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TOPCONS2 result file
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Sequence number: 1
Sequence name: sp|P51571|SSRD_HUMAN Translocon-associated protein subunit delta OS=Homo sapiens GN=SSR4 PE=1 SV=1
Sequence length: 173 aa.
Sequence:
MAAMASLGALALLLLSSLSRCSAEACLEPQITPSYYTTSDAVISTETVFIVEISLTCKNRVQNMALYADVGGKQFPVTRGQDVGRYQVSWSLDHKSAHAGTYEVRFFDEESYSLLRKAQRNNEDISIIPPLFTVSVDHRGTWNGPWVSTEVLAAAIGLVIYYLAFSAKSHIQA


TOPCONS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiii


OCTOPUS predicted topology:
iMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiii


Philius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo


PolyPhobius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiii


SCAMPI predicted topology:
iiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiii


SPOCTOPUS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiii


Homology:
No homologous hits found



Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G)

10 0.495
11 0.566
12 0.618
13 1.037
14 1.273
15 2.284
16 2.435
17 3.277
18 3.096
19 4.218
20 5.286
21 5.946
22 6.190
23 6.477
24 6.907
25 7.362
26 6.903
27 6.536
28 6.995
29 6.792
30 7.487
31 8.432
32 8.528
33 8.905
34 8.534
35 9.035
36 9.033
37 9.688
38 8.914
39 7.988
40 6.774
41 6.175
42 5.576
43 5.346
44 4.810
45 5.141
46 4.565
47 4.186
48 3.771
49 3.517
50 3.852
51 4.080
52 4.408
53 5.520
54 6.360
55 7.037
56 7.290
57 7.453
58 7.786
59 8.159
60 8.587
61 8.449
62 7.759
63 7.911
64 7.744
65 8.597
66 8.338
67 8.809
68 8.588
69 8.030
70 8.124
71 8.528
72 8.430
73 8.259
74 8.433
75 8.968
76 9.563
77 9.576
78 10.103
79 9.762
80 10.377
81 9.882
82 9.887
83 9.163
84 8.945
85 9.684
86 9.493
87 9.826
88 9.700
89 10.240
90 9.868
91 9.735
92 9.449
93 9.304
94 9.266
95 9.155
96 9.138
97 8.273
98 8.123
99 8.318
100 9.405
101 9.667
102 10.466
103 10.264
104 10.100
105 9.619
106 8.993
107 8.770
108 8.034
109 7.886
110 8.210
111 8.448
112 9.407
113 9.790
114 11.185
115 12.239
116 12.967
117 13.707
118 13.280
119 12.225
120 11.589
121 11.437
122 10.517
123 9.226
124 8.822
125 8.585
126 8.252
127 7.584
128 7.693
129 7.459
130 7.412
131 7.328
132 6.770
133 5.991
134 6.468
135 7.307
136 7.763
137 8.218
138 8.599
139 8.778
140 8.355
141 9.177
142 9.247
143 8.574
144 8.180
145 7.269
146 6.764
147 5.892
148 5.380
149 4.639
150 3.958
151 3.466
152 3.082
153 1.799
154 0.942
155 0.572
156 0.560
157 0.943
158 0.840
159 1.351
160 1.341
161 2.283
162 2.970
163 4.018
164 4.428

Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability)

11	60.00
12	60.00
13	60.00
14	61.90
15	63.81
16	65.71
17	67.62
18	69.52
19	71.43
20	73.33
21	75.24
22	77.14
23	79.05
24	80.95
25	82.86
26	84.76
27	86.67
28	88.57
29	90.48
30	92.38
31	94.29
32	96.19
33	98.10
34	100.00
35	100.00
36	100.00
37	100.00
38	100.00
39	100.00
40	100.00
41	100.00
42	100.00
43	100.00
44	100.00
45	100.00
46	100.00
47	100.00
48	100.00
49	100.00
50	100.00
51	100.00
52	100.00
53	100.00
54	100.00
55	100.00
56	100.00
57	100.00
58	100.00
59	100.00
60	100.00
61	100.00
62	100.00
63	100.00
64	100.00
65	100.00
66	100.00
67	100.00
68	100.00
69	100.00
70	100.00
71	100.00
72	100.00
73	100.00
74	100.00
75	100.00
76	100.00
77	100.00
78	100.00
79	100.00
80	100.00
81	100.00
82	100.00
83	100.00
84	100.00
85	100.00
86	100.00
87	100.00
88	100.00
89	100.00
90	100.00
91	100.00
92	100.00
93	100.00
94	100.00
95	100.00
96	100.00
97	100.00
98	100.00
99	100.00
100	100.00
101	100.00
102	100.00
103	100.00
104	100.00
105	100.00
106	100.00
107	100.00
108	100.00
109	100.00
110	100.00
111	100.00
112	100.00
113	100.00
114	100.00
115	100.00
116	100.00
117	100.00
118	100.00
119	100.00
120	100.00
121	100.00
122	100.00
123	100.00
124	100.00
125	100.00
126	100.00
127	100.00
128	100.00
129	100.00
130	100.00
131	100.00
132	100.00
133	100.00
134	100.00
135	99.05
136	98.10
137	97.14
138	96.19
139	95.24
140	94.29
141	93.33
142	92.38
143	91.43
144	90.48
145	89.52
146	88.57
147	87.62
148	86.67
149	85.71
150	84.76
151	83.81
152	82.86
153	81.90
154	80.95
155	80.00
156	78.10
157	78.10
158	78.10
159	78.10
160	78.10
161	78.10
162	78.10

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