Bioinformatique Structurale
Coarse-GrainVoici les différentes thématiques abordées et les différents intervenants impliqués dans l’enseignements les années précédentes:
Introduction à la structure des Macromolécules Biologiques: Visite de laboratoire expérimental
Cours RMN pour la résolution des structures des macromolécules Biologique – Dr Carine Tisné – (Laboratoire de Cristallographie et de RMN Biologique – CNRS – Université Paris Descartes-Paris 5)
Cours de Cristallographie pour la résolution des structures des macromolécules Biologique – Dr Daniel Picot (Institut de Biologie Physico-Chimique – CNRS – Université Pierre et Marie Curie)
Cours de Calcul des structures – Dr Thérèse Malliavin (Institut Pasteur – CNRS)
Cours Champs de Forces – Dr Krystina Zakrzewska (Insitut de Biologie et de Chimie des protéines – CNRS – Université de Lyon)
Cours Minimisation – Monte-Carlo – Dr Krystina Zakrzewska (Insitut de Biologie et de Chimie des protéines – CNRS – Université de Lyon)
Cours Dynamique Moléculaire – Dr Patrick Fuchs (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
Cours Mode Normaux – Dr David Perahia (Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée – CNRS – Ecole Normale Supérieure Cachan)
Cours Docking petites molécules/Drug Design – Dr Florent Barbaut (ITODYS – CNRS – Université Paris Diderot-Paris 7)
Cours Structure et Repliement des Protéines – Dr Jacques Chomilier (Institut de Minéralogie et de Physique de la Matière Condensé – CNRS – Université Pierre et Marie Curie)
Cours Simulations « Gros Grains » pour les macromolécules Biologique (Protéines, Lipides) – Dr Luca Monticelli (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
Cours Prédiction de Structures de Protéines – Dr Alexandre de Brevern (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
Cours Evaluation de Modèle de Structures de Protéines – Dr Jean-Christophe Gelly (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
Cours Docking de Macromolécules Biologiques – Pr Catherine Etchebest (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
Cours Docking Gros Grains de Macromolécules Biologiques (Protéines, ADN) – Dr Pierre Poulain ((Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
Voici le planning pour le module de Bioinformatique Structurale: Planning_Bioinfo_Struct_2010.pdf.
Voici les différentes thématiques abordées et les différents intervenants impliqués dans l’enseignement les années précédentes:
- Introduction à la structure des Macromolécules Biologiques: Visite de laboratoire expérimental
- RMN pour la résolution des structures des macromolécules Biologique – Dr Carine Tisné – (Laboratoire de Cristallographie et de RMN Biologique – CNRS – Université Paris Descartes-Paris 5)
- Cristallographie pour la résolution des structures des macromolécules Biologique – Dr Daniel Picot (Institut de Biologie Physico-Chimique – CNRS – Université Pierre et Marie Curie)
- Calcul de structures des structures des macromolécules Biologique – Dr Thérèse Malliavin (Institut Pasteur – CNRS)
- Champs de Forces pour la simulation – Dr Krystina Zakrzewska (Institut de Biologie et de Chimie des protéines – CNRS – Université de Lyon)
- Minimisation / Monte-Carlo – Dr Krystina Zakrzewska (Institut de Biologie et de Chimie des protéines – CNRS – Université de Lyon)
- Dynamique Moléculaire – Dr Patrick Fuchs (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
- Mode Normaux – Dr David Perahia (Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée – CNRS – Ecole Normale Supérieure Cachan)
- Docking petites molécules/Drug Design – Dr Florent Barbaut (ITODYS – CNRS – Université Paris Diderot-Paris 7)
- Docking petites molécules/Drug Design – Dr Nicolas Baurin (Sanofi-Aventis)
- Structure et Repliement des Protéines – Dr Jacques Chomilier (Institut de Minéralogie et de Physique de la Matière Condensé – CNRS – Université Pierre et Marie Curie)
- Modèles « Gros Grains » pour les macromolécules Biologiques (Protéines, Lipides) -Prof. Catherine Etchebest(Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7) Coarse-Grain.pdf
- Prédiction de Structures de Protéines – Prof. Catherine Etchebest et Dr Joseph Rebehmed Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)Modele3D.pdf
- Evaluation de Modèle de Structures de Protéines – Dr Jean-Christophe Gelly (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-Paris 7)
- Docking de Macromolécules Biologiques – Pr Catherine Etchebest (Dynamique des Systèmes et Interactions des Macromolécules Biologiques – INSERM – Université Paris Diderot-ParisProt-Prot-Interaction.pdf
- Le planning de l’année 2011-2012 pour le module de Bioinformatique Structurale est disponible sur didel (ainsi que le matériel de cours au format PDF).
