############################################################################## TOPCONS2 result file Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:39:22 Total request time: 5.8 seconds. ############################################################################## Sequence number: 1 Sequence name: sp|P43308|SSRB_HUMAN Translocon-associated protein subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SSR2 PE=1 SV=1 Sequence length: 183 aa. Sequence: MRLLSFVVLALFAVTQAEEGARLLASKSLLNRYAVEGRDLTLQYNIYNVGSSAALDVELSDDSFPPEDFGIVSGMLNVKWDRIAPASNVSHTVVLRPLKAGYFNFTSATITYLAQEDGPVVIGSTSAPGQGGILAQREFDRRFSPHFLDWAAFGVMTLPSIGIPLLLWYSSKRKYDTPKTKKN TOPCONS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiii OCTOPUS predicted topology: iMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiii Philius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii PolyPhobius predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiii SCAMPI predicted topology: iiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiii SPOCTOPUS predicted topology: SSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiii Homology: No homologous hits found Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G) 10 1.450 11 2.297 12 2.787 13 3.498 14 3.832 15 3.530 16 4.114 17 4.949 18 5.631 19 6.689 20 6.683 21 6.912 22 7.704 23 7.579 24 7.179 25 6.802 26 6.019 27 6.536 28 6.519 29 6.351 30 6.930 31 7.046 32 7.316 33 7.243 34 8.189 35 8.052 36 8.299 37 7.990 38 7.481 39 8.100 40 8.171 41 7.573 42 8.012 43 8.476 44 8.366 45 8.157 46 6.760 47 6.409 48 6.092 49 6.273 50 6.075 51 6.192 52 6.827 53 7.108 54 7.901 55 7.352 56 8.312 57 9.357 58 9.641 59 10.558 60 10.394 61 10.588 62 10.443 63 10.438 64 10.622 65 10.918 66 10.178 67 9.153 68 8.595 69 8.544 70 7.877 71 6.921 72 6.673 73 6.169 74 6.415 75 6.323 76 6.785 77 6.613 78 7.304 79 8.967 80 9.210 81 9.957 82 10.600 83 10.069 84 9.177 85 8.509 86 7.642 87 6.373 88 6.360 89 5.684 90 6.170 91 5.853 92 6.374 93 6.666 94 6.599 95 6.997 96 7.171 97 7.130 98 7.041 99 6.922 100 6.336 101 5.512 102 5.239 103 4.880 104 4.268 105 4.234 106 4.630 107 4.687 108 5.523 109 6.005 110 6.911 111 6.920 112 7.239 113 7.420 114 7.091 115 7.606 116 7.382 117 7.193 118 6.815 119 6.790 120 6.955 121 7.525 122 7.962 123 8.551 124 8.383 125 7.410 126 6.630 127 6.723 128 6.378 129 6.763 130 6.565 131 6.979 132 7.344 133 7.466 134 7.487 135 8.559 136 9.304 137 10.478 138 10.576 139 10.341 140 10.562 141 10.216 142 9.758 143 9.327 144 8.751 145 8.204 146 7.183 147 6.621 148 5.433 149 5.109 150 4.989 151 5.167 152 4.751 153 4.778 154 3.877 155 3.427 156 2.250 157 2.009 158 1.844 159 1.162 160 1.119 161 1.298 162 1.651 163 2.366 164 2.514 165 3.364 166 3.858 167 4.699 168 5.852 169 6.959 170 8.139 171 9.414 172 10.129 173 11.056 174 11.742 Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability) 11 48.57 12 48.57 13 49.52 14 51.43 15 53.33 16 55.24 17 57.14 18 59.05 19 60.95 20 62.86 21 64.76 22 66.67 23 68.57 24 70.48 25 72.38 26 74.29 27 76.19 28 78.10 29 82.86 30 87.62 31 92.38 32 97.14 33 99.05 34 100.00 35 100.00 36 100.00 37 100.00 38 100.00 39 100.00 40 100.00 41 100.00 42 100.00 43 100.00 44 100.00 45 100.00 46 100.00 47 100.00 48 100.00 49 100.00 50 100.00 51 100.00 52 100.00 53 100.00 54 100.00 55 100.00 56 100.00 57 100.00 58 100.00 59 100.00 60 100.00 61 100.00 62 100.00 63 100.00 64 100.00 65 100.00 66 100.00 67 100.00 68 100.00 69 100.00 70 100.00 71 100.00 72 100.00 73 100.00 74 100.00 75 100.00 76 100.00 77 100.00 78 100.00 79 100.00 80 100.00 81 100.00 82 100.00 83 100.00 84 100.00 85 100.00 86 100.00 87 100.00 88 100.00 89 100.00 90 100.00 91 100.00 92 100.00 93 100.00 94 100.00 95 100.00 96 100.00 97 100.00 98 100.00 99 100.00 100 100.00 101 100.00 102 100.00 103 100.00 104 100.00 105 100.00 106 100.00 107 100.00 108 100.00 109 100.00 110 100.00 111 100.00 112 100.00 113 100.00 114 100.00 115 100.00 116 100.00 117 100.00 118 100.00 119 100.00 120 100.00 121 100.00 122 100.00 123 100.00 124 100.00 125 100.00 126 100.00 127 100.00 128 100.00 129 100.00 130 100.00 131 100.00 132 100.00 133 100.00 134 100.00 135 100.00 136 100.00 137 99.05 138 97.14 139 96.19 140 96.19 141 96.19 142 96.19 143 96.19 144 96.19 145 96.19 146 96.19 147 96.19 148 96.19 149 96.19 150 96.19 151 96.19 152 96.19 153 96.19 154 96.19 155 96.19 156 96.19 157 96.19 158 97.14 159 96.19 160 96.19 161 96.19 162 96.19 163 96.19 164 96.19 165 96.19 166 96.19 167 96.19 168 96.19 169 96.19 170 96.19 171 96.19 172 96.19 ##############################################################################