############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:38:50 Total request time: 13.5 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P15151|PVR_HUMAN Poliovirus receptor OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PVR PE=1 SV=2 Sequence length: 417 aa. Sequence: MARAMAAAWPLLLVALLVLSWPPPGTGDVVVQAPTQVPGFLGDSVTLPCYLQVPNMEVTHVSQLTWARHGESGSMAVFHQTQGPSYSESKRLEFVAARLGAELRNASLRMFGLRVEDEGNYTCLFVTFPQGSRSVDIWLRVLAKPQNTAEVQKVQLTGEPVPMARCVSTGGRPPAQITWHSDLGGMPNTSQVPGFLSGTVTVTSLWILVPSSQVDGKNVTCKVEHESFEKPQLLTVNLTVYYPPEVSISGYDNNWYLGQNEATLTCDARSNPEPTGYNWSTTMGPLPPFAVAQGAQLLIRPVDKPINTTLICNVTNALGARQAELTVQVKEGPPSEHSGISRNAIIFLVLGILVFLILLGIGIYFYWSKCSREVLWHCHLCPSSTEHASASANGHVSYSAVSRENSSSQDPQTEGTR TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 -0.079 11 -0.027 12 -0.656 13 -0.690 14 -0.632 15 -0.136 16 0.538 17 1.047 18 1.922 19 3.181 20 3.254 21 4.158 22 4.904 23 6.269 24 6.558 25 7.067 26 7.438 27 8.241 28 8.154 29 8.855 30 8.945 31 9.003 32 8.329 33 8.330 34 8.235 35 8.143 36 8.051 37 7.694 38 6.804 39 7.107 40 7.056 41 6.785 42 5.616 43 5.839 44 5.399 45 5.902 46 5.948 47 6.084 48 6.572 49 6.249 50 6.577 51 7.443 52 7.114 53 7.214 54 7.481 55 7.248 56 7.248 57 7.210 58 6.594 59 6.571 60 7.147 61 7.974 62 8.176 63 8.754 64 9.077 65 9.224 66 9.527 67 8.960 68 8.922 69 8.285 70 7.969 71 7.959 72 7.129 73 7.017 74 7.731 75 8.173 76 8.756 77 8.748 78 9.231 79 9.371 80 9.671 81 9.913 82 10.018 83 9.731 84 10.502 85 10.551 86 10.811 87 11.039 88 11.371 89 10.643 90 9.657 91 9.523 92 8.483 93 8.152 94 7.001 95 6.485 96 7.118 97 6.650 98 6.434 99 5.776 100 5.540 101 5.601 102 5.652 103 5.519 104 5.593 105 5.617 106 5.555 107 6.295 108 6.662 109 7.538 110 7.694 111 8.465 112 7.709 113 8.177 114 8.269 115 7.454 116 7.283 117 6.967 118 7.180 119 6.665 120 6.700 121 7.253 122 6.967 123 7.336 124 7.037 125 7.167 126 6.205 127 6.334 128 5.925 129 5.777 130 5.497 131 6.022 132 6.312 133 6.232 134 6.485 135 6.972 136 7.277 137 7.672 138 8.736 139 8.408 140 8.086 141 8.641 142 8.259 143 8.590 144 8.482 145 8.523 146 8.801 147 8.854 148 9.049 149 9.659 150 10.088 151 10.506 152 10.876 153 11.075 154 10.694 155 9.973 156 9.363 157 8.668 158 8.335 159 8.236 160 7.520 161 7.719 162 7.402 163 7.370 164 8.054 165 7.955 166 8.306 167 8.912 168 8.489 169 8.031 170 7.618 171 8.371 172 8.173 173 8.555 174 8.142 175 8.455 176 8.676 177 8.653 178 8.762 179 9.466 180 9.106 181 9.031 182 9.541 183 8.956 184 8.774 185 9.110 186 8.383 187 8.252 188 8.520 189 8.975 190 8.065 191 7.550 192 7.094 193 7.320 194 6.782 195 6.719 196 6.074 197 5.126 198 4.296 199 3.505 200 2.787 201 2.583 202 3.038 203 2.944 204 3.130 205 3.543 206 4.388 207 4.463 208 4.679 209 5.623 210 6.025 211 6.438 212 6.864 213 7.622 214 7.844 215 9.431 216 10.874 217 11.870 218 12.629 219 12.320 220 12.567 221 12.314 222 12.270 223 12.471 224 12.072 225 11.344 226 11.091 227 10.775 228 10.648 229 10.299 230 10.078 231 9.718 232 8.839 233 8.137 234 7.508 235 6.948 236 6.590 237 6.396 238 7.165 239 6.364 240 6.619 241 6.601 242 5.948 243 6.699 244 7.569 245 7.930 246 7.743 247 7.182 248 7.058 249 7.559 250 8.488 251 9.878 252 11.040 253 11.070 254 10.895 255 9.733 256 9.594 257 9.035 258 9.269 259 8.554 260 7.963 261 8.093 262 8.284 263 8.162 264 8.694 265 10.018 266 10.581 267 11.416 268 11.154 269 11.247 270 10.285 271 10.042 272 9.994 273 9.942 274 10.234 275 10.471 276 10.912 277 10.078 278 10.320 279 10.674 280 9.702 281 8.768 282 7.941 283 6.746 284 6.254 285 6.346 286 6.059 287 6.635 288 5.762 289 5.475 290 4.911 291 4.769 292 4.992 293 4.971 294 5.257 295 5.362 296 6.683 297 6.894 298 7.973 299 9.013 300 9.497 301 9.370 302 9.175 303 8.334 304 8.192 305 7.825 306 6.939 307 7.526 308 7.518 309 6.856 310 6.798 311 5.909 312 5.590 313 5.533 314 5.303 315 5.596 316 5.745 317 5.691 318 6.031 319 6.864 320 7.580 321 8.054 322 8.920 323 8.513 324 8.816 325 9.318 326 9.112 327 9.781 328 10.950 329 11.370 330 11.902 331 11.945 332 11.965 333 11.823 334 11.350 335 11.406 336 10.989 337 10.597 338 9.630 339 9.106 340 8.688 341 7.262 342 6.723 343 5.699 344 4.160 345 3.082 346 1.410 347 0.084 348 -0.670 349 -1.745 350 -2.209 351 -2.461 352 -2.770 353 -3.202 354 -3.286 355 -3.247 356 -3.455 357 -3.275 358 -3.029 359 -2.583 360 -1.486 361 -1.215 362 -0.045 363 1.141 364 2.523 365 3.630 366 4.340 367 4.729 368 6.136 369 6.750 370 7.261 371 6.995 372 6.543 373 6.850 374 7.118 375 7.524 376 7.297 377 7.766 378 7.862 379 7.469 380 7.753 381 7.454 382 7.841 383 7.479 384 8.484 385 9.534 386 10.289 387 9.850 388 10.223 389 9.282 390 9.655 391 9.441 392 8.803 393 8.637 394 8.260 395 8.894 396 9.028 397 8.842 398 9.345 399 9.726 400 10.635 401 11.033 402 11.858 403 12.088 404 12.092 405 12.425 406 12.919 407 12.749 408 12.887 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; 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