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TOPCONS2 result file
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Sequence number: 1
Sequence name: sp|P19256|LFA3_HUMAN Lymphocyte function-associated antigen 3 OS=Homo sapiens GN=CD58 PE=1 SV=1
Sequence length: 250 aa.
Sequence:
MVAGSDAGRALGVLSVVCLLHCFGFISCFSQQIYGVVYGNVTFHVPSNVPLKEVLWKKQKDKVAELENSEFRAFSSFKNRVYLDTVSGSLTIYNLTSSDEDEYEMESPNITDTMKFFLYVLESLPSPTLTCALTNGSIEVQCMIPEHYNSHRGLIMYSWDCPMEQCKRNSTSIYFKMENDLPQKIQCTLSNPLFNTTSSIILTTCIPSSGHSRHRYALIPIPLAVITTCIVLYMNGILKCDRKPDRTNSN


TOPCONS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii


OCTOPUS predicted topology:
oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo


Philius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii


PolyPhobius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii


SCAMPI predicted topology:
oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo


SPOCTOPUS predicted topology:
oooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooo


Homology:
No homologous hits found



Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G)

10 5.144
11 4.038
12 3.698
13 2.914
14 1.621
15 1.194
16 0.370
17 0.218
18 0.369
19 0.544
20 0.486
21 1.187
22 1.680
23 2.450
24 3.024
25 2.880
26 3.420
27 3.610
28 3.862
29 4.279
30 5.204
31 5.190
32 5.463
33 5.961
34 5.460
35 6.168
36 6.161
37 6.158
38 6.388
39 7.024
40 6.777
41 7.006
42 6.227
43 6.723
44 7.547
45 7.419
46 7.281
47 7.251
48 7.650
49 7.673
50 7.935
51 8.908
52 10.001
53 11.250
54 11.593
55 12.295
56 13.018
57 12.967
58 13.553
59 14.412
60 14.077
61 14.555
62 13.591
63 12.405
64 11.826
65 11.333
66 11.187
67 10.787
68 9.949
69 9.669
70 10.229
71 9.942
72 9.831
73 9.670
74 8.917
75 8.230
76 8.492
77 8.067
78 8.087
79 8.229
80 8.136
81 7.852
82 7.589
83 7.055
84 6.700
85 6.375
86 5.035
87 4.942
88 4.797
89 4.701
90 5.215
91 5.948
92 6.809
93 8.304
94 8.318
95 9.490
96 9.942
97 10.442
98 10.956
99 11.543
100 12.933
101 13.096
102 13.271
103 13.709
104 12.849
105 12.941
106 12.956
107 12.020
108 11.199
109 10.394
110 9.531
111 8.869
112 7.892
113 8.573
114 8.194
115 7.768
116 7.394
117 7.170
118 6.702
119 5.898
120 5.325
121 5.095
122 4.499
123 4.380
124 3.780
125 3.382
126 4.141
127 4.756
128 5.675
129 5.705
130 6.070
131 6.281
132 6.242
133 5.845
134 6.201
135 5.600
136 5.724
137 5.951
138 6.476
139 6.760
140 7.464
141 8.029
142 8.745
143 9.385
144 10.110
145 9.399
146 9.349
147 9.275
148 9.381
149 9.012
150 8.754
151 8.588
152 8.494
153 8.635
154 8.443
155 8.613
156 8.327
157 7.948
158 8.490
159 8.087
160 8.400
161 8.490
162 8.763
163 9.048
164 9.773
165 10.182
166 10.213
167 10.805
168 10.526
169 11.216
170 11.301
171 11.371
172 10.410
173 10.663
174 10.521
175 10.341
176 10.551
177 11.188
178 11.399
179 10.863
180 10.333
181 10.712
182 10.871
183 11.240
184 10.719
185 10.196
186 9.997
187 9.581
188 8.682
189 8.198
190 7.861
191 8.003
192 7.379
193 6.287
194 5.845
195 5.786
196 5.200
197 4.791
198 4.805
199 5.064
200 4.894
201 4.474
202 4.441
203 5.166
204 5.484
205 5.925
206 6.199
207 6.402
208 6.474
209 6.154
210 6.734
211 7.746
212 8.440
213 9.347
214 9.109
215 8.873
216 8.328
217 6.910
218 5.562
219 4.488
220 3.395
221 2.219
222 1.541
223 0.887
224 0.163
225 0.180
226 1.058
227 1.472
228 1.885
229 1.649
230 1.663
231 1.958
232 2.080
233 2.765
234 3.586
235 4.628
236 5.827
237 6.716
238 7.667
239 9.143
240 10.718
241 12.393

Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability)

11	66.67
12	66.67
13	66.67
14	66.67
15	65.08
16	63.49
17	61.91
18	60.32
19	58.73
20	57.14
21	57.78
22	58.41
23	60.00
24	61.59
25	63.18
26	64.76
27	66.35
28	67.94
29	69.52
30	71.11
31	72.70
32	74.29
33	75.87
34	77.46
35	79.05
36	82.22
37	85.40
38	88.57
39	91.75
40	94.92
41	98.10
42	99.05
43	100.00
44	100.00
45	100.00
46	100.00
47	100.00
48	100.00
49	100.00
50	100.00
51	100.00
52	100.00
53	100.00
54	100.00
55	100.00
56	100.00
57	100.00
58	100.00
59	100.00
60	100.00
61	100.00
62	100.00
63	100.00
64	100.00
65	100.00
66	100.00
67	100.00
68	100.00
69	100.00
70	100.00
71	100.00
72	100.00
73	100.00
74	100.00
75	100.00
76	100.00
77	100.00
78	100.00
79	100.00
80	100.00
81	100.00
82	100.00
83	100.00
84	100.00
85	100.00
86	100.00
87	100.00
88	100.00
89	100.00
90	100.00
91	100.00
92	100.00
93	100.00
94	100.00
95	100.00
96	100.00
97	100.00
98	100.00
99	100.00
100	100.00
101	100.00
102	100.00
103	100.00
104	100.00
105	100.00
106	100.00
107	100.00
108	100.00
109	100.00
110	100.00
111	100.00
112	100.00
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114	100.00
115	100.00
116	100.00
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118	100.00
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120	100.00
121	100.00
122	100.00
123	100.00
124	100.00
125	100.00
126	100.00
127	100.00
128	100.00
129	100.00
130	100.00
131	100.00
132	100.00
133	100.00
134	100.00
135	100.00
136	100.00
137	100.00
138	100.00
139	100.00
140	100.00
141	100.00
142	100.00
143	100.00
144	100.00
145	100.00
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147	100.00
148	100.00
149	100.00
150	100.00
151	100.00
152	100.00
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154	100.00
155	100.00
156	100.00
157	100.00
158	100.00
159	100.00
160	100.00
161	100.00
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166	100.00
167	100.00
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169	100.00
170	100.00
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173	100.00
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182	100.00
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185	100.00
186	100.00
187	100.00
188	100.00
189	100.00
190	100.00
191	100.00
192	100.00
193	100.00
194	100.00
195	100.00
196	100.00
197	100.00
198	100.00
199	100.00
200	100.00
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203	100.00
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205	100.00
206	98.10
207	95.24
208	93.33
209	91.43
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211	87.62
212	85.71
213	83.81
214	81.90
215	80.00
216	78.10
217	76.19
218	74.29
219	72.38
220	70.48
221	68.57
222	66.67
223	64.76
224	62.86
225	60.95
226	59.05
227	59.05
228	59.05
229	58.10
230	57.14
231	56.19
232	55.24
233	54.29
234	53.33
235	52.38
236	51.43
237	50.48
238	49.52
239	48.57

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