############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:39:21 Total request time: 7.5 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P43307|SSRA_HUMAN Translocon-associated protein subunit alpha OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSR1 PE=1 SV=3 Sequence length: 286 aa. Sequence: MRLLPRLLLLLLLVFPATVLFRGGPRGLLAVAQDLTEDEETVEDSIIEDEDDEAEVEEDEPTDLVEDKEEEDVSGEPEASPSADTTILFVKGEDFPANNIVKFLVGFTNKGTEDFIVESLDASFRYPQDYQFYIQNFTALPLNTVVPPQRQATFEYSFIPAEPMGGRPFGLVINLNYKDLNGNVFQDAVFNQTVTVIEREDGLDGETIFMYMFLAGLGLLVIVGLHQLLESRKRKRPIQKVEMGTSSQNDVDMSWIPQETLNQINKASPRRLPRKRAQKRSVGSDE TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 -0.916 11 -1.672 12 -2.108 13 -1.926 14 -1.219 15 -1.299 16 -0.686 17 0.112 18 1.359 19 2.005 20 2.486 21 3.503 22 4.351 23 4.888 24 5.599 25 6.325 26 5.549 27 5.408 28 6.014 29 6.315 30 7.219 31 8.382 32 8.845 33 8.963 34 9.768 35 10.422 36 11.321 37 11.315 38 11.629 39 12.755 40 12.923 41 13.242 42 13.502 43 13.262 44 13.446 45 13.887 46 14.815 47 14.207 48 14.521 49 15.006 50 15.071 51 15.878 52 16.335 53 15.868 54 15.861 55 15.088 56 14.986 57 15.642 58 15.138 59 14.948 60 15.227 61 15.791 62 16.130 63 16.011 64 16.105 65 15.918 66 16.197 67 15.929 68 15.780 69 15.983 70 14.981 71 14.561 72 14.691 73 14.226 74 14.259 75 14.269 76 13.326 77 12.699 78 12.271 79 11.098 80 9.856 81 9.057 82 8.943 83 9.202 84 9.134 85 9.077 86 8.064 87 7.894 88 7.211 89 7.969 90 8.312 91 8.033 92 7.989 93 8.457 94 7.986 95 7.765 96 7.703 97 8.008 98 7.947 99 7.807 100 8.164 101 7.889 102 7.656 103 7.131 104 7.609 105 8.491 106 8.179 107 8.352 108 7.977 109 8.103 110 8.718 111 8.407 112 8.628 113 8.951 114 9.363 115 8.787 116 8.126 117 8.030 118 8.042 119 8.120 120 8.572 121 8.693 122 9.695 123 9.408 124 9.407 125 9.901 126 10.544 127 11.191 128 10.052 129 9.559 130 9.517 131 8.295 132 8.238 133 7.159 134 7.770 135 7.441 136 7.063 137 6.210 138 5.746 139 5.542 140 6.083 141 5.714 142 6.814 143 7.136 144 7.381 145 6.897 146 7.396 147 8.134 148 8.831 149 8.829 150 9.301 151 9.161 152 9.183 153 8.945 154 9.158 155 8.860 156 8.772 157 8.459 158 7.667 159 7.294 160 6.867 161 6.695 162 6.331 163 6.408 164 6.709 165 7.176 166 7.173 167 7.278 168 7.116 169 7.002 170 6.376 171 5.893 172 6.222 173 6.531 174 7.622 175 8.017 176 7.991 177 8.981 178 9.148 179 9.655 180 9.493 181 9.419 182 9.585 183 9.698 184 9.024 185 9.200 186 8.368 187 8.263 188 7.734 189 7.987 190 8.302 191 8.055 192 8.148 193 7.946 194 7.758 195 8.479 196 8.836 197 9.681 198 10.204 199 10.398 200 10.271 201 9.326 202 8.608 203 8.161 204 7.488 205 6.719 206 6.281 207 6.209 208 4.767 209 4.549 210 2.866 211 1.732 212 1.155 213 1.030 214 0.215 215 -0.071 216 -1.323 217 -0.801 218 -0.187 219 -0.060 220 -0.230 221 0.814 222 1.464 223 2.132 224 3.153 225 3.774 226 4.341 227 5.513 228 6.778 229 8.195 230 10.061 231 11.441 232 12.523 233 13.770 234 13.829 235 14.455 236 13.302 237 12.568 238 12.486 239 12.382 240 11.448 241 11.021 242 10.640 243 10.558 244 10.620 245 10.825 246 10.810 247 10.353 248 10.867 249 10.592 250 10.977 251 11.030 252 9.999 253 10.774 254 10.959 255 10.812 256 11.018 257 10.854 258 10.184 259 9.938 260 10.203 261 10.345 262 10.181 263 10.148 264 10.738 265 11.314 266 11.859 267 11.891 268 11.821 269 11.975 270 12.666 271 13.300 272 13.430 273 12.971 274 13.346 275 12.896 276 12.945 277 13.567 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability) 11 60.00 12 60.00 13 60.00 14 60.00 15 60.00 16 60.00 17 60.00 18 60.00 19 60.00 20 60.00 21 60.00 22 60.95 23 62.86 24 64.76 25 66.67 26 68.57 27 70.48 28 72.38 29 74.29 30 76.19 31 78.10 32 80.00 33 81.90 34 83.81 35 85.71 36 87.62 37 89.52 38 91.43 39 93.33 40 95.24 41 97.14 42 99.05 43 100.00 44 100.00 45 100.00 46 100.00 47 100.00 48 100.00 49 100.00 50 100.00 51 100.00 52 100.00 53 100.00 54 100.00 55 100.00 56 100.00 57 100.00 58 100.00 59 100.00 60 100.00 61 100.00 62 100.00 63 100.00 64 100.00 65 100.00 66 100.00 67 100.00 68 100.00 69 100.00 70 100.00 71 100.00 72 100.00 73 100.00 74 100.00 75 100.00 76 100.00 77 100.00 78 100.00 79 100.00 80 100.00 81 100.00 82 100.00 83 100.00 84 100.00 85 100.00 86 100.00 87 100.00 88 100.00 89 100.00 90 100.00 91 100.00 92 100.00 93 100.00 94 100.00 95 100.00 96 100.00 97 100.00 98 100.00 99 100.00 100 100.00 101 100.00 102 100.00 103 100.00 104 100.00 105 100.00 106 100.00 107 100.00 108 100.00 109 100.00 110 100.00 111 100.00 112 100.00 113 100.00 114 100.00 115 100.00 116 100.00 117 100.00 118 100.00 119 100.00 120 100.00 121 100.00 122 100.00 123 100.00 124 100.00 125 100.00 126 100.00 127 100.00 128 100.00 129 100.00 130 100.00 131 100.00 132 100.00 133 100.00 134 100.00 135 100.00 136 100.00 137 100.00 138 100.00 139 100.00 140 100.00 141 100.00 142 100.00 143 100.00 144 100.00 145 100.00 146 100.00 147 100.00 148 100.00 149 100.00 150 100.00 151 100.00 152 100.00 153 100.00 154 100.00 155 100.00 156 100.00 157 100.00 158 100.00 159 100.00 160 100.00 161 100.00 162 100.00 163 100.00 164 100.00 165 100.00 166 100.00 167 100.00 168 100.00 169 100.00 170 100.00 171 100.00 172 100.00 173 100.00 174 100.00 175 100.00 176 100.00 177 100.00 178 100.00 179 100.00 180 100.00 181 100.00 182 100.00 183 100.00 184 100.00 185 100.00 186 100.00 187 100.00 188 100.00 189 100.00 190 100.00 191 100.00 192 100.00 193 100.00 194 100.00 195 100.00 196 100.00 197 98.10 198 98.10 199 98.10 200 98.10 201 98.10 202 98.10 203 98.10 204 98.10 205 98.10 206 98.10 207 98.10 208 98.10 209 98.10 210 98.10 211 98.10 212 98.10 213 98.10 214 98.10 215 98.10 216 98.10 217 98.10 218 98.10 219 96.19 220 96.19 221 96.19 222 96.19 223 96.19 224 96.19 225 96.19 226 96.19 227 96.19 228 96.19 229 96.19 230 96.19 231 96.19 232 96.19 233 96.19 234 96.19 235 96.19 236 96.19 237 96.19 238 96.19 239 98.10 240 100.00 241 100.00 242 100.00 243 100.00 244 100.00 245 100.00 246 100.00 247 100.00 248 100.00 249 100.00 250 100.00 251 100.00 252 100.00 253 100.00 254 100.00 255 100.00 256 100.00 257 100.00 258 100.00 259 100.00 260 100.00 261 100.00 262 100.00 263 100.00 264 100.00 265 100.00 266 100.00 267 100.00 268 100.00 269 100.00 270 100.00 271 100.00 272 100.00 273 100.00 274 100.00 275 100.00 ##############################################################################