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TOPCONS2 result file
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Sequence number: 1
Sequence name: sp|P02724|GLPA_HUMAN Glycophorin-A OS=Homo sapiens GN=GYPA PE=1 SV=2
Sequence length: 150 aa.
Sequence:
MYGKIIFVLLLSEIVSISASSTTGVAMHTSTSSSVTKSYISSQTNDTHKRDTYAATPRAHEVSEISVRTVYPPEEETGERVQLAHHFSEPEITLIIFGVMAGVIGTILLISYGIRRLIKKSPSDVKPLPSPDTDVPLSSVEIENPETSDQ


TOPCONS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


OCTOPUS predicted topology:
oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


Philius predicted topology:
iiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


PolyPhobius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


SCAMPI predicted topology:
iMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


SPOCTOPUS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


1afoA:
ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii



Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G)

10 1.393
11 1.965
12 2.491
13 2.381
14 2.377
15 3.058
16 3.378
17 3.802
18 4.013
19 5.215
20 5.762
21 6.472
22 6.210
23 5.843
24 6.319
25 6.750
26 6.553
27 6.823
28 6.803
29 7.391
30 7.030
31 6.782
32 7.371
33 7.897
34 8.241
35 8.541
36 9.418
37 9.945
38 9.669
39 10.528
40 10.638
41 10.898
42 11.236
43 11.332
44 11.157
45 11.465
46 11.846
47 12.197
48 12.910
49 13.411
50 13.444
51 13.470
52 13.165
53 12.014
54 11.742
55 11.531
56 10.675
57 10.583
58 9.728
59 8.989
60 8.498
61 7.807
62 7.437
63 7.767
64 8.069
65 8.966
66 10.231
67 10.876
68 11.373
69 11.920
70 12.145
71 11.398
72 11.372
73 11.654
74 10.559
75 10.721
76 10.999
77 11.821
78 11.641
79 11.889
80 12.580
81 12.971
82 12.672
83 11.972
84 11.079
85 9.712
86 8.888
87 8.501
88 7.506
89 6.708
90 6.346
91 5.911
92 4.863
93 4.999
94 4.486
95 3.396
96 2.764
97 2.746
98 1.999
99 0.927
100 -0.046
101 -0.894
102 -0.429
103 -0.434
104 0.386
105 0.509
106 0.715
107 1.125
108 0.641
109 0.893
110 1.668
111 2.676
112 3.617
113 5.277
114 6.984
115 7.908
116 8.551
117 9.220
118 10.224
119 10.355
120 10.794
121 11.009
122 11.611
123 11.565
124 11.637
125 12.061
126 12.030
127 12.620
128 12.128
129 12.027
130 11.847
131 11.361
132 11.480
133 10.623
134 10.384
135 10.755
136 10.616
137 10.369
138 10.505
139 10.313
140 10.330
141 10.406

Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability)

11	38.10
12	39.05
13	40.95
14	42.86
15	44.76
16	46.67
17	49.52
18	52.38
19	55.24
20	58.10
21	60.95
22	63.81
23	66.67
24	69.52
25	72.38
26	75.24
27	78.10
28	80.95
29	83.81
30	86.67
31	90.48
32	94.29
33	96.19
34	97.14
35	98.10
36	99.05
37	100.00
38	100.00
39	100.00
40	100.00
41	100.00
42	100.00
43	100.00
44	100.00
45	100.00
46	100.00
47	100.00
48	100.00
49	100.00
50	100.00
51	100.00
52	100.00
53	100.00
54	100.00
55	100.00
56	100.00
57	100.00
58	100.00
59	100.00
60	100.00
61	100.00
62	100.00
63	100.00
64	100.00
65	100.00
66	100.00
67	100.00
68	100.00
69	100.00
70	100.00
71	100.00
72	100.00
73	100.00
74	100.00
75	100.00
76	100.00
77	100.00
78	100.00
79	100.00
80	98.10
81	96.19
82	95.24
83	94.29
84	94.29
85	94.29
86	94.29
87	94.29
88	94.29
89	94.29
90	94.29
91	94.29
92	94.29
93	94.29
94	94.29
95	94.29
96	94.29
97	94.29
98	94.29
99	94.29
100	94.29
101	94.29
102	94.29
103	92.38
104	91.43
105	91.43
106	91.43
107	91.43
108	91.43
109	91.43
110	91.43
111	91.43
112	91.43
113	91.43
114	91.43
115	91.43
116	91.43
117	91.43
118	91.43
119	91.43
120	91.43
121	91.43
122	93.33
123	95.24
124	98.10
125	100.00
126	100.00
127	100.00
128	100.00
129	100.00
130	100.00
131	100.00
132	100.00
133	100.00
134	100.00
135	100.00
136	100.00
137	100.00
138	100.00
139	100.00

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