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TOPCONS2 result file
Generated from http://commonbackend.computenode.pcons3.se at 2018-10-26 16:39:53
Total request time: 9.4 seconds.
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Sequence number: 1
Sequence name: sp|P55899|FCGRN_HUMAN IgG receptor FcRn large subunit p51 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FCGRT PE=1 SV=1
Sequence length: 365 aa.
Sequence:
MGVPRPQPWALGLLLFLLPGSLGAESHLSLLYHLTAVSSPAPGTPAFWVSGWLGPQQYLSYNSLRGEAEPCGAWVWENQVSWYWEKETTDLRIKEKLFLEAFKALGGKGPYTLQGLLGCELGPDNTSVPTAKFALNGEEFMNFDLKQGTWGGDWPEALAISQRWQQQDKAANKELTFLLFSCPHRLREHLERGRGNLEWKEPPSMRLKARPSSPGFSVLTCSAFSFYPPELQLRFLRNGLAAGTGQGDFGPNSDGSFHASSSLTVKSGDEHHYCCIVQHAGLAQPLRVELESPAKSSVLVVGIVIGVLLLTAAAVGGALLWRRMRSGLPAPWISLRGDDTGVLLPTPGEAQDADLKDVNVIPATA


TOPCONS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


OCTOPUS predicted topology:
oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


Philius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


PolyPhobius predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


SCAMPI predicted topology:
iiiiiMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


SPOCTOPUS predicted topology:
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMMiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiiii


Homology:
No homologous hits found



Predicted Delta-G-values (kcal/mol) (left column=sequence position; right column=Delta-G)

10 3.834
11 3.591
12 3.020
13 2.137
14 1.658
15 1.372
16 1.427
17 1.616
18 2.156
19 2.496
20 3.098
21 3.252
22 2.753
23 3.114
24 4.154
25 4.321
26 4.683
27 5.072
28 5.563
29 5.406
30 5.611
31 5.841
32 6.329
33 6.413
34 6.730
35 5.864
36 5.746
37 5.254
38 5.291
39 4.743
40 5.028
41 5.933
42 6.355
43 5.706
44 5.460
45 5.621
46 5.851
47 6.184
48 6.369
49 5.979
50 5.251
51 5.769
52 5.267
53 5.548
54 6.143
55 5.685
56 6.122
57 7.144
58 8.068
59 8.289
60 9.025
61 9.451
62 9.910
63 10.541
64 10.139
65 9.162
66 8.356
67 7.307
68 7.697
69 8.405
70 8.489
71 8.675
72 8.631
73 8.189
74 8.349
75 7.829
76 7.926
77 7.362
78 8.093
79 8.059
80 8.179
81 9.146
82 9.168
83 9.764
84 10.240
85 10.681
86 11.332
87 11.004
88 9.860
89 9.108
90 8.949
91 9.670
92 10.072
93 9.738
94 9.723
95 8.452
96 7.430
97 6.891
98 6.938
99 6.892
100 6.697
101 7.473
102 7.303
103 7.244
104 6.586
105 6.687
106 6.974
107 7.364
108 7.311
109 7.951
110 6.975
111 7.226
112 6.729
113 6.479
114 6.441
115 6.615
116 6.711
117 6.138
118 6.283
119 6.244
120 6.578
121 7.105
122 7.412
123 8.333
124 7.844
125 7.791
126 7.829
127 8.847
128 8.818
129 9.310
130 9.634
131 9.805
132 9.355
133 9.487
134 8.607
135 8.107
136 7.694
137 7.644
138 8.212
139 8.130
140 8.367
141 8.279
142 8.358
143 8.994
144 9.630
145 10.037
146 9.887
147 10.499
148 9.879
149 9.002
150 9.209
151 8.904
152 8.171
153 8.406
154 7.715
155 7.574
156 7.440
157 7.534
158 7.862
159 8.600
160 9.669
161 10.109
162 10.458
163 11.333
164 12.397
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166 12.418
167 12.663
168 12.848
169 12.388
170 11.726
171 10.566
172 9.767
173 9.182
174 9.076
175 8.516
176 7.281
177 6.014
178 5.266
179 5.503
180 6.020
181 5.987
182 6.792
183 7.261
184 7.604
185 8.622
186 9.501
187 10.697
188 10.920
189 11.889
190 11.886
191 11.543
192 12.031
193 12.212
194 12.028
195 12.300
196 12.427
197 12.176
198 10.773
199 10.271
200 10.507
201 9.904
202 10.481
203 10.552
204 10.972
205 11.179
206 11.245
207 11.492
208 11.284
209 11.279
210 10.217
211 9.130
212 8.036
213 7.190
214 6.174
215 5.352
216 5.277
217 5.065
218 4.442
219 4.720
220 5.148
221 5.270
222 4.961
223 5.600
224 5.072
225 5.105
226 5.287
227 4.701
228 4.884
229 5.802
230 6.317
231 6.136
232 6.133
233 6.367
234 7.055
235 6.905
236 7.477
237 7.628
238 6.957
239 6.582
240 5.255
241 5.812
242 5.730
243 6.945
244 7.563
245 8.424
246 9.381
247 10.052
248 9.551
249 10.259
250 10.892
251 11.197
252 11.530
253 11.542
254 11.038
255 10.525
256 9.762
257 9.316
258 8.936
259 9.261
260 9.303
261 9.477
262 9.550
263 10.260
264 10.132
265 10.006
266 9.968
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269 10.103
270 10.270
271 9.657
272 9.098
273 8.762
274 8.260
275 8.256
276 8.244
277 7.214
278 6.706
279 6.282
280 6.428
281 5.683
282 6.293
283 7.300
284 8.117
285 8.493
286 9.145
287 9.670
288 9.533
289 9.189
290 8.751
291 8.300
292 8.496
293 8.632
294 7.696
295 6.813
296 6.504
297 6.207
298 5.431
299 3.762
300 2.909
301 1.202
302 0.320
303 -0.383
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310 0.466
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313 -0.252
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316 -0.290
317 0.641
318 2.131
319 3.128
320 4.942
321 5.925
322 7.021
323 7.199
324 6.883
325 6.649
326 5.318
327 4.363
328 4.184
329 4.698
330 5.367
331 5.770
332 6.529
333 6.983
334 7.172
335 7.146
336 7.557
337 7.212
338 7.761
339 7.545
340 8.129
341 7.480
342 7.925
343 8.433
344 8.098
345 8.891
346 8.688
347 8.894
348 9.153
349 9.347
350 10.592
351 10.761
352 11.090
353 11.970
354 12.322
355 11.581
356 11.152

Predicted TOPCONS reliability (left column=sequence position; right column=reliability)

11	60.00
12	60.00
13	60.00
14	60.00
15	60.95
16	61.90
17	63.81
18	65.71
19	67.62
20	69.52
21	71.43
22	73.33
23	75.24
24	77.14
25	79.05
26	80.95
27	82.86
28	84.76
29	86.67
30	88.57
31	90.48
32	92.38
33	94.29
34	96.19
35	98.10
36	99.05
37	100.00
38	100.00
39	100.00
40	100.00
41	100.00
42	100.00
43	100.00
44	100.00
45	100.00
46	100.00
47	100.00
48	100.00
49	100.00
50	100.00
51	100.00
52	100.00
53	100.00
54	100.00
55	100.00
56	100.00
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59	100.00
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66	100.00
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77	100.00
78	100.00
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80	100.00
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88	100.00
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91	100.00
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95	100.00
96	100.00
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98	100.00
99	100.00
100	100.00
101	100.00
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109	100.00
110	100.00
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