[Mon Aug 29 18:01:44 2016] >Input file: TMW5Y2T3M1G.pdb >TM segments: 247-267_ 286-303_ 423-432 MAIDEN score = -6.5610 Below is the ranking list of the residue pairs and their related pseudo-energy (the lower, the better). This includes inter-chain residue pairs. The maximum (least favorable) pairwise energy value has been set to 10. See the MAIDEN software article: Postic,G., Ghouzam,Y. and Gelly,J.C. (2015) Biochimie, 115, 155–161. ----------- ---------------- Calpha pair Empirical energy ----------- ---------------- A264 -R297 1.03492748351096 M288 -L293 0.687744027802608 V261 -A267 0.650085956675549 V261 -G300 0.639751238467433 S265 -G300 0.59850856530009 T250 -M288 0.562173370345945 A264 -V298 0.516735563627627 I249 -R291 0.479096036181353 A251 -M288 0.438588144548214 V260 -Q302 0.424887157411228 A252 -M288 0.360019321304161 V298 -Y303 0.353563011146963 L263 -A299 0.353140842028017 L263 -Q302 0.335599375590082 E294 -G300 0.322660930152544 S266 -A299 0.317612245758092 V256 -Y303 0.29467116130959 A251 -R287 0.28552575223889 A252 -L293 0.2805723809325 V254 -V259 0.277111494290773 A264 -G301 0.271976929220209 T250 -E294 0.255829456468836 A253 -R291 0.250318998268984 A251 -G290 0.249306443421778 V260 -G300 0.247157029324755 M288 -R297 0.242606215266787 W247 -T289 0.236164741034684 A252 -T289 0.236064860472961 E294 -A299 0.228496830068833 H292 -R297 0.219294276805584 A251 -F257 0.218840973905253 R287 -M296 0.210547992678477 R287 -R297 0.210050073330663 G290 -Y303 0.209857689376872 V256 -M288 0.205247677221025 R287 -H292 0.192686661236881 V254 -R287 0.189472583435554 F257 -Q302 0.189378244134505 L263 -M296 0.183943429407264 V254 -G290 0.183518942346591 V260 -E294 0.169466128943999 A264 -R295 0.164611632932084 W247 -G290 0.160621528054118 V261 -E294 0.158996632545827 A252 -R295 0.150059181511378 V261 -Y303 0.147261200541342 A264 -H292 0.145011541959009 H292 -Q302 0.13474896865685 R258 -Q302 0.131576765002373 R258 -A267 0.131102238304107 M296 -Q302 0.130908869294302 A267 -R297 0.130845499989623 V256 -L293 0.130206635486464 I255 -L293 0.127678280990677 V256 -L263 0.124051914323596 L263 -G301 0.123360798790676 P262 -V298 0.122452281858322 H292 -A299 0.121190873149898 R291 -G301 0.120404914931552 V259 -G301 0.116159450897124 R291 -Q302 0.11564022279382 I255 -L263 0.113912686936887 V259 -S265 0.112346205433332 T250 -V286 0.109048523869292 R291 -R297 0.107186513872501 A253 -G290 0.10626096666244 A253 -H292 0.106137682541104 V259 -G290 0.105776194631338 A264 -L293 0.105535771060601 A252 -R258 0.104697950891365 V261 -M296 0.104003769396527 A267 -G301 0.102100618626898 M288 -E294 0.0997105276289614 R297 -Q302 0.0993437680096818 V259 -L293 0.0984207270419808 G290 -G301 0.0946691801078514 I249 -G290 0.0938873901863388 I255 -M288 0.092824673164734 I249 -T289 0.0878559640983312 S266 -G301 0.0877406166464505 G248 -V254 0.0852386119937611 V259 -Y303 0.0851024998556682 V256 -A264 0.0840365265447014 P262 -R297 0.0838928489328934 I249 -I255 0.0831232871981535 T289 -G300 0.0823760886232039 A252 -V261 0.0814646441438107 A251 -H292 0.0795470478225173 R295 -Q302 0.0783632282117277 G290 -G300 0.0782973645267933 A264 -Y303 0.0780356433497387 F257 -S265 0.0774448979588378 E294 -Y303 0.0761842072924588 V254 -T289 0.0741632248001478 V286 -R291 0.0732681032817368 A264 -G290 0.0729783473224361 L263 -R295 0.0725468612639931 V260 -R295 0.0720573531285333 R258 -L293 0.071930965948134 F257 -R291 0.0715375229145598 A251 -T289 0.0647838495849169 R258 -L263 0.0637567104301002 A264 -R291 0.0632410629308973 A253 -A264 0.0632000036796234 A252 -G290 0.0617728838012042 G248 -H292 0.0615886602191096 F257 -A299 0.0610216690398038 A251 -R258 0.059831573515029 T289 -R297 0.0595715998335977 V260 -G290 0.0587106863158553 A253 -G300 0.0585549970685912 L293 -G301 0.057173616529163 A267 -M296 0.0563132495064753 A252 -M296 0.0534845777552402 A253 -L263 0.0527450989827241 V286 -R295 0.0526559902737075 A253 -P262 0.0523801159574271 F257 -G301 0.0504191447628104 S265 -V298 0.0490285775544193 M296 -G301 0.0466215006139219 V259 -R297 0.0461097970361153 G248 -L293 0.0460982274908086 P262 -L293 0.0443479396576718 H292 -G300 0.0440415140977697 A267 -L293 0.0439187861724579 V256 -G301 0.0432761593990669 F257 -H292 0.0432086283409543 G248 -M288 0.0416157612339481 I255 -G290 0.0407751903156068 I249 -F257 0.0397642939317198 G290 -A299 0.0391926724491412 A425 -L430 0.0381927127127524 T289 -Q302 0.0367358650781193 V260 -R291 0.0366420731774038 V260 -S266 0.0350998774183051 F257 -R297 0.0301746950180585 T250 -V256 0.030096170775978 S265 -Q302 0.0286378356289472 G248 -V256 0.0285523936904388 A251 -V286 0.02719153939407 V256 -E294 0.0244804054586225 V259 -A267 0.0238725310785934 R291 -A299 0.0225339226564572 V254 -L263 0.0219389332059237 A264 -M296 0.0218587241672683 V261 -L293 0.0187674773416076 V259 -E294 0.0173938363802049 I249 -V254 0.0162933211876016 F257 -A267 0.0148409986798148 H292 -G301 0.0147830181107116 V260 -H292 0.0136492879361381 A267 -E294 0.0133574165578532 R295 -G301 0.012172958166623 G248 -R291 0.0114175538109283 V260 -V298 0.00767138328909867 R291 -G300 0.00657825129417067 I249 -Q302 0.0064949476599212 T250 -R291 0.00541688919889705 I255 -A264 0.00318622069846874 R258 -A299 0.00280366038621871 G290 -R295 0.00238245765621548 V256 -G300 0.00182109066156499 R258 -Y303 0.00126171289538013 V254 -V286 0.000304364728448192 R295 -Y303 -0.000497574651838306 A253 -M296 -0.000818357819375892 R258 -G301 -0.00181531967107063 G248 -R287 -0.00241558818296372 A253 -V261 -0.00331564280399821 R297 -Y303 -0.00387810642537545 A252 -V259 -0.00575089153994757 A267 -A299 -0.00578569984417321 F257 -L293 -0.00759180513143409 S266 -E294 -0.00791105899841998 V256 -Q302 -0.0105188583075415 L263 -G300 -0.011014083344298 L293 -Q302 -0.0110903069869694 T289 -E294 -0.0118404786979651 I255 -P262 -0.0125587170661748 V261 -G290 -0.0126698561511693 W247 -A253 -0.0127376725708246 A253 -L293 -0.014904218577841 F257 -T289 -0.0157278539368508 T250 -R295 -0.0160567951629402 I249 -V286 -0.0175786432571385 I255 -T289 -0.0176336278983107 I249 -R287 -0.0201103368424296 A253 -V286 -0.0222360797840195 V259 -S266 -0.0224259751007501 V254 -M288 -0.0229743546785919 F257 -S266 -0.0230487276640891 R258 -G300 -0.0235661269862022 A252 -V260 -0.0256516186695793 A251 -E294 -0.0274989537133346 F257 -R287 -0.0275003343065352 V259 -A299 -0.0293094179958137 G290 -Q302 -0.0293251344236237 W247 -A252 -0.0305659201771422 A251 -V260 -0.0308030467799707 R291 -M296 -0.0341345294867161 L263 -L293 -0.0343029849579555 V286 -M296 -0.0353624040097009 R287 -R295 -0.0372245148169766 R295 -G300 -0.0398574669770573 G248 -E294 -0.0413026912812033 R258 -R297 -0.0416006551005148 V254 -L293 -0.0421882631985211 R291 -Y303 -0.0436341256734685 V260 -A267 -0.0441053818887527 V260 -T289 -0.0451928743699943 T289 -R295 -0.0476660174245978 S266 -M296 -0.047832384772339 V260 -M296 -0.0478752840904928 S265 -E294 -0.0480238139947854 V286 -H292 -0.0497655446345844 V259 -A264 -0.0505687443636145 A252 -V286 -0.0517563827282128 A264 -Q302 -0.0520562053130488 A251 -V259 -0.0526831051892822 S265 -R295 -0.0548754658873518 G290 -R297 -0.0573649496155886 G424 -A429 -0.0604111042258087 W247 -R291 -0.061538067372167 L293 -G300 -0.0625918080703611 S265 -Y303 -0.0636835653312051 P262 -G300 -0.0650864158026652 L263 -G290 -0.0660884477344226 V256 -T289 -0.0667705839860662 I249 -Y303 -0.0676711470348813 A267 -R295 -0.0691334821070138 R258 -S265 -0.0692130293014376 F257 -V286 -0.069504565102493 V256 -R291 -0.0742490367665978 F257 -A264 -0.0755851480156551 V254 -P262 -0.0773646906999995 S266 -R297 -0.0773787780390712 S265 -R297 -0.0783164252807484 A253 -E294 -0.0807133284482833 T250 -H292 -0.0835974281242704 F257 -R295 -0.0853857326215937 A253 -R258 -0.0865566574280394 G248 -A253 -0.089166865338937 V254 -V261 -0.0897971895096132 S266 -R295 -0.0899680601055395 G248 -T289 -0.0924361822655371 A252 -R297 -0.0945149872493527 R258 -S266 -0.0954176296990505 M288 -V298 -0.0977884663539639 V261 -S266 -0.0983352067840304 A253 -Q302 -0.0994995132424341 F257 -Y303 -0.0999873568871879 S266 -G300 -0.10121499725042 V261 -V298 -0.102177208282522 R287 -L293 -0.102475854612907 I249 -R295 -0.10506733819941 A252 -F257 -0.111703693918772 M288 -M296 -0.112049321574472 V259 -G300 -0.113128491271611 P262 -A299 -0.113787069404823 P262 -Y303 -0.117502280851181 I249 -V260 -0.117563213394971 F257 -G300 -0.118710293255515 V256 -P262 -0.119994948854742 K423 -A429 -0.120373316341723 A264 -E294 -0.122042034762869 P262 -E294 -0.123153927518295 A253 -R297 -0.12639128066988 P262 -A267 -0.129252801228187 V260 -M288 -0.130876656682399 T250 -M296 -0.131016110790887 V261 -R295 -0.134901687026692 T250 -F257 -0.135579487671554 V260 -G301 -0.1399058721493 L293 -Y303 -0.140214748091961 F257 -V298 -0.14098186664432 R258 -E294 -0.141504670876409 G290 -V298 -0.142430631210734 V256 -G290 -0.142881906588432 V254 -R291 -0.143242785676934 W247 -V256 -0.143423545203153 T289 -V298 -0.147407157736787 G290 -M296 -0.151302809004999 A253 -R295 -0.156567292006221 R258 -G290 -0.162062253754036 R291 -V298 -0.163510436599279 L263 -Y303 -0.163616673145528 F257 -G290 -0.163624353089605 S265 -M296 -0.164459675358413 V286 -E294 -0.165385664123328 V260 -R297 -0.167555406609669 V256 -R297 -0.168518476190173 R287 -E294 -0.170511358333564 F257 -M296 -0.170952278027396 V261 -R297 -0.171568815933562 I249 -E294 -0.174701395325739 A264 -A299 -0.175634570547294 L263 -V298 -0.177433207620568 K423 -Y428 -0.179259024402872 A253 -R287 -0.179939128853927 R258 -A264 -0.182193254551225 T250 -R287 -0.184455094054672 S265 -L293 -0.187751226100013 F257 -P262 -0.191222526155368 L293 -A299 -0.193032557677705 V261 -G301 -0.193108721849554 V254 -E294 -0.193765496269819 I249 -V256 -0.198638770306684 A267 -G300 -0.202834633175145 A253 -V260 -0.20718935500569 F257 -M288 -0.208165411203246 A252 -R291 -0.209136835897143 L263 -E294 -0.211226792938769 P262 -G301 -0.212912251545478 M288 -R295 -0.223219779680867 T250 -L293 -0.225884606228122 V261 -Q302 -0.226058531372438 A251 -R291 -0.226682239652277 A267 -V298 -0.233203258709508 V261 -A299 -0.237771060847797 A252 -E294 -0.250924930861687 A251 -V256 -0.252269858313214 V254 -H292 -0.258961297169549 S265 -G301 -0.261412608953014 V256 -H292 -0.271751712103232 V286 -L293 -0.272256428494124 E294 -G301 -0.273434818302518 V256 -V261 -0.273555547303491 A251 -L293 -0.274023391290535 V286 -R297 -0.27616674570193 F257 -E294 -0.280114706771778 V256 -R287 -0.282643797266427 F257 -L263 -0.283081951422984 L263 -R297 -0.284162514059736 V254 -V260 -0.28924387884954 T250 -G290 -0.291705465547107 I255 -V260 -0.29564337265847 T289 -M296 -0.297946070870879 E294 -Q302 -0.304535491424728 V259 -Q302 -0.308804034585215 G248 -G290 -0.31347318430074 I249 -L293 -0.315410389849035 V260 -S265 -0.317002710358566 S266 -V298 -0.324713194898918 A253 -T289 -0.326957157563542 V260 -L293 -0.331343115826236 H292 -V298 -0.334612259080734 A253 -M288 -0.338418521547153 V260 -A299 -0.338495476719505 A253 -V259 -0.340248452464448 I249 -M288 -0.355094115104134 V260 -Y303 -0.381485669771319 T250 -T289 -0.381658803176243 A252 -H292 -0.387113948158535 A252 -R287 -0.396746285943736 S265 -A299 -0.410852788646262 I255 -V261 -0.413657148878067 L293 -V298 -0.427342965281879 I249 -H292 -0.522779701970542 P262 -Q302 -0.558315474574984 A264 -G300 -0.77929137644723