############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 02:41:04 Total request time: 12.0 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P13473|LAMP2_HUMAN Lysosome-associated membrane glycoprotein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=LAMP2 PE=1 SV=2 Sequence length: 410 aa. Sequence: MVCFRLFPVPGSGLVLVCLVLGAVRSYALELNLTDSENATCLYAKWQMNFTVRYETTNKTYKTVTISDHGTVTYNGSICGDDQNGPKIAVQFGPGFSWIANFTKAASTYSIDSVSFSYNTGDNTTFPDAEDKGILTVDELLAIRIPLNDLFRCNSLSTLEKNDVVQHYWDVLVQAFVQNGTVSTNEFLCDKDKTSTVAPTIHTTVPSPTTTPTPKEKPEAGTYSVNNGNDTCLLATMGLQLNITQDKVASVININPNTTHSTGSCRSHTALLRLNSSTIKYLDFVFAVKNENRFYLKEVNISMYLVNGSVFSIANNNLSYWDAPLGSSYMCNKEQTVSVSGAFQINTFDLRVQPFNVTQGKYSTAQDCSADDDNFLVPIAVGAALAGVLILVLLAYFIGLKHHHAGYEQF TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii 2mofA: ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiii Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 2.063 11 1.781 12 1.249 13 1.310 14 1.322 15 1.006 16 1.023 17 1.525 18 0.864 19 0.945 20 0.401 21 1.258 22 1.261 23 2.359 24 2.983 25 3.467 26 4.340 27 4.930 28 5.719 29 6.818 30 7.039 31 7.491 32 7.350 33 7.014 34 6.980 35 6.965 36 7.030 37 6.949 38 7.228 39 7.518 40 7.387 41 7.762 42 7.494 43 7.912 44 7.849 45 7.276 46 7.519 47 6.671 48 5.966 49 6.611 50 7.167 51 7.584 52 8.197 53 8.907 54 9.332 55 9.535 56 10.108 57 9.757 58 10.167 59 9.930 60 10.793 61 10.980 62 10.795 63 10.464 64 10.062 65 8.609 66 8.537 67 8.436 68 7.778 69 7.492 70 7.500 71 7.779 72 7.675 73 8.093 74 8.626 75 9.339 76 9.957 77 10.063 78 10.280 79 9.770 80 9.822 81 10.165 82 11.092 83 11.197 84 11.666 85 11.677 86 11.491 87 10.670 88 10.678 89 9.824 90 8.598 91 7.634 92 7.608 93 6.568 94 5.974 95 6.064 96 5.705 97 5.593 98 6.187 99 6.409 100 6.463 101 6.372 102 6.543 103 6.671 104 6.662 105 6.681 106 7.570 107 7.015 108 7.425 109 7.178 110 7.572 111 6.669 112 7.027 113 7.302 114 7.839 115 8.072 116 8.383 117 8.116 118 8.947 119 9.638 120 9.631 121 10.671 122 10.741 123 10.808 124 11.344 125 11.146 126 11.226 127 10.936 128 10.939 129 10.826 130 11.466 131 10.703 132 9.871 133 9.087 134 8.526 135 7.932 136 7.338 137 6.788 138 5.525 139 5.640 140 5.438 141 4.713 142 4.529 143 4.547 144 4.792 145 5.671 146 6.014 147 5.629 148 5.665 149 5.409 150 5.578 151 6.932 152 7.203 153 7.722 154 8.074 155 8.061 156 7.523 157 8.642 158 8.867 159 8.731 160 9.012 161 9.588 162 9.728 163 9.607 164 9.308 165 9.721 166 10.282 167 9.715 168 9.431 169 9.970 170 9.211 171 8.847 172 7.863 173 6.960 174 6.845 175 6.578 176 6.770 177 6.924 178 7.146 179 7.098 180 6.815 181 7.272 182 7.934 183 8.513 184 8.726 185 9.228 186 10.226 187 10.722 188 10.678 189 10.427 190 10.935 191 11.228 192 11.172 193 11.148 194 10.794 195 9.585 196 8.490 197 8.707 198 9.016 199 8.909 200 8.343 201 7.918 202 7.376 203 7.507 204 7.578 205 7.789 206 8.189 207 9.132 208 9.872 209 10.236 210 11.610 211 12.335 212 12.555 213 12.915 214 12.922 215 13.055 216 12.512 217 12.667 218 12.579 219 12.687 220 13.069 221 13.265 222 12.509 223 12.223 224 11.206 225 10.243 226 9.282 227 8.891 228 8.219 229 7.498 230 6.973 231 7.026 232 6.382 233 6.641 234 5.876 235 5.469 236 5.009 237 4.771 238 4.779 239 4.565 240 4.747 241 5.678 242 6.236 243 6.906 244 8.261 245 8.361 246 8.783 247 9.136 248 9.352 249 9.561 250 8.870 251 9.635 252 9.173 253 9.248 254 9.524 255 9.526 256 9.234 257 9.246 258 9.845 259 10.583 260 10.301 261 10.336 262 9.905 263 8.791 264 8.744 265 7.611 266 7.567 267 7.026 268 7.182 269 7.141 270 6.571 271 6.595 272 6.579 273 5.998 274 6.176 275 5.960 276 6.023 277 5.616 278 5.228 279 5.284 280 5.496 281 6.420 282 7.582 283 7.982 284 8.142 285 7.127 286 6.400 287 5.682 288 6.134 289 7.399 290 7.843 291 9.275 292 10.097 293 10.178 294 10.327 295 9.822 296 9.038 297 8.195 298 8.062 299 7.625 300 6.824 301 6.065 302 5.024 303 5.220 304 5.273 305 5.084 306 5.883 307 5.944 308 5.721 309 5.287 310 5.272 311 5.458 312 5.093 313 5.778 314 6.247 315 7.474 316 7.685 317 8.068 318 8.525 319 8.685 320 8.751 321 8.849 322 8.202 323 8.433 324 8.280 325 8.195 326 7.777 327 7.361 328 7.944 329 8.185 330 8.673 331 9.458 332 9.505 333 9.510 334 8.676 335 9.195 336 8.351 337 8.153 338 7.565 339 7.075 340 7.284 341 6.834 342 6.286 343 6.059 344 6.070 345 6.247 346 6.512 347 7.637 348 7.711 349 8.080 350 8.441 351 8.630 352 8.828 353 8.872 354 8.656 355 8.605 356 7.854 357 8.393 358 9.403 359 9.340 360 10.297 361 10.544 362 11.113 363 10.987 364 11.218 365 12.386 366 11.590 367 11.390 368 11.329 369 11.313 370 10.898 371 10.672 372 10.472 373 9.872 374 9.217 375 8.435 376 6.667 377 5.437 378 4.986 379 4.068 380 3.058 381 2.128 382 1.149 383 0.567 384 -0.613 385 -0.804 386 -0.750 387 -1.100 388 -1.905 389 -2.083 390 -1.789 391 -1.954 392 -1.754 393 -0.671 394 0.404 395 1.791 396 2.345 397 2.992 398 3.351 399 4.469 400 5.553 401 6.220 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; 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