -D66 -0.0897897926142033 G60 -V65 -0.0921852457598726 E43 -V69 -0.0951575402096072 Q39 -T59 -0.0963140669073277 N36 -H62 -0.0974562596743773 Q39 -S52 -0.0982483324175536 D54 -D66 -0.0983296419124744 E43 -K50 -0.0988982757644473 K50 -Y55 -0.0990180253383084 D54 -C67 -0.100703588749111 G60 -D66 -0.101109757382277 L53 -V69 -0.102247740944658 S52 -Y68 -0.104964828790396 A37 -S52 -0.106265787810472 F31 -A37 -0.106901008992127 Q39 -L53 -0.11111043335577 C40 -C67 -0.111514309054719 F31 -H62 -0.115169357982425 P34 -Y55 -0.116342993357113 V45 -C67 -0.117833229123127 L53 -H62 -0.118922083647788 P34 -G60 -0.120332205120552 E44 -V65 -0.122954552396048 E44 -D66 -0.123049170998716 F51 -Q56 -0.126009909173536 V57 -D66 -0.12663176788912 V45 -L53 -0.127711828547405 A37 -D66 -0.129873360625996 A37 -G60 -0.137640590908487 V65 -E70 -0.13868240140142 I58 -Y63 -0.139714124777077 D54 -T59 -0.139992348918627 L33 -K38 -0.14212736896856 L53 -I58 -0.145112691899642 F51 -V57 -0.147385989804517 N36 -V57 -0.150472002998257 K38 -D64 -0.151138296107999 E32 -D64 -0.154566576435723 Q39 -D54 -0.158168647570974 Y55 -D64 -0.15836609425613 L53 -D66 -0.161267717358321 E46 -L53 -0.162873015659287 Q47 -C67 -0.163237578887793 E32 -I58 -0.163353051479267 D35 -D54 -0.164390278149924 E46 -F51 -0.165666247540685 L29 -D35 -0.172506311314644 D35 -D66 -0.178032599682787 D35 -D64 -0.17826892526139 F41 -Y55 -0.179496733387146 E32 -Y63 -0.180933981019948 V45 -E70 -0.182411906354055 D35 -C67 -0.185270556964862 V49 -E70 -0.187287879094639 P34 -Y63 -0.188284505733557 V57 -D64 -0.188422942963929 E43 -G48 -0.189186482797481 V45 -D66 -0.197581947006839 P34 -V57 -0.19887153713167 D35 -C40 -0.202309323556367 K38 -Y63 -0.203889318409407 D54 -H62 -0.204936695430942 Q39 -F51 -0.207973143169917 Y55 -V65 -0.210819971617566 K38 -C67 -0.213112119609096 T30 -A37 -0.21446161708962 Q39 -V65 -0.220831005807946 Q39 -K50 -0.22729189964123 C40 -Y68 -0.231006768870792 T30 -G61 -0.236823149058346 F31 -T59 -0.241862003749145 K50 -C67 -0.243298131273318 Q39 -I58 -0.244376033250999 K38 -Q56 -0.244454765712689 P34 -I58 -0.248045446113967 K38 -Y55 -0.249250277673639 D54 -V65 -0.249473360683691 F31 -G61 -0.251506674984396 K38 -G61 -0.252223035757517 V45 -D54 -0.254740241440611 P34 -C40 -0.257013310648558 K38 -D54 -0.258248216941768 E32 -H62 -0.258646714390686 K38 -G60 -0.264685394459593 F31 -G60 -0.265983438736331 E46 -D71 -0.267982525921943 L33 -T59 -0.274703797911517 A37 -I58 -0.277562162431725 V45 -V69 -0.286481177983902 K38 -H62 -0.291383297292423 D35 -V65 -0.295413119566715 E32 -A37 -0.298213771970506 C40 -D64 -0.300405732134096 C40 -K50 -0.304508900671048 E44 -K50 -0.31850452895285 L33 -I58 -0.324252012016214 Q56 -G61 -0.330938811771421 E44 -C67 -0.333749668769562 Q39 -H62 -0.34024752821245 Q39 -G60 -0.340844946987062 A37 -Y55 -0.345456130074591 C40 -V65 -0.356272834051003 C40 -V57 -0.370447112649082 T30 -T59 -0.374017722826362 H42 -L53 -0.415372602367722 A37 -G61 -0.447980913297398 C40 -V45 -0.509047139087087 H42 -Q56 -0.52378645577374