############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:35:34 Total request time: 12.2 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P30453|1A34_HUMAN HLA class I histocompatibility antigen, A-34 alpha chain OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HLA-A PE=1 SV=1 Sequence length: 365 aa. Sequence: MAIMAPRTLVLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDRNTRKVKAQSQTDRVDLGTLRGYYNQSEDGSHTIQRMYGCDVGPDGRFLRGYQQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITQRKWETAHEAEQWRAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDAPKTHMTHHAVSDHEATLRCWALSFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWASVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEPSSQPTIPIVGILAGLVLFGAVIAGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYSQAASSDSAQGSDMSLTACKV TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: oooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 1.293 11 0.909 12 1.229 13 1.285 14 1.115 15 1.126 16 1.232 17 1.861 18 2.723 19 3.907 20 4.337 21 5.027 22 5.328 23 5.257 24 4.648 25 4.459 26 5.075 27 5.804 28 6.451 29 7.167 30 7.768 31 7.881 32 7.995 33 8.498 34 8.841 35 9.009 36 8.807 37 8.036 38 7.941 39 8.259 40 8.483 41 8.866 42 8.828 43 8.460 44 8.320 45 7.827 46 7.605 47 7.725 48 7.387 49 6.929 50 6.761 51 6.699 52 7.147 53 7.084 54 7.400 55 7.800 56 8.414 57 9.083 58 9.924 59 10.133 60 9.921 61 10.638 62 10.856 63 10.300 64 9.981 65 10.565 66 9.893 67 10.103 68 10.786 69 11.382 70 12.270 71 12.218 72 12.427 73 12.639 74 12.429 75 11.876 76 11.665 77 10.939 78 11.429 79 11.646 80 11.229 81 11.343 82 11.922 83 12.938 84 13.311 85 14.696 86 15.487 87 15.695 88 14.964 89 14.114 90 13.338 91 12.305 92 11.464 93 11.078 94 11.384 95 11.135 96 10.692 97 9.962 98 10.048 99 9.632 100 8.756 101 8.848 102 8.702 103 8.988 104 9.522 105 9.956 106 9.977 107 10.468 108 11.024 109 11.139 110 11.053 111 11.209 112 11.511 113 10.945 114 10.612 115 11.005 116 10.882 117 10.935 118 11.198 119 11.721 120 11.309 121 11.037 122 10.859 123 9.711 124 8.874 125 7.921 126 7.301 127 7.152 128 7.064 129 7.616 130 8.242 131 9.380 132 10.154 133 10.583 134 10.865 135 11.152 136 11.010 137 11.555 138 11.193 139 10.738 140 10.639 141 10.064 142 10.720 143 11.543 144 12.287 145 11.762 146 11.110 147 11.026 148 9.601 149 8.615 150 8.116 151 8.092 152 8.501 153 8.351 154 8.192 155 7.959 156 8.082 157 7.835 158 7.506 159 7.584 160 7.608 161 6.842 162 5.899 163 6.276 164 7.062 165 7.624 166 8.798 167 10.566 168 11.170 169 12.076 170 12.815 171 12.066 172 11.748 173 11.300 174 10.673 175 9.352 176 9.757 177 10.101 178 9.737 179 10.049 180 10.076 181 10.996 182 9.831 183 8.907 184 8.181 185 6.763 186 5.538 187 4.766 188 4.932 189 5.440 190 6.772 191 8.113 192 10.018 193 10.935 194 11.247 195 11.244 196 10.598 197 10.202 198 10.288 199 10.232 200 10.000 201 10.704 202 11.389 203 12.531 204 12.892 205 13.048 206 13.830 207 13.352 208 12.355 209 11.674 210 11.384 211 10.583 212 10.763 213 11.593 214 10.879 215 10.769 216 10.314 217 9.890 218 9.731 219 8.916 220 8.633 221 8.110 222 7.755 223 7.661 224 7.511 225 7.242 226 6.305 227 6.595 228 6.178 229 5.400 230 4.433 231 3.670 232 2.442 233 2.676 234 2.632 235 3.485 236 4.361 237 5.709 238 6.932 239 7.985 240 9.070 241 10.318 242 12.008 243 12.802 244 13.442 245 13.100 246 12.208 247 12.607 248 12.422 249 12.632 250 12.701 251 12.658 252 11.971 253 11.990 254 11.781 255 11.246 256 10.463 257 10.765 258 10.522 259 10.360 260 9.854 261 9.781 262 9.682 263 9.075 264 9.305 265 9.741 266 9.137 267 9.168 268 9.425 269 9.254 270 9.265 271 8.693 272 7.953 273 7.391 274 7.423 275 8.635 276 8.751 277 9.653 278 11.088 279 12.417 280 12.562 281 12.259 282 12.459 283 12.277 284 11.647 285 10.656 286 10.093 287 8.957 288 8.368 289 7.961 290 8.954 291 9.669 292 10.100 293 10.706 294 10.930 295 11.564 296 11.252 297 10.641 298 10.343 299 9.572 300 9.426 301 8.925 302 8.017 303 6.776 304 6.597 305 6.524 306 6.180 307 5.661 308 4.806 309 3.197 310 2.488 311 1.930 312 1.366 313 0.485 314 -0.010 315 0.293 316 0.379 317 -0.076 318 0.026 319 0.062 320 -0.259 321 -0.155 322 0.216 323 -0.016 324 -0.386 325 -0.154 326 0.209 327 1.315 328 2.561 329 3.743 330 4.955 331 6.478 332 8.328 333 9.830 334 10.593 335 10.940 336 11.424 337 11.927 338 11.815 339 11.637 340 11.782 341 11.807 342 11.790 343 11.436 344 10.859 345 10.771 346 10.437 347 10.211 348 10.326 349 10.340 350 10.396 351 9.887 352 9.691 353 9.335 354 9.330 355 9.202 356 8.534 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; 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