############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 02:40:59 Total request time: 11.2 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P11279|LAMP1_HUMAN Lysosome-associated membrane glycoprotein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMP1 PE=1 SV=3 Sequence length: 417 aa. Sequence: MAAPGSARRPLLLLLLLLLLGLMHCASAAMFMVKNGNGTACIMANFSAAFSVNYDTKSGPKNMTFDLPSDATVVLNRSSCGKENTSDPSLVIAFGRGHTLTLNFTRNATRYSVQLMSFVYNLSDTHLFPNASSKEIKTVESITDIRADIDKKYRCVSGTQVHMNNVTVTLHDATIQAYLSNSSFSRGETRCEQDRPSPTTAPPAPPSPSPSPVPKSPSVDKYNVSGTNGTCLLASMGLQLNLTYERKDNTTVTRLLNINPNKTSASGSCGAHLVTLELHSEGTTVLLFQFGMNASSSRFFLQGIQLNTILPDARDPAFKAANGSLRALQATVGNSYKCNAEEHVRVTKAFSVNIFKVWVQAFKVEGGQFGSVEECLLDENSMLIPIAVGGALAGLVLIVLIAYLVGRKRSHAGYQTI TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii 2mofA: ------------oooooooooooooooooooooooooo-oooooooooooooooooooo-oooooooooooooooooooooooo-oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo-oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo-----oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo-oooooooooooooooooo--oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiii-- Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 2.774 11 1.501 12 0.900 13 -0.202 14 -1.218 15 -1.205 16 -1.852 17 -1.931 18 -1.547 19 -1.437 20 -1.780 21 -1.276 22 -1.106 23 -0.509 24 -0.006 25 0.680 26 2.051 27 3.080 28 4.187 29 5.245 30 6.051 31 6.070 32 6.600 33 6.677 34 6.147 35 6.223 36 6.909 37 6.160 38 6.248 39 5.993 40 5.688 41 5.412 42 5.460 43 5.190 44 5.196 45 4.616 46 4.826 47 4.361 48 4.586 49 5.461 50 6.409 51 7.345 52 8.274 53 9.680 54 10.335 55 10.525 56 10.895 57 11.026 58 10.782 59 11.120 60 11.551 61 11.181 62 11.021 63 10.485 64 10.385 65 9.703 66 9.173 67 9.423 68 8.800 69 8.409 70 8.086 71 7.561 72 6.944 73 7.075 74 7.895 75 9.161 76 9.099 77 9.955 78 10.217 79 10.407 80 10.540 81 10.361 82 10.505 83 10.515 84 10.453 85 10.223 86 9.447 87 8.996 88 8.448 89 8.267 90 7.765 91 6.736 92 6.292 93 5.170 94 5.391 95 5.445 96 5.358 97 5.136 98 5.316 99 4.984 100 5.342 101 5.506 102 5.766 103 6.327 104 6.962 105 7.641 106 7.934 107 8.100 108 8.245 109 7.917 110 7.943 111 7.196 112 7.448 113 5.687 114 5.649 115 5.752 116 5.669 117 5.583 118 5.458 119 5.428 120 6.167 121 7.041 122 7.036 123 7.561 124 7.287 125 7.741 126 8.482 127 8.057 128 8.850 129 9.189 130 9.512 131 10.031 132 11.143 133 10.884 134 10.768 135 11.317 136 10.518 137 10.747 138 10.630 139 10.341 140 9.386 141 9.651 142 9.808 143 9.976 144 10.142 145 10.149 146 10.660 147 10.717 148 11.323 149 11.933 150 11.301 151 11.395 152 11.383 153 11.753 154 10.841 155 10.799 156 10.741 157 9.882 158 8.773 159 8.143 160 7.239 161 6.558 162 7.129 163 7.873 164 8.072 165 8.237 166 8.170 167 8.335 168 8.110 169 8.072 170 7.175 171 7.501 172 7.272 173 7.638 174 7.486 175 6.541 176 6.791 177 6.680 178 6.853 179 7.386 180 7.864 181 7.351 182 7.155 183 8.114 184 8.910 185 9.857 186 10.161 187 11.378 188 12.351 189 13.371 190 13.233 191 12.784 192 12.312 193 12.395 194 13.357 195 12.989 196 13.239 197 13.145 198 12.309 199 12.242 200 12.253 201 12.426 202 11.681 203 11.604 204 11.153 205 11.497 206 11.255 207 11.418 208 11.489 209 11.860 210 11.913 211 12.288 212 12.394 213 11.971 214 12.548 215 12.319 216 12.554 217 12.640 218 12.487 219 12.981 220 12.743 221 12.259 222 11.621 223 10.718 224 9.371 225 8.614 226 8.116 227 6.995 228 6.440 229 5.482 230 5.193 231 4.465 232 4.942 233 3.860 234 3.805 235 3.302 236 3.767 237 3.872 238 3.761 239 4.561 240 6.061 241 7.020 242 8.236 243 9.391 244 10.110 245 10.341 246 10.196 247 9.339 248 10.076 249 8.926 250 9.206 251 8.913 252 9.826 253 9.913 254 9.818 255 9.449 256 9.137 257 8.837 258 8.749 259 8.544 260 8.591 261 8.906 262 8.932 263 9.460 264 9.019 265 8.961 266 8.857 267 7.323 268 7.466 269 6.197 270 6.199 271 5.717 272 6.044 273 6.542 274 6.299 275 6.458 276 6.332 277 5.798 278 5.310 279 5.053 280 5.154 281 4.945 282 4.792 283 5.041 284 5.321 285 5.126 286 5.617 287 5.327 288 6.118 289 5.563 290 5.043 291 4.128 292 3.540 293 4.089 294 4.725 295 4.924 296 5.964 297 6.316 298 7.162 299 6.790 300 6.681 301 5.563 302 5.505 303 5.227 304 5.192 305 5.012 306 5.484 307 6.030 308 6.627 309 7.145 310 8.342 311 9.409 312 9.571 313 10.504 314 11.250 315 11.052 316 10.822 317 9.977 318 9.539 319 8.857 320 9.110 321 8.280 322 7.641 323 7.546 324 7.846 325 7.999 326 7.764 327 7.488 328 7.698 329 7.112 330 7.418 331 7.460 332 7.877 333 8.488 334 9.110 335 9.822 336 10.098 337 10.201 338 10.455 339 10.350 340 10.394 341 10.186 342 10.529 343 10.277 344 10.251 345 9.910 346 9.527 347 9.252 348 8.832 349 7.612 350 6.941 351 6.331 352 5.418 353 4.798 354 5.317 355 5.536 356 6.191 357 6.636 358 6.954 359 7.600 360 7.808 361 7.911 362 8.230 363 7.352 364 7.806 365 8.754 366 8.482 367 8.270 368 7.902 369 8.163 370 8.047 371 8.519 372 9.253 373 9.144 374 9.092 375 8.664 376 9.007 377 8.530 378 7.979 379 7.931 380 7.575 381 6.977 382 6.517 383 5.078 384 3.916 385 3.777 386 3.407 387 3.278 388 2.143 389 1.214 390 0.722 391 -0.103 392 -0.283 393 -0.081 394 -0.355 395 -1.401 396 -1.560 397 -1.443 398 -1.412 399 -1.177 400 -1.023 401 -0.019 402 1.755 403 2.653 404 3.734 405 4.945 406 6.172 407 7.229 408 7.691 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; 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