############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:35:13 Total request time: 12.9 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P10319|1B58_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, B-58 alpha chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HLA-B PE=1 SV=1 Sequence length: 362 aa. Sequence: MRVTAPRTVLLLLWGAVALTETWAGSHSMRYFYTAMSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASPRTEPRAPWIEQEGPEYWDGETRNMKASAQTYRENLRIALRYYNQSEAGSHIIQRMYGCDLGPDGRLLRGHDQSAYDGKDYIALNEDLSSWTAADTAAQITQRKWEAARVAEQLRAYLEGLCVEWLRRYLENGKETLQRADPPKTHVTHHPVSDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDRTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEPSSQSTIPIVGIVAGLAVLAVVVIGAVVATVMCRRKSSGGKGGSYSQAASSDSAQGSDVSLTA TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: oooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 1.184 11 0.841 12 1.359 13 1.261 14 0.980 15 0.874 16 0.821 17 1.296 18 2.009 19 2.824 20 3.671 21 4.414 22 4.875 23 5.081 24 5.255 25 5.049 26 5.213 27 5.472 28 6.112 29 6.833 30 7.400 31 7.423 32 7.526 33 8.004 34 8.333 35 8.554 36 8.321 37 7.580 38 7.501 39 7.805 40 8.031 41 8.429 42 8.419 43 8.091 44 7.948 45 7.827 46 7.605 47 7.725 48 7.387 49 6.929 50 6.761 51 6.699 52 7.147 53 7.084 54 7.400 55 7.800 56 8.414 57 9.083 58 9.854 59 10.035 60 9.834 61 10.548 62 10.761 63 10.227 64 9.933 65 10.552 66 9.939 67 10.192 68 10.956 69 11.566 70 12.434 71 12.376 72 12.548 73 12.716 74 12.478 75 11.903 76 11.677 77 11.292 78 11.792 79 11.935 80 11.427 81 11.628 82 11.929 83 12.577 84 12.504 85 13.337 86 13.564 87 13.642 88 12.978 89 11.988 90 11.305 91 11.238 92 10.825 93 10.611 94 10.698 95 10.160 96 9.814 97 9.051 98 9.049 99 8.832 100 7.954 101 8.337 102 8.500 103 8.835 104 9.274 105 9.463 106 9.350 107 9.647 108 10.142 109 9.693 110 8.410 111 8.200 112 8.367 113 8.004 114 7.581 115 7.600 116 7.938 117 8.429 118 8.480 119 9.225 120 9.068 121 9.171 122 9.281 123 8.446 124 8.089 125 7.277 126 6.757 127 6.664 128 7.602 129 8.210 130 8.739 131 9.753 132 10.329 133 10.582 134 10.718 135 10.878 136 10.675 137 11.481 138 11.063 139 10.637 140 10.504 141 9.945 142 10.614 143 11.619 144 12.455 145 11.948 146 11.538 147 10.981 148 9.761 149 8.833 150 8.238 151 7.981 152 8.104 153 7.687 154 7.356 155 7.070 156 7.219 157 7.307 158 7.461 159 7.940 160 8.239 161 7.609 162 6.800 163 7.240 164 7.937 165 8.044 166 8.412 167 9.149 168 9.461 169 10.146 170 10.782 171 9.977 172 9.903 173 9.721 174 9.233 175 7.934 176 8.221 177 8.267 178 7.367 179 7.463 180 7.340 181 8.150 182 7.123 183 6.285 184 5.754 185 5.243 186 4.729 187 3.928 188 3.984 189 4.388 190 5.877 191 7.313 192 9.296 193 10.299 194 10.678 195 10.739 196 10.144 197 10.187 198 10.258 199 10.763 200 10.601 201 11.366 202 12.104 203 13.285 204 13.682 205 13.871 206 14.706 207 14.247 208 13.638 209 13.032 210 12.787 211 11.999 212 12.181 213 13.006 214 12.250 215 12.129 216 11.679 217 11.220 218 10.599 219 9.728 220 9.386 221 8.816 222 8.391 223 8.184 224 7.930 225 7.600 226 6.550 227 6.450 228 6.024 229 5.247 230 4.272 231 3.490 232 2.239 233 2.429 234 2.394 235 3.320 236 4.183 237 5.553 238 6.819 239 7.904 240 9.032 241 10.318 242 12.008 243 12.802 244 13.442 245 13.100 246 12.208 247 12.607 248 12.422 249 12.632 250 12.701 251 12.658 252 11.971 253 11.990 254 11.401 255 10.901 256 10.185 257 10.597 258 10.559 259 10.698 260 10.560 261 10.420 262 10.543 263 9.977 264 10.066 265 10.201 266 9.198 267 8.826 268 8.934 269 8.534 270 8.410 271 7.774 272 7.030 273 6.854 274 6.896 275 8.116 276 8.267 277 9.210 278 10.705 279 12.097 280 12.694 281 12.405 282 12.621 283 12.452 284 11.832 285 10.846 286 10.280 287 8.957 288 8.368 289 7.961 290 8.954 291 9.669 292 10.100 293 10.706 294 10.930 295 11.466 296 11.123 297 10.462 298 10.098 299 9.284 300 9.087 301 8.554 302 7.620 303 6.643 304 6.468 305 6.410 306 6.096 307 5.620 308 5.204 309 3.502 310 2.609 311 2.063 312 1.506 313 0.791 314 0.378 315 0.677 316 0.690 317 0.104 318 0.034 319 -0.089 320 -0.534 321 -0.450 322 -0.363 323 -0.236 324 -0.413 325 0.042 326 0.615 327 1.469 328 2.807 329 3.855 330 5.155 331 6.442 332 7.792 333 9.021 334 9.552 335 9.482 336 9.486 337 9.761 338 9.555 339 9.392 340 9.623 341 9.969 342 10.264 343 10.436 344 10.340 345 10.645 346 10.524 347 10.478 348 10.700 349 10.340 350 10.396 351 9.886 352 9.685 353 9.318 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; 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